Nick Castle, un famoso romanziere annoiato dal suo successo, viene chiamato dalla polizia a collaborare in due casi di omicidio molto simili a delitti commessi nei suoi romanzi.

Le indagini su un corpo trovato avvolto in un tappeto a bordo strada conducono Castle e Beckett nel profondo della vita politica newyorkese. I due scoprono un mondo di scorte costose, imprenditori arroganti, ispettori corrotti e gli effetti del tradimento. L'uomo era forse rimasto vittima di un ricatto.

Molti impegni per Castle: un romanzo da promuovere e sistemare le cose con Beckett, in collera con lui per aver indagato contro la sua volontà sulla morte della madre. Intanto la polizia deve risolvere il misterioso omicidio di un uomo trovato tra i rami di un albero.

Castle e Beckett indagano su quello che sembra l'omicidio di un agente segreto. Intanto, la storia con Demming continua, mettendo a rischio la relazione tra Kate e Rick, costringendo i due ad ammettere una volta per tutte cosa provano l'uno per l'altra.

Beckett e la sua squadra irrompono in un appartamento nel corso di un'indagine di omicidio e restano sorpresi nel trovare Castle, del quale non avevano notizie da mesi, accanto al cadavere con la pistola in pugno. L'agente non ha altra scelta che arrestare lo scrittore, costretto a dover dimostrare la propria innocenza.

Beckett e Castle sono costretti a collaborare con l'agente Fallon, per cercare di evitare una catastrofe che minaccia l'intera città.

Mentre Beckett lotta per la vita, Castle cerca di trovare il responsabile della sparatoria. Nel frattempo Ryan ed Esposito cercano di adattarsi all'arrivo del nuovo boss.

Castle e Beckett si risvegliano, dopo essere stati drogati, ammanettati insieme in un seminterrato. Mentre loro tentano il possibile per ricordare cosa è successo e un modo per scappare, Ryan ed Esposito lavorano con il loro capitano per ritrovarli prima che sia troppo tardi.

Il tempo sta per scadere e Castle e Beckett fanno di tutto per rintracciare Linchpin per evitare qualcosa che potrebbe portare il paese sull'orlo di una guerra.

Castle e Beckett affrontano finalmente i problemi che ci sono tra di loro quando un caso si rivela essere connesso alla sparatoria in cui Kate è rimasta ferita e all'omicidio di sua madre.

Becket e il team stanno indagando un omicidio dai tratti ritualistici e scoprono delle tracce che collegano Castle al crimine. Le prove contro di lui aumentano e Beckett si chiede se questi quattro anni sono stati soltanto un'illusione.

l’FBI non riesce a trovare la figlia di Castle e lui decide di prendere in mano la situazione per raggiungere una soluzione e recuperare Alexis. Il nostro amato scrittore scoprirà presto che il rapimento di sua figlia potrebbe essere parte di un progetto ancora più grande di quello che si sia pensato finora.

Centesimo episodio di Castle. Mentre Castle se ne sta rintanato in casa con una gamba rotta, Beckett indaga sulla morte di un agente dell’IRS senza di lui, lasciando il partner infelice e annoiato; ma Richard pensa di essere testimone dell’assassinio di una giovane donna in un appartamento dall’altra parte della strada, in una situazione in stile La Finestra sul Cortile con un misterioso omicidio che accade di fronte casa sua.

Nell’ultimo appuntamento di questa quinta stagione. Beckett ha un colloquio con un'agenzia del settore legale della polizia: questo incontro la spinge a riconsiderare la sua carriera, e anche il destino della sua relazione con Castle. Intanto il team indaga sulla morte di una giovane donna ritrovata in un serbatoio idrico.

Un terribile omicidio porta Castle e Beckett ad interrogare un sospettato, che asserisce di aver viaggiato nel tempo per fermare degli eventi terribili, che avrebbero cambiato irrimediabilmente il destino del genere umano: si tratta di una strategia disperata di difesa di un assassino o l’uomo dice la verità? Castle, naturalmente, vuole appassionatamente credere alla storia del viaggio nel tempo.

Mentre indagano sull'incendio doloso di un edificio, Castle e Beckett scoprono di dover cercare non un piromane, ma un vero assassino. Intanto la moglie di Ryan entra in travaglio, ma qualcosa sta per rovinare questo felice momento.

Beckett è chiamata a collaborare con la Squadra Narcotici. Ma l'indagine prende una brutta piega quando un'operazione sotto copertura viene scoperta, mentre Kate stessa sarà in pericolo di vita.

In questo finale della sesta stagione: L'attesa è finalmente finita, il giorno del matrimonio di Castle e Beckett è finalmente arrivato. Kate però fa una scoperta che potrebbe ritardare se non impedire le nozze.

When a pool shark is murdered by an unseen force, Castle and Becket uncover evidence that the killer may have paranormal powers. Meanwhile, Castle and Beckett attempt to get their lives back to normal following his disappearance.

When an ice cream vender is shot, evidence leads Beckett and Castle to believe that an unknown second-grader may have vital information about the case. Castle goes undercover at an elementary school to try and identify the second-grader but nothing goes as planned.