In un bosco di Nuova Luxor Andromeda si imbatte in Cigno Nero, un Cavaliere nero al servizio di Phoenix. Con le sue tecniche congelanti, Cigno Nero attacca il Cavaliere di Andromeda, che si trova in seria difficoltà ma viene salvato dal provvidenziale intervento di Cristal. Il Cavaliere del Cigno ed il seguace di Phoenix, molto simili tra di loro quanto a potenza e tecniche, si affrontano in un intenso duello, interrotto però dall'arrivo degli altri Cavalieri oscuri: Pegasus Nero, Dragone Nero e Andromeda Nero. I quattro Cavalieri neri fuggono subito, ma il tempo della battaglia è ormai cominciato. All'Isola della Regina Nera, Phoenix riunisce i suoi guerrieri e divide tra di loro le cinque parti della Sacra armatura d'oro in suo possesso.

A Nuova Luxor Lady Isabel riceve una lettera di sfida da Phoenix, che invita i Cavalieri dello zodiaco a combattere per il possesso della Sacra armatura d'oro. La ragazza è preoccupata non solo per la sorte di Pegasus, che dovrà combattere senza la propria armatura contro i temibili Cavalieri neri, ma anche per l'assenza di Sirio, partito per riparare la sua corazza e quella dell'amico. Il Cavaliere del Dragone, dopo aver incontrato il Maestro dei Cinque Picchi e dopo essere stato messo alla prova, si reca nello Jamir, una sperduta e desolata regione del Tibet: qui vive il Grande Mur, l'unico uomo sulla Terra in grado di riparare le armature di Cavaliere. Dopo un lungo e complicato viaggio, Sirio riesce a raggiungere la dimora del Grande Mur, il quale si rivela essere un uomo dotato di grandi poteri soprannaturali. Questi però si dice impossibilitato a riparare le due armature che Dragone ha portato con sé, poiché "morte". L'unico modo per riportarle all'antico splendore è donando la vita di un Cavaliere, non un gesto facile per Sirio che, spinto dall'amicizia nei confronti di Pegasus, decide comunque di compiere.

Pegasus, Cristal e Andromeda accettano la sfida di Phoenix e si recano nella Valle della Morte, luogo dello scontro. Poco prima che la battaglia inizi, Pegasus viene raggiunto da Kiki, fratello minore del Grande Mur, che gli consegna la sua armatura, riparata appena in tempo. Per far rivivere la corazza Sirio ha dovuto cedere una grande quantità del suo sangue, ma il Grande Mur, colpito dal suo gesto eroico, ha salvato il Cavaliere prima che morisse dissanguato. Pegasus affronta così ad armi pari la sua controparte malvagia, Pegasus Nero, che riesce a sconfiggere e dal quale conquista un pezzo della Sacra armatura d'oro. Tuttavia, anche se vittorioso, il Cavaliere dello zodiaco si ritrova vittima di grandi sofferenze e con un corpo pieno di ematomi, provocati dal Fulmine di Pegasus Nero. Nel frattempo, anche Cristal ha incontrato e vinto Cigno Nero, grazie al suo Vortice Fulminante dell'Aurora: al Cavaliere del Cigno non resta che raggiungere Phoenix e affrontarlo.

Cristal ha la peggio nel combattimento contro Phoenix e viene sconfitto dal Pugno Diabolico del Cavaliere della Fenice. Nel frattempo Andromeda trova Pegasus caduto in un crepaccio della Valle della Morte: la sua pelle si è completamente colorata di nero e al giovane eroe non resta molto da vivere. Andromeda tenta di recuperarlo, ma viene interrotto dall'arrivo della sua controparte malvagia, Andromeda Nero, che lo attacca con la sua micidiale catena speciale. Andromeda è così costretto ad abbandonare l'amico nel burrone e ad affrontare il nemico, che riesce a sconfiggere e al quale conquista il pezzo della Sacra armatura. Intanto, anche Dragone è giunto in aiuto agli altri Cavalieri dello zodiaco, dopo aver riparato sia la sua armatura che quella di Pegasus nello Jamir. Siro dovrà affrontare Dragone Nero, l'ultimo Cavaliere nemico rimasto.

Mentre Andromeda tenta di recuperare Pegasus in fin di vita caduto in un crepaccio, Sirio lotta contro Dragone Nero, pur non essendo nelle condizioni migliori per affrontare un nemico così tosto, dopo aver perso una gran quantità di sangue per riparare l'armatura. Nel corso della battaglia, Sirio cerca di spiegare all'avversario perché vale la pena combattere in nome dell'amicizia e della lealtà. Concluso lo scontro, Sirio ha perso un'ulteriore gran quantità di sangue a causa delle ferite, ma Dragone Nero, profondamente colpito dai discorsi sull'amicizia dell'avversario, decide di salvargli la vita, prima di morire colpito dal Colpo Segreto del Drago Nascente. Recuperato il corpo di Pegasus, Dragone riesce a risvegliarlo colpendo le tredici stelle della costellazione di Pegasus situate sul corpo del Cavaliere e facendo fuoriuscire il sangue infetto. I Cavalieri dello zodiaco si apprestano così ad affrontare Phoenix nel duello decisivo.

Ripresosi dopo il duro combattimento contro Phoenix, Cristal affronta il nemico e riesce a respingere il suo colpo segreto con la Polvere di Diamanti. Ma il Cavaliere della Fenice non si dà per vinto e attacca i quattro avversari con le Ali della Fenice, alle quali solo Pegasus riesce a resistere, salvato dalla Sacra armatura d'oro, che si è composta da sola e si è disposta a difesa del giovane Cavaliere. Questi affronta il nemico a campo aperto e, ricevuti in aiuto lo scudo del Dragone, la catena di Andromeda e il gelido cosmo di Cristal, grazie all'unione dei poteri di tutti i quattro Cavalieri dello zodiaco, riesce a sconfiggere Phoenix.

Vinto in battaglia da Pegasus, Phoenix decide di svelare il suo passato agli altri Cavalieri dello zodiaco. Mandato all'Isola della Regina Nera per diventare un Cavaliere, Phoenix ha dovuto rinnegare ogni sentimento buono e nobile e ha dovuto persino uccidere il suo istruttore, un guerriero mascherato di nome Guilty. Improvvisamente irrompe un nuovo e pericoloso nemico, Docrates, giunto per rubare la Sacra armatura insieme al suo esercito di soldati. Ai Cavalieri dello zodiaco, sopraffatti dalla forza impressionante dell'avversario, vengono sottratti otto dei nove pezzi dell'armatura d'oro. Riconosciuti i propri errori e messo alle spalle il proprio passato, Phoenix cerca di contrastare il nemico con le Ali della Fenice, provocando una grande frana e restandovi sotterrato insieme a Docrates. Gli altri quattro Cavalieri dello zodiaco piangono la morte dell'amico ritrovato, mentre nelle loro mani è rimasto soltanto l'elmo dell'armatura Sacra.