실험 시설에 갇힌 블랙 라이트닝. 영웅이 사라진 프리랜드는 아수라장이 되고, ASA가 도시를 장악한다. 그사이, 아니사와 갬비는 격리된 메타들을 도울 계획을 짠다.

어떻게든 이 아이들을 구해야 한다! 벼랑 끝에서 무너지는 마리암을 돕는 린. 난민 유입을 놓고 퍼디와 대립하는 아니사. 이때, 오델은 치명적인 새 무기를 개발한다.

메타 격리 시설에 치명적인 바이러스가 돈다. 이와 관련된 원인과 상태를 조사하는 린. 제퍼슨과 제니퍼를 포섭하는 데 성공한 오델은 그의 야심 찬 계획을 실행한다.

제퍼슨은 달라진 일상에 적응하기가 힘들다. 계엄령이 떨어진 프리랜드. 아니사는 영웅 행세를 하고, 제니퍼는 잘못된 생각을 하고 있다. 게다가 린은 무리하게 일만 한다.

블랙버드를 신고하라니, 헨더슨이 정말 변한 걸까? 아빠의 부탁으로 위험한 임무를 맡는 아니사. 메타 유전자 안정화를 연구하는 린은 뜻밖의 실험 상대를 만난다.

죄책감에 괴로워하는 제퍼슨. 아니사는 예상 밖의 치명적 공격을 받고 생사의 기로에 선다. 브랜던의 집에 잠입해 조사하는 제니퍼. 그가 무슨 일을 꾸미고 있는 걸까?

칼릴에 대한 놀라운 사실을 발견하는 갬비와 린. 브랜던을 위한 정보를 얻는 제니퍼. 아니사는 아빠와 뜻이 맞지 않지만, 이번 일만큼은 그에게 부탁할 수밖에 없다.

프리랜드의 실상을 외부에 알려야 한다! 가능한 방법을 마련하는 아니사와 갬비. 제퍼슨은 이전과 달리 ASA에 강경한 태도를 보이고, 린은 ASA의 실체를 알고 동요한다.

누구를 믿고 따라야 할까? 상반된 신념 사이에서 고민하는 제니퍼. 붉은 폭풍이 불자, 그녀는 평행 세계로 빨려 들어간다. 믿기 힘든 진실을 마주할 다른 차원으로.

돌아온 제니퍼, 겉모습은 같지만 생각이 달라졌다. 갬비의 은신처를 찾아오는 TC. 중요한 구출 작전을 펼치는 아니사와 제퍼슨. 왜인지 린은 극도로 불안한 모습을 보인다.

오델을 붙잡는 제퍼슨과 아니사. 구덩이에 있는 수감자를 빼돌리려는 린. 하지만 ASA도 가만있진 않는다. 엄청난 습격을 당하는 순간, 제니퍼는 칼릴과 마주친다.

칼릴의 뇌와 교감하는 TC. 그가 칼릴을 예전처럼 되돌릴 수 있을까? 위험에 처한 린을 구하기 위해, 팀을 꾸리는 제퍼슨과 아니사. 지금은 적의 도움도 마다할 수 없다.

어려운 임무를 위해 훈련하는 팀원들. 긴장 속에서 제각각 다른 고민과 갈등에 빠진다. 마코비아에서 정신을 조종당하는 린. 사랑하는 가족을 위해, 마침내 그들이 나선다.

서로 숨기지 말자. 그간의 비밀을 털어놓고 화해하는 피어스 가족. 하지만 평화로운 시간도 잠시. 퍼디는 공격을 받고, 갬비는 최초의 메타휴먼에 대해 알게 된다.

린이 두고 온 혈청으로, 능력을 더욱 강화하는 그레이브디거. 그가 프리랜드를 침략할 준비를 한다. 전쟁 전에 다 함께 모인 가족. 그런데, 제니퍼 혼자 사라지고 없다.

프리랜드를 완전히 뒤집어놓는 그레이브디거. 피어스 가족과 모든 동맹 세력이 그에게 저항하지만, 역부족이다. 위기를 느낀 ASA는 흔적을 없애고 피할 준비를 한다.

마코비아 분쟁이 끝난 지 1년. 하지만 문제는 아직 남아있다. 게다가 새로운 이미지로 돌아온 토비아스. 프리랜드를 위해 계속 싸울 것인가, 어떻게 싸울 것인가? 제퍼슨과 가족들이 충돌한다.

원 헌드레드와 코브라 카르텔 간의 전쟁이 격렬해진다. 분노로 날뛰는 제퍼슨, 위험한 총격전에 뛰어드는 그의 가족들. 갬비는 새로운 위협에 대응하고, 아니사는 새로운 동료와 친해진다.

잘못을 바로잡아야겠다. 다친 동료를 돕기 위해 그의 뒤를 밟는 제퍼슨. 왜곡 보도에 화가 난 젠은 진실을 알리고 싶다. 신무기를 손에 넣는 갬비. 큰일이다! 생각했던 것보다 훨씬 강력하다.

끝나지 않는 악몽, 계속되는 린의 거짓말. 불안한 제퍼슨은 은밀한 취미로 화를 푼다. 그런 모습에 충격을 받는 가족들. 누가 계획한 일일까. 시장이 참석한 행사에서 큰 혼란이 일어난다.

젠을 데려올 수 있을까? 목숨을 걸고 이온층에 가는 제퍼슨. 갬비와 TC는 입자 응축기를 준비한다. 하지만 모두 자책감에 괴로울 뿐이다. 로페즈 서장은 라이트닝을 살인 용의자로 선포한다.

젠의 사고 여파에 모두 당황한다. 하지만 현실을 받아들여야 한다. 정면으로 맞서는 랄라와 데스티니. 토비아스는 속내를 드러내는 깜짝 발표를 한다. 제퍼슨 가족에게 또 다른 위험이 다가온다.

뒤늦게 신혼여행을 떠나는 신혼부부. 그곳에서 그레이스가 괴한에게 납치당한다. 그녀를 구하려는 아니사 앞에 나타난 칼릴. 끊임없이 페인킬러와 싸우는 그를 만나다니, 이거 정말 우연일까?

기쁜 일로 모인 가족에게 웬 날벼락인가. 횡령 혐의로 FBI의 조사를 받는 제퍼슨. 학교에 간 첫날, 전학생 제이제이는 새 친구를 사귄다. 린은 드디어 발의 비밀스러운 능력을 알아낸다.

라이브 방송을 하던 라이트닝이 위험에 노출된다. 또 다른 위협, 메타 사냥꾼. 제퍼슨은 이스마엘을 추적하고 직접 처리하려 한다. 모욕적인 일을 당하는 린. 가족 모두 차례로 무너져 내린다.

뭔가 잘못됐다. 갑자기 능력을 잃은 제퍼슨의 가족. 갬비는 그 이유를 알아내기 위해 애쓴다. 오랜 친구의 도움으로 곤경에서 벗어나는 린. 아니사는 병원에서 무슨 일을 일어나는지 알게 된다.

범죄 사건에 휘말린 제퍼슨과 린. 이 모함의 중심에 위험한 메타가 있다. 사라진 줄 알았던 그녀를 뒤쫓는 칼릴. TC는 젠을 위해 행복한 시간을 준비한다. 유라이아와 데이트하는 거 어때?

우리의 싸움을 끝내야 한다. 모노비스타를 공격할 계획을 세우는 아니사, 레드에게 복수하려는 젠. 제퍼슨은 토비아스를 만나러 간다. 능력을 쓸 수 없는 상황에서 적에게 뭘 할 수 있을까.

어둠 속에 갇힌 제퍼슨을 구해야 한다. 토비아스의 공포 정치를 끝내야 한다. 능력을 되찾기 위해, 치밀한 계획을 세우는 가족들. 마지막 싸움과 심판 뒤에, 무엇이 그들을 기다리고 있을까.