Daniel Jackson objevuje adresu ztraceného města Antiků - Atlantidu. V SGC je připravena expedice, která má za úkol město prozkoumat, avšak energie vystačí pouze na cestu tam, takže se nemusí již vrátit zpět. Po příchodu naleznou město Atlantis, které je ale zcela opuštěné a pod hladinou moře. Energie města vystačí jen pár dní a až dojde, bude celé město zatopeno vodou...

Tým majora Shepparda se vrací zpět na Atlantidu - byl opět přepaden Wraithy. Je to již popáté, co byli napadeni a dr. Weirová se domnívá, že na Atlantis je špeh, který Wraithy informuje...

Tým majora Shepparda (Teyla, Ford, McKay a Sheppard) se vrací pod palbou. Wraithové po nich střílí stunnery (wraithská zbraň - paralyzátor). Po průchodu bránou dostane Rodney zásah. Je dočasně paralyzován a nemůže mluvit.

Když McKay, Zelenka a Ford kontrolují město po bouři, zaslechnou radiové volání o pomoc. V blízké chodbě narazí na mrtvého Wagnera a Johnsonovou. Ta brzy rovněž umírá. Vše nasvědčuje tomu, že se smrtelná nákaza rozšiřuje z poničené laboratoře...

Daedalus se vrací zpět na Atlantis společně se členy expedice. Dr. McKay ale zjistí, že systémy Daedala byly infikovány wraitským virem, který nastavil kurs loďi k těsnému průletu kolem slunce. Má tak zabít radiací posádku a Wraithové pak Daidala použijí k letu za svou potravou na nové planetě Zemi.

Výsadek při pátrání po poručíku Fordovi objeví štvance Ronona Dexe. Wraithové mu do zad voperovali zařízení, pomocí kterého jej sledují a pak jej pro zábavu loví. Za to, že mu doktor Beckett zařízení odstraní, Ronon slibuje, že chytí Forda...