Ayant tenu sa part du marché, Ryuko demande des réponses à son professeur principal, Aikuro Mikisugi, et apprend le secret du pouvoir de Senketsu et des uniformes Goku.

La bataille de Ryuko contre les Elite Four prend son envol ! Pendant ce temps, plus de spectateurs convergent vers Honnouji Academy. Mais qui est la mystérieuse fille qui se promène dans la ville et quels secrets détient-elle ?

La fureur de Ryuko continue, et grâce à Ragyo et Nui, elle a un nouvel allié inattendu. Avec Satsuki comme cible, les Elite Four et Nudist Beach pourront-ils résister à l'assaut ?

C'est la remise des diplômes à l'Académie Honnouji, mais tout n'est pas comme on le croit. Ryuko Matoi et la bande doivent vaincre leur dernier ennemi.