Un avocat est abattu dans son bureau en fin de journée et l'un de ses dossiers est retrouvé brûlé. La police soupçonne très vite un client du cabinet, Lloyd Grayson... Pendant ce temps, Monk est confronté à un témoin, qui ressemble étrangement à son ex-femme.

Christine Rutherford profite du tremblement de terre qui ravage San Francisco pour assassiner son mari et faire croire que ce dernier a été victime de la chute d'un objet lourd.

Les corps d'un couple sont retrouvés dans une voiture abandonnée. Une caméra vidéo a enregistré la présence d'un suspect qu'Adrian Monk croit reconnaître. Il entame son enquête dans l'univers du base-ball.

Les corps d'un couple sont retrouvés dans une voiture abandonnée. Une caméra vidéo a enregistré la présence d'un suspect qu'Adrian Monk croit reconnaître. Il entame son enquête dans l'univers du base-ball.

Plusieurs bombes de moyenne importance ont explosé dans les environs de Los Angeles. Monk croit connaître l'identité du criminel mais il apprend que son suspect est dans le coma.

L'employé d'un poste de péage est assassiné pendant son service. A l'autre bout de la ville, une femme est tuée dans un cinéma. Ces deux victimes viennent accroître le nombre d'homicides mystérieux perpétrés depuis des semaines dans le secteur.

Nestor, un livreur de journaux, est assassiné en voulant arrêter un voleur qui venait de dérober le journal de Monk. Ce dernier est convaincu qu'un indice se trouve dans le quotidien qu'il devait lire ce matin-même.

L'ex-femme de Brad Terry, un animateur-vedette de la télévision, a été poignardée chez elle. Monk ne partage pas l'avis de la police qui pense qu'il s'agit d'un vol avec effraction ayant mal tourné.

Karen Stottlemeyer, l'épouse du capitaine, est victime d'un accident. Monk est persuadé qu'il s'agit en fait d'une agression.

Ian Blackburn, un producteur de disques, est retrouvé mort dans son appartement alors qu'il travaillait sur des chansons destinées à son épouse, une star de musique pop. Lorsque la police arrive sur les lieux, elle assiste à une scène pour le moins incroyable. Darwin, le chimpanzé de la victime, couvert de sang, se tient près de son maître, un revolver à la main. Stottlemeyer et Disher sont contraints de soupçonner l'animal de meurtre mais ils demandent bientôt l'aide de Monk afin qu'il mène sa propre enquête et découvre si le chimpanzé est bien l'auteur du drame.

Une bombe explose dans une centrale électrique de San Francisco, causant la mort de trois personnes. Sharona, Monk, Stottlemeyer et Disher mènent l'enquête. Ils rencontrent tout d'abord la séduisante Michele Rivas, porte-parole de la centrale électrique puis, Gene Edelson, un ingénieur sur le site. Monk cherche à connaître l'auteur de cet attentat en relevant de précieux indices et en remontant dans le temps.

Stottlemeyer enquête sur un incendie criminel qui a eu lieu dans une fabrique de perruques. Mais le commissaire Brooks, son nouveau supérieur, lui demande de s'occuper d'une affaire beaucoup plus urgente. Le torse d'une femme vient, en effet, d'être retrouvé dans la baie de San Francisco. Le capitaine part aussitôt sur les lieux avec Monk.

Lorsqu'un homme ensanglanté s'approche de Sharona dans un parking, celle-ci demande l'aide de Monk qui l'attend à l'extérieur. Lorsqu'ils retournent ensemble, quelques instants plus tard, au même endroit, celui-ci a disparu. La police ne trouve aucun indice susceptible de prouver les dires de Sharona. Stottlemeyer suggère à Monk de donner quelques jours de vacances à Sharona qui est visiblement surmenée.

Edna Coruthers, qui vient d'être plébiscitée meilleure employée du mois, se rend très tôt au magasin "Mega Mart" afin de débuter sa journée de travail. A son arrivée, elle trouve un mot lui indiquant de se rendre aussitôt dans l'entrepôt du supermarché. Lorsqu'elle arrive sur les lieux, un chariot élévateur fonce vers elle, la projetant sous une pile de téléviseurs. La jeune femme meurt écrasée. Le capitaine Stottlemeyer et le lieutenant Disher mènent l'enquête. Tout semble penser que le décès est dû à un accident. Mais le directeur de la sécurité du magasin estime, en revanche, que la victime a été assassinée et fait appel à Monk.

Le capitaine Stottlemeyer et le lieutenant Disher procèdent à une arrestation de routine lorsqu'un homme, visiblement étrange, leur tire dessus depuis son véhicule, blessant Stottlemeyer. Celui-ci est immédiatement transporté à l'hôpital et Monk rejoint Disher afin de mener l'enquête. Leur premier suspect est l'homme que les deux officiers cherchaient à arrêter au moment de la fusillade. Mais alors que Monk et Disher sont prêts à l'intercepter, les troubles compulsifs de Monk permettent au suspect de s'échapper. Se sentant coupable d'avoir fait échouer l'arrestation, Monk se rend chez le Dr Kroger afin de lui demander son aide. Ce dernier lui prescrit un nouveau traitement.

Sharona, qui s'est remariée avec son ex-époux, n'est plus l'assistante de Monk. Ce dernier cherche donc une remplaçante lorsqu'il reçoit la visite d'une jeune veuve accompagnée de sa fille.

Nathalie a décidé de se présenter à l'élection qui se déroule dans l'école où est scolarisée sa fille, en vue de devenir la représentante des parents d'élèves. Sa motivation est d'autant plus grande qu'un projet visant à fermer l'établissement a vu le jour et, dans cette optique précise, les élèves seraient rattachés à un lycée voisin. Pourtant, l'engagement de l'assistante de Monk semble gêner quelqu'un car son Q.G. est bientôt la cible d'un tireur fou...

Le petit Tommy Graser, tout juste âgé de vingt-deux mois, trouve un doigt sectionné dans un parc et le remet à un agent de police. Monk revient bientôt dans le parc avec le petit garçon, mais il ne trouve ni corps, ni trace d'un éventuel crime. A sa surprise, il se prend d'affection pour ce garçonnet, aussi calme qu'intelligent, qui ne cesse de répéter le nom de Monk et de s'essuyer les mains à chaque fois qu'il touche quelque chose. Après un minutieux travail d'identification, un expert affirme que ce doigt appartient à un homme âgé de vingt-cinq ans. Monk parvient même à en déduire que la victime jouait du violon. Celui-ci se rend ensuite au domicile de Daniel Carlyle, un musicien qui correspondrait à leurs recherches.

Un agent de sécurité est tué sur le parking d'un centre commercial dont la bijouterie a été cambriolée. Par ailleurs, le bijoutier a disparu. Marty Eels, un détective, arrive sur les lieux du crime et trouve des indices là où Monk n'a rien vu. Stottlemeyer, épaté, décide d'employer Eels à la place de Monk.

Monk réalise qu'il va beaucoup mieux. Stottlemeyer décide de l'aider à réintégrer la police. Au même moment, Nathalie intercepte une conversation entre un homme dénommé Zach Ellinghouse et une femme appelée Trudy, qui présente de fortes ressemblances avec l'ancienne femme de Monk.

Lors d'un rendez-vous avec un homme qui prétend pouvoir lui donner des informations concernant la mort de Trudy, Monk prend un coup sur la tête et se réveille, le lendemain matin, sur la remorque d'un camion dans une petite ville du Wyoming, souffrant d'amnésie. Une résidente excentrique du nom de Cora le persuade qu'il est son nouveau mari, Jerry. Même s'il ne sait pas qui il est, Monk est toujours Monk.

Alors qu’ils n’ont pas mené d'enquête depuis trois semaines, Monk et Natalie n'ont plus du tout d'argent. Ils décident donc de partir à la recherche du célèbre diamant d'Alexandre, un joyau d'une valeur inestimable qui vient d'être volé. En effet, la récompense s'élève à un million de dollars pour celui qui le retrouvera. Malheureusement, ceux-ci sont en concurrence avec de nombreux autres détectives dont un ancien investigateur de Scotland Yard, un chasseur de primes et un détective privé.

Monk doit résoudre une affaire très complexe. Une femme qui venait de rédiger une biographie d'un célèbre astronaute est, en effet, retrouvée morte chez elle. Si tout laisse à penser qu'elle s'est suicidée, Monk est convaincu qu'elle a été assassinée. L'astronaute est le premier suspect, mais il était dans l'espace au moment du meurtre.

Après que Michelle Cullman l'ait entrainé à son appartement pour des jeux illicites, Jack Leverett devient fou de rage en découvrant une caméra vidéo clandestine. Jack et Michelle s'étripent sous l'œil de l'appareil, la bagarre s'intensifie et Michelle tombe raide morte. Jack efface ses empreintes, s'empare de la caméra et débarrasse le plancher. Le jour suivant, Monk et Natalie arrivent à l'appartement de Michelle Cullman pour mener l'enquête. Mais en plus du capitaine Stottlemeyer et du lieutenant Disher, une nouvelle tête fait son apparition : un grand nom du cinéma hollywoodien, le dénommé David Ruskin. Ce dernier, en effet, s'apprête à endosser le rôle de Monk pour son prochain film et il désire suivre au plus près l'enquêteur pour créer son personnage.

La grève des ordures la plus importante jamais vécue dans l'histoire de San Francisco vient de commencer. Partout les déchets s'accumulent, et le patron de l'union sanitaire, Jimmy Cusack, menace de prolonger l'arrêt de travail. Pour Monk, c'est un scénario-catastrophe, et rien ne s'arrange quand Cusack est retrouvé mort dans son bureau. Tout laisse penser à un suicide. Mais l'union sanitaire, redoutant un acte criminel, suspend toutes les négociations avec la ville et engage Monk pour qu'il fasse la lumière sur la mort de Cusack. L'union ne reviendra à la table des négociations que si Monk arrive à prouver que Cusack s'est bel et bien suicidé, comme l'a conclu la police.

Alors que Monk se poste à la caserne des sapeurs-pompiers pour vérifier ses détecteurs de fumée, un incendie se déclare dans une maison voisine. Les pompiers ayant été appelés en renfort, Monk se retrouve seul avec un ancien soldat du feu prénommé Rusty, désormais à la retraite. Aussitôt après, un inconnu pénètre dans la caserne. Rusty affronte l'intrus, qui finit par le frapper à la tête à coup de pelle. Au moment où Monk réagit, l'inconnu lui balance du dissolvant dans les yeux et s'enfuit, laissant derrière lui un mort, Rusty, et un aveugle, Monk.

Tôt un matin, on retrouve la femme de ménage du docteur Kroger poignardée à mort dans son bureau. Obsédé par l'idée qu'un de ses patients pourrait être le meurtrier, Kroger décide de cesser ses activités, abandonnant Monk à ses angoisses profondes. Monk est alors incapable de découvrir ce qui est réellement arrivé à la victime.

Gail Segalis et son nouveau petit ami reviennent d'un voyage en Europe. Pour célébrer l'anniversaire de la première semaine de leur couple, Gail débouche une très chère bouteille de vin. A sa grande surprise, il semble y avoir quelque chose à l'intérieur, mais qui n'est pas du vin. Son petit ami, qui vient juste de sortir de la douche, devient fou de rage et tente de l'étrangler avec une serviette ! Gail Segalis s'écroule, morte. Retour à la maison de Gail, une scène de crime où les enquêteurs sont en pleine action. Monk est sur place, il s'avère qu'il connaissait la victime. Gail était un ancien agent de police, Monk et elle avaient pris l'habitude de partager la même patrouille.

Alors que Monk accompagne Natalie chez ses parents, leur conversation s'engage sur le voisin, Paul Buchanan. Il s'avère que Paul a grandi aux côtés de Natalie et qu'il nourrissait des sentiments pour elle, mais à ses yeux, Paul n'est qu'un sale type. Ses parents expliquent alors les circonstances de la mort du père et de la belle-mère de Buchanan. Aux questions posées par Monk au sujet du drame, Natalie soupçonne qu'un crime a eu lieu et que Paul Buchanan est, d'une manière ou d'une autre, impliqué dans ce crime. Elle invite alors Monk à enquêter.

Il est presque minuit et un musicien de rue s'apprête à rentrer chez lui. Malheureusement, ce n'était pas une nuit pour lui. Alors qu'il marche dans une allée plongée dans le noir, un inconnu surgit et le frappe violemment à la tête avec un démonte-pneu. Mais le tueur n'en a pas fini. Il commence à étouffer, empoisonner, poignarder, shooter puis écraser sa victime, la tuant de six manières différentes en une seule, avant de signer son crime par cette note : « Le Tueur aux Six Manières », et qui promet qu'il frappera encore dans 36 heures. Le gouvernement fédéral prend le contrôle des opérations et le préfet de police ordonne à Stottlemeyer, Disher et Monk de collaborer avec le policier en charge de l'enquête fédérale, l'agent Thorpe.

Un meurtre a eu lieu sur une plage naturiste : Monk est donc contraint de surmonter sa phobie de la nudité.

En suivant une carte au trésor apportée par Troy, le fils du docteur Kroger, Monk déterre un tas d'ennuis !

Monk est complètement déstabilisé par ce qu'il apprend sur Harold Krenshaw, son plus grand rival.

Sur la base de nouvelles preuves, un détenu est libéré après avoir passé plusieurs années en prison. Monk se sent coupable et l'aide à se réinsérer.

Une nuit d'insomnie, une simple balade nocturne mène Monk tout droit à un meurtre.

Monk est rejeté par son entourage après avoir tiré sur un homme déguisé en Père Noël. Il n'a que quelques jours pour blanchir sa réputation et déjouer un complot criminel avant Noël.

Dans le but de résoudre un crime, Monk rejoint une secte, mais tombe vite sous le charme du gourou...

Alors qu'un tueur en série s'attaque aux femmes qui portent le nom de la fille de Nathalie, Monk doit trouver le meurtrier au plus vite.

Un amateur d'art veut acheter toutes les peintures que fait Monk.

Monk poursuit l’assassin de sa femme dans le dernier épisode de la série.