À la fête, Kôko ne voit pas sa sœur. Choqués devant cette révélation, Tomoya et Nagisa cherchent à en savoir plus et continuent de plancher sur le mariage de Kôko.

Tomoya et Nagisa viennent dormir avec Fûko à l'école, alors que tout son entourage sauf eux deux semble l'avoir oubliée.

Nagisa demande à M. Kômura de lui servir de superviseur, mais il a déjà accepté d'être celui de la chorale. À cette occasion, une fille de la chorale cherchera à la dissuader de recourir à M. Kômura, à l'origine superviseur de la troupe de théâtre, ce qui rend Sunohara furieux.

Constatant les relations dégradées entre Tomoya et son père, Nagisa lui propose de venir habiter chez lui. Un tout nouveau quotidien s'offre à Tomoya, mais il n'ira pas sans son lot d'incertitudes.

Tout le club de théâtre prépare assidûment la pièce qui sera jouée pendant la fête du lycée. Tomoya en apprend plus sur le fameux jour d'hiver où la vie des Furukawa a basculé.

La fin de l'année approche, et avec elle la fin du lycée pour Tomoya et Nagisa ! Malheureusement pour eux, Nagisa tombe soudainement malade. Le verdict du médecin est sans appel, elle risque de devoir tripler, un résultat qui ne plaît pas à Tomoya, et le mot est faible...

Tomoya décide de prendre le taureau par les cornes et de demander à Akio la main de sa fille. Cependant, le père de Nagisa ne l'entend pas de cette oreille...