ยุนกับฮาเบรุสันนิษฐานว่ามิซากิโอคุอาจมีส่วนเกี่ยวข้องกับเหตุราดอนบุกเมือง ส่วนเมเข้าร่วมการบรรยายของศาสตราจารย์หลี่ที่ดูไบ ซึ่งเป็นเวทีใช้เปิดตัววัสดุชนิดใหม่

ไคจูยักษ์ที่ตามฝูงแมนด้ามากำลังมุ่งหน้าขึ้นฝั่งโตเกียว ระหว่างนั้น เที่ยวบินไปลอนดอนของเมกับศาสตราจารย์หลี่ต้องเปลี่ยนเส้นทางไปมิลานเพราะฝุ่นแดง

กองกำลังภาคพื้นดินใต้บังคับบัญชาของมัตสึบาระเตรียมรับมือการโจมตีของก็อดซิลล่าที่โตเกียว ส่วนที่ลอนดอนเมหาทางไขปริศนาที่ซ่อนอยู่ในงานวิจัยของอาชิฮาระ

ก็อดซิลล่ารุกคืบเข้าใกล้โตเกียวมากขึ้นทุกขณะจนฝุ่นแดงปกคลุมหนาทั่วบริเวณ ส่วนทีมโอทาคิต้องรีบรุดไปช่วยคนที่ติดกับไคจูแมงมุม

ที่คฤหาสน์อาชิฮาระ ยุนและฮาเบรุพยายามที่จะถอดรหัสงานวิจัยของศาสตราจารย์โดยการใช้เจ็ตจากัวร์ ที่อินเดีย ลีน่าพาเมไปพบบีบี

ก่อนจะมุ่งหน้าไปที่เครื่องคำนวณมิติพิเศษ บีบีได้พาเมไปดูจุดเอกฐาน ขณะที่ทีมโอทาคิต้องออกเดินทางไปกำจัดก็อดซิลล่าที่โตเกียว

เมได้รู้เรื่องการระเบิดครั้งใหญ่ที่เกิดจากเครื่องคำนวณของอาชิฮาระเมื่อหลายปีก่อน ด้านคาโนโกะนำจุดกำเนิดเส้นทแยงมุมมุมฉากมาให้มัตสึบาระใช้จัดการกับก็อดซิลล่า