Во время одного из опасных заданий полковник НАТО Ив Бэрд встречает любопытного персонажа — Флинна, Библиотекаря, который носится по странным местам и решает загадки, получая таким образом магические артефакты. После того, как начальник Ив читает в ее отчете о загадочном библиотекаре, он отправляет ее в отпуск. Но долго грустить Ив не приходится – на пороге дома она находит странное письмо о приглашении в Городскую Публичную Библиотеку. Придя туда, полковник Бэрд узнает, что ее избрали хранителем, и теперь она должна защищать Флинна, а также претендентов на должность библиотекарей – Эзекиля, Кассандру и Джейка.

Флинн получает волшебную рану от Экскалибура, и ему остается около суток для того, чтобы вернуть Библиотеку. А это не так легко сделать, особенно учитывая то, что ребята оказались посреди неизвестного леса. Но удача улыбается им, по дороге их встречает Дженкинс и отвозит всех в свой флигель, являющийся мини-версией основной Библиотеки. Флинн, Ив, Джейк и Эзекиль отправляются на поиски камня, из которого извлекли Экскалибур. А в это время Кассандра, узнав получше Ламию и Дюлака, начинает сомневаться в правильности своего решения.

Пока Флинн странствует в поисках Библиотеки, Ив пытается тренировать новоиспеченных библиотекарей, и результаты ее совсем не впечатляют. Но Эзекиль, Джейк и Кассандра мечтают поскорее отправиться на настоящее задание, и вскоре им предоставляется такая возможность. В разных концах страны таинственным образом исчезают молодые люди, и единственное, что связывает жертв – корпорация Голден Экс Фудз. Придя в главное здание компании на разведку, библиотекари и Ив понимают, что это место является настоящим Лабиринтом Минотавра, и сами попадают в ловушку злодеев.

Все, кроме полковника Бэрд, охвачены праздничным настроением и готовятся к Рождеству, но внезапно Дженкинсу поступает тревожный звонок от жены Санта-Клауса. Оказывается, что Рождество отменяется из-за того, что Санту похитили. В ходе расследования библиотекари выясняют, что в похищении виновато Змеиное Братство. Дюлак собирается убить Санту ровно в полночь, чтобы высвободить накопленную за год волшебную энергию и завладеть ею.

По всей планете проходит волна землетрясений, причиной которых являются проснувшиеся драконы. Флинн возвращается к своим подопечным, чтобы встретиться с адвокатом Восточных драконов Дрейком и уладить все проблемы. Но из-за глупой ошибки представителем Библиотеки становится Эзекиль. Поэтому он остается улаживать дипломатические вопросы, а Флинн и команда отправляются искать пропавшую волшебную жемчужину Фей Ланг.

В маленьком американском городке Бремене начинают случаться странные вещи: складывается ощущение, будто по какой-то причине в городе оживают сказки. Библиотекари находят там тролля под мостом, а на улице встречают разгуливающего в чем мать родила мэра и волка в рюшевом чепчике. После изучения волка Дженкинс приходит к выводу, что всему виной Либрус Фабула, древняя книга сказок. Она оживляет волшебные истории, но с ужасающими последствиями. Библиотекарям предстоит спасти город и его жителей от страшной гибели.

На Чикагской научной выставке СТЭМ случается волшебный апокалипсис, и Дженкинс посылает свою команду разобраться с этой проблемой. Библиотекари притворяются судьями конкурса, чтобы обнаружить эпицентр магической вспышки. Вскоре круг подозреваемых сужается до нескольких человек, но команда еще не знает, что на самом деле за всем происходящим стоит фея Моргана.

Команда попадает в блуждающий дом ужасов, перемещающийся по всему свету в поисках жертв. Последними пострадавшими были друзья девушки Кейти, которую Ив и библиотекари встретили в лесу. Кассандра чувствует себя слабым звеном из-за того, что Ив поручает ей присматривать за Кейти, в то время как Эзекиль и Джейк будут помогать Ив искать маньяка.

Независимый журналист Виктор Финч пропал без вести в окрестностях Коллинс Фолс, куда приехал в поисках НЛО. Расследуя исчезновение Финча, библиотекари начинают подозревать, что с самим городом что-то не так. Джейк и Кассандра знакомятся с городским архивариусом Мейбл Коллинс, чтобы побольше узнать об истории этого поселения. А в это время Эзекиль и Ив исследуют место происшествия, но внезапно... пропадает сама полковник Бэрд!

Флинн приходит к команде с хорошими новостями: он наконец-то нашел способ вернуть Библиотеку. Если соединить эффект от всех добытых магических артефактов, то получится найти дрейфующую меж измерений Библиотеку и связать ее с пристройкой Дженкинса. Благодаря магии артефактов Флинн и Ив оказываются перед прялкой судьбы, но Дюлаку удается добраться до нее первым. Он рассекает ткань истории, изменяя таким образом реальность. Ив начинает путешествовать среди параллельных вселенных, встречая разные версии Библиотекарей. Но как ей вернуться в свою вселенную?

Библиотекари сталкиваются с крайне необычным явлением: всем известные литературные персонажи внезапно материализуются в нашем мире после открытия лей-линий. Что они задумали и стоит ли ждать беды — на эти и многие другие вопросы предстоит ответить Флинну, Ив, Эзекилю, Джейку, Дженкинсу и Кассандре.

Новой целью Просперо становится возвращение волшебного посоха. Библиотекари пытаются предугадать следующие стратегические шаги злого волшебника и застать его врасплох. Пока остальные ищут информацию, Ив и Флинн отправляются в бывшее имение Джона Ди, чтобы забрать обломки посоха.

Книга вырезок сообщает Библиотекарям о гигантском разломе в земле, случившемся в штате Оклахома при прокладывании труб. Приехав на место происшествия, Джейк, Эзекиль и Кассандра обнаруживают, что руководит работами никто иной как Стоун-старший, отец Джейка. Ребята узнают о том, что в этих землях завёлся хитрый оборотень, который подпитывается от лжи и хаоса, которые сам создаёт, принимая обличье разных людей.

В колледже Уэкслера в Массачусетсе периодически пропадают студенты и преподаватели. Это неудивительно, ведь Джозайя Уэкслер основал свой гуманитарный университет в 1813 году, чтобы собирать там волшебные артефакты и исследовать природу магии. Кассандра, Джейк, Ив и Эзекиль отправляются в кампус, чтобы раскрыть тайны этого необычного колледжа.

Команда Библиотекарей и Ив охотятся за пропавшим Оком Заратустры и внезапно встречают Флинна. Счастливое воссоединение омрачается звуками флейт Пана, из-за которых все засыпают и попадают в очередную передрягу. Некто Рэй Гласный похищает мистера Карсена и Око Заратустры. Но каковы его намерения? Это предстоит выяснить Дженкинсу и его команде.

Ив приезжает в Нью-Гэмпшир, чтобы помочь своему бывшему боевому товарищу Сэму Деннингу в борьбе за пост мэра города. После исчезновения его помощницы Брэнди Варгас шансы Сэма на победу значительно уменьшились. Когда Книга вырезок присылает троих Библиотекарей на поиски пропавшей, Ив понимает, что в деле замешана магия.

Библиотекари становятся свидетелями цепочки странных событий в Лондоне. Пострадавшие в происшествиях люди становятся жертвами грехов и проступков, которые не совершали. Джейк думает, что ответ на эту загадку надо искать в местном ночном клубе для «избранных».

Кассандра, Ив, Эзекиль и Джейк переносятся в сверхсекретную военную лабораторию, чтобы забрать у ДАРПА тауматит из самой Атлантиды, но в итоге оказываются во временной петле. Тем временем Дженкинс призывает волшебного духа, чтобы узнать о планах Просперо.

Флинн возвращается в Библиотеку и обнаруживает, что Дженкинс совершенно не помнит о Джейке, Ив, Эзекиле и Кассандре. Внезапная амнезия оказывается результатом очередного злодейства Просперо, который создал город-иллюзию, куда отправил забывших обо всем библиотекарей и хранителя.

Внезапно во всем мире прекращает работать электроника и пропадает интернет, что побуждает Флинна начать немедленно действовать, пока из-за козней Просперо не наступил настоящий хаос. Карсен и полковник Бэрд отправляются в прошлое, чтобы встретиться с создателем Просперо — самим Шекспиром.

Книга вырезок взрывается, не выдержав огромного наплыва грядущих сверхъестественных происшествий. Новым испытанием для команды становится дело об оживших экспонатах в Бостонском музее науки. После расследования библиотекари понимают, что им противостоит египетский бог Апоп.

Флинн и Ив полагают, что Шарлин находится в плену у радикальной испанской группировки, однако когда они наконец ее находят, оказывается, что Шарлин смогла подчинить себе адептов культа с помощью артефакта. Когда библиотекари наконец решают вернуться к остальным, то обнаруживают, что Шарлин вновь пропала, и, судя по всему, ее похитил Апоп. Библиотекари отправляются по следам и попадают в комплекс, где располагается коллайдер.

Кассандра и Джейк отправляются в заснеженную Швецию за волшебным Ангрободским кристаллом и случайно попадают на встречу древних сверхъестественных существ, сами того не подозревая. А в это время Эзекиль пытается доказать Дженкинсу и Ив, что на него можно положиться.

Ив привыкла к мысли о том, что ей нужно защищать Библиотеку и библиотекарей, но кто же защитит Хранителя? Кассандре, Эзекилю и Джейку предстоит спасти полковника Бэрд от преследующего ее Жнеца и страшной судьбы.

Дженкинс получает странное видео от библиотекарей, которые поехали в Айову, чтобы посмотреть на возникающий из ниоткуда карнавал, на котором пропадают люди. Дженкинс находит своих подопечных в весьма странном виде и обстановке. Смогут ли библиотекари избавиться от чар и спасти всех похищенных людей от злобного волшебника?

Флинн возвращается к команде и сразу попадает под шквал критики от своих коллег. Главный библиотекарь советует своим приятелям поменьше думать о задетых чувствах и сосредоточиться на поиске Глаза Ра. Совместными усилиями библиотекари вычисляют, что артефакт давным-давно затерялся в Бермудском треугольнике, куда они и отправляются.

Книга вырезок отправляет Ив, Джейка, Кассандру и Эзекиля заниматься загадочным культом, почитающим некую Синди. Библиотекари подозревают, что Синди стала обладательницей сильнейшего нового артефакта, и теперь им предстоит понять, что же привлекает к девушке толпы почитателей?

Книга вырезок сообщает о случае спонтанного самовозгорания гольфиста из Чарльстона. В ходе расследования библиотекари выясняют, что мужчина перед этим прошел курс лечения в особом спа-санатории, которым, как потом выясняется, управляют вампиры.

Наставник Джейкоба, обучавший его боевым искусствам, становится жертвой магии Стерлинга Лама, который решает захватит себе посох Шангри-Ла и весь город. Джейку удается сбежать от наемников Лама, и теперь ему с друзьями предстоит придумать, как спасти затерянный город Шангри-Ла и стать повелителем волшебного посоха.

Ив рассказывает своим подопечным о разговоре с ДОСА и сообщает, что департамент напал на след потерянного артефакта, за которым теперь отправляются Кассандра, Джейк и Эзекиль. Но прибыв на место, библиотекари понимают, что это был лишь отвлекающий маневр, и пока они отсутствовали в Библиотеке, ДОСА уже успели ее захватить.

Репетиция торжественного ритуала прерывается сигналом бедствия, сообщающем о раскрытии местонахождения одного из камней старой Александрийской библиотеки. Узнав от Дженкинса о масштабах катастрофы, способной произойти, когда остальные камни будут найдены и попадут не в те руки, друзья заручаются помощью давней знакомой Флинна. Стараниями Дженкинса до этого момента она считалась погибшей. Между тем Стоун, Эзекиль и Кассандра раскрывают личности похитителей артефактов, а те, в свою очередь, разрабатывают план получения желаемого с помощью незадачливых библиотекарей.

Когда невероятная череда неудач доводит сразу нескольких человек, в том числе и приятеля Стоуна, до больницы, команда подозревает, что здесь не обошлось без магии. Они отправляются в связывающее всех жертв невезения место — игровой комплекс, состоящий из казино и ипподрома для скачек. Проследив за посетителями, Ив с Джейком вычисляют причину происходящих с людьми изменений — она явно связана с владельцем заведения и его очаровательной подругой, хранящей многовековую тайну.

Оставив Стоуна, Киллиан и Джонса присматривать за санями Санта-Клауса, Дженкинс, Флинн и Ив отправляются на рождественские каникулы, не подозревая, в какие приключения вскоре ввяжутся их друзья. Невинное желание Эзекиля доказать матери, что он совсем не неудачник, оборачивается большими проблемами, когда женщина, представительница клана воров, узнает о библиотеке. Незадачливому юноше и его коллегам придется потрудиться, чтобы вернуть на место все украденные миссис Джонс вещи, в процессе чего им предстоит познакомится с честолюбивым братом Санты, мечтающим лишить родственника магической силы.

Согласившись пойти с Ив на ретроспективу черно-белого детективного фильма, Флинн не подозревает, что вскоре они с Бэрд окажутся на месте главных героев внутри кинокартины. Вскоре остальные члены команды, потерявшие своих товарищей, узнают о произошедшем, однако попытки Стоуна, Кассандры и Эзекиля помочь коллегам, оборачиваются новыми неприятностями. Закон пребывания в кинофильме гласит — пройди все повествование до конца и освободишься. Но все ли так просто в случае с незадачливыми библиотекарями?

Пытаясь разобраться в причине внезапного старения жителей одного из городков, друзья встречаются с библиотекарем из прошлого и кумиром Флинна Дэррингтоном Дэйром. Последний прибыл в настоящее, чтобы сразиться со своим заклятым врагом, имеющим непосредственное отношение к происходящему. Карсен исполняет давнюю мечту, объединившись с Дэйром в расследовании этого дела. Дэррингтон спешит предупредить мужчину о грозящей библиотеке опасности, предотвратить которую сможет только Флинн.

Не сообщив остальным о своих планах, Ив отправляется по следам сбежавшей Нун, надеясь убедить ее восстановить потерянную связь с библиотекой. Поначалу напряженная встреча хранителей вскоре оборачивается вынужденным союзом ради завершения миссии Николь по защите крайне важного артефакта от русских бандитов. Но сможет ли Бэрд уговорить девушку пересмотреть свое решение и вернуться к бывшей должности? Тем временем Флинн с Дженкинсом отслеживают перемещение коллеги. Присоединившись к операции, они раскрывают коварный замысел, казалось бы, давно почившего русского целителя.

Уход Флинна заставляет остальных библиотекарей всерьез задуматься о словах их предшественника. Ив же решает развеять мрачные мысли друзей, предложив отправиться на новое задание и по совместительству в лагерь тимбилдинга. Бэрд надеется сплотить коллег, а заодно и выяснить, какая именно аномалия там творится. Вскоре после приезда в кэмпинг Эзекиль и остальные начинают замечать загадочные исчезновения членов других команд. Когда в числе пропавших оказывается один из библиотекарей, дело принимает серьезный оборот.

Не в состоянии забыть о своем провале в Эквадоре, Кассандра решает проверить, действительно ли ей предназначено быть библиотекарем. Взяв небольшой отпуск, женщина отправляется в кажущийся идеальным городок штата Огайо. Однако то, что остальные принимают за данность, вскоре начинает вызывать у нее подозрения с подачи недавно переехавшего в это место юного Фредди. Предчувствие мальчика оказывается не напрасным, когда выясняется, что местность защищается плененным магическим существом, за годы заточения накопившем достаточно гнева, чтобы стереть поселение с лица земли.

С уходом Флинна оставшиеся охотники за артефактами задают себе непростые вопросы. Кто из них свяжет силу с хранителем и сколько библиотекарей вообще нужно в библиотеке? Пытаясь отложить решение на потом, Ив, Эзекиль и Стоун отправляются в неприметный городок, где были замечены призраки братьев-солдатов, много лет назад вставших по разные стороны в войне Севера и Юга. Кассандра же, оставшись с Дженкинсом, признается ему в страхе потерять свою должность. Она заручается помощью старика в поиске информации о первых двух библиотекарях, чья вражда послужила поводом для выбора лишь одного служителя на все последующие века.

Дженкинс обнаруживает себя в теле предприимчивого молодого мужчины по имени Джефф. Оказывается, он не только одержим библиотекарями, но и нашел способ поменяться с одним из них телами. В чужом обличье старик ищет возможность вернуть все на круги своя, для чего ему приходится заручиться поддержкой друзей Джеффа, совсем не возражающих против такого рода приключений. Тем временем изменившееся до неузнаваемости поведение Дженкинса начинает вызывать подозрения у Кассандры и остальных. Выведя обманщика на чистую воду, библиотекари понимают: его поступок — это еще не самое страшное, что ждет их впереди.

Так и не связав себя с кем-либо из коллег, Ив навлекает на своих товарищей гнев библиотеки. Кассандра же, прочитав запретный свиток, невольно провоцирует хранилище артефактов на организацию ужасного испытания между библиотекарями — смертельного состязания за право быть связанным с хранителем. Каждого из троицы ожидает встреча с потаенными страхами, а также сражение друг с другом. Однако главный кошмар ждет Бэрд, когда ей открывается, кто в действительности виновен во всех случившихся за последнее время событиях.

Попав в реальность без знаний, Ив получает послание от Флинна. Она начинает поиски остальной троицы библиотекарей, отчаянно пытаясь сохранить те крохи воспоминаний о прошлом, что у нее остались. Стоуна и Кассандру не приходится долго искать, а вот попытка добраться до Эзекиля оборачивается для Бэрд заключением в психиатрическое отделение, где женщина встречается с обаятельным сумасшедшим, подозрительно напоминающим ей кого-то из давних снов. Сумеет ли хранитель выбраться из заключения, восстановить библиотеку и спасти мир от разрушительных планов озлобленного врага?