È passato ormai un anno ma Goku è ancora in viaggio. La vita scorre tranquilla e Gohan è assillato dalla madre per lo studio, tanto da affidarlo a Mr Shu un duro e brusco tutore che poi si rivelerà molto cattivo e molto violento con Gohan che lo fece arrabbiare moltissimo, ma sarà cacciato via con la forza proprio da Chichi che lo insegue dopo averlo inveito contro. Intanto, dallo spazio, ritorna anche Vegeta, ospitato a casa di Bulma, dove facendo la doccia è costretto ad indossare vestiti terrestri. Crilin e Gohan cominciano ad avvertire due strane presenze avvicinarsi alla Terra, ed una è quella di Freezer, quindi decidono di recarsi sul luogo dove hanno sentito la strana presenza, insieme ai loro amici.

I terrestri raggiungono il punto in cui poco dopo atterra la navicella spaziale di Freezer e suo padre, Re Cold. L'imperatore dello spazio infatti sebbene fosse stato severamente mutilato, è stato rinvenuto ancora vivo da suo padre tra i detriti di Namecc. È stato quindi sottoposto ad una fase di ricostruzione con parti metalliche che gli hanno sostituito parti del corpo, aumentandone anche la forza; una volta guarito, lo scopo di Metal Freezer è quello di vendicarsi di Goku e distruggere la Terra per ripicca. Prima che i soldati di Re Cold comincino ad attaccare la Terra, appare un ragazzo intenzionato a fermare i loro piani, che li uccide rapidamente.

Dopo aver sconfitto facilmente i soldati, il ragazzo, minaccia Freezer e Re Cold profetizzando la loro morte, sotto lo stupore di tutti quindi, si trasforma in Super Saiyan, esattamente come Goku, che sembra conoscere. In pochi minuti il giovane spiazza Freezer, che tenta prima di ucciderlo con un attacco potentissimo che non ha effetto, e poi con una Supernova con l'intenzione di distruggerlo insieme al pianeta, ma che il giovane sorregge con una mano, Freezer allora la fa esplodere, ma il ragazzo spunta illeso da un'altra parte e con un Burning Attack gli fa abbassare la guardia in modo da tagliarlo a metà con la sua spada.

Dopo aver tagliato Freezer a metà, il giovane misterioso lo affetta per poi disintegrarlo definitivamente. Eliminato Freezer, il ragazzo va per far lo stesso con suo padre Re Cold, che appare sicuro di sé credendo che il merito sia della spada. Cold lo invita a diventare suo alleato, ma il giovane rifiuta e lo uccide con due colpi, dopodiché invita i terrestri ad aspettare il ritorno di Goku insieme a lui: egli infatti sa che Goku atterrerà nelle vicinanze di lì a tre ore, ma non vuole rivelare nulla di sé agli altri. Vegeta non crede che lui sia un vero Saiyan, in quanto differentemente dai puri di razza egli non ha i capelli neri e oltretutto è certo che non esistano altri Saiyan sopravvissuti. Alla fine Goku arriva sulla Terra esattamente come il misterioso guerriero aveva predetto.

Il ragazzo decide di svelare solo a Goku la sua identità a patto che lui gli dimostri di essere il Super Saiyan che si aspettava. Goku gli mostra esattamente quello che lui voleva e il giovane gli rivela la sua identità. Lui è Trunks, arrivato dal futuro con una macchina del tempo, ed è il figlio di Vegeta e Bulma, tornato per avvisare tutti che di lì a tre anni dei Cyborg faranno la loro comparsa per distruggere tutto. Trunks li avvisa perché possano allenarsi in vista del loro arrivo perché nel suo futuro tutti i guerrieri (a eccezione di Goku, che sei mesi prima della comparsa dei nuovi nemici non sopravvive a causa di una malattia cardiaca, per la quale nel presente non esiste un farmaco in grado di combatterla) sono morti per mano dei cyborg, e che lui è stato allenato da Gohan finché non fu ucciso anche lui. Trunks se ne ritorna nel suo futuro consegnadogli una medicina del suo tempo. Goku spronato da Piccolo che aveva sentito tutto, racconta dei cyborg agli altri.

Goku racconta ai suoi amici come si è salvato dall'esplosione di Namecc; prima della deflagrazione totale, ha notato una delle cinque navicelle monoposto della Squadra Ginew e vi si è fiondato dentro riuscendo a scampare dalla morte. Con questa navicella è atterrato sul pianeta Yardrat poiché quelle erano le coordinate della prossima invasione della banda di Freezer. Dagli abitanti di Yardrat, di cui Goku possiede anche il vestito, ha imparato una nuova tecnica dopo un addestramento di un anno; il teletrasporto. Bulma propone di localizzare e uccidere direttamente il Dr. Gelo, ma gli altri rifiutano per svariati motivi. I guerrieri si organizzano per ritrovarsi fra tre anni, il 12 maggio verso le nove del mattino su un'isola a 9km verso la città del sud, e quindi allenarsi duramente nell'attesa. Goku, Piccolo e Gohan si alleneranno insieme. Yamcha va invanamente in palestra, Crilin alla Kame House, Tenshinhan insieme a Jiaozi in zona desertica, infine Vegeta in una stanza a gravità 150.

I guerrieri Z continuano il loro duro allenamento in vista dell'arrivo minaccioso dei cyborg, ognuno trova il suo modo per allenarsi; Yamcha normalmente vicino alla Capsule Corporation, mentre Vegeta in una stanza creata dal Dr. Briefs su sua richiesta (nell'episodio precedente), dove arriva a gravità 300 rischiando anche di morire (nella convalescenza sogna Trunks e Goku SSJ, ed infine Re Vegeta). Ripreso, finisce per raggiungere i 400, nonostante le lamentele di Bulma, sicuro che prima o poi anche lui diventerà Super Saiyan superando il suo rivale Kakaroth, scopo che ne sta accrescendo l'odio e l'ossessione. Intanto Gohan fa grandi progressi allenandosi con Piccolo e Goku.

Dopo essere stata attaccata da un cinghiale mentre faceva spese, aver invidiato una passeggiata in macchina dei vicini, Chichi costringe Goku ad iscriversi a scuola guida ed a prendere la patente, in questa storia si ritrova coinvolto Piccolo che era lì presente e che quindi prende lezioni insieme a Goku. Piccolo viene affidato ad una gentile istruttrice e dopo qualche difficoltà inizia a farci la mano, Goku invece ad un vecchieto malandato, dandogli non pochi problemi nell'addestramento. Durante un'esercitazione sotto un temporale, un pulmino con bambini a bordo cade in un burrone, il saiyan e il namecciano li salvano prontamente, così gli istruttori dicono che è inutile che due persone con tali poteri prendano la patente. I tre anni sono passati, il gruppo di Goku si mette in partenza.

Goku, Piccolo e Gohan raggiungono il luogo dove gli androidi faranno la comparsa, aggregandosi a Crilin, Bulma, Yamcha ed infine Tenshinhan che ha lasciato a casa Jiaozi. Tutti i presenti (ad eccezione di Goku) si sorprendono nel vedere Bulma con un neonato (Trunks) che scoprono essere di Vegeta. Poco dopo arriva Yajirobei per consegnare dei fagioli magici in caso di bisogno. L'orario previsto sfora ma dei due cyborg nessuna ombra e nessuno percepisce forze spirituali. Quando Yajirobei viene attaccato sul suo aeroplanino, Gohan comprende che i cyborg non hanno aura, così divisi scendono in città a cercarli. Yamcha scorge degli esseri umani uccisi dai due androidi, ma il tempo di leggere lo stemma del Red Ribbon sui berretti, che viene immobilizzato e attraversato da un braccio da uno dei due cyborg.

Percependo la riduzione dell'energia di Yamcha, i guerrieri si precipitano sul posto, trovando il loro amico morente trafitto da uno dei due androidi. Crilin prende il corpo dell'amico e lo riporta alla postazione iniziale. Goku propone al cyborg Numero 20 di spostarsi in quanto è pieno di gente, quest'ultimo acconsente ma solo dopo aver fatto alcuni danni. Intanto Yamcha si riprende grazie ad un fagiolo magico, e rivela che quei cyborg assorbono l'energia col contatto, così insieme a Gohan e Crilin cercano di raggiungere gli altri. Raggiunto un alto piano disabitato e roccioso, lo scontro sta per iniziare, Goku diventa Super Saiyan sorprendendo gli avversari, ma egli appare stranamente molto stanco.

Goku Super Saiyan e C-19 iniziano a combattere, e Goku appare subito in vantaggio. Intanto alla Kame House arriva Marion in cerca di Crilin, e il maestro Muten gli racconta di quando Goku bambino sconfisse l'esercito del Red Ribbon. Yamcha, Gohan e Crilin raggiungono il luogo del combattimento informandoli del potere degli androidi. Goku pur essendo in netto vantaggio non sembra lottare come al solito, questo poiché sta iniziando a sentire i primi sintomi della malattia cardiaca predetta da Trunks. Il Super Saiyan lancia una Kamehameha che viene assorbita dai palmi delle mani di Numero 19, a questo punto il cyborg riesce anche a colpire l'avversario.

Goku inizia a sentire gli effetti della malattia cardiaca, Crilin gli dà un fagiolo magico ma si rivela inutile confermando che si tratta del famoso virus. C-19 riesce quindi a sconfiggerlo facilmente per poi iniziare ad assorbirgli l'energia. Prima di dargli il colpo di grazia arriva Vegeta, che mette in salvo Goku per regolarci i conti in futuro, e sorprendentemente si trasforma in Super Saiyan; il principe racconta che allenandosi duramente, prima a gravità 450 e poi affrontando una tempesta di meteoriti nello spazio, è riuscito a risvegliare il suo sangue di SSJ per la rabbia dovuta all'invidia verso il suo rivale Kakaroth, superando anche il suo potere. Yamcha riporta Goku a casa, così che possa prendere le medicine per il cuore. Numero 19 inizia ad attaccare Vegeta, ma il suo primo attacco a sorpresa non ha effetto.

Vegeta incassa il primo attacco senza risentirne e poi mette in difficoltà Numero 19 senza problemi scagliandolo al suolo con violenza. L'androide riesce ad acchiappare Vegeta, ma in realtà il Super Saiyan si fa assorbire l'energia di proposito per capire l'effettivo potere dell'avversario, a quel punto stendendo gli arti inferiori riesce a strappare le braccia di C-19, per poi distruggerlo definitivamente con il Big Bang Attack, non prima di averlo visto urlare di terrore, confermando che anche i cyborg hanno paura. Vegeta scioglie la trasformazione mostrandosi tranquillo, così il misterioso Numero 20 fugge per dirigersi al laboratorio sfruttando la conformazione montuosa del posto. Vegeta prende un fagiolo magico e con tutti gli altri vanno alla ricerca del nemico. Numero 20 nascosto riesce ad assorbire un potente attacco energetico di Vegeta, lanciato da quest'ultimo per stanarlo.

Numero 20 nascosto osserva i guerrieri Z in attesa di assorbire da qualcuno l'energia; alla fine sceglie Piccolo in quanto il più forte dopo Vegeta, lo prende quindi alle spalle ed inizia a prelevargli la forza tappandogli la bocca. Piccolo prima di perdere tutte le forze utilizza la telepatia per avvertire Gohan, che corre in suo aiuto liberandolo e attirando tutti gli altri. Il namecciano dopo aver mangiato un fagiolo magico si offre di affrontare egli stesso l'androide, e sorprendentemente gli si mostra superiore strappandogli anche una mano. Intanto Bulma e Yajirobei si dirigono sul luogo, invece Trunks appena arrivato dal futuro rimane sconcertato dai rottami di Numero 19, in quanto non ha mai visto quel cyborg. I guerrieri Z credono di aver risolto tutto, ma Trunks arriva informandoli che quelli non sono gli androidi che hanno devastato il mondo nel suo tempo. Inoltre Vegeta scopre che il giovane misterioso venuto dal futuro è suo figlio, poiché Piccolo lo ha chiamato per nome.

Trunks conferma che C-19 e C-20 non sono gli androidi del suo futuro, e che probabilmente con il suo precedente viaggio si è modificata la storia. Bulma giunge sul luogo e riconosce in N.20 il Dr. Gelo, a questo punto l'androide sfrutta l'occasione per fuggire facendo baccano e annunciando l'imminente risveglio di C-17 e C-18. Trunks rimane stupito che Vegeta non abbia cercato di salvare suo figlio e Bulma, quest'ultima spiega che anche se un po' diverso Numero 20 è certamente il Dr. Gelo, sebbene Trunks avesse detto che era stato ucciso dai cyborg del suo futuro; Numero 17 e 18. Dopo averli descritti, ed essere informati sull'identità di Trunks, tutti si dirigono nella zona in cui dovrebbe celarsi il laboratorio per distruggerlo, mentre Gohan trasporta Bulma, suo figlio e Yajirobei al monte Paoz. Il Dr. Gelo capisce le loro intenzioni avendo anche lui riconosciuto in Bulma la figlia del presidente della Capsule Corporation. Infine Piccolo rivela a Bulma la vera identità del ragazzo venuto dal futuro.

Goku soffre ancora per la malattia, intanto Crilin, Tenshinhan e Piccolo raggiungono il luogo in cui dovrebbe trovarsi il laboratorio, e si dividono, spartendosi due fagioli magici a testa. Il Dr. Gelo che li osservava, si fa localizzare da Crilin dopo aver incontrato un cacciatore, ma il dottore prende Crilin da dietro riuscendo a malmenarlo. Quest'ultimo lo segue fino al laboratorio ma non riesce ad impedirgli di entrare, alza quindi l'aura per richiamare gli altri. Il Dr. Gelo attiva Numero 17 e Numero 18, rivelando che lui si è trasformato in un cyborg per avere vita eterna, mentre C-17 e C-18 erano difettosi e usati per il reattore a energia infinita. Senza avere il tempo di far nulla, 17 acchiappa il telecomando e lo distrugge per evitare di essere controllato. Piccolo, Tenshinhan e poi Vegeta seguito da Trunks, arrivano al portone del laboratorio, così Vegeta lo distrugge, nonostante le suppliche di Trunks di non affrontarli.

C-17 uccide il Dr. Gelo e attiva C-16 che ha un solo obiettivo: uccidere Goku.

Vegeta decide di testare i suoi poteri di Super Saiyan su C-18 e i due combattono ma, nonostante la forza del Saiyan, lei vince facilmente spezzandogli anche un braccio.

Piccolo, Tenshinhan e Trunks affrontano C-17 e C-18 ma vengono facilmente sconfitti da questi ultimi.

Gli Androidi se ne vanno e Piccolo prende una decisione: vuole riunirsi a Dio.

Piccolo arriva al palazzo di Dio chiedendogli di fondersi con lui, ma la divinità vuole rimanere ad osservare la situazione perché sia gli eventi che i cyborg appaiono molto diversi dal futuro raccontato da Trunks. Nel frattempo gli Androidi rubano un camion e affrontano un gruppo di teppisti su motocicletta. Tenshinhan si dirige a recuperare Jiaozi per allenarsi, mentre Crilin, Trunks, Yamcha, Chichi, Gohan e l'infermo Goku si dirigono alla Kame House per prevenire l'attacco dei cyborg.

Mentre il gruppo si dirige dal maestro Muten, Trunks rivela che modificando il passato ha creato una nuova linea temporale, e che quindi il suo futuro rimarrà inalterato. Intanto Vegeta dopo uno scatto d'ira per la sconfitta, si convince di poter superare ulteriormente il suo limite. Bulma invia un fax al gruppo, dove è ritratta una macchina del tempo coperta da muschio.

Bulma e Gohan trovano una vecchia macchina del tempo, identica a quella di Trunks, così i nostri eroi trovano un uovo di un mostro nella macchina del tempo di Trunks e ne deducono che qualcuno ha viaggiato nel tempo prima di lui, infatti secondo la macchina qualcuno è arrivato 4 anni prima, cioè un anno prima che Trunks uccidesse Freezer e Re Cold, vicino l'uovo inoltre trovano la muta di una creatura simile ad un insetto.

Dio avverte il pericolo di un nuovo nemico e per scongiurare la minaccia decide di ricongiungersi con Piccolo. Intanto i notiziari televisivi avvertono la popolazione che gli abitanti di alcune città sono misteriosamente scomparsi, lasciando per strada soltanto gli abiti. Il super guerriero namecciano è nato e va a confrontarsi con la creatura misteriosa.

Piccolo raggiunge la nuova minaccia che grava sulla Terra, questo essere assorbe gli esseri umani per via del suo pungiglione presente all'estremità della coda. I due si tengono testa, ma Piccolo sembra essergli superiore, secondo N.16 il suo potere è pari a quello di N.17. Trovandosi in difficoltà, l'avversario usa prima il Makankosappo, e poi la Kamehameha, dimostrando di possedere diverse aure familiari.

Il mostro Cell avvolge Piccolo e inizia ad assorbirlo. Quando Cell molla la presa dopo avergli sgonfiato il braccio, Piccolo prende tempo e l'androide spiega di essere stato costruito dal Dr. Gelo usando le cellule di Goku, Vegeta, Piccolo, Freezer e Re Cold e di essere stato sviluppato dal computer del dottore rimasto intatto nei sotterranei. Cell gli spiega che lui è venuto dal futuro, dopo aver ucciso Trunks, con la macchina del tempo che Bulma e gli altri hanno trovato nei boschi. Sta cercando C-17 e C-18 per assorbirli e diventare l'essere perfetto. Dopo il racconto, Piccolo rigenera il braccio sgonfio e la lotta ricomincia.

Il combattimento viene interrotto dall'arrivo di Crilin e Trunks, Cell, spiega che se volesse potrebbe utilizzare anche la Genkidama, dopo questo scappa dopo aver accecato temporaneamente Piccolo con un Taiyoken e continua a diventare sempre più forte assorbendo una squadra di muscolosi giocatori di rugby. Nel frattempo anche Vegeta viene a conoscenza del mostro, e Goku inizia a dare cenni di ripresa.

Piccolo e gli altri discutono sul da farsi, mentre Vegeta è convinto di superare il limite del Super Saiyan e che quindi non ci sarebbe bisogno di fermare ne i cyborg ne Cell. Trunks e Crilin vanno nei sotterranei del laboratorio del Dr. Gelo per distruggerlo, sia per evitare che si sviluppi in un futuro prossimo, sia per trovare qualche indizio; i due trovano i disegni del telecomando per disattivare i cyborg e li portano da Bulma. Tenshinhan e Piccolo cercano di stanare Cell senza successo.

Piccolo, Crilin e Tenshinhan trovano Cell mentre assorbe altre persone, ma il mostro anche questa volta riesce a fuggire via azzerando l'aura, in compenso riescono a salvare alcune persone. Chichi con sorpresa trova Goku che si allena in perfetta forma; il Saiyan si è rimesso dalla malattia e nel sonno convalescente ha ascoltato tutti i discorsi dei suoi amici, sapendo dei cyborg e di Cell. Goku rivela che l'unica soluzione è superare il limite del Super Saiyan.

Goku, guarito dalla malattia cardiaca, raggiunge Vegeta, che vuole superare il limite del Super Saiyan, dicendogli che esiste un posto in cui un giorno vale un anno: la stanza dello spirito e del tempo, una stanza dove il tempo passa molto lentamente, un giorno in questa stanza equivale ad un anno terrestre. Mr. Popo porta i guerrieri Z nella stanza dello spirito e del tempo, primi ad entrare sono Trunks e Vegeta che si preparano ad allenarsi lì. I tre Cyborg approdano alla Kame House per sapere dove sia Goku e Piccolo li porta in un'isola poco distante per combattere.