Jane e Maura si recano a L.A. per indagare su due casi di omicidio: una vittima di Los Angeles e una di Boston che hanno nomi e impronte digitali simili.

Una guardia giurata in un negozio di marijuana ferma una rapina ma viene ferita, tuttavia lui uccide uno dei ladri. La polizia ha molte domande sull'accaduto che però rimangono semza risposta. Rizzoli e Isle sono alla ricerca del complice dei rapitori, in seguito Rizzoli continua con i suoi sforzi di proteggere Isle e Angela.