Ace nella sua cella parla con Jinbe, un uomo-pesce membro della Flotta dei 7, il quale gli racconta di aver tentato di fermare la guerra tra la Marina e Barbabianca allo scopo di tutelare l'isola degli uomini-pesce, protetta proprio da quest'ultimo. Molti altri pirati prigionieri nello stesso livello, incluso Crocodile, vogliono invece Barbabianca morto, avendo egli distrutto i loro sogni di gloria. Intanto, al Livello 2, Rufy, Bagy e Mr. 3 fuggono inseguiti dalle bestie demoniache che infestano il posto ed incappano nella Sfinge. Mr. 3, con l'intenzione di fuggire verso il livello superiore assieme a Bagy, tenta di distrarre la Sfinge usando Rufy e delle repliche in cera di sé stesso come esche. Prima che i due detenuti riescano a fuggire, tuttavia, la Sfinge colpisce una delle repliche di cera e distrugge accidentalmente il pavimento facendo cadere sé stessa ed i suoi avversari fino al Livello 3.

Con la Sfinge assente, essendo essa caduta al piano inferiore, al Livello 2 scoppia una rivolta. Sengoku è indignato dall'irruzione di Rufy nella prigione, considerata da tutti inespugnabile non essendone sfuggito nessuno da quando venti anni prima era evaso Shiki. Rufy, Bagy e Mr. 3 si aggirano per il Livello 3, un deserto rovente nel quale i prigionieri non ricevono viveri, finché non vengono catturati, assieme alla Sfinge, da una rete di agalmatolite innescata da Saldeath, il comandante delle guardie. La Sfinge riesce a rompere la rete e, mentre Rufy si batte con le guardie, Bagy e Mr. 3 tentano, senza successo, di lasciare il livello. Intanto, Hancock si avvicina alla prigione di Ace mentre, al Livello 3, Mr. 2 canta allegramente all'interno della sua cella.

Mr. 3 e Bagy trovano la cella di Mr. 2 e, grazie ai poteri di Mr. 3, questi viene liberato. All'esterno della prigione, alcuni membri della Marina si offrono di aiutare Impel Down a superare l'emergenza, ma Sady-Chan, una guardia, non li fa entrare affermando che sarebbero solo d'impiccio e chiude ogni uscita della prigione rendendola completamente isolata dall'esterno. Il gruppo di Hancock arriva alla cella di Ace e la bellezza della donna causa un parapiglia fra gli altri detenuti che viene, però, sedato da Magellan con l'Idra; durante il trambusto, Hancock riesce a comunicare ad Ace che Rufy è nella prigione ed è intenzionato a salvarlo. Rufy viene attaccato da delle guardie e dalla Sfinge, ma, in suo aiuto, giunge Mr. 2 che mette fuori combattimento il mostro e si offre di accompagnare il ragazzo al Quinto livello di Impel Down in quanto anche lui desidera incontrare qualcuno lì.

Rufy e Mr. 2 attraversano il Livello 3 combattendo fino ad incontrare Minotauros, uno dei Quattro Guardiani Demoniaci, che Cappello di Paglia abbatte utilizzando il Jet Bazooka. Giunto sulla soglia del Livello 4, Mr. 2, dopo che Rufy ne nota l'intenso calore, afferma di prestare attenzione a non cadere nelle fiamme o nelle pozze di sangue bollente sottostanti. Intanto, Mr. 2 spiega di essere in cerca del leggendario transgender Iva, regnante di Kamabakka. Minotauros, che, nel frattempo, si è ripreso, insegue Bagy e Mr. 3 fino al luogo in cui si trovano Rufy e Mr. 2 dove viene sconfitto dalla forza combinata dei quattro. Intanto, Magellan ordina a tutti i suoi uomini di raggiungere il Livello 4 per uccidere Rufy.

Sconfitto Minotauros, il pavimento sotto i piedi di Rufy e compagni cede facendoli cadere al livello sottostante. Mentre Hancock lascia Impel Down, Momonga viene a sapere che Shanks il rosso si sta battendo con Kaido nel Nuovo Mondo per prevenire che questo attacchi Barbabianca. Nel frattempo, Magellan ordina a Sady-Chan ed ai restanti Guardiani Demoniaci di mettersi a guardia delle scale che conducono al Livello 5 mentre Hannyabal si occuperà di quelle che portano al Livello 3. Intanto, Rufy e gli altri atterrano al Livello 4, dove è detenuto tra gli altri anche Das Bornes alias Mr. 1, riuscendo ad evitare le pozze di sangue bollente. Cappello di Paglia e Mr. 2 attraversano il livello in cerca di cibo fino a quando non vengono intercettati da Magellan.

Rufy inizia a battersi con Magellan nonostante Von Clay lo esorti a fuggire e si rende conto di non essere in grado di attaccare per via del corpo velenoso del suo avversario e dei suoi attacchi a lungo raggio. Mr. 2 esita ad aiutare Cappello di Paglia perché è conscio che il solo tentare lo porterebbe alla morte. Mr. 3 e Bagy tentano di fuggire verso il livello superiore, ma, nonostante Hannyabal sia disposto a lasciarli passare per mettere nei guai il Direttore, i due non si fidano ed attaccano lui e le guardie. Intanto, Rufy decide di sacrificare le sue mani per sconfiggere Magellan e lo colpisce con il Jet Bazooka, rimanendo avvelenato.

Nonostante il contatto col veleno, Rufy non si arrende e continua a lottare disperatamente contro il Direttore Magellan che sembra invece non risentire degli attacchi del ragazzo. Nel frattempo, Mr. 2 continua la sua fuga in lacrime ed inizia a combattere con Hannyabal che ha appena sconfitto e catturato Mr. 3 e Bagy. Magellan mette definitivamente fuori combattimento Rufy avvelenandolo completamente.

Dopo averlo sconfitto, Magellan fa imprigionare Cappello di Paglia al Livello 5 fino a quando il veleno non lo ucciderà. Mr. 2, assunto l'aspetto di Hannyabal, decide di salvare Rufy per riparare al fatto di averlo abbandonato, ma viene a sapere che nemmeno l'antidoto può più salvarlo. Egli decide allora di cercare Emporio Ivankov, sovrano del Regno di Kamabakka, per curare Rufy, ma scopre che è misteriosamente scomparso dal Livello 5. Mr. 2 si reca sul posto assieme a Bagy e Mr. 3 che lo abbandonano non appena il gruppo viene attaccato dai lupi. Mentre Rufy, nonostante le sue condizioni, è ancora determinato a salvare Ace, Mr. 2 raggiunge il ragazzo ed afferma di volerlo salvare in nome della loro amicizia.

Mr. 2 si scusa con Rufy per averlo abbandonato e si mette alla ricerca di Ivankov. I due vengono attaccati dall'Unità Lupi che viene, però, respinta dall'Ambizione di Rufy prima di essere soccorsi da Inazuma. Mentre Bagy e Mr. 3 tentano di fuggire dal Livello 5, Saldeath ha finito di sopprimere la rivolta scoppiata al Livello 2, Sady-Chan cerca Mr. 2 al Livello 3, Magellan è chiuso in bagno in preda al mal di pancia ed Hannyabal è ancora legato nel magazzino. Intanto, Mr. 2 si risveglia al Livello 5.5, un luogo nascosto all'interno della prigione dove tutti i detenuti scomparsi hanno trovato rifugio, compreso Emporio Ivankov.

Emporio Ivankov dà dimostrazione dei suoi poteri fermando una palla di cannone lanciata da un pirata semplicemente sbattendo le palpebre e trasformando poi lo stesso pirata in una donna. Ivankov rivela a Von Clay di averlo salvato esclusivamente a seguito delle suppliche di Cappello di Paglia. L'ex-sovrano spiega inoltre che sta curando Rufy con i suoi poteri basati sugli ormoni e che il trattamento ha effetto solo su persone con un'eccezionale volontà di vivere. La cura, tuttavia, ha anche degli effetti collaterali. Oltre a richiedere più di due giorni, sprecando tempo prezioso in vista dell'esecuzione di Ace, ed essere estremamente dolorosa, essa accorcerà di dieci anni la vita di Rufy.

Ivankov spiega che, grazie al frutto Horu Horu, ha il potere di manipolare gli ormoni e che il luogo dove si trovano è situato tra il Livello 5 ed il 6 della prigione. Egli spiega, inoltre, che il Livello 6 è dove vengono detenuti gli individui che il Governo mondiale considera più pericolosi, tra cui anche l'ex-capo carceriere di Impel Down Shiryu. Mentre Mr. 2 continua ad incoraggiare Rufy nonostante le speranze che si salvi siano poche, le guardie si rendono conto della scomparsa del ragazzo e si preparano a trasportare Ace sul luogo dell'esecuzione. Eccezionalmente, dopo poco più di un giorno dall'inizio del trattamento, Rufy si riprende e si dichiara guarito.

Ivankov scopre che Cappello di Paglia è il figlio di Monkey D. Dragon, del quale era sottoposto nell'armata dei rivoluzionari prima di venire catturato, e decide pertanto di aiutare il ragazzo a salvare Ace. Dopo aver somministrato a Rufy un ormone per permettergli di ignorare la fatica per un giorno, Ivankov, assieme ad Inazuma ed allo stesso Rufy, si fa strada verso il Livello 6. Intanto, Bagy e Mr. 3 ritornano al Livello 4, Hannyabal dà disposizioni per la cattura degli evasi e Magellan si appresta a consegnare Ace ai marine che lo porteranno a Marineford.

Rufy, Ivankov ed Inazuma raggiungono il Livello 6, ma scoprono che Ace è già stato portato via. Il gruppo rimane vittima di una trappola di gas dalla quale riesce a fuggire grazie ai poteri di Inazuma. Intanto, Ace rimane turbato dall'apprendere che Rufy sta cercando di liberarlo. Mentre Cappello di Paglia dichiara di non volersi arrendere nonostante gli ostacoli che lo attendono, Crocodile dice al ragazzo di essere a conoscenza di un modo per fuggire dal livello.

Rufy è riluttante all'idea di liberare Crocodile, ma Ivankov si offre di tenerlo a bada ricattandolo con qualcosa che lui sa sul suo conto. Dopo che Jinbe si è unito al gruppo, volendo egli fermare la guerra tra Barbabianca e la Marina, i cinque fuggono dal livello. Gli evasi si uniscono a Mr. 2 assieme al quale attraversano, combattendo, il Livello 4 dove Crocodile libera Mr. 1. Intanto, mentre Hannyabal si reca a combattere con i prigionieri, Ace viene condotto al Cancello della Giustizia e Bagy e Mr. 3 raggiungono il Livello 2.

Mentre Rufy ed i suoi compagni continuano a combattere al Livello 4, Bagy e Mr. 3 raggiungono il Livello 2 dove rilasciano i prigionieri nel tentativo di causare confusione e coprire la loro fuga. Intanto, Barbanera arriva alla prigione ed assale le guardie che lo accolgono. Mentre si sta dirigendo al Livello 4, Hannyabal viene aggiornato sulla situazione all'entrata ed al Livello 2 e, non sapendo come affrontare la cosa, si dispera finché Magellan non lo informa di aver già sedato la rivolta al Livello 2 e di voler liberare Shiryu per fargli affrontare Barbanera. Intanto, al Livello 6, Shiryu uccide le guardie che lo hanno liberato.

I Guardiani Demoniaci riescono a sconfiggere numerosi prigionieri, ma Rufy, Jinbe e Crocodile li abbattono con un solo colpo. Mentre, al Livello 2, Bagy e Mr. 3 vengono intrappolati dal veleno di Magellan, al Livello 1, Shiryu incontra Barbanera e, dopo avergli parlato, lo lascia procedere indisturbato. Intanto, Hannyabal riceve l'ordine di fermare i prigionieri finché Magellan non avrà raggiunto il Livello 4. Sady-Chan attacca i prigionieri, ma Ivankov, dopo aver cambiato sesso, ingaggia la donna in duello consentendo a Rufy di proseguire. Rufy si imbatte, dunque, in Hannyabal che è pronto ad affrontarlo.

Hannyabal si batte con Rufy, ma viene subito atterrato dal Gear Second. Intanto, mentre Barbanera usa i suoi poteri per rimuovere la barriera di veleno al Livello 2, liberando Bagy ed i suoi uomini, Magellan arriva al Livello 4. Hannyabal, nonostante le ferite riportate, si rialza determinato a sconfiggere Rufy, tuttavia, Barbanera, giunto sul posto, lo abbatte con un attacco a sorpresa. Quest'ultimo spiega a Cappello di Paglia di aver avuto intenzione di catturarlo per entrare a far parte della Flotta dei 7, ma che la cattura di Ace gli ha già garantito tale posizione. Rufy, adirato da queste parole, colpisce Barbanera con il Jet Pistol.

Dopo che Rufy e Barbanera si sono colpiti a vicenda, Jinbe convince Cappello di Paglia a proseguire e non sprecare tempo con Teach. Crocodile chiede a Barbanera il motivo per cui ha attaccato Impel Down rischiando di compromettere il suo posto come membro della Flotta dei 7, ma questi gli risponde che fa tutto parte di un piano più grande. Intanto, mentre Magellan si avvicina ai fuggitivi, Ivankov sconfigge e lega Sady-Chan, Rufy abbatte Minotauros e Bagy e Mr. 3 raggiungono il Livello 1. Nel frattempo Magellan, dopo aver avvelenato Barbanera e la sua ciurma, procede alla volta di Rufy e dei suoi compagni.

Mentre Rufy ed i suoi compagni attraversano il Livello 3, Magellan li raggiunge. Ivankov ed Inazuma rimangono indietro nel tentativo di fermare il direttore, ma vengono entrambi sconfitti. Nel frattempo Rufy e Jinbe pianificano il furto di una nave della Marina per raggiungere Marineford. Al Livello 1, Rufy ed il suo gruppo si riuniscono con gli altri fuggitivi e respingono nuovamente gli attacchi delle Guardie Demoniache, tuttavia Magellan li raggiunge nuovamente.

Magellan raggiunge gli evasi che si dividono in due gruppi. Crocodile, Jinbe, Mr. 1 e Bagy proseguono verso l'esterno nel tentativo di rubare una nave mentre Mr. 3 supporta Rufy nel combattimento col Direttore, essendo la sua cera in grado di proteggere Cappello di Paglia dal veleno del loro avversario. Raggiunto l'esterno della prigione, il gruppo di Bagy si rende conto che Magellan ha ordinato a tutte le navi di allontanarsi rendendone impossibile il furto. Jinbe, tuttavia, trasporta Crocodile, Mr. 1 e Bagy su una delle navi a nuoto.

Mentre Jinbe, Crocodile, Mr. 1 e Bagy riescono ad impossessarsi di una nave della Marina, Magellan sfodera la sua tecnica più potente, il Venom Demon, che costringe i suoi avversari alla ritirata. Mr. 2 e gli altri detenuti vengono raggiunti all'entrata principale da Rufy e Mr. 3 prima e da Ivankov ed Inazuma poi. Anche Magellan arriva sul posto e, poco dopo, Jinbe, mediante il lumacofono, dice a tutti di gettarsi in mare. Ivankov, con un potente Hell Wink, riesce a far abbandonare a tutti la prigione lasciando il solo Magellan all'entrata principale. In quel momento, una flotta di squali balena, comandati da Jinbe, salva tutti impedendo loro di cadere in mare.

Rufy e gli altri iniziano la fuga con la nave della Marina rubata, ma vengono inseguiti dal resto della flotta e si trovano dinanzi il Cancello della Giustizia chiusa. Improvvisamente, questo si apre e Jinbe confida a Rufy che Mr. 2 è rimasto ad Impel Down proprio per aprire il cancello. Von Clay viene scoperto, ma riesce, comunque, a far chiudere il cancello dietro ai fuggitivi. Poco prima che il collegamento con gli evasi venga interrotto, l'ex-agente della Baroque Works riceve i più sentiti ringraziamenti da tutti e dice a Rufy di confidare che riuscirà a liberare il fratello.

Shiryu salva Barbanera e la sua ciurma dando loro l'antidoto per il veleno di Magellan e si unisce ad essi. Gli evasi sulla nave festeggiano la loro fuga, ma alcuni rimangono contrariati nell'apprendere che la loro meta è il Quartier Generale della Marina. Gli ex-prigionieri, impressionati dal passato di Bagy sulla nave di Gol D. Roger, vengono convinti dal clown a seguirlo al Quartier Generale nella speranza di sconfiggere Barbabianca e regnare al suo posto. Intanto, la nave che trasporta Ace raggiunge il Quartier Generale della Marina.

Mentre la nave di Rufy è in rotta verso il Quartier Generale della Marina, Nami si sta dirigendo verso l'arcipelago Sabaody su Weatheria, l'isola galleggiante, dove riceve una dimostrazione dei poteri meteorologici del suo anziano compagno di viaggio. Nel frattempo, sull'isola Karakuri, Franky è ancora sotto l'effetto del tè. Quando il cyborg viene attaccato da alcuni animali suoi simili, il tè comincia a bollire, ristabilendo la sua normale personalità. Venuto a sapere che sull'isola abita il dr. Vegapunk e che questi ha modificato Orso e costruito i Pacifisti, Franky si dirige a casa sua.

Mentre cerca di sfuggire ai travestiti sull'isola Momoiro, Sanji incontra Caroline, la "regina" che sostituisce Ivankov. Il cuoco sfida Caroline a duello per cercare di lasciare l'isola ma perde e viene costretto a vestirsi da donna. Nel frattempo, nel Regno Torino, Chopper si sta prendendo cura di un pulcino ferito, nella speranza che, una volta guarito, possa riportarlo all'arcipelago Sabaody in volo. Gli umani dell'isola tentano di catturare Chopper ed il pulcino ma la madre di quest'ultimo li salva. La renna ringrazia la loro salvatrice ma, in quel momento, si rende conto di non avere idea di quando il pulcino potrà volare.

Robin è tenuta prigioniera in una torre a Tequila Wolf dove viene interrogata. Soran, dopo essersi incontrata con la donna che ha tradito Robin, decide di andare a parlare con la ragazza. Robin si trova nella cella accanto al capo dei rivoluzionari che, quando viene liberato dai suoi sottoposti, fa liberare anche lei. Nel frattempo, a Greenstone, Usop subisce continui attacchi dalle piante e dagli animali dell'isola ed Heracles gli consiglia di mangiare per diventare più forte. Mentre cerca di seguire il consiglio, Usop rischia di venire mangiato a sua volta.

A Kuraigana, Perona ha intenzione di sfruttare Zoro per ritornare a Thriller Bark, ma questo si allontana dal castello nel tentativo di ritrovare i suoi compagni. Dopo che la ragazza ha raggiunto lo spadaccino, i due si imbattono in una lapide gigante e vengono attaccati da diverse figure indistinte. Intanto, a Namakura, Brook, in debito con i locali per averlo sfamato ed avergli mostrato le loro mutande, decide di aiutarli a difendersi dalla tribù Braccia-Lunghe. Nel frattempo, la nave di Rufy è quasi giunta a Marineford.