济公普度众生，以四海为家。济公欲登船却因满座被船夫阻止，猎户闻得济公赶往救人，遂让位给他；后来客船因事翻倒，猎户得以避过一劫，感激济公相救。屠青云背起假装不良于行的济公渡河后，始知被骗。青云到访净慈寺，又见济公突然搬走菩萨像，欲阻无从。周员外邀道士上门驱邪，济公接连闯入生事。商小勇闻见后打了济公一拳，济公随即吐血并扬言要报官；小勇无奈向济公叩头道歉。蛇妖迷惑周志魁，欲夺道士之性命，却被菩萨像镇压。

周府众人惊见道士痴痴呆呆，桌上更离奇出现菩萨像；周员外深信菩萨像有神力。庞森好心救起病卧街头的盲汉，获其传授面相学，后转行当相士。济公到周府取回菩萨像，收服蛇妖，并解救周志魁；周员外为表谢意，答应捐助净慈寺。商小勇被济公教训，心服口服欲拜他为师。小勇阻止李兄跳崖，答应为其取回灵符，刚巧目睹董昌杀害陈员外；小勇领官差逮捕董昌，却见陈员外平安归来。济公教训小勇勿乱出头，并送上灵符及神丹救助李氏夫妻。

庞森被指神棍，沮丧买醉。商小勇求拜济公为师，却被打发。屠青云不忍秦倩红折磨雀鸟，上前劝阻不果，竟答应接受胯下之辱换取雀鸟生命。屠彪与青云父子团聚，却见其包袱藏有僧袍，愤慨不已。青云摆档卖画，又被倩红强夺画作。秦霸天调戏良家妇女，小勇见状制止，二人大打出手。恶汉再访庞森，竟大赞其神机妙算，庞森重拾自信。庞森为陈员外物色吉地，迁葬其先父山坟，未料陈员外竟强抢百姓墓地。陈员外招惹鬼魂缠身，慌忙求助济公。

赌仔祥嗜赌成性，忽略妻儿，又为避债劫杀债主；赌仔祥与济公对赌，竟押上妻子、房子，甚至自己的性命，最终输清光。此时赌仔祥从睡梦中惊醒，立誓洗心革面，戒除赌瘾。庞森赠言陈先生是日不宜借钱后，却目击他遭其朋友杀害；庞森要求分赃，更在纠缠间杀死对方。济公本欲阻止庞森作孽，却被佛祖召见，领悟因果不能改的道理。春花知道秦倩红喜欢屠青云，请他重绘雀鸟画，怎料他赴约时却当面拒绝倩红；倩红遇上商小勇，掌掴他出气。

济公闯入万法寺捣乱，被戒律僧驱赶；济公设计令主持答应收留。屠青云在市集卖画，忽见秦倩红来找，竟匆匆收拾离开。为阻父亲杀生，青云竟偷偷放走猪只；猪只误闯万法寺遇见济公后，又被带回屠家。青云为养家并让父亲早日封刀，决定改行到万香楼工作。青云积极游说食客改吃斋菜，时遇秦霸天，却被故意留难，更强逼茶楼老板辞退青云；小勇见状力聘青云到府上当字画老师。庞森意外发现一处宝地，竟无视济公劝阻，一心将先父骨灰下葬。

庞森途经茶店被迷晕劫杀之际，一条树根从地上钻出将贼人杀死。庞森惊悉获神秘力量保护，遂遵从其指引去到同安镇。慧德、慧能不满济公屡犯寺规，要求主持处罚他不果，竟设局诬陷济公偷钱，怎料却自食其果。商小勇为讨秦倩红欢心，请屠青云代笔画其丹青。倩红识穿丹青是青云手笔，亲自上门力邀青云当字画老师，惟被拒。商小勇再求济公收他为徒，却被戏弄一番。庞森依神秘力量指示赠言青云，着其不可出家，否则会令父亲早逝。

流氓受聘殴打庞森，却反被击毙，秦霸天见状慌张而去。慧德、慧能心脏剧痛，遍寻医方未果；商小勇依济公之言向二人面授几句，即见二人不药而愈。商文玉被屠青云的琴音吸引，对他留下印象。董昌得庞森赠言若与有权势人士合作做生意，必如虎添翼；董昌遂游说侄儿秦霸天合作开赌档。青云被父亲催婚，大感烦恼。何贵赌债累累，欲上吊自尽。秦明镜闻悉有人在镇上开赌，领官兵查封赌档，始知老板是霸天及董昌；明镜见钱开眼，竟同流合污。

贵嫂被债主追债，幸得商小勇好心送钱周转。小勇上门求秦明镜下令禁赌，却未果。庞森半夜不自觉地走到魔树前，得其赋予神秘力量。秦倩红找庞森测姻缘，获赠言只要主动争取爱情，定可打动对方。倩红女扮男装偶遇屠青云，二人交谈甚欢，相约出外游玩。倩红得悉屠彪已为青云安排亲事，不禁愤然而去；青云追至却识穿倩红假扮男生。屠彪在赌档收获不少，董昌派手下夺回银両，却在纠缠间刺伤屠彪。青云出外寻找父亲，瞥见父亲重伤倒地……

商小勇追查杀害屠彪的真凶，遇见两名赌坊打手慌张逃去，遂制服二人并押往衙门；可惜秦明镜藉词证据不足，草草释放二人。屠青云茶饭不思，日夜颂经守护亡父尸体，终体力不支倒地，得秦倩红悉心照料；小勇看在眼里，感不是味儿。两名凶手被屠彪鬼魂缠绕，终不打自招；二人畏罪潜逃，竟遭怪树杀害。怪树着庞森收服屠彪鬼魂，以他日对付青云。屠彪鬼魂抵受不住庞森诱惑自投罗网，济公苦劝不果感灰心；庞森继而对付济公，却不敌。

秦霸天被商文玉的琴声吸引，竟攀上高墙窥探，不料失足跌倒；文玉闻声而至与霸天邂逅，二人互相欣赏。商万财替商小勇向秦倩红提亲，并欲将文玉许配霸天，获秦明镜首肯。倩红闻讯怒掴小勇。胡世伯为青云退婚之事状告他，明镜审理后竟判处青云终生不得娶妻。倩红一厢情愿求青云带她私奔，却遭拒爱；明镜率兵寻至，以诱骗良家妇女罪名逮捕青云，继而施以杖刑。青云负伤前往万法寺出家，途中被庞森用术谋害，幸得菩萨显灵，得以脱险。

屠青云决心出家，惟戒律僧认定青云一心避情，出言婉拒。戒律僧奉命到李员外府上，为疑似中邪的李凝香颂经消灾，未料竟意外看到凝香的肌肤。戒律僧颂经抑制色心不果，竟欲自毁双眼以免破戒，济公现身制止并指点一番。采花贼死性不改，欲再度奸污凝香，终被济公制服。主持被济公说服往见长跪佛门前的青云，终答应为他剃度。商小勇知道秦倩红不爱自己，竟想到假扮疯癫，成功取消婚约。倩红欣然到万法寺还神，遇见青云剃度，伤心晕倒。

屠青云为怕寺庙房间舒适影响修行，竟提出入住柴房。主持将万法寺交托戒律僧后，圆寂归去。商万财因担心商小勇而得病，小勇只好向父母交代诈疯原由。秦霸天为报复殴打小勇，小勇为免被拆穿真相只得吞声忍气。霸天设计令商文玉深信他是好人，并向文玉提亲；小勇苦心劝阻文玉，却未果。济公答应收小勇为徒，并带他往潮汕修行。霸天与文玉拜堂成亲；秦倩红惦挂青云上寺寻之，却被济公弄晕；青云安置倩红到柴房后，决心走入深山逃避她。

屠青云决心定居隐蔽山洞清修。秦倩红上山寻找青云，遇山贼抢劫，幸得商小勇相救。小勇求济公帮助倩红不果，竟胡乱指引寻找青云的方向。曹文龙在茶楼重遇小勇，二人聚旧一番；文龙明言将与李凝香成亲，却见周遭食客暗中嘲笑，大感奇怪。小勇忍无可忍抓住村民问话，惊悉凝香遇采花贼之事。文龙找李员外对质，誓言绝不迎娶失去清白之身的凝香。文龙借酒消愁，济公施术令文龙面部被烫伤，藉此教训他；文龙恍然大悟，与凝香和好如初。

庞森与屠彪鬼魂合计骗取村民财富，时撞见一名貌似屠彪的乞丐。庞森诱骗乞丐入山洞寻宝，乞丐一时激动引发心脏病，一命呜呼；庞森施法助屠彪借尸还魂。秦倩红不忍看见商文玉郁郁不欢，直闯妓院劝说秦霸天，却未果。董昌被债主告上公堂，师爷周明受贿帮助董昌；秦明镜是非不分，下令杖打债主。债主派人刺杀董昌，被其手下击杀；周明领官兵来至却又包庇董昌，招致民怨四起。明镜见董昌变本加厉，命周明及官差收押董昌，未料反被关押。

董昌察觉秦倩红与春花有异，派手下紧随左右；二人使计逃走，惟未能摆脱董昌，更遭强行带回秦家。商小勇上门探望商文玉，见倩红被软禁，欲硬闯之际，又被秦霸天阻拦。小勇夜闯秦府险被发现，幸获济公解围。曹文龙替岳父收取田租后，遭朋友嫁祸杀人；朋友更下药迷晕李凝香，欲行不轨。济公及时解救曹氏夫妇，将真凶绳之以法。万法寺派饭回馈百姓，劝村民勿再沉迷赌博。青云苦劝董昌不要逼良为娼，却被打至重伤，此时忽然地动山摇……

庞森完成招魂大法之际，竟被打坐颂经的屠青云无意中破坏。董昌为免生意再受影响，设计对付青云及商小勇；周明奉命禁制万法寺僧人擅离寺院。董昌贪图商文玉美色，趁霸天出门强闯文玉房间欲行不轨。秦倩红在婢女口中惊悉此事，假装自杀惊动各人，令董昌未能得逞；董昌愤然将倩红及春花押入监牢。董昌诬陷文玉勾引他，霸天闻言竟虐打文玉，并逐她出家门。小勇得济公暗中帮助，成功捉拿霸天、周明，救出秦明镜等人，只可惜被董昌逃脱。

秦明镜为整肃民风，亲领官差查封妓院及赌坊。屠彪奉命盗取尸体，助庞森修练招魂大法。商小勇闻得有人盗尸领人埋伏，却意外救出被掳的秦倩红。屠青云重遇屠彪，喜极上前亲近父亲之际，却见父亲剧痛难耐。屠彪方知被庞森所骗，却被控制挥刀袭击青云，青云不忍对付父亲。济公见状助屠彪解脱，屠彪安心投胎。庞森急需一具尸体完成招魂大法，时见董昌来至，狠心杀之，终助怪树寻回灵光。秦霸天诱骗商文玉把他释放，逃出后却遇上庞森。

商文玉因擅自放走秦霸天，向秦明镜请罪。秦倩红随文玉到万法寺祈福，竟重遇屠青云，方知他尚在人世；倩红坦言已明白不可强求的道理。霸天携董昌首级回见明镜，将功赎罪，并向父亲送上古玩致歉。明镜忽染怪病，求医无方；此时庞森上门治愈明镜，取得众人信任。青云得济公教化，法力渐渐提升。霸天于井水下毒，村民纷纷感染瘟疫，将曾作预言的庞森奉若神明。青云作法求得六月飞霜驱除瘟疫，挽救苍生；庞森将错就错，在百姓面前领功。

（大结局）庞森藉词祈求上天除去灾害，骗说百姓拜祭魔树，众人深信不疑。商小勇诈病求庞森医治，藉以当众指控他是江湖神棍，却未果。济公为救小勇，被庞森击中一掌。百姓拜祭魔树后，受心魔迷惑，肆意做出各种暴行。屠青云率众僧颂经点灯，设法消除百姓的心魔。小勇不敌修练邪术的秦霸天，身陷险境之际，商文玉扑上前阻挡终被霸天所杀。在济公教路之下，青云与小勇合力对抗庞森及霸天，最终击杀二人，并成功毁灭魔树……