I ragazzi in un mercatino trovano un anello che sembra provenire dal set de "Il signore degli Anelli" e che è causa dell'ennesima discussione.

Sheldon ed Amy decidono di dar vita a molte voci su di loro come test. Intanto Howard fa un ulteriore passo avanti nella sua relazione con Bernadette.

Raj spera di curare la sua incapacità di parlare alle donne. Intanto Penny recluta Bernadette per spiare Leonard e Priya.

La signora Wolowitz finisce in ospedale dopo l'annuncio di Howard del suo fidanzamento con Bernadette. Mentre si trovano lì, Leonard non è contento dell'intesa tra Penny e Priya.

Il gruppo deve affrontare le conseguenze del finale della stagione precedente. Penny teme di aver rovinato tutto con i suoi amici; intanto Sheldon prende il comando della squadra di paintball.

Un litigio tra Penny e Sheldon fa sì che Amy si ritrovi nel mezzo. Intanto Leonard cerca di movimentare la sua relazione a distanza con Priya.

La madre di Sheldon arriva in visita in città ma Sheldon è sorpreso e dispiaciuto che sua madre non è più quella di prima.

Amy si sente tradita quando scopre che Penny e Bernadette sono andate a fare shopping senza di lei.

Leonard e Penny scrivono una lista di difetti della loro relazione con l'intento di fortificarla. Sheldon e Amy creano una web series su Youtube chiamata Fun with Flags e Raj sviluppa un'ossessione per Siri sul suo iPhone.

Leonard non ce la fa' più a sopportare l'egoismo di Sheldon e decide di dissolvere il contratto tra loro due. Howard vorrebbe avere un soprannome fico per quando diventerà astronauta.

Durante l’addio al celibato di Howard vengono rivelati episodi "piccanti" della sua vita che fanno infuriare Bernadette.

Bernadette decide di voler sposare Howard a tutti i costi prima della sua missione nello spazio.

Sheldon ed Amy festeggiano il loro bi-anniversario, ma il protagonista farà arrabbiare Amy invitando Raj, alle prese con un brutto problema di solitudine. Leonard e Penny decideranno di passare del tempo insieme, con il primo disposto a trascorrere una serata birra e football pur di parlare con la seconda della loro relazione; le cose saranno però rovinate da Raj, che dopo aver lasciato Sheldon e Amy piomberà nell’appartamento e tenterà di costringere Penny a rivelare i veri sentimenti per Leonard. Anche dallo spazio, infine, Howard sarà costretto a sentire le discussioni tra sua madre e Bernadette.

I ragazzi celebrano Halloween nel negozio di fumetti di Stuart, mentre Leonard seduce Penny con la scienza. Howard è accusato da tutti di cogliere qualsiasi occasione per parlare della sua esperienza nello spazio.

Wolowitz è alle prese con il trasloco dalla casa di sua madre a quella che ha preso con sua moglie Bernadette: ad aiutarlo ci saranno Leonard e Raj. Wil Wheaton ritorna nel ruolo di se stesso, quando Sheldon lo invita ad uno speciale di Sheldon Cooper Presents: Fun With Flags (lo show che Sheldon e Amy diffondono su YouTube per insegnare vessilologia, lo studio delle bandiere) dedicato a Star Trek. Il personaggio di Jim Parsons si ritroverà però intrappolato in una discussione tra il suo amico/nemico e la sua fidanzata Amy, che non si piacciono e non fanno nulla per nasconderlo.

Quando Howard si comprerà un’auto, l’università riassegnerà il posto del parcheggio di Sheldon a Wolowitz, il litigio tra i due influisce su tutti [incluse Bernadette e Amy] e Sheldon non esiterà a passare alle maniere forti: come si concluderà l’escalation di dispetti?

Leonard organizza una serata "dungeons & dragons" a tema natalizio a cui partecipano tutti i ragazzi del gruppo. Penny, Bernadette ed Amy, arrabbiate per essere state lasciate sole, escono per una serata "solo ragazze" dove con scarso successo tentano di trovare una ragazza per Raj.

Alex chiede a Leonard di uscire una sera a cena, la cosa provoca grande entusiasmo a Leonard, rabbia e insicurezza a Penny e totale confusione a Sheldon.

Sheldon è costretto a lavorare con Barry Kripke e arriva a mettere in dubbio le sue capacità. Nel frattempo, Howard (Kunal Nayyar) e Raj (Simon Helberg) spendono mille dollari per una serie di action figures che li ritraggono.

Quando Sheldon e Leonard litigano, la cosa sconvolgerà le vite di Penny ed Amy. A causa dell’assenza di Howard, Raj è invece costretto a prendersi cura di Mrs. Wolowitz; nell’episodio, in onda stasera, ritroveremo anche Margo Harshman nel ruolo di Alex, assistente di Sheldon vista l’ultima volta qualche episodio fa.

Leonard, Howard e Sheldon sono obbligati dall'università a promuovere le scienze nelle scuole medie mentre le ragazze saltano il lavoro per passare la giornata a Disneyland. Raj ha invece il primo appuntamento con Lucy, la ragazza conosciuta in fumetteria.

Leonard, Sheldon e Raj lottano per un posto accademico all'università e lo scontro si fa ancora più duro quando vengono coinvolte anche le ragazze.

L’amicizia tra Leonard e Sheldon viene messa alla prova e la relazione di Wolowitz con sua madre minaccia la mascolinità del giovane.

Alla Cheesecake Factory i protagonisti parlano delle cene con delitto e decidono di organizzare una caccia al tesoro. Le coppie verranno “scoppiate” e le squadre saranno formate dalla sorte dopo aver estratto i nomi da un cappello, ecco gli accoppiamenti: Sheldon e Penny, Howard e Amy, Leonard e Bernadette. A organizzare la caccia al tesoro ci pensa Raj e il tesoro è una moneta. Penny e Sheldon iniziano dal loro appartamento, il negozio di fumetti, la lavanderie, il laboratorio di geologia e finiscono nell’appartamento 4A.

Sheldon fa una scoperta eccezionale, ma la sua eccitazione dura pochissimo perché scopre di aver commesso un errore. Dopo che Howard scrive una canzone per celebrare l'anniversario del primo incontro con Bernadette, Penny pensa a un gesto romantico per Leonard. Per mettere in atto il suo piano romantico, Penny chiede aiuto a Raj. Sheldon dà la colpa a Amy del suo errore e le chiede di baciarla, ma è solo un sogno!

Sheldon protesta quando il gruppo lo trascina a festeggiare la festa del Ringraziamento a casa della signora Wolowitz. Nel frattempo, Pennye e Leonard devono fare i conti con un errore commesso dalla ragazza nel passato. Oltre alla signora Wolfowitz (la voce di Carol Ann Susi), a casa ci sarà anche il padre di Bernadette (Casey Sander).

Will Wheaton aiuta Sheldon a fare i conti con il suo nuovo status da star, Leonard smonta la teoria dimostrata da Sheldon. Leonard e Amy aiutano Sheldon a fare i conti con l’umiliazione che prova dopo aver fallito a contribuire alla storia della scienza. Raj , intanto, deve passare una settimana a casa di Howard e Bernardette. Raj finirà nei guai per qualche consiglio di troppo.

Mentre Sheldon è in Texas per le feste di Natale, perché la sorella Missy è appena diventata mamma, tutti quanti si ritrovano a casa di Leonard per addobbare l’albero di Natale e si rendono conto di quanto sono cambiate le loro vite grazie a Sheldon. Bernardette realizza che non avrebbe mai incontrato Howard se non fosse stato per lui, Howard e Raj pensano che sarebbero diventati grassi. Mentre Penny starebbe ancora insieme a Stuart. Amy divide un cupcake con Stuart è Leonard tenta di approcciare Penny al Cheesecake Factory.

Sheldon tenta ti rilassarsi visto che è in vacanza. Nel frattempo, dopo aver chiarito il malinteso creato dall'impulsiva proposta di matrimonio, Penny informa Leonard di essersi licenziata dal suo lavoro di cameriera per perseguire a tempo pieno la sua carriera da attrice. Bernadette chiede aiuto a Stuart per cambiare un fumetto di Howard. Josh Peck interpreta Jesse un rivale di Stuart.

Non essendo riuscito ad aggiudicarsi i biglietti per il comic-con e rifiutandosi di acquistarli dai bagarini, Sheldon decide di dare vita ad una propria convention.

Bernadette convince Howard a migliorare i suoi rapporti con Sheldon così Howard lo invita alla Nasa ad assistere ad una conferenza a cui e' stato invitato.

Mentre Sheldon non riesce a decidere se comprare la PS4 o l'XBOX ONE, Penny si rivolge a Wil Wheaton per un consiglio professionale.

Dopo aver ripristinato l'usanza del "giovedì del tutto può accadere", Sheldon e Penny scoprono che Amy e Bernadette hanno detto loro delle bugie per poter uscire da sole.

In questo finale della settima stagione: L'università non vuole che abbandoni la teoria delle stringhe, Leonard progetta di andare a vivere con Penny. Il negozio di fumetti ha preso fuoco: è troppo per Sheldon, che opta per una soluzione radicale.

Penny e Bernadette entrano in conflitto dato che la prima non mostra particolare interesse per lo studio dei materiali che la seconda le ha fornito per il suo nuovo lavoro e quest'ultima è fin troppo assillante. Amy allora, per sentirsi al centro dell'attenzione, prende le parti di ciascuna all'oscuro dell'altra; alla fine però le due si riconciliano e studiano insieme. Nel frattempo la signora Davis informa Sheldon che l'università ha deciso di consentirgli di passare dallo studio della teoria delle stringhe a quello della materia oscura a patto che accetti la promozione a professore associato: il fisico accetta, ma a causa della sua fama nessuno si iscrive al suo corso; Howard, allora, intenzionato a prendere il dottorato come tutti i suoi amici, si candida come alunno, ma Sheldon, ritenendolo non all'altezza, lo sottopone a prove molto dure. I due si comportano male a vicenda fino a che Howard tira una pallina di carta nella bocca di Sheldon, che lo denuncia alle risorse umane, provocando la rinuncia al corso del suo unico studente.

Bernadette racconta alle amiche che una rivista vuole fare un articolo sulle 50 scienziate più sexy della California e la vorrebbe tra le protagoniste, provocando il disappunto di Amy che reputa la cosa sbagliata in quanto dovrebbero essere giudicate solo per il proprio lavoro. Quando però a causa di una lettera di Amy l'articolo viene annullato, lei litiga con la sua amica scienziata che la accusa di aver fatto tutto questo per gelosia. Nel frattempo Sheldon incontra nel condominio il dottor Oliver Lorvis, un medico cliente di Penny, mentre sta portando alla ragazza dei fiori, ingannato dalle sue carinerie a scopo di vendita. Sconvolto dalla notizia viene invitato nella casa dei ragazzi, i quali fanno amicizia con lui scoprendo così che è un medico di celebrità, lavoro che nel corso degli anni gli ha permesso di accumulare molti cimeli relativi a film e serie TV. I quattro vengono invitati nel seminterrato del dottore per vederli e rimangono estasiati da tutto ciò, ma il dottor Oliver, interpretando male le parole di Sheldon, rinchiude i quattro per tornare a casa di Penny, anche se poi finisce per concentrarsi su Amy quando si mostra gentile con lui, rivelandosi come una persona che assilla qualsiasi ragazza si comporti nello stesso modo con lui.

Leonard e Sheldon vengono convinti da Penny ed Amy a fare qualcosa che piaccia alle ragazze e i quattro vanno a fare shopping. Mentre le due si provano dei vestiti, i due scienziati hanno una discussione sui compromessi che hanno dovuto fare e decidono che Leonard potrà dormire una notte la settimana a casa della fidanzata, salvo ritrovarsi Sheldon, incapace di vivere senza l'amico, sul divano di Penny. Nel frattempo Raj è molto teso perché la sonda che inviò assieme ad una squadra su Plutone nove anni prima sta per giungere a destinazione; Howard, per confortarlo, si offre di accompagnarlo al tempio induista, dove il ragazzo indiano sfoga la sua frustrazione su un anziano che colpisce con lo sportello la sua auto, ma il messaggio che la sonda si è riattivata lo fa tornare alla consueta calma.

Sheldon non riesce a fare progressi riguardo alla ricerca sulla materia oscura e arriva alla conclusione che probabilmente riuscirebbe a raggiungere risultati migliori se fosse sotto tensione: decide quindi di sottoporsi a stimoli negativi che incrementino l'ansia, ma ciò non fa altro che rendere la vita impossibile a chi gli sta intorno. Alla fine Penny e Leonard lo costringono a dormire contro la sua volontà facendolo stendere sul letto e cantandogli "Soffice Kitty". Intanto Howard ha creato un gioco, chiamato "Emily o Cannella", in cui i partecipanti devono indovinare quali frasi di Raj sono indirizzate alla fidanzata e quali alla cagnolina, solo per mettere in evidenza il fatto che lui spesso tratta Cannella come se fosse un essere umano a causa del suo eccessivo affetto nei suoi confronti; Emily, tuttavia, afferma di non sentirsi a disagio a causa di questo, ma anzi trova attraente il fatto che Raj sia così apprensivo nei riguardi della cagnolina, salvo trovarsi dei peli di cane in bocca quando lo bacia.

Durante una cena con Penny, Leonard ha un'intuizione riguardo ai superfluidi e assieme a Sheldon elabora una teoria che i due decidono di pubblicare in un forum che si occupa di teorie non ancora pubblicate: la maggior parte dei commenti è entusiasta, ma un account anonimo li sbeffeggia apertamente. Leonard e Sheldon, assieme a Raj e Howard, scoprono che il loro denigratore è Stephen Hawking, che dice loro di essere anch'egli impressionato dal loro risultato e di averli solo voluti prendere in giro per noia. Penny, Bernadette e Amy, intanto, passano la serata a prendersi in giro rivangando nel loro passato: prima vedono il film sul gorilla assassino cui ha partecipato Penny, poi il concorso di bellezza cui prese parte Bernadette e infine la fanfiction su La casa nella prateria che Amy ha scritto e pubblicato su un forum, che tuttavia alla fine le appassiona.

Amy parla ai ragazzi di un esperimento che ha letto, secondo il quale due persone possono innamorarsi rispondendo a varie domande personali e fissandosi negli occhi per quattro minuti consecutivi. Penny e Sheldon decidono di tentare: lei gli confida di come invidi la loro intelligenza, mentre lui di come vorrebbe riuscire a interpretare meglio le emozioni umane; le rivela inoltre che è il giorno del suo compleanno e di non averlo detto mai a nessuno perché odia le feste a sorpresa. L'esperimento non li fa innamorare ma cementa notevolmente la loro amicizia. Amy, Leonard, Raj e Emily partecipano nel frattempo ad una sorta di teatro interattivo nel quale devono risolvere degli enigmi realizzati da uno scienziato travestito da zombie, venendone a capo in soli sei minuti. Bernadette e Howard intanto si trovano all'aeroporto di ritorno dal funerale, in attesa di recuperare il bagaglio con le ceneri della madre che è stato accidentalmente smarrito. Howard si sente in colpa per non aver accompagnato la madre all'aeroporto quando glielo chiese; quando la valigia viene ritrovata, Howard promette alla madre che terrà l'urna sempre al suo fianco. La puntata si conclude con Sheldon che rientra a casa e trova i ragazzi che gli hanno preparato una festa a sorpresa.

Leonard decide di trasferirsi da Penny per iniziare così a vivere insieme, suscitando in Sheldon una forte sindrome da abbandono, tanto da eliminare tutto quello che è stato portato nell'appartamento dopo il 2003, anno del trasferimento di Leonard. Dopo dei tentativi mal riusciti di cercare un nuovo coinquilino, alla fine, su invito della ragazza, Leonard torna nella vecchia stanza, decidendo di dormire solo ogni tanto a casa di Penny. Nel frattempo Stuart vorrebbe tenere un evento musicale nel negozio di fumetti per attirare più clienti e Raj ed Howard si offrono di cantare un genere folk ma con argomenti che si rifanno alle loro passioni e scrivono quindi una canzone su una lotta tra Thor e Indiana Jones.

i decidono di fare dello sport e di entrare nel circolo di scherma universitario di Kripke, che, una volta saputo che Sheldon ed Amy si sono lasciati, le chiede di uscire. Nel frattempo le ragazze vanno al negozio di fumetti per aiutare Stuart, che vorrebbe aumentare la clientela femminile. Di ritorno dalla lezione di scherma Sheldon ed Amy si incontrano per le scale e parlano del fatto che Kripke abbia chiesto alla ragazza di uscire e il fisico confessa ad Amy che ha chiesto ad altre ragazze di uscire perché ciò lo potrebbe aiutare a "passare oltre", notizia che turba molto la neuroscienziata.

Incuriosite da Dave, l'uomo con cui sta uscendo Amy, Bernadette convince Penny, che la raggiunge assieme a Leonard, a seguire di nascosto l'amica; la serata tuttavia si conclude con un fiasco, perché Dave, dopo aver scoperto che la ragazza stava con Sheldon, passa tutto il tempo a parlare e chiedere di quest'ultimo essendone un grande ammiratore. Nel frattempo Sheldon chiede aiuto a Raj ed Howard per trovare una nuova compagna, visto che gli avevano già trovato Amy: i tre elaborano quindi una serie di indovinelli che lasciano su un sito web apposito, in modo che la "candidata" possa dimostrare la sua intelligenza. Poco dopo la fine del tempo massimo si presenta a casa di Sheldon una splendida ragazza, Vanessa, esperta di tutto quello che piace al fisico, che tuttavia la scarta perché in ritardo.

Mentre lavora con Leonard, Sheldon comincia a canticchiare un motivetto, ma non riesce a ricordarsi la canzone in questione, temendo di stare per diventare pazzo; Amy, intanto, invita Dave a cena a casa sua, nonostante il loro precedente appuntamento sia andato male, perché abbattuta dopo il rifiuto del suo ex di tornare insieme. Sheldon riesce infine a ricordarsi della canzone, Darlin' dei Beach Boys, e capisce che non riusciva a togliersela dalla testa perché gli ricorda Amy: il fisico si precipita quindi a casa sua, le dichiara il suo amore e le dà un lungo bacio. Nel frattempo Raj e Howard scoprono che un ragazzo è un fan della loro band dopo che li ha visti esibirsi al negozio di fumetti. Dopo aver seguito on line le mosse del ragazzo, Trent, i due decidono di andare a trovare il loro fan, ma scappano a gambe levate quando scoprono che si infila le dita nel naso e mangia le sue caccole.

Manca poco alla prima del nuovo film di Star Wars e i ragazzi hanno già preso i biglietti da tempo, però la data coincide col compleanno di Amy e Sheldon non sa che fare; gli appare allora in sogno Arthur Jeffries, che gli fa capire come la cosa giusta sia stare con la sua ragazza, a cui decide di regalare una maggior intimità: i due finiranno quindi per avere un rapporto sessuale per la prima volta. Nel frattempo Leonard, Howard e Raj danno il biglietto del loro amico a Wil Wheaton, che si presenta vestito da Spock per far loro capire che alla fine è solo un film e, indipendentemente dalla sua qualità, le loro vite andranno avanti lo stesso.

Sheldon è stato male per via di un'influenza ed ha trattato tutti gli amici peggio del solito; gli altri ragazzi decidono quindi di organizzare un week end a Las Vegas senza di lui, che, una volta saputa la notizia, si offende molto. Amy, però, riesce a fargli capire quanto si sia comportato male con i suoi amici, che non volevano far altro che aiutarlo, e lui decide quindi di scusarsi con tutti in maniera sincera per riuscire così a partire con loro. Nello scusarsi, però, offende ancor di più Emily dicendo che in quanto dermatologa non è un vero medico; Raj, presente alla loro discussione, non prende le parti della ragazza, che se ne va arrabbiata dalla casa del giovane indiano. Alla fine però Sheldon riesce a far capire ad Emily che, per quanto possa risultare offensivo, lui non offende mai nessuno consapevolmente e, una volta ristabilita la pace nel gruppo, i ragazzi partono tutti insieme per Las Vegas.

Bernadette rivela ad Howard di essere incinta e questi, nonostante la gioia iniziale, viene assalito dai dubbi su come fare ad essere un buon padre. Il gruppo di amici, appresa la notizia, porta i futuri genitori fuori per farli rilassare e, durante la serata, Howard ha un'intuizione con cui potrebbe collaborare alla teoria di Leonard e Sheldon in modo da guadagnare abbastanza per mantenere la sua famiglia. Al termine della serata Howard e Bernadette, più sicuri di loro stessi, si dichiarano il loro amore, mentre Leonard e Penny parlano anch'essi di quando avranno dei figli.

Amy convince Sheldon a dare una festa per il suo compleanno cercando di superare i traumi subìti in passato a causa dei tremendi scherzi che in tale occasione gli amici di sua sorella gli facevano. Gli amici più cari di Sheldon, quindi, si ritrovano tutti nel suo appartamento e il fisico, nonostante un momento di difficoltà superato grazie a Penny, alla fine riesce a godersi la festa.

Leonard, Sheldon e Howard sono intenti a registrare il loro brevetto, ma vengono informati che il 75% dei profitti sarà dell'università e inoltre l'ingegnere, essendo formalmente un dipendente federale della NASA, non ha diritto a nessun guadagno. Leonard e Sheldon però decidono di dividere con lui le loro quote del progetto e di formalizzare il tutto tramite un contratto. Bernadette fa notare al marito che tutte le volte che lavora con Sheldon finisce sempre col pentirsene dato che lui è sempre irrispettoso nei suoi riguardi e quindi Penny propone di includere una clausola in virtù della quale il fisico sarà costretto a essere rispettoso nei confronti dell'amico. Sheldon accetta e inoltre, di sua iniziativa, include un'altra clausola per cui un quarto dei suoi guadagni verrà versato per un fondo per l'istruzione scolastica del figlio di Howard e Bernadette, gesto che tutto il gruppo apprezza. Nel frattempo Raj riceve da Emily un regalo che lei gli aveva comprato per San Valentino prima che si lasciassero, un sestante; inoltre la dermatologa lo chiama al cellulare e gli chiede di andarla a trovare a casa sua come amico, ma Penny gli fa capire che lo sta manipolando per tornare con lui. Mentre Raj va da Emily riceve una chiamata da Claire che gli dice che tra lei e il suo fidanzato le cose non sono andate bene e che vorrebbe uscire con Raj, ma quest'ultimo si lascia manipolare da Emily finendo a letto con lei.

Penny e Bernadette raggiungono Howard e Leonard al laboratorio dell'università e si offrono di sostituirli in un lavoretto manuale mentre i due escono per comprare del materiale; durante l'uscita vengono invitati a vedere la prima del film Suicide Squad e Howard, per fargli rabbia, invia un messaggio a Raj informandolo della cosa, non sapendo che questi ha raggiunto le due ragazze. Raj, Penny e Bernadette, quindi, si organizzano per smascherare i ragazzi, che avevano detto alle mogli di essere in ritardo perché avevano bucato una ruota, ma al loro ritorno i due dicono la verità ed escono tutti a cena. Nel frattempo Amy convince Sheldon a comprare un nuovo computer e questi le mostra il deposito in cui conserva tutte le cose che ha avuto in vita sua; la ragazza, quindi, lo aiuta a compiere il primo passo nel liberarsi dal suo attaccamento a tali oggetti.

I ragazzi si ritrovano per vedere insieme Il Trono di Spade, ma prima dell'inizio della puntata scoppiano alcune discussioni: Leonard litiga con Sheldon quando gli dice che si rifiuta di andare alla riunione trimestrale tra coinquilini, Penny col marito perché lui si lamenta quando lei non prende le sue difese e Amy col ragazzo per lo stesso motivo e Howard con Raj perché infastidito dal fatto che quest'ultimo si vanta in continuazione di uscire contemporaneamente con Emily e Claire; il gruppo allora si divide tra l'appartamento di Leonard (in cui si ritrovano questi, Amy e Howard) e quello di Penny (questa, Sheldon, Raj e Stuart). Howard, inavvertitamente, mangia del pistacchio e la reazione allergica che subisce lo fa portare d'urgenza in ospedale, dove il gruppo fa pace.

Si avvicina il giorno dell'incontro con il colonnello dell'aeronautica militare e i ragazzi sono molto tesi, temendo che gli portino via l'invenzione e la possibilità di arricchirsi vendendola e che venga usata per scopi militari. Nonostante loro non vogliano, a causa di Sheldon e del suo orgoglio, visto che il colonnello, ingegnere del MIT come Howard, asserisce che i suoi colleghi possano fare il lavoro in 4 mesi, sono costretti ad accettare di miniaturizzare il giroscopio in soli 2 mesi. Nel frattempo Bernadette, infuriata perché tutti i suoi colleghi hanno scoperto che è incinta e questo potrebbe portarle dei rallentamenti di carriera e l'affidamento di alcuni lavori ad altri, medita vendetta con quella che pensa sia la responsabile, anche se in realtà è stata Penny.

Sheldon scopre che Amy gli ha nascosto il fatto che il suo appartamento è pronto già da due settimane, mentre Leonard che Penny ha tolto di torno gran parte dei suoi memorabilia; i due confrontano quindi le rispettive metà e i loro amici sul da farsi: il fisico decide di rimanere a vivere con la fidanzata, mentre Leonard accetta il nuovo stile imposto dalla moglie alla loro camera da letto, pur andando a nascondere alcuni oggetti della ragazza nel suo vecchio appartamento.

Bert, del dipartimento di geologia, viene insignito della prestigiosa borsa di studio MacArthur per i suoi studi sui microbi delle rocce causando un forte senso di invidia in Sheldon, che alla fine però capisce che deve essere felice per quello che ha. Nel frattempo Howard ritrova un giocattolo radiocomandato da lui costruito con le fattezze di Stephen Hawking, che però tutti ritengono di cattivo gusto; per questo motivo Howard decide di non farlo vedere ad Hawking, salvo poi scoprire a fine puntata che lo avrebbe invece gradito.

Tutta la compagnia si ritrova nell'appartamento di Penny e Leonard e insieme cominciano a parlare di come hanno passato le vacanze: Amy e Sheldon si sono recati in Texas dalla madre di quest'ultimo, Mary, per chiedere la sua benedizione circa il fatto che vivano assieme; Penny e Leonard hanno avuto una disavventura con l'albero di Natale; Howard e Bernadette hanno scoperto il modo per far addormentare la loro figlioletta, aiutati da Raj e Stuart.

Sheldon, rendendosi conto che spesso non si dimostra gentile perché non distingue quello che provano gli altri, decide di procurarsi un rilevatore di emozioni per riuscire a correggersi e farsi accettare meglio. Penny ospiterà suo fratello Randall per trovare lavoro a Pasadena e Leonard sembrerebbe contento, ma grazie al rilevatore di emozioni di Sheldon dimostra che in realtà è irrequieto; i due giungono comunque ad accordarsi di non ospitarlo più, perdonando Sheldon per la sua invadenza. Nel frattempo Raj, stanco di essere single, decide di riunire a casa sua le sue ex Emily, Lucy, Claire e Emily (sordomuta), per capire dove ha effettivamente sbagliato ed evitare in futuro di ripetere gli errori.

Sheldon e Amy, durante una serata romantica al ristorante, incontrano Bert, che si deve vedere con una ragazza conosciuta su un sito di incontri per geologi; quando la ragazza non si presenta il fisico lo invita al loro tavolo, ma durante la conversazione Amy scopre che il suo fidanzato ha raccontato particolari intimi del loro rapporto a molte persone dell'università, facendola andare su tutte le furie. Nel frattempo viene fatto notare a Raj quanto sia viziato e che questo è un motivo di scarso interesse delle ragazze nei suoi confronti: l'indiano decide così di rinunciare ai soldi che il padre gli elargisce di continuo e di diventare autosufficiente.

Raj chiede a Sheldon di gestire le sue finanze e questi gli proibisce di andare al Comic-Con, essendo lui in bolletta; l'indiano cerca quindi di racimolare il denaro necessario vendendo alcuni dei suoi oggetti da collezione e lavorando per il negozio di fumetti di Stuart. Intanto Penny e Leonard mentono l'un l'altro circa la partecipazione all'evento in quanto la prima non vuole andarci, ma si offre di farlo per far piacere al marito, che in verità non la vuole con lei perché sa che non le piace. Nel frattempo Howard si piega ad ogni capriccio di Bernadette per ottenere il permesso per andare alla manifestazione fumettistica. Alla fine, in segno di gratitudine per l'aiuto dato loro per la piccola Halley, Howard e Bernadette offrono una somma di denaro come arretrati a Raj, permettendogli di andare al Comic-Con, ma sorprendentemente l'indiano decide di non andare, a riprova della sua nuova maturità; questa decisione fa cambiare idea a tutti tranne che a Sheldon, che, non volendo andarci da solo, tenta in ogni modo di convincere Amy ad accompagnarlo.

Raj, intento a cercare una casa meno costosa, viene ospitato temporaneamente nella vecchia stanza di Sheldon, che non accetta di buon grado la cosa; contatta allora Beverly Hofstadter, che gli spiega come lui veda quella stanza come una via di fuga dalla relazione con Amy e che Leonard e Penny avrebbero accettato di ospitare Raj per problemi coniugali. Saputa la cosa, i due sposini litigano e Raj si rifugia a casa di Howard e Bernadette. Alla fine, entrambe le coppie sarebbero disposte a ospitare Raj, che però decide di stare con Leonard e Penny.

Sheldon decide di lavorare contemporaneamente al progetto del sistema di guida e a quello di unire biologia e fisica e ci riesce, ma per questo si ammala. Prende quindi una medicina che lo fa agire in maniera inconsueta e addirittura gli fa dimenticare quello che ha fatto durante la giornata, cioè andare in un country club, ballare con gli altri avventori e raccontare a tutti del progetto top secret che sta svolgendo con Leonard ed Howard. Nel frattempo, Bernadette è turbata perché deve tornare al lavoro e teme di non passare più del tempo con la figlia, ma contemporaneamente non vuole rinunciare al suo lavoro.

Amy si trova già a Princeton, per cui Sheldon è tornato nuovamente nella vita di Leonard, che deve accompagnarlo come era abituato a fare in passato. La routine è rotta dal ritorno di Ramona Nowitzki per un post dottorato alla Caltech, dove era già stata quando era una studentessa passando la maggior parte del tempo con Sheldon, a cui si appiccica subito. Tutto il gruppo è preoccupato perché ritiene che Ramona sia interessata al ragazzo in una maniera che va oltre l'amicizia, ma lui non la pensa in questo modo; quando però ne parla con la ragazza, lei lo bacia. Sheldon, turbato, se ne va dal suo ufficio e prende il primo aereo per andare da Amy, che, aprendo la porta della sua stanza, lo trova inginocchiato intento a chiederla in sposa.

Dopo aver fatto la proposta di matrimonio ad Amy ed aver ricevuto una risposta positiva, Sheldon e la sua fidanzata vanno a cena con i colleghi di lei e finiscono per litigare perché il fisico cerca, senza riuscirci, di attirare su di sé le attenzioni dei commensali, intenti invece a celebrare la ragazza; dopo aver parlato con Stephen Hawking, il ragazzo capisce il suo errore e promette alla futura moglie di fare di tutto per migliorarsi. Nel frattempo, Bernadette scopre di essere di nuovo incinta, ma la notizia non sarà presa bene dai due neo genitori, spaventati dall'avere subito un altro figlio.

Amy ha bisogno di un ingegnere per un progetto sul controllo delle onde celebrali sulle articolazioni robotiche e offre il lavoro ad Howard; i due iniziano a passare molto tempo insieme a lavoro, facendo sentire trascurati Sheldon e Raj, che si sfogano con gli altri amici. Questa loro assidua presenza però non è molto apprezzata: Sheldon torna a tormentare Leonard mentre Raj sta sempre da Bernadette. Penny però, grazie ad un libro di Bernadette sull'educazione dei bambini, riesce a tenere a bada il fisico, ma finisce per litigare col marito che la accusa di viziare troppo l'amico. Alla fine Raj e Sheldon decidono di trascorrere insieme il loro tempo libero.

Sheldon propone al colonnello Williams una versione migliore del progetto realizzato con Leonard e Howard senza tuttavia dirlo ai suoi amici, che, una volta scoperto, lo accusano di essersi comportato come Edison nei confronti degli scienziati a cui ha rubato le idee. I due però decidono di vendicarsi trovando un modo per migliorare la versione dell'amico. Avendo necessità di aiuto per i calcoli, chiedono aiuto a Kripke, che però presenta il progetto a suo nome lasciando i tre a mani vuote. Nel frattempo Bernadette chiede a Raj di scoprire se Ruchi, con cui si sta frequentando, sta cercando di approfittarsi della sua assenza per soffiarle i progetti a cui sta lavorando; la ragazza ammette candidamente che lo sta facendo e, dopo una discussione con l'astrofisico, lo scarica.

Raj e Howard sono ancora arrabbiati per i rispettivi comportamenti e il secondo, per ripicca, nonostante non ne avesse voglia, organizza una festa di compleanno per la figlia, senza invitare il primo; la festa però non l'aveva davvero organizzata ed è costretto a chiedere l'aiuto dell'indiano che accetta e i due così si riappacificano. Nel frattempo Sheldon organizza una cena storicamente accurata a tema "La casa nella prateria" per il compleanno di Amy, ma qualcosa del cibo da lui preparato li fa stare male entrambi. Intanto Leonard, dopo aver letto la lettera con gli auguri di Natale del fratello, cerca di pensare a cosa ha fatto di grandioso nell'ultimo anno con la moglie, ma ad entrambi non viene in mente nulla.

Raj, durante una delle sue mostre al planetario, viene avvicinato da una ragazza, Nell, con cui comincia una breve relazione prima di scoprire che questa ha da poco divorziato. Il suo ex, Oliver, va al planetario per incontrare l'astrofisico che, inizialmente spaventato, si convince della bontà d'animo di quest'ultimo e i due diventano amici; quando Nell lo scopre molla Raj e si rimette con Oliver, che va a festeggiare proprio con l'indiano. Nel frattempo Sheldon convince i suoi amici ad affittargli la sua vecchia camera per poterci lavorare; Leonard rimane molto a disagio di fronte all'atteggiamento pressoché perfetto dell'ex inquilino e infatti, quando il fisico torna ad approfittarsi di lui, ne rimane contento.

La data prevista per la nascita del secondo figlio è finalmente giunta e Bernadette non vede l'ora che ciò avvenga, ma potrebbero volerci ancora fino a due settimane. Dato che Howard deve aiutare Amy a scrivere una richiesta di finanziamento, chiede agli amici di passare del tempo con lei, in attesa della rottura delle acque. Si ritrovano però tutti nella loro casa, su invito di Sheldon che vuole far giocare tutti ad un complicatissimo gioco da tavolo, mentre i due litigano perché Bernadette ha scelto in autonomia come nome del figlio quello di suo padre Michael. Alla fine, dopo il parto, mediano chiamando il figlio Neil Michael Wolowitz.

Penny viene incaricata di mostrare a Bill Gates l'azienda farmaceutica per cui lavora perché la sua fondazione vuole sviluppare vaccini economici e, quando lo dice ai ragazzi, loro ne sono subito entusiasti, tranne Sheldon che pensa sia solo uno scherzo. Nonostante la ragazza non voglia portare nessuno con lei perché l'agenda dell'imprenditore è piena, Leonard scopre l'hotel in cui alloggia e lui, Howard e Raj si recano subito lì e lo conoscono. Penny però riesce a strappare un invito per il marito al rinfresco organizzato il giorno successivo, che rifiuta fingendosi malato per non farsi scoprire; quando però lei lo videochiama per fargli vedere Gates la bugia viene fuori. Nel frattempo Amy passa del tempo con Bernadette che, anche in assenza dei figli, non fa che parlare di loro; quando questo gli viene fatto notare, lei si rammarica perché teme di diventare una di quelle mamme che non fa che parlare della prole. La neurobiologa però le spiega come il cervello delle neo-mamme si sviluppi molto, così la microbiologa sfrutterà i racconti che legge ai bambini per imparare nuove cose.

I ragazzi sono sul tetto in attesa di osservare, tramite il telescopio di Raj, il pianeta Mercurio; quando tocca a Penny, lei osserva un corpo che si scopre essere una cometa, di cui l'astrofisico si prenderà tutti i meriti, mandando la ragazza su tutte le furie. Nonostante l'ammettere che la scoperta sia condivisa con la ragazza potrebbe fargli perdere di credito nella comunità scientifica, Penny pretende comunque che il ragazzo dia anche a lei il nome del corpo celeste scoperto. Nel frattempo, dopo che Neil Gaiman ha twittato di essersi trovato molto bene nella fumetteria di Stuart, il negozio diviene frequentatissimo, al punto che il ragazzo è costretto ad assumere una commessa, Denise. Sheldon, dapprima turbato sia per la grande presenza di sconosciuti che per una nuova persona dietro al bancone, su consiglio di Howard mette alla prova la ragazza, che si rivela preparatissima, per la gioia del ragazzo e la gelosia di Amy, che non fa che sentire il suo fidanzato parlare di Denise. La ragazza allora si reca in fumetteria, pretendendo dalla commessa di ricevere informazioni sui fumetti, così da riuscire a parlarne col futuro marito.

Sheldon, costretto dalla madre che altrimenti non si presenterebbe al suo matrimonio, si reca in Texas, accompagnato da Leonard, per riconciliarsi con suo fratello maggiore George, con cui non si parla da anni. Il fisico è ancora arrabbiato per le vessazioni subite da piccolo, mentre il fratello, uomo d'affari di successo che gestisce una catena di negozi di pneumatici, non sopporta il fatto che né lui né il resto della famiglia abbiano mai sentito dei ringraziamenti da parte sua, che tutti hanno continuamente protetto e coccolato senza mai fargli pesare nulla, nemmeno la brutta situazione in casa dopo la morte del padre. Sheldon capisce quindi di essere stato ingiusto con suo fratello maggiore e gli chiede scusa e lo ringrazia dal profondo del cuore, e, una volta riappacificati, George accetta l'invito al matrimonio. Nel frattempo, a causa dei figli di Howard e Bernadette tutti, tranne Penny, si prendono la congiuntivite, ad una settimana dal matrimonio, ma fortunatamente si può curare in poco tempo.

La luna di miele di Sheldon e Amy si arenata a New York. Penny e Leonard scoprono di essere spiacevolmente simili ai genitori di Amy. Raj insulta il fisico Neil deGrasse Tyson e inizia una guerra su Twitter.

Quando Amy non ha il tempo di lavorare sulla super-asimmetria, Sheldon fa di tutto per assicurarsi che sia disponibile a lavorare con lui anche se ciò significhi sabotare accidentalmente la sua carriera nel processo. Raj non vuole che Howard si unisca a lui per ospitare uno spettacolo al planetario.