前任の松ケ崎中学時代に妻の里美(倍賞美津子)を亡くした坂本金八(武田鉄矢)は､そのショックで教壇から遠ざかっていた｡ある日､桜中学の野村孝一郎校長(早崎文司)が金八に泣きついてきた｡今の3年B組は何人も担任を追放し､受験生にとって大事なこの9月にも女性教師が辞めてしまったという｡

3年B組の石田智樹(古屋暢一)がクラスメートの石築朋子(小野寺菜央)を殴った｡智樹は偶然当たっただけだと言い張るが､朋子は思い切りロッカーに頭をぶつけて床に倒れた｡金八(武田鉄矢)が駆け付けた時には朋子は顔を腫らし､身動きひとつしなかった｡金八は智樹にことの次第を聞くが､わざとやったわけではないから謝らないと主張した｡

不登校の蓑田紀美(藤田瞳子)は相変わらず学校に来ない｡金八(武田鉄矢)は心配して紀美の家を訪ねた｡紀美の母･友紀(水木薫)は美容院を経営しながら､女手1つで紀美を育ててきた｡友紀が紀美に不登校の理由を聞いても､言いたくないの一点張りらしく､金八としては､しばらく様子を見るほかなかった｡

学級総会が3年B組で開かれることに｡議題は班替えということだが､金八(武田鉄矢)の本当の狙いはいじめの芽を摘むことにあった｡生徒たちがいじめの標的としてあげたのは､伸也(小池直樹)だった｡これ以上友達の伸也をいじめないでほしいと立ち上がったのは､豊川康(若菜大輔)だ｡ところが､伸也を1番いじめてたのが､ほかならぬ康だったから､一同は驚く｡

金八(武田鉄矢)が紹介したスポーツチャンバラ､略して”スポチャン”が3年B組で流行り始めた｡受験勉強や塾通いでストレスの溜まっている生徒たちは､一時の息抜きに水を得た魚のようだ｡とりこになったのは生徒だけではなく､数学の阿部一智先生(前田淳)も子どもたちに混じって､スポンジの刀を振り回した｡

桜中学で合唱コンクールが開かれることになった｡これから本格的に受験準備に入る3年生にとっては､最後の集団行事になる｡全力で臨もうとする3年B組の女子たちだが､やる気のない者も多い｡音楽の八木先生(城之内ミサ)の伴奏で練習しても､救いようもないほどバラバラ｡金八(武田鉄矢)の指導で参加することだけは決まったが､先が思いやられる｡

3年B組の樫木真穂(幸早恵子)が授業中､カッターを自らの手にあてた｡放心状態の真穂は何かを思い詰めている様子で､血を見て騒ぎ出したクラスメートの叫び声で我に帰った｡保健室に担ぎ込まれた真穂だが､金八(武田鉄矢)が駆け付けた時には落ち着きを取り戻していた｡原因を聞き出すと､真穂は母親の祥子(梶三和子)とのトラブルを打ち明けたが､2人の間に何があったのかは言おうとしなかった｡

3年B組の杉山修一(佐々木卓馬)が恋をした｡相手は金八(武田鉄矢)の長女･乙女(星野真理)｡中華料理店を営む自分の両親を騙して､修一は金八のいない間に坂本家にせっせとラーメンの出前を届ける｡しかし､乙女もそう何度も修一の好意に甘えるわけにはいかない､代金を払うと言うが､修一は受け取らない｡そんな中､修一の魂胆を見破ったのはクラスメートの坂田拓也(渡辺卓)だった｡

3年B組では進路指導の三者面談が始まった｡志望校選択の目安となる偏差値がなくなってからというもの､どこの学校が自分の能力に合ってるのかがわからず､生徒たちの不安は募るばかり｡金八(武田鉄矢)は生徒たちになぜ偏差値制度をなくしたかをわかりやすく説明するが､本人たちにはよく理解できない様子｡

不登校の紀美(藤田瞳子)が学校に行く決心をした｡再三に渡って登校を促していた宮沢歩(橋本光成)の努力がやっと実ったことになる｡紀美の元気な姿を見て､金八(武田鉄矢)を始め3年B組の生徒たちは大喜び｡これで全員の生徒がそろってホッと一息の金八だが､今度は歩が両親の事で騒ぎを起こした｡歩は15年前､当時中学3年生だった保(鶴見慎吾)と雪乃(杉田かおる)の間に生まれた｡

両親の事をからかわれて家を飛び出した歩(橋本光成)は､池内先生(吉行和子)宅で一夜を過ごした｡翌朝､金八(武田鉄矢)に警察から電話が入った｡前夜､倉庫荒らしがあり､現場に歩のコートが落ちていたというのだ｡金八は歩を連れて警察へ向かい､歩は前夜1人でディスコに行き､見知らぬグループにコートをはぎ取られた事実を話し､帰宅が許可された｡金八が学校に戻ると､3年B組では､歩の話題で持ちきりだった｡そんな時､金八は卒業生の山田麗子(三原じゅん子)に呼び出され､そこには星野清(近藤真彦)も来ていて…｡

年が明け､私立高校の推薦入試が始まった｡試験の当日､金八(武田鉄矢)のところに康(若菜大輔)から電話が入った｡一緒に試験会場に向かっていた伸也(小池直樹)が､突然現れた犬を追って行方不明になったというのだ｡伸也を探していたのでは康も試験に間に合わないので､金八は半ベソの康に伸也のことは諦めるよう説得した｡その後､美香(小嶺麗奈)が受験した高校から電話がかかってきた｡

3年B組から初めての高校合格者が出た｡菅原東子(神保良美)や田上容子(渡部はるか)たちだ｡金八(武田鉄矢)は2人に､まだ合格が決定していないクラスメートの手前､はしゃぎすぎないようにと注意する｡しかし2人の勢いは止まらず､東子は仲間とカラオケに繰り出し…｡一方､同じ3Bの哲也(坂口剛)と伸也(小池直樹)が高校へ行かないと言い出す｡

桜中学を14年前に卒業した加藤優(直江喜一)が突然､金八(武田鉄矢)を訪ねてきた｡同級生の渡辺八重子(川上麻衣子)について相談に乗ってほしいという｡八重子は夫とうまくいってないらしく､このままだと離婚かもしれないとのことだった｡その夜､今度は雪乃(杉田かおる)が金八の家にやってきて…｡その頃､3年B組の日下信二(小野寺行哉)が自分の部屋で籠城を始める｡

都立高校の願書提出日がやってきた｡金八(武田鉄矢)は3年B組全員に､提出する時の心得を話して聞かせた｡志望校別にグループを作り､それぞれが目指す高校に向かった｡その中で港東高校に向けて出発したグループの中の1人･美香(小嶺麗奈)が突然､願書提出に行かないと言い出す｡

私立高校入試前日､金八(武田鉄矢)は生徒たちの緊張を解消しようと3年B組全員でスポーツチャンバラ大会を企画した｡一方､帰宅した美香(小嶺麗奈)を出迎えたのは､見知らぬ不動産屋だった｡美香の母親･沙耶(寺田路恵)からの依頼でマンションを査定しているという｡

私立高校の合格発表が始まり､佐藤賢治(反田孝幸)たち秀才組が3人も名門の開栄高校に受かったことは､桜中学始まって以来の快挙だった｡たとえ私立に失敗しても､まだ都立がある､と金八(武田鉄矢)は植田浩子(井村翔子)たち都立挑戦組にエールを送ろうと3Bに提案｡しかし､本人たちはさらし者にするのか､と反発した｡

都立高校の合格者が発表された｡3年B組では智樹(古屋暢一)､修一(佐々木卓馬)､拓也(渡辺卓)､朋子(小野寺菜央)の4人が不合格｡知らせを受けた金八(武田鉄矢)は学校で4人を待つが､修一と拓也だけは姿を現さなかった｡その頃､当の修一たちは､とあるライブハウスにいて…｡

桜中学で美術教師をしていた田沢悦子先生(名取裕子)から､久々に連絡が入った｡今は海外で画家として活躍していて､個展のために帰国し､金八の家にやってくるという｡普段は遅くまで仕事をしている金八だが､大急ぎで帰宅した｡悦子が帰った後､幸作(佐野泰臣)は金八に､悦子先生となら再婚してもいいと言う｡

今まで進路が決まっていなかった3年B組の仲間も､無事行き先が決定した｡二次募集に合格した生徒､調理学校へ進学する修一(佐々木卓馬)などさまざま｡交通事故で入院していた賢治(反田孝幸)も退院した｡卒業までの短い間､金八(武田鉄矢)は中学生活の思い出に残る授業をしようと以前から考えていた”ディベート”､要するに”議論のスポーツ”を実現することに｡

先生たちの発案で､｢卒業する生徒に贈る教師たちのやりたかった授業｣が行われることに｡職員室では金八(武田鉄矢)をはじめ､先生たちが授業の打ち合わせで大忙し｡まずは家庭科と社会科の授業として､本場のインドカレーを作ることになった｡北先生(金田明夫)の指導でスパイスから調合して作る本格的なカレーに､3年B組の生徒は興奮気味｡

卒業まであと1週間という時に､3年B組の伸也(小池直樹)が風邪を引いた｡母親の絹子(澤井伽名子)は学校を休ませると電話を入れたが､本人は登校したくて仕方ない｡我慢できなくなった伸也は親友の康(若菜大輔)に頼んで､パジャマのまま学校に連れて行ってもらった｡しかし伸也はすぐに保健室に担ぎ込まれ､金八(武田鉄矢)に説教される始末｡

卒業式の前日､3年B組の伊藤美文(宮本ゆか)が金八(武田鉄矢)に話があると言い出す｡美文は合格した高校を諦め､祖国の台湾に帰るというのだ｡長いこと入院し余命宣告をされ､生まれた村で余生を送りたいという祖父について行くという｡そして卒業式の当日､卒業生を代表した答辞で､3Bの美香(小嶺麗奈)が教師たちに向かって話し始めた｡

桜中学3年B組担任の中野(ラサール石井)が生徒たちから暴行を受け､救急車で搬送された｡同行した金八(武田鉄矢)に､中野は机にぶつかっただけとウソをつくが…｡

桜中学に老人介護施設がオープンする前夜､校舎の窓ガラスが大量に割られた｡捕まったのは､3年B組の入船力也(西原幸男)｡金八(武田鉄矢)は力也から事情を聞くが…｡

中間試験が終わった直後､真っ青な顔をした3年B組の秀才･市村篤(内田祐介)が保健室に連れていかれた｡篤の家に見舞いに行った兼末健次郎(風間俊介)だが､実は…｡

学校の窓ガラスを割った力也(西原幸男)がガラス代の入った封筒を教室で落としてしまう｡1人冷静に騒ぎを見ていた健次郎(風間俊介)こそ､力也の封筒を隠した犯人で…｡

文化祭の季節がやってきた｡空手部員の加藤バーバラ(大山千穂)と健次郎(風間俊介)は顧問の遠藤先生(山崎銀之丞)に､全学合同の空手を披露したいと頼むが…｡

3Bの文化祭の出し物がソーラン節に決まると､遠藤先生(山崎銀之丞)が金八(武田鉄矢)を訪ねてきた｡翌日から遠藤が指導することを知った花子先生(小西美帆)は…｡

三者面談で､金八(武田鉄矢)は希望や目標を書くアンケート用紙を配る｡その中で､太田アスミ(森下加奈)が｢進路は芸能界､スターになります｣と言い切るが…｡

不登校を続けている篤(内田祐介)は三者面談にも顔を出さず､金八(武田鉄矢)を心配させる｡その頃､篤は自宅療養している前担任の中野(ラサール石井)を訪ねていて…｡

不登校の篤(内田祐介)について聞くため､金八(武田鉄矢)は健次郎(風間俊介)を自宅に呼ぶ｡一方､アスミ(森下加奈)がクラスメートを連れて原宿に向かうと…｡

服部肇(上條恒彦)が金八(武田鉄矢)を訪ねてきた｡今はフリースクールで不登校児たちの面倒を見ている服部に､金八は中野先生(ラサール石井)のことを頼んだ｡

年が明けた坂本家に､大西元校長(織本順吉)が招かれた｡3年B組の先輩たちも駆けつけ､現役3Bとの楽しい新年会に｡新学期が始まり､大西は3Bの教室に顔を出すが…｡

金八(武田鉄矢)が3Bの生徒代表を殴って辞表を提出し桜中学は大騒ぎ｡体罰だと騒ぐ親が出てくる中､新聞が金八のことを暴力教師と書き立て､マスコミの取材が殺到し…｡

安井ちはる(岡あゆみ)が幸作(佐野泰臣)に､最近元気がない健次郎(風間俊介)の力になるよう頼む｡その夜､幸作は健次郎を呼び出し､ちはるが心配していると話すが…｡

好太(森雄介)が､落合加奈恵(中島由香里)がつきまとってくると職員室に飛び込んできた｡一方､教室でちはる(岡あゆみ)と2人だけになった健次郎(風間俊介)は…｡

青嵐高校を受験した幸作(佐野泰臣)､森山慶貴(桑原朋宏)､健次郎(風間俊介)は合格発表の掲示板の前で肩を落とす｡心を閉ざす健次郎に対して金八(武田鉄矢)は…｡

健次郎(風間俊介)と篤(内田祐介)は名門の開栄に合格したが､慶貴(桑原朋宏)はまさかの不合格｡すると､慶貴と母親の綾子(うつみ宮土理)が桜中学に乗り込んできた｡

兄･雄一郎(須藤公一)を巡って一家でウソをつき続け､それがバレたことで健次郎(風間俊介)の家族が崩壊しようとしていた｡そんな中､金八(武田鉄矢)は…｡

都立高校一般入試合格発表の日､荒川土手にはリュックサックを背負って歩く明彦(亀梨和也)の姿が｡目的がはっきりしない明彦を大森巡査(鈴木正幸)は家出と判断し…｡

受験も終わり､3Bでは体験学習が行われた｡健次郎(風間俊介)たちが卒業生･修一(佐々木卓馬)のラーメン屋で学んでいると､健次郎の兄･雄一郎(須藤公一)が現れ…｡

健次郎(風間俊介)の兄･雄一郎(須藤公一)が退院することに｡2人だけでマンション暮らしをするという母親･麻美(田島令子)に雄一郎は反発し､果物ナイフを取り…｡

母親の麻美(田島令子)をナイフで刺した健次郎(風間俊介)の事件が新聞記事になった｡金八(武田鉄矢)が､健次郎は卒業式に出られないかも知れないと3Bに伝えると…｡

卒業式を控え､3Bでは中学生最後の特別授業が始まっていた｡傷害事件を起こした健次郎(風間俊介)は授業に参加できない中､中野先生(ラサール石井)を訪ねると…｡

健次郎(風間俊介)の家裁審判が出るのが卒業式の3日後に｡その期日では健次郎は卒業式に出席できないため､金八(武田鉄矢)はどうにかならないかと食い下がるが…｡

坂本金八（武田鉄矢）が担任を務める桜中学３年B組は、２学期になって２人の転入生・成迫政則（東新良和）と鶴本直（上戸彩）を迎えた。男子の何人かが直をからかうと…。

転校早々何かにつけて物議を醸している直（上戸彩）が校長室に呼び出された。千田新校長（木場勝己）は和を乱すとしてスカートの長さを注意するが…。

信太宏文（辻本祐樹）の遅刻が続いた。金八（武田鉄矢）は単なる朝寝坊だと思うが、別の原因があり…。一方、入院中の幸作（佐野泰臣）のストレスが限度に達していた。

自分が悪性リンパ腫と知った幸作（佐野泰臣）は自暴自棄に。一方、３Bでは俊大（途中慎吾）や崇行（中尾明慶）がふざけて非常ベルを押し、驚いた哲郎（太田佑一）が…。

文化祭が迫ってきたが、３年B組の出し物は決まっていなかった。話し合いは平行線をたどるが、病気と闘っている幸作（佐野泰臣）のためにソーラン節を踊ることに。

３年B組が卒業証書の原料になるケナフの刈り入れをしていた時、崇行（中尾明慶）がナイフで指を切ってしまう。崇行の血を見て震え保健室に運ばれた政則（東新良和）は…。

３年B組の教室では、江藤直美（鈴田林沙）が同性の直（上戸彩）のことを好きなのではないかというウワサが広まっていた。授業中もその話題が手紙で行き交い…。

最近多発しているひったくり対策のため夜回りが始まることに。儀（斉藤祥太）はバイクで暴走行為や引ったくりを繰り返している兄・武（白川峻）に止めるよう懇願するが…。

受験シーズンも近づき、三者面談が行われた。３Bの生徒たちは誰も金八（武田鉄矢）の意見を聞かず夢や考えを語るが、金八は欠席を続ける儀（斉藤祥太）のことが心配で…。

両親が食事を作るようになり、迷惑そうにしながら喜ぶ儀（斉藤祥太）をほほ笑ましく思う金八（武田鉄矢）だが…。一方、乾先生（森田順平）は英子（原日出子）の出産を…。

儀（斉藤祥太）はお腹を押さえて苦しそうにしている乾先生（森田順平）の妻・英子（原日出子）を見つける。一方、直（上戸彩）は充宏（川嶋義一）に怒りをあらわにし…。

儀（斉藤祥太）の兄・武（白川峻）が帰ってきた。儀は何も言わずいなくなった兄を責め、大ゲンカが始まる。そして乱闘の最中に倒れたストーブから引火して儀の家が火事に！

再び無菌室に入った幸作（佐野泰臣）を心配する金八（武田鉄矢）だが推薦入試を控えた３Bを気遣うよう幸作に助言される。一方、美紀（森田このみ）の父親が自殺を図り…。

美紀（森田このみ）と和解した直美（鈴田林沙）が３Bに戻る。一方、美紀は父親が一命を取り留めたにも関わらず推薦入試には行かないと言って金八（武田鉄矢）を困らせる。

都立推薦入試の結果が発表された。陽子（中分舞）は青嵐高校に落ち、金八（武田鉄矢）に八つ当たりする。その頃、正臣（佐々木和徳）と奈津美（谷口響子）は…。

ついに私立高校一般入試が訪れた。ふとしたことで崇行（中尾明慶）と他校の生徒の間で小競り合いが起き、そこに俊大（途中慎吾）も加わって大騒動になってしまう。

高校にも落ち、正臣（佐々木和徳）に振られて傷心の奈津美（谷口響子）は、当てつけに長谷川奈美（中村友美）と出会い系サイトに伝言を残すと、すぐに返事があり…。

“成迫”という教師が犯した殺人事件についての週刊誌の記事に目を留めた充宏（川嶋義一）らは、同姓の政則（東新良和）に父親のことを根ほり葉ほり聞き始め…。

政則（東新良和）の父親のことで、激しいケンカを始めた直（上戸彩）と充宏（川嶋義一）。賢（加藤成亮）は政則を心配し、弁護士の父親・清史（中島久之）に協力を頼む。

金八（武田鉄矢）は政則（東新良和）が週刊誌で報道された問題について、３年B組全員で考えるべくディベートを提案。一方、ディベートに参加しなかった直（上戸彩）は…。

金八（武田鉄矢）は直（上戸彩）とカウンセラーを訪れ、直にクラスへ戻るよう呼びかける。そして３Bでは、本田先生（高畑淳子）や金八らによる総合学習授業が行われる。

特別授業の後、直（上戸彩）は都立ひかり高校定時制に合格した。３Bの皆も“男”である直を受け入れつつあり壁はなくなったかと思われたが、充宏（川嶋義一）だけは…。

名誉毀損で雑誌社と争うことを報告するため、政則（東新良和）は金八（武田鉄矢）と共に服役中の父・政之（佐戸井けん太）のもとを訪れた。そして、卒業式が始まるが…。

坂本金八（武田鉄矢）が桜中学を去ってから、2年の月日が経とうとしていた。桜中学2年B組の担任・花子先生（小西美帆）が出産し、和田教育長（長谷川哲夫）は金八に桜中学に勤務してほしいと頼む。そうして2Bの担任として教壇に戻った金八は、引き続き3年B組を担任することとなる。そして迎えた10月、3Bに転校生・飯島弥生（岩田さゆり）がやってきた。一方、桜中学を含む地域一帯には麻薬をめぐる問題が発生！また、3Bの生徒・丸山しゅう（八乙女光）は密かに何か問題を抱えているようで…。

ある日､3年B組の生徒が慌てて金八(武田鉄矢)を呼びにくる｡田中菜穂佳(石田未来)や麻田玲子(福田沙紀)が､弥生(岩田さゆり)の事情を学級委員しか知らされていなかったことについて不満を訴えたのがきっかけで､大騒ぎになっていたのだ｡金八は生徒たちに､弥生の発達障害について全員に言わなかった理由を話す｡

金八(武田鉄矢)は､校内で小さなつぶれた機械が落ちているのを見つける｡何かわからず3年B組で心当たりを聞いてみると､園上征幸(平慶翔)が教室から飛び出して行く｡金八が拾ったのは､征幸の弟で1年A組の幸夫(沼田和紘)の補聴器とわかる｡幸夫はクラスメートから陰湿ないじめを受けており､補聴器を無理矢理はずされることも度々で…｡そんなある晩､スーパーさくらから金八の元に電話が入る｡

文化祭の季節がやってきた｡歴代3年B組がやってきたソーラン節が候補にあがるが､意見がまとまらない｡そんな中､金八(武田鉄矢)は給食費を滞納している狩野伸太郎(濱田岳)の自宅を訪ねる｡だが父親の伸介(田口浩正)も母親の亜弥(阿知波悟美)も､時間がないからと金八の話に聞く耳を傾ける素振りもない｡

3年B組の生徒たちがとった行動にショックを受けた金八(武田鉄矢)｡しかし翌日の登校時には､なにくわぬ顔で生徒たちにあいさつする金八の姿があった｡生徒の中には素直に謝ろうとする者もいる一方､伸太郎(濱田岳)などは今まで以上に反抗心が強くなったかのようだった｡そして､これは私と生徒の勝負で今回の件は謝らなくてもいい､文化祭で成果を見せてくれさえすればいいと言う金八に､生徒たちは勝負を受けて立とうと奮い立つ｡

文化祭の興奮もようやくおさまった桜中学で､孝太郎(竹内友哉)だけは大麻での一件に懲りた様子もなく､和晃(村上雄太)に加え女子にまで金をせびり始めていた｡そんなある日､卒業生の高鳥よし江(水間ちづる)らが金八(武田鉄矢)と本田先生(高畑淳子)を訪ねてきた｡性教育の教材として作った男女1体ずつの人形を預かってほしいという｡

シンナーでハイになり､高笑いしながら夜の道を走っていた孝太郎(竹内友哉)は､普段から和晃(村上雄太)の家に入り浸っていた｡ある日､和晃の母･律子(柳岡香里)の怒りが頂点に達し､桜中学にやってきて､和晃と孝太郎を別のクラスにしない限り和晃を学校には来させないと言う｡

学校を欠席するようになった崇史(鮎川太陽)を心配した金八(武田鉄矢)は崇史を訪ねるが､家にはいなかった｡そんな中､スペシャルオリンピックスのトーチラン本番の日がやってくる｡練習を重ねてきた弥生(岩田さゆり)は､金八や乙女(星野真里)､母･昌恵(五十嵐めぐみ)や3年B組の仲間たちが見守る中､伴走する養護学校の圭吾(加藤隆之)と走り出す｡

和田教育長(長谷川哲夫)と金八(武田鉄矢)は､教育関連企業の部長･板橋香奈(木野花)に面会に行く｡板橋こそ桜中学に来年度から迎え入れる予定である民間校長の第1候補者なのだ｡一方､幼なじみのしゅう(八乙女光)を心配する稲葉舞子(黒川智花)が金八のところに相談に来る｡そこで金八は舞子からしゅうの家庭事情を聞く｡

クリスマスも近いある夜､遠藤先生(山崎銀之丞)ら夜回り隊は暗い路地で抱き合ってキスをする幼いカップルを見つける｡2人はなんと小学6年生だった｡翌日､国井教頭(茅島成美)が2人の通う小学校へ報告に行くと､偶然にもクラス担任は桜中学の卒業生･伊丸岡ルミ(松下恵)だった｡クラスに妊娠しているらしい女子がいて､その対応に困っていると言う｡

新しい年を迎え､3年B組の生徒たちが来月に控えた高校受験の準備態勢に入っている中､金八(武田鉄矢)のところに3年B組の鈴木康二郎(薮宏太)がやってきた｡名前も知らない女性に恋してしまったという｡そんな中､桜中学に卒業生･鶴本直(上戸彩)が現れた｡性同一性障害の悩みを抱えている直は､自らの決断を金八に報告する｡

飛び降り自殺を図り､一命はとりとめた崇史(鮎川太陽)だが､意識は戻らず予断を許さない容態だ｡金八(武田鉄矢)は､病院から学校へ戻る前にしゅう(八乙女光)の家に立ち寄るが…｡その頃､桜中学には崇史の件でPTAからの問い合わせが殺到し､職員はその対応に追われていた｡3年B組の生徒たちの動揺も激しい｡

崇史(鮎川太陽)の自殺未遂を発端に､ショックのあまり学校を休む生徒､しゅう(八乙女光)の家庭事情をウワサする生徒､騒ぎを起こされると受験に迷惑だと言う生徒など､まとまりかけた3年B組が､またバラバラになってしまった｡翌日､金八(武田鉄矢)は空席が目立つ教室で､崇史の容態には変化が見られないことを伝え､いつものように出席をとり始める｡

私立高校の推薦入試の時期となった｡3年B組は坪井典子(上脇結友)､大胡あすか(清浦夏実)､金丸博明【通称･車掌】(府金重哉)の3人が2日後に推薦入試の試験を控えている｡しかし博明は試験の前に､クラスのある女子への恋の告白をどうしても済ませておきたかった｡博明は親友の富山量太(千代将太)に協力してもらい告白を実行に移すが…｡

受験シーズンは本番に突入した｡幸作(佐野泰臣)は教育学部を受験すると金八(武田鉄矢)に報告する｡3年B組でも早くも数人の生徒は推薦入試で合格｡学級委員の島健一郎(筒井万央)も推薦で合格を決めた1人なのだが､表情はなぜか暗い｡給食の時間になっても食事に手をつけない健一郎を周囲は心配した｡

私立高校の一般入試の結果が出て､3年B組の生徒たちは悲喜こもごも｡ふとした進路の話題から弥生(岩田さゆり)が軽いパニックを起こしてしまう｡一方､しゅう(八乙女光)は高校に進学せず､中学卒業後は働くと言い張っていた｡金八(武田鉄矢)はしゅうの母･光代(萩尾みどり)としゅうの進路について話し合う｡そんな中､舞子(黒川智花)は､しゅうの腕にある注射跡について､どうすればいいのかと1人苦悩していた｡そしてついに…｡

しゅう(八乙女光)は覚せい剤の罠にはまりつつあった｡保釈され自宅に戻ってきた母･光代(萩尾みどり)は､どうにかしてしゅうを止めなければならないと心に誓う｡そして都立高校一次試験の本番の日がやってきた｡前日に受験心得と激励の言葉を生徒たちに伝えてから送り出した金八(武田鉄矢)だが､どうも当日は落ち着くことができない｡

長い療養生活を終えて久しぶりに崇史(鮎川太陽)が登校する｡卒業を待たずに就職かと思われた弥生(岩田さゆり)もきちんと学校に通うことになり､久しぶりに3年B組に全員がそろう｡しかし､しゅう(八乙女光)は母･光代(萩尾みどり)の必死の努力もむなしく､いまだに覚せい剤の禁断症状から脱せなかった｡

桜中学に覚せい剤を買った生徒がいるという警察の情報に､職員たちは衝撃を受ける｡さまざまな意見が交わされる中､教室から戻ってきた金八(武田鉄矢)は､それは3年B組のしゅう(八乙女光)であると告げる｡早速､警察へ通報しようとする国井教頭(茅島成美)らに対し､通報するのは待ってほしいと金八は頼み､3Bの生徒たちを教室に集める｡

しゅう(八乙女光)の覚せい剤使用発覚を受けて､桜中学では保護者や地域住民への説明会が開催された｡学校側からは板橋新校長(木野花)､国井教頭(茅島成美)､金八(武田鉄矢)ら教師たちが出席｡国井教頭は事実関係を説明するが､保護者たちからは受験に影響するから子どもを転校させたいという声や､警察に通報せずに授業を行った金八の対応を非難する声が次々とあがる｡

退職願を提出した金八(武田鉄矢)｡職員室の教師たちは金八の決意までは知らないものの､その様子から､彼が受けた精神的打撃の大きさを感じ取り心配する｡そんな時､フリースクールの服部先生(上條恒彦)から乾先生(森田順平)に電話が入る｡一方､3年B組では舞子(黒川智花)が欠席｡

しゅう(八乙女光)の身柄が鑑別所に移された｡その頃､3年B組生徒たちは､学級委員を中心に謝恩会について話し合っていた｡しゅうが戻ってこなければ謝恩会をやる意味はないと意見が一致し､代わりに何かできることはないかアイデアを募ることに｡また舞子(黒川智花)は､しゅうが少年院に入らず保護観察処分で済むよう､みんなで署名を集めて家庭裁判所に嘆願書を出そうと提案する｡

理科の遠藤達也先生(山崎銀之丞)が痴漢容疑で捕まったという知らせを受けた桜中学の坂本金八(武田鉄矢)をはじめ教員たちは騒然となる｡数日後､3年B組の生徒･長谷川孝志(坂本優太)の両親(平栗あつみ･吉見一豊)が桜中学へ乗り込んでくる｡

3年B組に転校生がやってきた｡金八(武田鉄矢)は校長室で真っ赤なセーターを着た私服姿の転校生･森月美香(草刈麻有)と対面する｡副校長の北尚明(金田明夫)は次の日からは制服を着てくるよう注意するが､美香は制服を着る意味がわからないと平然と言い､北の指導を拒む｡

かたくなに制服着用を拒み､毎日私服で登校する転校生の美香(草刈麻有)｡3年B組ではそんな美香の行動に影響され､日ごとに私服で登校する生徒が増えていった｡金八(武田鉄矢)は私服組になぜ制服を着てこないのかを問い､全員に”規則”について議論させる｡

父･和彦(小宮孝泰)から受験に専念するようにと大好きな野球を取り上げられ､ショックで部屋に引きこもってしまった里中憲太郎(廣瀬真平)｡憲太郎の幼なじみでもある諏訪部裕美(山田麗)から様子が変だと聞いた金八(武田鉄矢)は憲太郎の家を訪ねるが､憲太郎が引きこもっていることを隠している母親の恵美(広岡由里子)からは話をはぐらかされ早々に追い返されてしまう｡

3年B組で1番成績の悪い川瀬光也(高橋伯明)が突然､教師になりたいと言い出した｡卒業後の就職も内定していたが｢人のためになる仕事がしたい｣と訴える｡心打たれた金八(武田鉄矢)は光也の力になろうと決意をするが､今の成績では高校受験も無理だ｡そこで金八は､希望者が全員受けられる補習を先生たちに呼びかける｡

真面目で成績もいい中村美恵子(藤井真世)が突然髪を金色に染め､周囲を驚かせた｡大事な定期テストを前にその美恵子が､何をするのも一緒で仲良しの平野みなみ(菅澤美月)とぎくしゃくし始める｡そして定期テストの日｡岩崎浩一(真田佑馬)と渡部剛史(岩方時郎)の出来は予想通り最悪｡最終日にはなんとかしたいと考えた2人は､偶然拾った鍵で職員室に忍び込み､数学の試験問題を盗もうと企んだ｡

3年B組の漆田駿(坂井太陽)が赤ん坊を背負って登校してきた｡駿は父親･錦次(渡辺正行)が大衆演劇一座の座長をしており､赤ん坊はその座員の子どもだった｡一座が地方巡業に出てしまったため､仕方なく駿が面倒を見る羽目になったというのだ｡金八(武田鉄矢)はとりあえず職員室で赤ん坊を預り､事態を収める｡数日後､錦次が金八を訪ねてきた｡

中学生英語スピーチコンテストが近づいてきた｡3年B組からは帰国子女で英語が得意な金井亮子(忽那汐里)が選出される｡そんな中､茅ヶ崎紋土(カミュー･ケイド)はアメリカにいる父親から届いた手紙のことで悩んでいた｡紋土の父親は軍人だが､彼が生まれてすぐアメリカに単身で戻ってしまった｡

紋土(カミュー･ケイド)が出場したスピーチコンテストも無事終了｡金八(武田鉄矢)や3年B組の生徒たちは当然､紋土がアメリカの父に会いに行くだろうと考えるが､紋土はアメリカ行きをためらっていた｡その理由が渡米費用の問題だと知った生徒たちは､金を工面しようとネットオークションで持ち寄った品物を売ろうと計画するが､佐藤千尋(森部万友佳)だけが協力を拒んだ｡

日頃から金銭に関して異常な執着をみせ､みんなから総攻撃を受けた千尋(森部万友佳)は3年B組の裏サイトにそんな自分を励ます会を開くという書き込みがあるのを見つけた｡仲間の誰かが味方してくれると喜んだ千尋は指定のファミレスへと向かうが､千尋の前に現れたのは見知らぬ男(山本浩司)だった｡

ある日､大将(亀井拓)が目の周りにアザを作って登校してきた｡以前から大将の家庭では父親が家族に暴力をふるうという話を耳にしていた金八(武田鉄矢)は､原因は父親だろうと察するが､大将は何も語ろうとしない｡そんな中､受験の方針を話し合うために憲太郎(廣瀬真平)の父･和彦(小宮孝泰)が金八を訪ねてきた｡

新年を迎えた｡乙女(星野真里)が交際中の湯山(蟹江一平)のことで浮かない顔をしているのを見た金八(武田鉄矢)は､乙女に湯山を家に招いてみてはと提案する｡その頃､父親の聡(山本龍二)から家庭内暴力を受けている3年B組の大将(亀井拓)は､母親の信子(木村理恵)から父を見捨てて逃げようと言われ困惑する｡

酒癖が悪い父･聡(山本龍二)に愛想を尽かし､母･信子(木村理恵)が弟妹を連れて家を出て行ってしまった大将(亀井拓)｡家族が家を出て行ったことで反省したのか､聡が酒を絶ち真面目に働くと言い出し大将は喜ぶが…｡

桜中学では､鹿島田校長(浅野和之)と北副校長(金田明夫)による3年生の推薦入試に備えた面接の練習が始まる｡父親のことで心の晴れない大将(亀井拓)は面接官役の校長たちに不真面目な態度をとり､怒らせてしまい､校長が大将の推薦を取り消すと言い出した｡

受験勉強と同様､バレエのレッスンにも熱心に取り組んでいる和田順子(井本杏子)が､間近に控えた発表会で主役に抜てきされた｡順子と仲良しの安藤みゆき(梶尾舞)らも大喜び｡ところがそんな折､みゆきが学校の階段でバランスを崩し､よろめいた拍子に順子と接触｡みゆきとぶつかった順子は､階段から転げ落ちて脚を負傷してしまう｡

川上詩織(牛山みすず)が金八(武田鉄矢)の授業中に疲労で倒れてしまう｡保健室で目が覚めた詩織は､金八の背後に見知らぬ人の姿を見つける｡詩織は母親の英子(歌川椎子)にそのことを告白すると､それは金八の守護霊で神社を営む詩織の家では代々､女に霊能者の素質があるのだと説明され､詩織は困惑する｡

3年B組男子で1番体格が大きく相撲好きの玉田透(米光隆翔)は､相撲部が有名な私立高校を第1希望にしていた｡その透が志望校の入試を翌日に控えた日､五十嵐雅迪(田辺修斗)が風邪で高熱を出しているにも関わらず､無理矢理授業に参加｡受験を控えた周囲の生徒たちは風邪をうつされては困ると早退を勧めるが､3年間無遅刻無欠席無早退の皆勤賞を狙っている雅迪は拒む｡見かねた英語の矢沢亮先生(山田純大)の指示で､雅迪は保健室に連れて行かれるが､1人で帰宅できず､透が雅迪を背負って帰ることに｡

日頃から色気よりも食い気が優先の塚田りな(萩谷うてな)｡そんなりながある日､悠司(布川隼汰)から大事な話があると言われる｡期待と不安を抱きながら放課後､りなは悠司がサッカーの練習をするグラウンドへと向かうが､悠司の大事な話とはりなにサッカー部の引退試合でゴールキーパーとして出てほしいという依頼だった!

都立高校の合格発表日を迎えた｡桜中学では､職員室で待つ金八(武田鉄矢)のもとに3年B組の生徒たちが続々と合否を知らせにやってくる｡合否結果を受け､3Bではアメリカへ留学予定の美香(草刈麻有)と､都立高校の二次試験を受験する剛史(岩方時郎)以外の生徒たちの進路が決まった｡

金八(武田鉄矢)が美香(草刈麻有)を自宅に泊めたという話が教師や生徒たちの間に広まった｡ウワサを嗅ぎつけた週刊誌の記者が桜中学に現れ｢このことを記事にする｣と宣告｡金八は自分の行為が軽率だったと反省する一方､ウワサが広まった原因が学校裏サイトで､3年B組の祐樹(植草裕太)がなんらかの形で関係しているかもしれないと知り､がくぜんとする｡

金八(武田鉄矢)が美香(草刈麻有)を自宅に泊めたという話が教師や生徒たちの間に広まった｡ウワサを嗅ぎつけた週刊誌の記者が桜中学に現れ｢このことを記事にする｣と宣告｡金八は自分の行為が軽率だったと反省する一方､ウワサが広まった原因が学校裏サイトで､3年B組の祐樹(植草裕太)がなんらかの形で関係しているかもしれないと知り､がくぜんとする｡

生徒たちの自分を思う気持ちに心を揺さぶられた金八(武田鉄矢)は､生徒と共に闘うことを決意｡3年B組の担任に戻してもらうことを学校側へ要求し､彼らと合流して体育館に立てこもった｡生徒たちが帰宅しないことを心配した親が続々と桜中学に押しかけてくる中､校長(浅野和之)は副校長(金田明夫)や他の教師たちに､バールで体育館の扉をこじ開け全員を引きずり出すよう命じるが､副校長ら職員室の面々は校長の命令に反対する｡