Le vent de la rouille balaie le Japon, dévorant les matières organique et inerte. Milo, un jeune docteur, cherche un remède pour sauver sa sœur à partir de champignons suspectés d'être l'origine du problème.

Akaboshi Bisco et Jabi voyagent vers Imihama à la recherche du dévorouille. Bisco est contraint de solliciter l'aide de Milo pour soigner Jabi blessé au combat.

Pendant que Bisco affronte la milice et les hommes du préfet, Milo apprend l'existence du dévorouille et la raison de leur voyage.

Bisco et Milo se dirigent vers les mines de charbon blanc d'Ashio pour atteindre Akita. En chemin, ils retrouvent le crabe géant Actagawa et Milo tente de l'amadouer.

En chemin pour Akita, Bisco et Milo traversent la mer de Calvero et arrivent dans une ville habitée par des enfants.

Bisco et Milo continuent leur périple et rencontrent à nouveau Tirol alors qu'elle est sur le point de mourir de froid dans la préfecture enneigée de Shimobuki.

Après avoir traversé le tunnel, Bisco et Milo arrivent enfin dans la vallée des larmes. Alors qu'ils affrontent un cylindrophis, Pawoo les interrompt.

Kurokawa a volé le dévorouille et capturé Pawoo et Jabi. Milo se rend seul dans la base militaire afin de les sauver.

Bisco aide Milo à récupérer de ses blessures et décide d'aller affronter seul Kurokawa. Jabi apprend le plan maléfique que le préfet a mis au point.

Bisco s'est sacrifié pour arrêter Kurokawa, mais le combat n'est malheureusement pas terminé. Le robot géant a repris vie et menace de détruire le Japon une nouvelle fois.

Le robot géant détruit tout sur son passage et menace le Japon entier. Milo marche dans les pas de Bisco et tente de l'arrêter par lui-même.

Le robot se dirige vers Imihama sans que les attaques de Milo ne puissent l'arrêter. Mais, alors que la situation est désespérée, Bisco s'extrait du robot géant et revient à la vie.