Un grupo de piratas dirigidos por Alvida atraca un barco, donde encuentran un barril que contiene a un muchacho extraño llamado Luffy. Luffy está buscando el tesoro legendario One Piece y él traba amistad con el grumete del barco, Coby, que en realidad quiere alistarse en la marina. Luffy derrota Alvida y junto a Coby se embarca a la aventura.

Mientras navegan a la deriva, Zoro quiere averiguar mas sobre el pasado de Luffy y la razón por la cual desea convertirse en el rey de los piratas, Luffy le cuenta la historia del sombrero de paja que lleva, y de su dueño, la persona que lo inspiro a seguir ese sueño, mientras que por otro lado, una extraña joven engaña a unos piratas y les roba su barco.

Por circunstancias ridículas Luffy y Zoro se separan, y el primero termina repentinamente en pueblo de una isla cercana, donde conoce a muchacha huyendo de unos piratas, luego descubre que su nombre es Nami y el pueblo donde están se encuentra ocupado por la banda pirata del temido Capitán payaso Buggy, engañando al sombrero de paja, esta lo entrega al mismísimo capitán.

Ahora que tienen a Nami en su tripulación, pueden navegar con facilidad, pero aún no están listos para ir a Grand Line, necesitan una nave más grande, lo que suponen que podrán conseguir en la próxima isla, donde conocen a un extraño joven de nariz larga y a su tripulación, un grupo de niños, amigos suyos.

Luffy reconoce al joven como el hijo de uno de los piratas de Shanks, llamado Usopp. También conocen a Kaya una muchacha con una enorme herencia pero quien yace sola y enferma tras de la muerte de sus padres. Mientras, un extraño hombre llamado Jango llega a la isla también.

Luffy y Usopp descubren una conspiración de Jango y de uno de los mayordomos de la mansión de Kaya, llamado Kurahadol para asesinar a Kaya, quedarse con su herencia, y destruir el pueblo. Ussop trata de advertir a todos, pero luego de años de mentirle a la gente del pueblo, pierde credibilidad ante ellos, inclusive ante la misma Kaya.

Luffy y los demás aceptan ayudarle a defender el pueblo que tanto aprecia. El día de la batalla, debido a un error de dirección, sólo Usopp y Nami llegan al sitio de desembarco de los piratas.

Cuando Usopp es herido en la batalla, Zoro y Luffy llegan y vencen a toda la tripulación fácilmente, pero debido a los poderes de hipnosis de Jango, Luffy cae dormido, el capitán decide mandar a los hermanos Nyaban a terminar el trabajo, pero Zoro los enfrenta con algo de dificultad tras perder dos de sus espadas, justo entonces Kurahadol llega a escena.

Kurahadol, cuya verdadera identidad es Captain Kuro esta molesto porque aún no ha llegado al pueblo, y amenaza con matarlos a todos en cuatro minutos, Nami consigue devolver sus espadas a Zoro, quien termina por derrotar a los dos hermanos, y después logra despertar a Luffy, cuando de pronto la señorita Kaya aparece.

Al enterarse de los planes de su mayordomo, Kaya le pide que se detenga y a cambio le entregara la herencia si eso quiere, pero el no esta interesado solamente en su dinero, con ayuda de la hipnosis Jango consigue que Buchi, uno de los hermanos Nyaban regrese de nuevo a la pelea, los piratas de Usopp también llegan al lugar, Usopp le ordena a sus amigos proteger a Kaya, estos le obedecen llevándola al bosque seguidos de cerca por Jango.

Zoro derrota nuevamente a su oponente y con ayuda de Usopp deciden ir a por sus amigos quien para sorpresa de Jango logran darle pelea con tácticas y engaño, mientras que Luffy finalmente pelea con Kuro, quien utiliza un par de garras extra-largas como armas y una técnica de supervelocidad conocida como el pie sigiloso, pero luego Luffy logra superar su velocidad e inclinar la pelea a su favor, Kuro finalmente decide revelar su técnica secreta, el Shakushi.

El shakushi es una técnica de super velocidad con la que el usuario se desplaza y corta todo lo que a su alrededor este, pese a ello Luffy lo derrota finalmente, furioso de ver como atacaba a todos a quemarropa, incluyendo a sus propios camaradas, mientras que Usopp y Zoro logran salvar a Kaya justo antes de que este sea asesinada por Jango, y aunque deciden no decirle nada a nadie de lo ocurrido, en agradecimiento Kaya les entrega el “Alma de Merry” una carabela de 3 velas para ellos, Ussop decide irse con Luffy y Zoro para seguir su sueño, convirtiéndose en el tercer miembro.

Zoro recuerda a Kuina, una joven que conoció en su niñez a la cual nunca pudo vencer y murió sin llegar a cumplir el sueño que ambos se prometieron, ser los mejores espadachines del mundo. Pero después un extraño sujeto ataca el barco.

Zoro reconoce al extraño sujeto, su nombre es Jhonny y venia acompañado de su amigo Yosaku fueron amigos cuando el era un cazarecompensas, Nami les dice a todos que otra prioridad más antes de zarpar hacia Grand Line, es encontrar un cocinero, Jhonny les habla de alguien de un famoso restaurante puede ser el indicado.

Después de conocer a Sanji, uno de los cocineros del Baratie, Luffy tiene que trabajar en el restaurante para pagar unos destrozos que causo, cuando aparece un hombre llamado Gin quien ordena que le den comida pese a no tener con quien pagar, con lo cual es botado del lugar, pese a ello Sanji acepta a darle algo de comer.

Mas Tarde vemos que Gin es en realidad un pirata a las órdenes de la flota del Capitán Don Krieg uno de los piratas más temidos del mar del Este, con una flota de 50 naves y más de 5000 hombres a su mando quien llega al restaurante por comida.

Pese a la negación de todos en el restaurante Sanji le da de comer a él también, aunque luego recibe un golpe de parte de este y la orden de preparar mas comida para su tripulación que se encuentra en su barco, Zeff en defensa de Sanji y le entrega la comida a Krieg, mientras que afuera el barco de Krieg que volvió del Grand Line es partido a la mitad por un poderoso ataque.

Gin decide entrar al combate, peleando contra Sanji, quien ya se encuentra malherido por el ataque de "Muro de hierro" Pearl, pese a su malvada reputación, Gin revela que se ha hecho amigo de Sanji y que no quiere matarlo, Krieg enfurecido decide acabar con él y con todos usando el MH5, una bomba de gas venenoso.

Pese al mortal ataque, todos consiguen ponerse a salvo del gas, excepto Gin quien le había entregado su mascara a Luffy, enfurecido el sombrero de paja se arroja al ataque pese a las advertencias de este, sorprendiendo a todos, incluso al mismo Krieg, del cual se dice que vence a sus enemigos sin recibir ni un golpe de estos.

Continua la batalla de Luffy contra Krieg, quien revela su arma secreta, una enorme lanza bomba, después de recibir unos cuantos ataques Luffy rompe la lanza e inclina la batalla a su favor, después de muchos ataques, Luffy finalmente derrota a Krieg para sorpresa de todos y del mismo Gin, quien antes de partir y pese estar condenando le pide a Sanji que le diga que estará bien.

Con todos recuperándose de la batalla, los cocineros del restaurante logran convencer a Sanji de marcharse con el sombrero de paja, y en una emotiva despedida, les promete a todos que regresara, no sin antes agradecer a Zeff por todo, convirtiéndose en el cuarto miembro.

Luffy y sus amigos llegan a Little Garden como parada obligatoria en su ruta hacia Arabasta, allí descubren una isla prehistórica con muchos peligros. Mientras, Baroque Works mueve ficha y envía a Mr. 3 y su pareja Miss Golden Week a acabar con los Sombrero de Paja en la isla.

Crocodile utiliza su rango de Shichibukai para hacerse pasar por un héroe en Arabasta sin que nadie sepa que en realidad él es Mr. 0. Por otro lado, Luffy y su tripulación tienen un encuentro fortuito con Mr. 2 de camino a Arabasta.

La tripulación llega a Nanohana, un puerto en Arabasta y Vivi encarga a Carue que se dirija rápidamente al palacio del reino para entregar un mensaje a su padre. Por otro lado, Luffy sale en busca de comida y se separa demasiado de la banda.

Nami y Vivi encuentran una manera más rápida de viajar por el desierto gracias a Matsuge, un camello con unos gustos peculiares. Ace se queda atrás y los Sombrero de Paja se encuentran con unos piratas que viven en las arenas.

Luffy no está de acuerdo con Vivi en cual será el próximo paso a dar para detener la rebelión y se enfrentan, tras la pelea se marcan un nuevo objetivo.

Chopper se encarga de distraer a Crocodile por Rain Base mientras Sanji intenta liberar a Luffy y al resto antes de que Rain Dinners se venga abajo. Mr. 3 vuelve a escena para intentar poner las cosas más difíciles a Sanji.

La tripulación consigue salir de Rain Base y se dirige a Alubarna para detener al ejército rebelde antes de que empiece la guerra, pero Crocodile aparece y Luffy debe quedarse atrás para luchar contra él mientras el resto de la banda sigue el camino. Comienza así un enfrentamiento que rápidamente se decantará por uno de los dos.

Smoker deja a Tashigi a cargo de la situación y se marcha de Rain Base. Mientras, la tripulación sin Luffy se dirige veloz a Alubarna antes de que sea demasiado tarde. Luffy es rescatado entre la arena por alguien inesperado pero está gravemente herido.

Kohza cae herido de bala por un agente de Baroque Works camuflado entre el ejército Real, este acto hace que el ejército rebelde vuelva a tomar las armas y se reanuda el enfrentamiento. Vivi, desde lo alto de Palacio, intenta hacerles parar a gritos, pero Crocodile la arroja al abismo. En ese momento llega Luffy.