Encore sous le choc d'avoir tué le suspect d'une affaire, Graham est demandé sur une nouvelle affaire : un tueur « cultive » ses victimes pour que leurs corps développent des champignons. Lecter est donc chargé de faire l'évaluation psychologique du profiler.

La fille du suspect que Graham a tué, est sortie du coma. Ils doivent donc déterminer si elle était complice. Elle doit faire face à l'animosité de ses voisins.

Graham est demandé dans un institut psychiatrique de Baltimore où l'un des patients a tué une infirmière de façon similaire à celle d'un tueur encore en liberté. Le Dr Chilton, qui dirige l'institut, est persuadé de détenir le tueur insaisissable mais Crawford est persuadé du contraire. Ce dernier confie au Dr Lecter que ce tueur a également tué l'une de ses stagiaires prometteuses.

Une nouvelle affaire met Will Graham dans une situation difficile : un totem fait de cadavres tués sur 40 ans est retrouvé sur une plage de Virginie, et Graham est tellement bouleversé par le cas qu'il en perd tout contrôle mental, souffrant d'absences répétées. Abigail Hobbs envisage de publier un livre sur l'affaire avec Freddie Lounds, ce que Graham et Hannibal désapprouvent.

Le Dr Gideon s'échappe pendant son transfert et laisse trois cadavres derrière lui. Malgré sa maladie qui l'affaiblit, Will Graham parvient à comprendre ce que veut le tueur : se venger des psychologues qui selon lui ont manipulé son esprit, mais surtout rencontrer l’Éventreur de Chesapeake.

Georgia Madchen meurt brûlée vive dans un caisson oxygéné. Will Graham commence enfin à comprendre que l'imitateur est derrière tous les crimes suspects. Hannibal est sur le point d'être démasqué et commence alors à manipuler son entourage.

Le procès de Will bat son plein. Le procureur cherche à prouver que l'accusé ne souffre d'aucun trouble mental et qu'il n'est autre qu'un redoutable psychopathe. Jack Crawford témoigne en faveur de Will, s'attirant les foudres de l'inspectrice Alana Bloom. Les déclarations de Chilton renforcent quant à elles l'accusation. La confusion règne. La plus grande agitation gagne la salle d'audience lorsque Will reçoit une enveloppe contenant une oreille humaine. L'allusion au corps d'Abgail Hobbs est claire. Le soir même, le FBI retrouve le corps de l'un des huissiers du tribunal, mutilé, brûlé et empalé sur une tête de cerf. Cette découverte macabre pourrait bien innocenter Will...

Un de membres de l'équipe de Jack est tué et son corps découvert dans une mise en scène macabre. Will se porte volontaire pour dresser le profil psychologique de l'assassin. Pour lui, il ne fait aucun doute que l'auteur de ce nouveau crime est l'éventreur de Chesapeake. Il est également persuadé que celui-ci et l'Imitateur ne sont qu'une seule et même personne : Hannibal Lecter. Will interroge le docteur Gideon, avec l'espoir qu'il lui confirmera la justesse de son hypothèse...

Après avoir tué en légitime défense, Will l'apporte à Hannibal. Ce dernier lui suggère de lui donner la mort qu'il mérite. Will le monte sur des ossements de dinosaures dans le musée dans lequel il travaillait. Hannibal continue la thérapie de Margot en la poussant peu à peu vers le meurtre de son frère.

Margot Verger annonce à Hannibal qu'elle est enceinte de Will ; ce dernier s'interroge sur le rôle qu'il souhaite avoir pour l'enfant. Mason craint plus pour son héritage, qui pourrait lui échapper si sa sœur a un héritier et pas lui. Le contexte pousse Will et Hannibal à reparler d'Abigail et de sa place dans leur relation. Pendant ce temps, le corps de Freddie Lounds est retrouvé, et le Dr Bloom suspecte vite Will de l'avoir tué.

Conscient d'être sur le point de se faire arrêter, Hannibal prépare sa fuite. Le double jeu de Will commence à lui peser et il hésite entre fuir avec Hannibal ou faire son devoir et obéir à Jack, car tous ignorent qui parviendra à survivre à la confrontation finale.

La visite de Will Graham à Hannibal suscite l'intérêt d'Alana, qui craint de voir son ancien collègue se remettre en danger à cause du cannibale, et de Freddie Lounds, revenue pour suivre Will et se mêler de la traque de la « Petite Souris ». Francis Dolarhyde rencontre une femme avec qui il pourrait s'ouvrir : la développeuse des pellicules, aveugle et à l'aise dans une chambre noire.

Jack Crawford décide de tendre un piège au Grand Dragon Rouge : Will Graham va donner une interview à Freddie Lounds où il va saper l'image du tueur. Récemment discrédité sur ses écrits concernant Hannibal par Hannibal lui-même, le Dr Chilton accepte de participer afin de donner du poids à l'interview. Tous croient que Will sera visé, mais c'est Chilton qui va subir la colère du Dragon.