1547年，道格和托尼被送往亚利桑那州的大峡谷。与此同时，破坏者劳尔·尼蒙杀死了阿尔弗雷德·斯蒂尔斯博士，并在相位同步器控制台中安装了一枚带有定时装置的核弹；然而，安全部门封锁了所有出口，尼蒙通过道格和托尼固定的时间隧道逃跑。柯克将军命令科学家们抓获尼蒙并找出炸弹的藏身之处。然而，隧道失去了控制，这三个人在一个像蜂巢一样组织起来的社会里生活了一百万年。然而尼蒙来了。。。

道格和托尼必须帮助马可波罗阻止13世纪中国蒙古人的进攻。托尼遇见并爱上了忽必烈·卡恩的女儿。