Un vendedor de coches aparece muerto en el fondo de un desfiladero y se descubre que ya estaba muerto antes de que lo tirasen desde lo alto del puente, por lo que el suicidio queda descartado; en el laboratorio, los huesos del muerto empiezan a echar espuma, lo que provoca el cierre inmediato del laboratorio; el equipo se da cuenta de que solo tiene 24 horas para descubrir la causa de la muerte antes de que los huesos se desintegren por completo.

El Capítulo número 100 remonta a los espectadores seis años atrás, para recordar el primer caso en el que Brennan y Booth trabajaron juntos.

Durante una increíble tormenta de nieve en Washington, la Doctora Brennan y Booth quedan atrapados en un ascensor. La larga espera propiciará que ambos hablen por fin de lo que sienten el uno por el otro después de la ruptura del agente con Hannah.

Un malvado genio de la tecnología, antiguo sospechoso en un caso de Brennan y Booth, reaparece en la apelación.

Christopher Pelant reaparece y asesina a varios agentes del FBI que compartieron pasado con Booth. Sweets se da cuenta a través de las evidencias de que algo le resulta familiar, y descubre que se está basando en unos documentos inéditos escritos por él. Brennan reevalúa su relación con Booth, temiendo que él sea su objetivo final, por lo que cambia su manera de pensar respecto a su situación de pareja.

Con Kovac todavía en libertad, el equipo busca pruebas para localizarlo. Pero cuando Brennan es víctima de una ataque, el resto del equipo debe averiguar cómo encontrar a Kovac sin ella, poniendo a prueba todo lo que han aprendido de ella. Finalmente, cuando todas las señales apuntan a que que Kovac tiene ayuda externa, así como un escondite, Booth y Brennan van a por él.