Ellen experimenta su resurrección en la nave base cylon, en ella discute con Cavil, ya que éste la culpa de haberle creado con limitaciones. Uno de los cinco últimos recuerda su pasado, que fue borrado por Cavil de sus cerebros, como consecuencia de una bala alojada en su cerebro.

La rutina empieza a hacer mella en los ánimos de Starbuck, que sigue preguntándose si es realmente humana o es una cylon. Una noche, en el bar de Galactica, la piloto conoce a un joven que está componiendo una sinfonía. El recuerdo de su padre, también pianista, hará que acabe trabando amistad con el misterioso músico. Por otro lado, la recién elegida representante de los cylon en el Quorum, una seis, pide a Roslin que les entreguen a Boomer, la ocho que disparó a Adama. La presidenta se sorprende al descubrir que los cylon pretenden ejecutarla por traición al unirse al bando de Cavil en la guerra civil. A nadie parece importarle el futuro que aguarda a Boomer excepto a Tyrol, que empieza a recordar la relación que mantenían antes de descubrir su auténtica identidad. Mientras tanto, en la enfermería, Anders sigue inconsciente tras la extracción de la bala de su cerebro. Los demás cylon creen que está tratando de reiniciarse.

Los ingenieros trabajan a marchas forzadas para reparar el agujero provocado por el salto de Boomer. Un accidente, que se lleva las vidas de varios de los trabajadores, pone en evidencia el mal estado en el que se encuentra la nave. Por otro lado, un 'heavy rider' parte en busca de la pequeña Hera. Aunque todos coinciden en que la niña desempeña un papel muy importante en el futuro de humanos y cylon, Adama no está dispuesto a invertir más recursos en recuperarla. Starbuck, mientras tanto, explica a Baltar su descubrimiento en la Tierra y le entrega su chapa para que la analice y le dé una explicación. Y la Presidenta, cuyo estado físico ha empeorado notablemente desde que reanudó su tratamiento, pide a Adama que transfiera el mando a Galactica y desmonte la nave.

Adama ultima los detalles de la expedición para rescatar a la pequeña Hera. Cottle da a Roslin una medicina que la mantendrá viva tan sólo 48 horas. Mientras tanto, Ellen, Tight y Tyrol preparan a Anders para que, una vez aterricen en la colonia donde están los cylon, inutilice a los híbridos. Adama nombra a Hoshi almirante y su hijo Lee ofrece el puesto de Presidente a Lampkin, el abogado de Baltar. Una vez está todo listo, la nave de combate es evacuada de civiles y personal militar y sólo se queda el grupo que tratará de recuperar a Hera, que parte hacia el nido cylon. De forma intercalada, se muestran escenas de la vida de los principales protagonistas humanos de la serie (Adama, Roslin, Baltar, Starbuck) poco antes del ataque cylon que acabó con las Doce Colonias.

Adama solicita voluntarios para una misión final que quiere poner fin a los planes de Cavil de una vez por todas, aunque la Galactica acabará sufriendo daños irreparables. Tras la batalla final, la flota consigue realizar un último salto según las coordenadas de la música que Starbuck recordaba de su niñez y los viajeros llegan a un sistema solar con un planeta habitable, al que llaman "Tierra" en recuerdo de la decimotercera colonia destruida, ya que es éste realmente el planeta en el que acabarán su viaje.