Ora Claire lavora per una ONG in Penamstan, ma scopre alcuni segni che le ricordano Raccoon City. Leon si dirige alla Casa Bianca, senza sapere che è sotto attacco.

Con gli agenti Jason e Shen May, Leon intraprende una missione sotto copertura a bordo di un sottomarino nucleare per infiltrarsi in una struttura di ricerca a Shanghai.

Claire scopre una scena terribile a casa di uno degli ultimi sopravvissuti dell'unità Cani Rabbiosi. Shen May avverte Leon di una sinistra cospirazione.

Il segretario Wilson minaccia Claire, chiedendole di abbandonare l'indagine. Leon e Shen May si precipitano al grande laboratorio di armi biologiche.