Reese e la Macchina uniscono le loro forze per rintracciare Finch che è stato rapito dal misterioso Root.

Reese sta indagando su un vecchio caso e si avvicina sempre di più a Finch e al suo rapitore, Root.

Finch è di nuovo nella Biblioteca mentre Reese ritorna sul campo per affrontare il suo caso più difficile, proteggere la figlia di un diplomatico brasiliano.

Reese e Finch sono presi in un conflitto morale quando la Macchina tira fuori il nome di un mafioso che necessita protezione. Cosa fare? Agire secondo i loro parametri come fatto fin'ora o lasciare che il karma segua il suo corso facendo giustizia?

Reese si sta occupando della protezione di una giornalista, ma gli riesce difficile farlo senza suscitare la sua curiosità e diventare anche lui uno dei suoi reportage.

Reese sta lavorando sotto copertura in un quartiere apparentemente idilliaco per occuparsi dell'ultima persona indicata dalla Macchina.

Reese e Finch si occupano della protezione di un dirigente, che deve sottoporsi a una procedura chirurgica segreta, e della moglie del chirurgo in questione, entrambi in pericolo per via di un ex agente dell'MI6 e di un gruppo di ex agenti dell'SAS.

Il team stavolta avrà molto da fare visto che la Macchina ha indicato non una ma ben due persone, un uomo e sua moglie.

Finche e Reese sono messi a dura prova nel caso riguardante un tassista di New York, il cui assassino potrebbe essere chiunque dei suoi clienti.

L'ultimo caso di Reese si trasforma in una faccenda personale quando scopre che la persona che deve proteggere è la sorella di un soldato caduto sul campo di battaglia.

Mentre sta lavorando sotto copertura nel ruolo di insegnante supplente, Finch protegge un giovane genio che gli ricorda sè stesso. Carter è alle prese con un pericoloso incarico per l'FBI.

Carter è impegnato in una guerra di astuzia con l'FBI per far sì che Reese riesca ad evitare l'agente Donnelly. Reese intanto è alle prese con nemici vecchi e nuovi, mentre il detective Fusco è costretto a lavorare da solo mentre cerca di proteggere la top model Karolina Kurkova.

Reese viene rapito da una persona del suo passato che sta organizzando un massiccio e letale attacco nel cyber-spazio.

Finche Reese sono alle prese con un miliardario esperto di tecnologia che minaccia di esporre la loro operazione.

Reese e Finch stanno cercando di salvare la vita di una cameriera d'albergo, ma il numero di sospettati è davvero elevato. Carter intanto riceve un'offerta interessante dall'FBI.

Un'agente governativa che si occupa di neutralizzare minacce terroristiche prima che abbiano luogo si trova in fuga da un pericolo imminente e Reese e Finch decidono di aiutarla. Tuttavia l'impresa è più facile a dirsi che a farsi.

Finch e Reese sono con l'acqua alla gola perché stanno cercando di proteggere sei persone contemporaneamente. Le indagini li portano in una città costiera e durante una tempesta i due sono costretti a rifugiarsi nella stazione di polizia locale con un gruppo di cittadini, con la consapevolezza che tra di loro si nasconde un assassino.

Finch e Reese si recano ad Atlantic City per indagare sulla vita dell'ultima Persona indicata dalla Macchina, un anziano scommettitore la cui vita però sembra assolutamente ordinaria. A New York Carter sta portando avanti una battaglia per smacchiare la reputazione di un collega, ma la sua ricerca la porta pericolosamente vicino al dipartimento delle Risorse Umane.

La Macchina indica una dei principali leader nel settore tecnologico e quando Finch s'infiltra nella sua compagnia per raccogliere informazioni non riesce a determinare se la donna sta lavorando per il successo della società o se intende distruggerla dall'interno. Carter continua a sospettare dell'integrità del Detective Beecher, specialmente dopo che quest'ultimo procura delle prove incriminanti su un collega.

Reese e Carter sono in lotta contro il tempo per salvare la vita di un luminare della medicina che è stato avvelenato con una sostanza che agisce lentamente ma porta a morte certa. Carter intanto decide di prendere in mano la situazione con l'IAB quando Fusco viene accusato dell'uccisione di Stills.

Reese e Finch scoprono che la Macchina è affetta da un virus che ha compromesso la sua capacità di individuare i prossimi obiettivi. Mentre cercano di trovare una soluzione, sono allo stesso tempo a lavoro per rintracciare un ricco genio della tecnologia che ha fama di essere un eremita. Carter è determinata a mettere le mani sull'assassino di Cal Beecher ma l'organizzazione criminale dell'HR sta seguendo ogni sua mossa.

La Macchina è offline e non può fornire informazioni di nessun genre, Finch e Reese devono chiedere aiuto ad alleati inaspettati per risolvere la situazione.

Reese e Finch, con l'aiuto di Shaw, Fusco e Carter, si rimettono al lavoro e cercano di salvare un marinaio coinvolto in un traffico illegale di diamanti grezzi. Nel frattempo Root e' alle prese con lo psichiatra che la cura, alla quale fa una rivelazione a dir poco terrificante.

Wayne Kruger è il fondatore di una società specializzata nel trovare le persone e, spesso, utilizza la sua posizione per vendere al miglior offerente i dati personali delle persone che ha ricercato, creandosi molte inimicizie. Reese, Finch e Shaw dovranno impedire che Kruger venga ucciso.

La squadra al completo, con l'aiuto di Zoe, deve salvare il signor Murphy, un conquistatore di donne. Nel frattempo Root riesce a scappare dall'ospedale in cui Finch l'aveva fatta rinchiudere.

Vanessa, ex procuratore, viene accusata dell'omicidio del marito, un avvocato legato alla malavita. La donna fugge dalla centrale di polizia dov'era stata portata dopo l'arresto. Finch e Reese sanno che il numero uscito appartiene a Vanessa, ma non sanno se la donna possa essere una vittima o una minaccia.

Questa volta il numero uscito appartiene ad una bambina immigrata di nome Gen, appassionata di spionaggio. La curiosità la porta a registrare conversazioni pericolose tra la HR e i Russi per l'immissione sul mercato di una nuova droga sintetica, nota come "i sali da bagno" o "droga dei cannibali". Nel frattempo Laskey decide di eliminare Carter e le tende una trappola.

Root preleva Shaw dal suo appartamento e la convince ad affiancarla in una missione guidata, a suo dire, dalla Macchina. Mentre Reese si occupa della scomparsa di Shaw, Finch cerca di capire cosa minacci Sloan, un detective immobiliare che indaga sulla morte del fratello adottivo Jason. Le due storie finiranno per incrociarsi.

Il numero uscito dalla Macchina appartiene ad Hayden, un ipnoterapeuta specializzato nella truffa. La squadra cercherà di salvare Hayden, ma la situazione si farà sempre più drammatica.

Carter continua la sua battaglia solitaria contro la HR, raccogliendo molte prove e tentando di scatenare una guerra tra la HR e la banda dei Russi allo scopo di ottenere qualche prova rilevante. Reese e Finch insistono nel volerla aiutare, ma e' una partita che Carter sente di dover giocare da sola.

Carter e Reese devono riuscire a portare Quinn nella sede dell'FBI a Federal Plaza, ma la HR ha messo sulle loro tracce tutti i suoi uomini. Nel frattempo Fusco finisce nelle mani di Simmons.

Dopo la morte di Carter si scatena la caccia a Simmons. Reese, nonostante sia in gravi condizioni, lascia il letto d'ospedale e segue le tracce che portano a Quinn, l'unico che sa dove trovare Simmons. Finch a sua volta vuole trovare l'amico per impedirgli di commettere un omicidio e decide di ricorrere all'aiuto di Root.

Mentre Reese cerca conforto nei luoghi frequentati una volta dal padre, Fusco cerca di convincerlo a tornare. Shaw e Finch, invece, devono occuparsi di Claypool, un ex compagno di università di Finch, genio dell'informatica. Claypool è minacciato sia da Collier che dall'organizzazione per la quale lavorava un tempo Shaw.

Root riesce a liberare Finch e Shaw, ma poi cade nelle mani di Diane. Finch, Claypool e Shaw vanno in una banca per recuperare i drive del Samaritan, ma finiscono tra due fuochi, da una parte Hersh con i suoi uomini, dall'altra gli attivisti guidati da Collier.

Reese viene coinvolto direttamente dalla Macchina nel salvataggio di un insospettabile genio del crimine, creatore di un mercato di stupefacenti online. La Sfinge, cosi' viene chiamato, si trova a bordo di un volo per Roma, insieme a diversi personaggi che lo vogliono morto.

L'agente Bouchard dell'Interpol da tempo da' la caccia a una ladra di opere d'arte e oggetti antichi, una certa Kelly Lin. Finch, Reese e Fusco scoprono che Kelly è una ex ginnasta cinese collegata ad banda di estorsori cechi.

Finch, nel ruolo di operatore del 911, segue da vicino Sandra, il numero di cui la squadra si sta occupando. La donna è impiegata alla centrale operativa e assiste in diretta telefonica al rapimento di un bambino. Fusco nel frattempo aiuta una recluta in un caso di omicidio.

L'episodio si svolge nel 2010: a quel tempo Finch aveva come socio il signor Dillinger e Reese era ancora un agente della CIA. Il numero uscito è quello di Daniel Casey, un giovane informatico incaricato dal governo di verificare se la Macchina ideata da Finch e Ingram sia vulnerabile. A dare la caccia a Casey sono in molti, tra cui anche il nostro Reese.

Decima vuole recuperare un chip in grado di rendere operativo Samaritan, ma Root fa di tutto perchè questo non accada. Anche Reese, Shaw e Finch vengono coinvolti.

Maria è una dipendente di un società energetica privata che esporta infrastrutture in Medio Oriente. Il suo obiettivo è quello di far uscire di prigione Omar, il suo fidanzato iracheno accusato di terrorismo.

Reese e Shaw vanno fuori città per proteggere un nuovo numero: un avvocato minacciato dai suoi vecchi compagni di scuola. Nel frattempo Finch e Fusco vanno a Washington per recuperare dei documenti sequestrati dai federali.

Finch riceve il numero di un deputato del Congresso, Roger McCourt, che apparentemente sembra minacciato dagli uomini di Decima. Nel frattempo Greer prende contatti con Garrison e lo convince a collaborare.

Finch è sparito, Reese, Shaw e Root sono braccati dagli "occhi" di Samaritan, ma la Macchina invia loro un numero: è quello di Grace.

Finch è nelle mani di Greer con il quale scambia opinioni riguardo alla Macchina. Nel frattempo Garrison cerca di convincere il governo ad acquistare Samaritan.

In questo finale delle terza stagione: Collier ha intenzione di processare le cinque persone che ha sequestrato, tra le quali c'è Finch. Reese e Hersh cercano di scoprire dove si sta svolgendo il processo, mentre Root e Shaw tentano di sabotare Samaritan.

Samaritan e' entrata in funzione e i protagonisti della serie sono costretti a nascondersi dietro false identita' per non venir rintracciati dai loro nemici. Finch si e' arreso e ha deciso di mantenere un basso profilo per non destare sospetti ma Root, in contatto con la Macchina, rintraccia i vari componenti del gruppo decisa a farli tornare in azione.

Reese riceve il numero di una studentessa, Claire, che e' impegnata in un pericoloso gioco ideato da Samaritan per reclutare adepti. Reese, Shaw e Root riescono a convincere Finch di dar loro una mano e scoprono che il creatore della Macchina aveva gia' deciso di ributtarsi nella mischia.

Reese riesce ad entrare nelle grazie del nuovo capitano Moreno risolvendo tre casi in un giorno. Fusco si occupa dell'ultimo numero che corrisponde ad Andre, uno specialista dell'abbordaggio. Root coinvolge Finch nella vendita illegale di un lanciarazzi con lo scopo di racimolare soldi per finanziare l'attivita' della squadra.

Due bambini del ghetto si appropriano di una borsa piena di denaro, destinato ad un acquisto di droga. La Fratellanza gli da' la caccia, ma Reese, Shaw e Fusco riescono a fare in modo che i due bambini possano ricominciare una vita normale.

Il nuovo numero arrivato corrisponde a Simon Lee, sondaggista del governatore Murray, nelle elezioni che si stanno per svolgere. Simon, in realtà, è la vittima designata di Samaritan che vuole che diventi governatore Dawson, il vice della rivale di Murray, Michelle Perez. La squadra interviene e in qualche modo riesce a rimettere le cose a posto.

Il nuovo numero da salvare è Walter Dang, un anonimo impiegato che si finge detective per scoprire chi ha ucciso il fratello di una sua collega della quale è innamorato. Questo scatena una guerra tra Elias e la banda di Dominic. Nel frattempo, Finch è a Honk Kong alle prese con Elisabeth Bridges, un operativo di Samaritan.

Shaw si unisce a un team di ladri internazionali per tenere d'occhio l'ultima persona di cui si stanno occupando ma un imprevisto la mette in pericolo e rischia di essere rintracciata dal Samaritan.

Reese si offre volontario come istruttore all'accademia di polizia di New York per controllare una giovane recluta le cui azioni suscitano sospetti. Martine intanto, è sulle tracce di uno dei membri del team grazie alle informazioni ricevute da Samaritan.

Reese sta cercando di salvare Elias dalla Brotherhood, ma non riesce ad avere aiuto né da Root né da Shaw, visto che la copertura di quest'ultima è saltata e Root sta cercando di far perdere le sue tracce.

Samaritan dimostra il suo vero potere quando prende controllo della città di New York in 48 ore, cancellando ogni crimine dalla Grande Mela con l'intento di attirare la Macchina allo scoperto.

Samaritan lancia un cyber attacco al mercato azionario, costringendo il team a una missione suicida per fermare un disastro economico di proporzioni mondiali.

Control è nuovamente in gioco e comincia a dubitare dei metodi e delle intenzioni di Samaritan. Inoltre i media riportano una serie di reportage su una coppia di vigilantes che sta impazzando nel nord-est del Paese.

La caccia a Shaw e Root porta Reese in una piccola città dello stato di New York dove non tutto è così idilliaco come sembra. Fusco lavora insieme a una vecchia conoscenza.

Mentre si trova a far parte di una giuria in un caso di omicidio, Finch comincia a sospettare di un altro giurato. Reese decide di rivolgersi a un terapeuta.

Reese cerca di proteggere una programmatrice con una misteriosa seconda vita, ma non è chiaro quale delle sue due vite parallele stia arrivando la minaccia. Intanto Finch viene contattato da una giovane hacker di nome Claire.

Reese e Finch stanno proteggendo un'artista della truffa il cui ultimo piano per derubare un carico di contanti è fallito.

Finch e Reese cercano di proteggere uno psicologo i cui metodi poco ortodossi potrebbero costargli la vita. In un flashback vediamo Finch nei giorni successivi alla morte del suo caro amico Nathan Ingram.

Reese sta proteggendo una cacciatrice di taglie che non intende sospendere la sua caccia per una banale minaccia alla sua vita. Finch cerca di avviare il piano che ha messo a punto in Shanghai.

Reese e Finch tentano di salvare un CEO preso di mira da un hacker che ha esposto tutti i suoi segreti, rovinandogli la vita.

Reese cerca di onorare la memoria di Carter risolvendo un vecchio caso che lei non riuscì a chiudere.

Reese e Fusco rimangono invischiati nella guerra tra Elias e Dominic, mentre Finch e Root stanno seguendo una pista per rintracciare Shaw.

Finche e Root sono in gara contro il tempo per salvare la Macchina che è stata localizzata dall'altra Intelligenza Artificiale che vuole la loro distruzione.

Lionel è indagato in relazione alla morte di Dominic. Reese e Finch cercano di salvare il codice sorgente della macchina; Root deve salvarsi dagli agenti di Samaritan.

Root e Finch sono al lavoro per riportare online il rifugio di Northern Lights, la Macchina dopo essere ritornata operativa taglia fuori Finch e Root considerandoli una minaccia.

La copertura di Reese potrebbe saltare quando si rende conto che l’ultimo nominativo fornito dalla Macchina ha dei legami con Kara Stanton, la sua ex collega della CIA.

Shaw subisce un intervento chirurgico da parte dei suoi rapitori di Samaritan, ma appena può coglie l’occasione per fuggire e riunirsi ai suoi amici ma ben presto scopre che in realtà è ancora prigioniera ed è sottoposta a una serie di simulazioni mentali da parte di Samaritan.

Reese protegge un’analista della polizia di New York, nel mirino di Samaritan. Nel frattempo, Fusco viene avvicinato da Bruce Moran, socio e amico d'infanzia di Elias che vuole sapere chi ha ucciso il suo partner.

La Macchina invia Reese e Finch a un matrimonio per proteggere due persone di interesse il giorno del loro matrimonio. Intanto Fusco si arrabbia per essere stato tenuto all'oscuro dalla squadra e comincia a indagare su alcune persone scomparse.

Root va sotto copertura per proteggere il conduttore di un programma radiofonico, teorico della cospirazione, minacciato dagli agenti di Samaritan. Per Shaw è sempre più difficile distinguere la realtà dalle simulazioni a cui la sottopone Samaritan.

Reese e Finch sono intrappolati in un ospedale che diventa il focolaio di un’epidemia virale mortale. Nel frattempo, una nuova recluta di Samaritan ha un ripensamento mentre Shaw continua a lottare con la realtà.

La misteriosa mente criminale conosciuta come "The Voice" ritorna e intrappola Reese e Fusco contro numerosi nemici e alcune persone di interesse. Nel frattempo Root fa una scoperta sconvolgente.

La Macchina da' come persona d’interesse il numero di Finch quando un errore fatale fa saltare la sua identità dando il via a una micidiale escalation di scontri con agenti di Samaritan.

La squadra è immischiata in una cospirazione quando il presidente degli Stati Uniti diventa per la Macchina una persona di interesse. Finch contempla l'adozione di misure drastiche per combattere Samaritan.

Mentre Reese e Shaw provano a stare al passo di Finch questi si infiltra in una struttura governativa di massima sicurezza e da il via a una missione disperata che potrebbe significare la fine non solo per Samaritan ma per la Macchina e lo stesso Finch.

Finch, Reese, Fusco e Shaw si imbarcano in una ultima definitiva missione per impedire che Samaritan distrugga la Macchina e prenda definitivamente il controllo dell’intero genere umano.