Edward și Alphonse cunosc un așa-zis lider religios care poate face minuni, crezând că acesta poartă cu el piatra filozofală.

Edward și Alphonse nu sunt hotărâți dacă să dezvăluie adevărul din spatele minunilor lui Cornello și să distrugă astfel viețile celor care locuiesc în oraș.

Tinerii Ed și Al vor să-și învie mama decedată, care le-a fost sprijin de nădejde în vremurile tulburi ale războiului.

Încercând să găsească o persoană importantă din copilăria lor, Ed și Al nimeresc într-un oraș bântuit de fantoma unei femei.

Ed și Al se urcă într-un tren spre Central City și se văd brusc nevoiți să apere de teroriști pasagerii, printre care se numără și gen. Hakuro.

Odată ajunși în Central City, Ed și Al se mută în casa imensă a lui Shou Tucker, alchimistul coaserii vieții, și încep să se pregătească pentru examenul de alchimie.

Din noua poziție de alchimist de stat, Ed privește mai îndeaproape experimentele lui Tucker cu himere și își dă seama că e ceva necurat la mijloc.

Deziluzionat, Ed se retrage din rangul de alchimist de stat. Proaspăt sosită în oraș, Winry ar putea fi următoarea victimă a criminalului în serie.

Ed și Al merg să inspecteze o colonie minieră mică și descoperă că locuitorii acesteia sunt impozitați din greu de un tiran și de alchimistul acestuia.

Cât încearcă să-l evite pe Mustang, Ed și Al ajung într-un orășel și sunt atrași în căutarea unei variante feminine a lui Robin Hood.

Ed și Al merg la Xenotime în speranța că vor găsi acolo piatra filosofală, însă dau doar de doi băieți care creează o apă roșie ciudată.

Ed și Al descoperă o conspirație care are legătură cu tatăl fraților Tringham, descoperitorul apei roșii, și cu boala care a lovit orașul Xenotime.

Ed îi dă raportul lui Mustang în East City, însă discuția despre doctorul Marcoh și piatra filozofală dă naștere unui duel între cei doi.

Invidia metamorfă se deghizează în Cornello. Ed și Al îl găsesc pe Marcoh și află despre rolul pietrei în revolta din Ishbal.

În timp ce alchimistul Braț-Puternic îi apără de haosul din jur, Marcoh le dezvăluie fraților Elric atrocitățile comise în timpul masacrului din Ishbal.

Marcoh este în fața unei confruntări mortale cu Desfrânare, iar Armstrong și frații Elric pleacă la Resembool. Ed se înfurie după ce îl pierd pe Al pe drum.

În timp ce se odihnește și este reparat la Resembool, Ed vizitează mormântul mamei sale, iar Al își mărturisește îngrijorarea privind pierderea memoriei.

Ed și Al sunt forțați să caute o altă sursă pentru cartea lui Marcoh după ce Desfrânare, Lăcomie și Cicatrice ard din temelii filiala centrală a Bibliotecii.

Ed și Al sunt îngroziți când descoperă ingredientul-cheie folosit la fabricarea Pietrei Filosofale, dar merg înainte cu explorarea unui laborator abandonat.

O serie de defecte la armură îi împiedică pe Ed și Al în confruntarea lor cu niște suflete torturate legate de armuri goale.

Barry declanșează o serie de explozii care îi eliberează involuntar pe Avariția și ceilalți prizonieri. Tucker revine din morți și îmbracă o formă nouă și surprinzătoare.

În vreme ce Invidia, sub forma lui Basque Grand, adună ingredientele umane pentru a alcătui Piatra, Maes Hughes pleacă să-i salveze pe frații Elric din Laboratorul 5.

Refuzul lui Edward de a vorbi o supără pe Winry, iar Alphonse decide să-l înfrunte pe Edward cu întrebările sale despre sufletele artificiale.

Alphonse fuge și dă nas în nas cu Cicatrice, care se ascunde printre refugiații din Ishbal, hărțuiți de mercenari.

Când Ed și Al o iau pe Winry pentru a porni pe urmele lui Cicatrice și a afla mai multe despre Piatră, descoperă o legătură între Laboratorul 5 și războiul din Ishbal.

Ed, Al și Winry ajung în Rush Valley pentru a recupera proteza metalică. Mustang crede că un ofițer de rang înalt trebuie să fie responsabil de moartea lui Hughes.

Edward și Alphonse se tem de moarte când ajung față în față cu Izumi Curtis, fostul lor profesor, care îi aduce înapoi în Dublith.

Pentru a le da o lecție de viață și a le oferi timp de reflecție, Izumi îi lasă pe Ed și pe Al pe insula Yock, locul unde i-a găsit când a început totul.

Edward și Alphonse descoperă că băiatul de pe insula Yock este atât homunculus, cât și alchimist, fiind în stare să-și transforme corpul.

Armata îl ia prizonier pe băiatul misterios de pe insula Yock și îl încarcerează la Centrul de Comandă din Sud. Yoki îl zărește pe Cicatrice într-un grup de ishbalani.

Invidia se deghizează în Bradley și-i smulge lui Izumi copilul homunculus. Băiatul își amintește propriul trecut după ce mănâncă bucăți de piatră.

Izumi apare pe când Ed și Al se luptă cu Mânia, un nou homunculus care vrea restul corpului lui Edward pentru a deveni uman.

Martel preia armura lui Al și îl aduce la cartierul general al lui Avariție, de unde numai Izumi și Edward îl mai pot salva.

Lt. col. Archer îi are în arest pe Ed, Izumi și Sig. El îl repune în funcția de alchimist de stat pe Shou Tucker și le ordonă oamenilor săi să-l vâneze pe Avariție.

Edward și Alphonse merg la tabăra din Ishbal cu Winry. Desfrânarea e la un restaurant când un bărbat din trecutul ei intră în încăpere.

Ed și Alphonse speră să afle mai multe despre Piatra Filosofală ajutând un grup de refugiați din Ishbal care sunt duși în sud.

În timp ce îl anchetează pe Mustang, lt. Havoc îi ordonă aghiotantului său, Falman, să-i găsească o iubită. Mai târziu, Mustang trebuie să investigheze Depozitul 13.

Ed, Al și Winry se despart după o ceartă. Al se întâlnește întâmplător cu o figură familiară, iar Winry decide să investigheze împreună cu Sheska uciderea lui Hughes.

Kimblee este numit alchimist de stat și pleacă cu trupele în Liore, unde Cicatrice scobește pământul cu o piatră mare.

După ce Desfrânare și Lăcomie aterizează în mijlocul confruntării dintre Edward și Cicatrice în Liore, cel de-al șaptelea și ultimul homunculus este dezvăluit.

Ajutat de Sfânta Mamă Rose, Cicatrice le spune locuitorilor din Liore să nu provoace violență atunci când vor ademeni armata să intre în oraș.

Ed este ocupat să-i ajute pe oamenii din Liore, așa că numai Cicatrice îl poate ajuta pe Alphonse când armura sa începe să se transforme într-un compus explozibil.

Când frații Elric fug din Liore, Winry întâlnește în Resembool un necunoscut care îi este mai târziu prezentat ca fiind tatăl lui Al și al lui Ed.

Tatăl fraților Elric, Hohenheim Luminosul, pornește să-l înfrunte pe liderul homunculușilor, iar Lyra și Rose găsesc o scară secretă într-o biserică veche.

În timp ce Van Hohenheim Luminosul se luptă cu Dante, liderul homunculușilor, iese la iveală o poveste complexă și încâlcită.

Separați unul de altul, frații sunt în pericol. Ed revine acasă la Dante pentru a căuta indicii. Al se întâlnește cu dezaxatul Shou Tucker.

Mânia crede că Lenea e mama lui adevărată. Lenea se luptă cu Shou Tucker. Ed își dă seama că Al a fost păcălit de Tucker.

Armstrong declanșează o revoltă contra Comandantului Suprem la granița nordică, în timp ce Ed și Izumi luptă contra homunculușilor rămași în Central.

King Bradley vine acasă pentru a-i face un cadou aniversar fiului său. Edward se întâlnește cu Russell într-o biserică părăsită. Maria și Denny vin în ajutorul lui Izumi.

Edward Elric este tras prin Poartă și ajunge în Primul Război Mondial. Roy Mustang își confruntă dușmanul, homunculusul Mândria.

Edward Elric își dă seama că trebuie să facă sacrificiul suprem pentru a-și salva fratele, al cărui suflet e la poartă. Hawkeye reușește să scape de cei care au răpit-o.