Adolescente à problèmes, Nikita a été sauvée de la mort par une organisation secrète connue sous le nom de la Division. L'agence a simulé l'exécution de la jeune fille et lui a donné une seconde chance de débuter une nouvelle vie en servant son pays. Ce qu’ils ne lui avaient pas dit c’est qu’elle allait être entraînée pour devenir une machine à tuer. Cependant, en dépit de son entraînement à la Division, Nikita n’a jamais perdu son humanité, tombant même amoureuse d’un civil. Et quand son fiancé est assassiné, Nikita réalise qu’elle a été trahie et qu’elle ne peut faire confiance à personne. Elle prend alors la fuite. Trois ans plus tard, toujours en cavale, la jeune femme est toujours déterminée à détruire ses anciens employeurs. Pendant ce temps, la Division continue d’entraîner de jeunes recrues, effaçant toute trace de leur ancienne vie pour les transformer en tueurs froids et efficaces. Michael, ancien formateur de Nikita, est désormais chargé de Thom, Jaden et Alex. Celle-ci, hantée par un violent passé, a connu un parcours très similaire à celui de Nikita...