Il preside della facoltà di legge Alvah Case è incaricato di investigare le cause della rivolta e la gestione dell'incidente da parte del governatore Devlin.

Il Paradiso riapre dopo essere rimasto chiuso dieci mesi. Sebbene McManus cerchi di riportare la calma, continuano i disordini. Peter Schibetta assume la gestione della cucina per vendicarsi di Adebisi che gli ha ucciso il padre.

Alvarez sa chi ha stuprato la figlia di Glynn, ma non vuole dirlo al direttore. Wangler fa progressi a scuola, ma il suo compagno di cella, Adebisi, non ama l'istruzione. Quando il giudice di Hill è condannato per corruzione, Said si occupa del caso.

L'appello di Augustus Hill è respinto nonostante gli sforzi di Said, che ha miglior fortuna con le poesie di Poet. Intanto, O'Reily sopravvive alla lumpectomia e ora si concentra sulla dott.essa Nathan.

Gli animi tra loro si infiammano e Adebisi avvelena Schibetta, ma non in modo fatale. Ora che suo fratello si è costituito per omicidio, Glynn non deve più alcun favore a Schibetta.

Schillinger prova ad arruolare Said per farlo uscire di prigione. Ripresosi dall'avvelenamento, Schibetta è aggredito da Adebisi e perde il "controllo" di Oz. Intanto, Alvarez è spodestato al comando dei Latinos da Raoul Hernandez, detto El Cid.

Cyril O'Reily, fratello di Ryan, è incarcerato e finisce sotto il controllo di Schillinger. Ryan prova a portarlo a Oz, ma Cyril finisce nella fossa. El Cid dice ad Alvarez che ha solo un modo per "restare nel gioco".

Nel finale della seconda stagione, Wittlesey è trasferito tra i criminali comuni e rimpiazzato da Metzger, un nazi. Mack e un altro Ariano provano a scappare dal buco di Busmalis e Rebadow. Hill ha l'idea di fuggire da Oz nascondendosi in una bara.

Nella prima puntata della terza stagione, Beecher è ancora in ospedale per le fratture inflittegli da Schillinger, Alvarez è ancora in isolamento per aver accecato Rivera, Adebisi torna in cucina e McManus comincia a vedere un nuovo comandante.

Nessuno sa chi ha ucciso Metzger. McManus assume come comandante il suo amico Murphy e lancia un programma di boxe. Hill si trova a un bivio quando un nuovo detenuto confessa un crimine orribile. Adebisi infilza Nappa con una siringa infetta di Aids.

Nel gruppo di boxe, O'Reily droga la bottiglia spray di Robson prima dell'incontro con Cyril. La madre di Rebadow cerca di convincerlo a incontrare il figlio e il nipote. Intanto, Nappa scopre di essere sieropositivo e viene spostato nel braccio E.

O'Reily e Keller tramano contro Andrew. McManus è obbligato dai piani alti ad accordarsi con Howell dopo che lei l'ha denunciato di molestie. Hanlon è assolto dall'accusa di omicidio e può tornare tra i detenuti comuni, dove lo attendono nuovi guai.

Wrangler "scopre" che sua moglie e l'amante sono stati uccisi in stile esecuzione. Intanto, Poet e Pierce vengono bruciati da Hernandez, Ricardo e Guerra. Scatta l'isolamento e Wrangler si ritrova a essere vulnerabile… e in cella con Adebisi.

Cyril deve boxare con Pancamo e O'Reily vuole usare il trucco della bottiglia, ma prima deve occuparsi di Cudney. Alvarez vede la foto di Rivera con gli occhi cavati e perde la testa. Il nuovo arrivato Nat Ginzburg si offre come segretario di Nappa.

La visita della "impiegata del Dipartimento di Stato" Lana Keese costa a Kosygin in isolamento la vita. Adebisi accusa McManus di aver molestato Wangler. Bellinger incontra McManus e chiede l'impiccagione. C'è solo un problema: lei è incinta.

Con il nuovo millennio alle porte, la situazione precipita al Paradiso mentre crescono le tensioni razziali. Glynn licenzia Hughes che prima di andare fa un regalo ad Adebisi: una pistola.

Finisce l'isolamento. Dopo che ad Hamid Kahn viene staccata la spina, i Musulmani scelgono Arif come loro leader. Intanto, Cyril ha incubi sull'aver sferrato il colpo mortale a Khan nell'incontro di boxe. Ryan chiede a Sorella Pete di intervenire.

I detenuti afro-americani puntano il dito contro McManus per essersi fatto sfuggire di mano il Paradiso. Dopo i suoi ultimi comportamenti bizzarri, McManus prende l'ascia di Glynn. La copertura di Mobay è quasi saltata.

Glynn apprende da Adebisi che la pistola gli è stata data dall'ex comandante Hughes. Con l'aiuto di Rebadow, Morales prende il posto di Hernandez nel traffico di droga gestito da Adebisi e Pancamo. Mobay si ritrova in una posizione pericolosa.

Il Paradiso ha un nuovo responsabile, Martin Querns, dai metodi decisamente poco ortodossi. Il crivello di Beecher sui figli scomparsi peggiora quando Schillinger gli presenta un pacchetto inaspettato. McManus torna a Oz in una nuova veste.

Mentre Querns avvia il suo nuovo piano d'azione, le dinamiche al Paradiso iniziano a cambiare, causando frizioni con l'ufficiale Murphy. Beecher sprofonda nella depressione mentre si interroga sul destino dei suoi figli.

Nel tentativo di ridurre la violenza, i detenuti bianchi sono trasferiti fuori dal Paradiso. Said ed Arif parlano con Querns dell'impatto negativo dei suoi cambiamenti, ma invano. Mobay entra nelle grazie del gruppo di Adebisi… ma ne paga il prezzo.

Le cose si fanno dure al Paradiso. O'Reily inizia una relazione inattesa. Zabitz chiede a Schillinger protezione da Keller, che cerca di entrare in riabilitazione per scusarsi con Sorella Pete. Beecher vuole vendicarsi del rapitore dei suoi figli.

Dopo l'attacco di Hughes a Devlin, Glynn si ritira dalla corsa. Miguel Alvarez è ancora a piede libero. Supreme Allah riceve una sgradita sorpresa. Hill la paga quando dice a Mobay di sapere che lui è sotto copertura. Intanto, Said fa l'impensabile.

Una troupe televisiva arriva al Paradiso, ma i risultati non sono da prima serata. O'Reily vede la visita come un'occasione per vendicarsi del conduttore dello show, Jack Eldridge, che fece un pezzo negativo sui fratelli O'Reily quindici anni prima.

Arriva un nuovo detenuto, Burr Reading, pronto a prendere il comando del giro afro-americano della droga. La dott.essa Nathan torna al Paradiso e ha difficoltà ad accettare i suoi sentimenti per O'Reily. Tidd prova ad accordarsi con Schillinger.

Morales vuole mettere i Cinesi contro Redding. Alvarez si offre a Glynn come informatore per provare a uscire dall'isolamento. La dott.essa Nathan annuncia che i detenuti saranno selezionati per testare un farmaco e ciò potrebbe ridurre la loro pena.

O'Realy si pente di aver coinvolto Cyril nel test clinico quando il farmaco inizia a fare effetto. Giles richiede un'esecuzione inusuale: ciò crea polemiche e i rifugiati cinesi sono espulsi… ma non prima di aver tramato lo loro vendetta su Morales.

Una sorpresa attende O'Reily quando un visitatore rivela la verità sul suo passato, mentre Cyril va incontro a problemi per il suo comportamento. Intanto, Morales e Redding preparano un piano che potrebbe portare a una guerra totale nel Paradiso.

McManus chiede una tregua di facciata tra Redding e Morales. Basil vede finalmente la moglie, ma Hughes rovina la loro felicità. Intanto, l'ultima scenata di Cyril si rivela essere la goccia che fa traboccare il vaso.

McManus non può voltare le spalle a White. Beecher dice ai genitori della ragazza che ha ucciso di aver chiesto la condizionale. Howell prova a ricattare O'Realy così da arrivare a Cyril, ma lui la spiazza, prima che un segreto spiazzi lui.

Nell'ultima puntata della quarta stagione, Hill scopre chi sono i suoi veri alleati a Oz. Il piano di Redding di usare il colonnello contro Morales ha un esito inaspettato. L'angoscia di Beecher per l'udienza porta a un finale sconvolgente.

Nella prima puntata della quinta stagione, Oz riapre dopo le grandi ristrutturazioni in seguito a un'esplosione di gas.

McManus crede che White potrebbe ricredersi se trascorresse del tempo con Said. Alvarez propone a Guerra una soluzione singolare alla loro disputa. La madre di O'Reily, Suzanne Fitzgerald, inizia un periodo di servizi sociali insegnando musica a Oz.

Brass vuole sapere chi gli ha tagliato il tendine. Redding e Morales formano un'altra difficile alleanza. La misteriosa influenza del rev. Cloutier sui seguaci si fa intrigante. Keller torna a Oz ma ad attenderlo c'è una vecchia accusa di omicidio.

A Penders, Hill e Alvarez viene data l'occasione di addestrare cani guida. Martinez serve a Brass un "cocktail" che non era di certo stato ordinato. Il triangolo amoroso tra Beecher, McClain e Keller si fa più complicato.

Robson alimenta le frizioni tra White e Said. Intanto, la malattia di Pancamo potrebbe tornare utile ai suoi nemici. Schillinger tenta una conciliazione amichevole ma sospetta con Beecher e Morales vuole vendicarsi sul marito violento della sorella.

Mentre il processo di Cyril inizia purtroppo in maniera fredda, le tensioni tra Mukada e Kirk si inaspriscono. Inoltre, un prete di nome Meehan arriva a Oz mentre White e Said voltano pagina nel loro rapporto.

La guarigione di Hill porta a rinnovati attriti tra Redding e Morales. Il desiderio di Alvarez si realizza quando il programma "Il miglior amico dell'uomo" termina e Meehan propone alcune idee rivoluzionarie per aiutare Cyril.

Nell'ultima puntata della quinta stagione, Robson fa di tutto per rimediare al problema delle gengive. Intanto, McManus è combattuto sulla decisione di rimanere a Oz e Rebadow fa i conti con il destino di suo nipote.

Nella prima puntata della sesta stagione, Alvarez e Schillinger escono dall'isolamento e tornano tra i detenuti comuni. Intanto, l'umore a lutto di Rebadow si solleva quando è trasferito in biblioteca e incontra la nuova bibliotecaria, Stella Coffo.

L'arrivo inaspettato del sindaco Loewen a Oz scatena una svolta ironica per Schillinger e Beecher. Intanto, la dott.essa Nathan scopre che i detenuti in isolamento si stanno ammalando. L'idea di un nuovo business a Oz ispira Redding.

Schillinger ha un incontro deludente con il sindaco Loewen. Glynn deve affrontare la verità sul problema tossicologico a Oz. In isolamento, Brass passa del tempo con Morales. Intanto, Cyril O'Reily è sottoposto a una terapia inusuale.

Glynn riceve notizie contrastanti sul problema tossicologico. Intanto, la relazione tra Rebadow e la bibliotecaria Stella subisce un intoppo, Keller e Beecher trovano un accordo e Robson finalmente si riscatta.

Ognuno al Paradiso ha un'opinione diversa sul nuovo detenuto, Idzik. Intanto, Alvarez riceve delle notizie sconvolgenti, Murphy fa una confessione a Glynn e Beecher si trova in una posizione scomoda per la sua devozione nei confronti di Keller.

Il nuovo detenuto Idzik affronta i suoi nemici e chiede il trasferimento. Intanto, il caso Loewen si complica sempre di più, i Musulmani hanno problemi d'affari e la popolazione carceraria si dà da fare per sostenere gli O'Reily.

A Oz arrivano tre nuovi detenuti, uno dei quali particolarmente vicino al clan O'Reily. Intanto, il triangolo Keller-Beecher-Schillinger si fa più spigoloso e un banchetto di premiazione porta a una fatidica scoperta.

Nella puntata finale, Oz è in agitazione per il ritorno di Martin Querns. Intanto, Howell e Robson ricevono brutte notizie e gli O'Reily provano a fare ammenda. Finalmente, la rappresentazione di "Macbeth" termina con un atto finale sbalorditivo.