유에이 고교로 빌런이 침입했다! 출동 요청을 받은 1학년 A반 학생들. 각자의 개성을 구사해 현장을 정리하려는 찰나, 빌런들을 눈앞에서 마주한다. 아니, 너희가 빌런이라고?

최초의 원 포 올과 손을 맞잡은 미도리야. 꿈이었지만 그 순간의 감각은 선명히 남아 있다. 한편 오늘의 수업은 A반과 B반의 대항전. 자, 어디가 더 뛰어난지 결판을 내자고!

드디어 대항전이 시작됐다. 첫판부터 시시다의 힘을 앞세워 밀어붙이는 B반. A반도 신소를 중심으로 반격을 준비하는데. ‘페르소나 코드’라니, 그건 어떤 새 장비일까?

1차전 뒤 승자도 패자도 시합 내용을 반성하는 모습, 역시 학생답다. 2차전에선 야오요로즈 대 켄도, 두 소녀가 오랜만에 만나는데. 어, 둘이 서로를 은근히 의식하고 있었네.

잠시 휴식을 취하는 사이 올마이트가 미도리야에게 어떤 당부를 한다. 곧이어 시작된 3차전에서 A반 공격의 중심은 역시 토도로키. 하지만 그건 B반에서도 이미 예상한 바다.

현재까지는 박빙, 이번 4차전을 이기는 반이 승기를 잡는다. 하지만 B반의 작전에 말려든 A반은 시작부터 위기를 맞고, 이때 바쿠고가 뜻밖의 행동으로 모두를 놀라게 한다.

A반과 B반의 대결 5차전, 드디어 마지막 시합이 시작됐다. 선두에서 선 미도리야를 일대일로 막아서며 도발을 걸어오는 모노마. 결국 말려든 미도리야는 서서히 흥분하는데.

신소의 히어로과 편입 발표와 함께 두 반의 치열했던 대항전이 막을 내린다. 하지만 그 검은 힘은 무엇이었을까? 미도리야는 답을 알아내려 바쿠고와 모의 전투를 해 본다.

호크스가 준 책에 충격적인 경고가 암호로 숨겨져 있었다니! 이번 인턴 교육의 진짜 목적도 이해하게 된 엔데버. 결국 현재 넘버 원 히어로인 그가 직접 학생 지도에 나선다.

엔데버와 쇼토 부자에게 뜻밖의 식사 초대를 받은 미도리야와 바쿠고. 쇼토의 누나 후유미가 준비한 식탁에 모두 둘러앉는데. 역시 이 가족은 화목해지려면 갈 길이 멀다.

식사를 마치고 엔데버와 기숙사로 돌아가는 학생들. 이때 이들의 차를 막아서는 빌런. 엔데버를 동경한다는 그놈은 차남 나츠오를 인질로 잡고 미치광이 같은 요구를 해 온다.

주민의 90%가 이능력 해방군의 해방전사가 된 데이카시. 그 한복판에 발을 들인 빌런 연합과 이들을 맞이하는 해방군의 간부 하나바타. 이제 두 세력의 충돌은 피할 수 없다.

빌런 연합 대 이능력 해방군의 총력전. 가짜 트와이스 군단에 붙잡힌 토가가 위험에 처하자, 진짜 트와이스는 새로운 개성에 눈을 뜬다. 한편, 다비는 게텐과 대치하는데.

히어로 아마추어 야구 리그 HLB의 결승전인 오르카즈와 라이오넬즈의 시합이 시작되고 양 팀은 개성을 사용하며 우승을 향한 격전을 벌인다. 갱 오르카와 시시도의 열정적인 지휘 아래 선수들은 줄지어 퇴장하고 드디어 마주한 두 사람의 맞대결 직전 사이렌이 울리는데...

호크스로부터 시가라키가 이끄는 초현실 해방 전선의 정보를 얻은 히어로와 경찰들은 이들을 소탕하기 위해 모이고 히어로과 학생들 또한 이 작전에 참여한다. 히어로들은 두 팀으로 나눠 각자 군가 산장과 쟈쿠 병원으로 향하고 올 포 원의 심복인 가라키를 붙잡는다. 그때 갑자기 나타난 노우무가 히어로들을 공격하는데…

가라키 확보를 위해 쟈쿠 병원에 돌입한 엔데버 팀은 대량의 노우무와 접전을 벌인다. 한편 No.5 히어로 미르코는 앞서 가라키를 쫓지만 가라키는 최강 노우무 하이엔드를 깨우고 그녀는 압도적인 힘을 가진 하이엔드와 맞서 싸우는데…

엣지쇼트 팀은 군가 산장을 향해 습격을 시작하고 히어로과 학생들과 프로 히어로들은 적들을 차례로 쓰러뜨린다. 한편 정체를 드러낸 호크스는 트와이스에게 투항을 권하지만 트와이스는 배신감에 그를 공격하고 갑자기 나타난 다비의 공격으로 호크스는 위기에 빠지는데...

호크스는 계속되는 다비의 공격에 위기를 맞고 쟈쿠 병원에선 엔데버 일행이 하이엔드를 상대로 고전한다. 미르코는 하이엔드와의 싸움 중 캡슐에 든 시가라키를 찾아내지만 큰 부상을 당하고 프레젠트 마이크의 마지막 일격으로 캡슐이 파괴되는데...

다비의 공격으로 중상을 입은 호크스는 마지막 순간 토코야미에 의해 구출되고 쟈쿠 병원에선 결국 시가라키가 깨어난다. 미도리야는 머릿속에서 들리는 초대 원 포 올의 목소리에 당황하고 시가라키의 개성으로 순식간에 모든 것이 붕괴되는데...

시가라키는 엔데버와 류큐의 공격에도 불구하고 아이자와에게 달려들고 미도리야는 그런 시가라키를 막아선다. 한편 기간토마키아는 연합 멤버들과 함께 시가라키에게 향하고 히어로들은 그를 막기 위해 총력을 다하는데...

야오요로즈는 기간토마키아를 막기 위해 A반, B반 학생들을 진두지휘하고 유에이 학생들은 그에 따라 작전을 실행한다. 한편 시가라키는 한계를 뛰어넘은 채 움직이며 아이자와를 노리는데...

우라라카에게 달려든 토가는 미도리야를 향한 우라라카의 마음을 눈치채고 시가라키는 올 포 원의 만류에도 공격 의지를 멈추지 않는다. 토도로키와 하도가 시가라키를 공격하는 순간 기간토마키아가 이를 방해하고 다비는 엄청난 사실을 털어놓는데...

시가라키의 몸을 차지한 올 포 원은 니어 하이엔드를 앞세워 타르타로스를 공격하고 올 포 원 본체는 수감돼 있던 빌런들과 함께 탈옥한다. 한편 인턴 학생들과 히어로들은 센트럴 병원에서 치료를 받고 토도로키는 다비를 떠올리며 괴로워하는데...

미도리야는 역대 계승자들의 개성을 이용해서 레이디 나강에게 맞서지만 실패한다. 전직 공안 직속 히어로였던 레이디 나강은 자신이 히어로 사회를 혐오하며 올 포원의 계획에 가담한 이유를 말하는데...

이즈쿠를 걱정하는 1학년 A반 학생들. 이즈쿠가 혼자 싸우지 않고 학교로 돌아오도록, 지금 쓸 수 있는 모든 힘을 쏟아붓는다.

자책감을 느끼던 올마이트는 뜻밖의 정보를 얻고 다시 마음을 다잡는다. 그리고 얼마 뒤, 이즈쿠와 친구들은 빌런들과의 결전에 나서는 올마이트를 돕기로 결심한다.

외출 금지로 한가한 시간을 주체하지 못하는 1학년 A반에 3학년 토오가타 밀리오가 찾아온다. 그가 가져온 건, 서포트과가 제작한 카드 게임 '유에이 히어로즈 배틀'! 유에이 학생 각자의 카드를 사용해 싸우는 이 게임은, 유에이답게 보통 방법으로는 다루기 힘든 것이었다. 과연, 카드 배틀의 승자는!?

자신이 마스터라고 부르는 올마이트의 요청을 받고 혼돈의 일본으로 날아간 아메리카 No.1 히어로 스타 앤 스트라이프. 그 앞길을 막아선 것은 마와의 후계자 시가라키 토무라였다.

개성 '뉴 오더'로 시가라키를 압도하는 스타 앤 스트라이프, 하지만 시가라키, 올 포원에겐 해아릴 수 없는 책략과 힘이 있었다. 과연 승부의 행방은...!?