Des terroristes menacent de propager un virus mortel dans Los Angeles si Ramon Salazar n'est pas libéré. D'après le Dr Macer, ce virus agit très vite et aucun vaccin ou antidote ne sont connus. Wayne fait savoir à la CAT que le Président ne cèdera à aucune menace terroriste. Le principal suspect est Hector Salazar, le frère du détenu...

Chase s'inquiète pour Jack Bauer qu'il sait accro à la drogue...

De son côté, malgré les réticences du jeune homme, Kim met au courant son père de sa relation avec Chase...

Après avoir immobilisé Chase à la prison, Jack tente de faire évader Ramon Salazar en créant une émeute...

Enfermé dans une cellule avec sa copine Linda par les troupes de Salazar, Kyle Singer tente de se suicider afin d'éliminer le virus qui est en lui. Toute l'équipe de la CAT se mobilise pour essayer de les localiser...

Durant le débat télévisé du président Palmer, Anne Packard est mis en accusation par le sénateur Keeler dans une affaire de falsification de documents dans une clinique...

En l'absence de Tony Almeida, Ryan Chapelle reprend la direction des opérations à la CAT...

Kyle Singer et son amie sont enfin retrouvés, libérés et pris en charge par la CAT...

Jack réussit à prendre la fuite en hélicoptère avec Ramon Salazar malgré l'intervention de Chase pour l'en empêcher. La CAT veut à tout prix lesintercepter afin d'informer Jack que le virus a été contenu et qu'il peut livrer Salazar...

Le bâtiment où se trouve Saunders est encerclé par l'équipe de la CAT. Mais en faisant pression sur Tony Almeida - il a fait kidnappé son épouse Michelle -, Saunders parvient à échapper à Bauer et ses hommes...

Tout le monde s'interroge sur la façon dont Saunders a pu leur échapper. Défaillance technique ou complice en interne ? Dans tous les cas, Chloe et Adam rassemblent des infos pour comprendre ce qu'il s'est passé. L'étau se resserre autour de Tony, d'autant plus que Jack rentre au QG et que Saunders menace de tuer Michelle si sa fille n'est pas relâchée... Sherry Palmer, de son côté, demande à rencontrer le Sénateur Keeler, l'adversaire de son ex-mari aux élections présidentielles, pour lui faire une proposition...

Tony parvient à sortir des locaux de la CAT avec Jane Saunders. Ayant retrouvé Chloe enfermée, Jack apprend que Tony a l'intention d'échanger la fille de Saunders contre Michelle. La CAT met en oeuvre tous les moyens à sa disposition afin d'éviter que leur seul moyen de pression contre Saunders leur échappe...

Le Président Palmer reçoit la visite de son adversaire aux élections présidentielles, le sénateur Keeler. Ce dernier exige la démission de son rival...

Pendant que le Président s'arrange pour éloigner Sherry de chez elle, Wayne et Foxton en profitent pour fouiller la maison de celle-ci afin de mettre la main sur la boîte de médicaments dont Sherry se sert pour faire chanter son ex-mari...

Jack Bauer parvient à arrêter Saunders. Mais ce dernier refuse de dévoiler l'emplacement des 11 autres fioles...

Brad Hammond, le nouveau directeur de la Division, ordonne l'arrestation de Tony Almeida pour trahison...

Toutes les fioles ont été récupérée. Il ne reste plus que celle de Los Angeles qui vise un lieu public très fréquenté. En attendant d'identifier le porteur, Athur Rabens, la CAT ferme les accès à la station de métro où ce dernier a été localisé...

Michelle assure Theresa, la femme de Gael Ortega, que son mari est mort en héros et qu'il n'a pas souffert...

Wayne raconte à son frère le drame qui s'est déroulé chez Sherry...

La CAT est alertée de l'attaque d'un train ce matin à 7h00. Les soupçons se portent sur un dénommé Tomas Sherek qui a été vu récemment en ville. Chloe prévient Mlle Driscoll, sa nouvelle patronne, que des informations indiquent la possibilité d'une attaque à 8h00... En téléchargeant des logiciels, un programmeur trouve quelque chose de suspect sur le net...Jack Bauer travaille désormais pour le Ministère de la Défense et a une liaison avec Audrey, la fille de son patron. Ayant rendez-vous aujourd'hui à la CAT pour représenter le Secrétaire Heller, Jack doit affronter Erin Driscoll, responsable de son renvoi de la CAT...

Alors qu'il rendait une visite à son fils, Heller et sa fille ont été kidnappés. Seul témoin ayant échappé à la tragédie, Richard est amené à la CAT pour y être interrogé... Jack trouve un allié en la personne de Chloe qui lui communique des infos sur la situation. Jack est alors bien placé pour faire pression sur Driscoll afin d'obtenir une permission temporaire pour reprendre du service.Cette dernière accepte à la condition qu'il soit sous la responsabilité de son remplaçant, Ronnie Lobell... Ayant accédé sur le net à des infos qu'il ne devait pas voir, Andrew Paige a pris la fuite depuis que des tueurs n'ont pas hésité à éliminer tout le personnel de son bureau...

Les terroristes annoncent qu'ils vont juger le Secrétaire Heller dans 3h pour crimes de guerre, et l'exécuter. Et tout cela sera diffusé à travers le monde sur internet. Cet événement pourrait être la première étape d'une série d'attaques à plus grande échelle... Pendant qu'à la CAT on interroge le fils de Heller, sur le terrain, Jack est sur les traces de l'homme qui a capturé Andrew. Alors que Driscoll lui ordonne d'arrêter l'ennemi, Jack préfère le suivre discrètement en espérant qu'il l'amènera jusqu'à Heller... Behrooz se retrouve dans une situation délicate lorsque son père apprend que Debbie a vu l'entrepôt où est gardé le secrétaire Heller...

Alors qu'il est sur la piste de Kalil Hasan, Jack Bauer est intercepté par la police. La CAT contactée, Erin n'a guère le choix de permettre à Jack, sur le terrain, de poursuivre le terroriste, la seule piste qui peut les mener à l'endroit où Heller est retenu prisonnier... Marianne, motivée par l'ambition de gravir rapidement les échelons, fait pression sur Edgar, qu'elle sait être complice de Chloe, pour obtenir une autorisation de niveau 3... Plus que jamais, le temps est toujours compté. Le procès de Heller doit débuter dans moins d'une heure. Celui-ci tente de convaincre sa fille de l'aider à mettre fin à ses jours pour faire avorter le projet des terroristes...

Le procès de Heller, Secrétaire à la Defense, a commencé. Un groupe de terroristes s'apprête à exécuter un représentant des Etats-Unis devant le monde entier. En effet, le déroulement des événements est retransmis en direct sur internet. Pour mettre fin à cette comédie humiliante, le Président a donné l'ordre de détruire l'immeuble où Heller est retenu prisonnier. Seul et contre l'avis de Driscoll, Jack n'a que quelques minutes pour intervenir et sauver Heller et Audrey, la fille de celui-ci...

La CAT découvre que l'enlèvement de Heller n'était qu'une couverture pour une attaque de plus grande ampleur. Les terroristes ont utilisé la diffusion du procès pour surcharger le réseau internet et détourner l'attention. Ils sont désormais en possession d'une technologie volée permettant de prendre le contrôle des 104 centrales nucléaires des Etats-Unis... Audrey pense avoir rencontré l'un des types présents à l'entrepôt lors d'une soirée. Jack veut lui faire visualiser les vidéos de surveillance du dîner en question pour lui permettre d'identifier cet homme : leur unique piste...

Edgar est parvenu à maîtriser la plupart des centrales nucléaires du pays. Mais 6 restent encore sous le contrôle des terroristes. En possession du contrôleur supérieur, ceux-ci peuvent provoquer la fusion nucléaire de chacune des centrales. La Garde Nationale est alertée et le Président ordonne l'évacuation des 6 villes concernées... Tony vole au secours de Jack et Audrey. Il les héberge chez lui le temps qu'ils procèdent à l'identification. Bauer prévient Heller qu'il y a une taupe à la CAT... Marianne, toujours en poste, doit trouver un moyen de détourner les soupçons...

Alors que Jack et Tony s'apprêtaient à arrêter Henry Powell, l'un des maillons essentiels pouvant les conduire aux terroristes et au contrôleur supérieur, l'homme a été abattu sous leurs yeux par un sniper. Jack espère trouver une piste en remontant les derniers appels passés sur son portable... Pour ne pas avoir de problèmes avec la Division, Erin et Curtis décident de falsifier quelques dossiers pour expliquer comment une espionne telle que Marianne Taylor a pu entrer si vite et si haut à la CAT et accéder à des fichiers de haute sécurité... Le réacteur de San Gabriel Island étant dans un état critique, la population de la région concernée est en cours d'évacuation...

Le nom du mari d'audrey figure sur le bail de la société qui possède le bâtiment dans lequelles terroristes ont monté leur affaire. Jack mène un interrogatoire musclé pour amener Paul à parler... Marwan, le chef des opérations, s'active pour faire fondre les réacteurs restants à l'aide du contrôleur. Il ordonne à ses hommes de tuer Curtis, l'agent de la CAT qu'ils retiennent prisonnier dans le même immeuble...

Driscoll apprend le suicide de sa fille, Maya. En état de choc, elle tente néanmoins de faire face et de se concentrer sur son travail... Habib Marwan parvient à fuir. La CAT découvre que l'homme travaillait, sous le nom de Harris Barnes, pour McLennen-Forster, la société qui a créé le contrôleur. Jack décide d'aller sur place pour accéder aux fichiers personnels du terroriste... Chez McLennen-Forster, on s'inquiète de ce que les fédéraux pourraient découvrir en mettant leur nez dans leurs affaires...

Poursuivis par un commando armé dans la zone de black-out, Jack et Paul ont trouvé refuge dans une boutique de vente d'armes. Aidés des propriétaires des lieux, ils ont pu repousser leurs adversaires jusqu'à l'arrivée de l'équipe d'intervention de la CAT. Grièvement blessé, Paul est hospitalisé d'urgence... Grâce au document trouvé chez McLennan-Forster, le nom d'un des contacts du réseau de Marwan est découvert. Jack propose de se servir de Dina Araz pour infiltrer le réseau...

Aux commandes d'un chasseur furtif F117 indétectable par les radars, Mitch Anderson se dirige vers sa cible... La CAT perd la trace de Behrooz malgré les émetteurs placés sur lui. Grâce à l'ingéniosité de Jack, la CAT parvient à localiser le repère de Marwan et une équipe d'assault s'apprête à attaquer... Le Président, à bord d'Air Force One depuis près de 20 heures, décide d'atterrir à Los Angeles et de tenir une conférence de presse pour informer le peuple américain des événements du jour...