Il tenente Harmon Rabb e il suo partner, il sottotenente Caitlin "Kate" Pike, indagano a bordo della USS Seahawk dove una donna, pilota di F-14 Tomcat, viene gettata fuori bordo. I membri del JAG devono scoprire chi l'ha uccisa.

Il tenente Harmon Rabb e il suo partner, il sottotenente Caitlin "Kate" Pike, indagano a bordo della USS Seahawk dove una donna, pilota di F-14 Tomcat, viene gettata fuori bordo. I membri del JAG devono scoprire chi l'ha uccisa.

Harm viene inviato a bordo di un sottomarino con il suo nuovo partner, il tenente Megan Austin, dove devono evitare che un siluro colpisca una nave civile.

During a simulated attack, a seriously wounded Marine is found on the beach. JAG is called in to investigate. Harm and Meg follow two ways: An executed Code Red or a brawl. Locations: Camp Pendleton and area; Los Angeles

After a lightning strike, a damaged Tomcat flying over Cuba is forced to land by the Cuban air force. Harm and Meg, accompanied by Cdr. Krennick and undersecretary of state Bair go to Cuba to negotiate the return of the pilot and aircraft. The main goal is to prevent the download of the Tomcat's classified software. But the CIA's actual plans are totally different ... Locations: Washington,D.C.; Cuba

Due to the transposition of two digits of a phone number, Lt. Austin receives a fax with the itinerary for a person with the codename 'Shepherd'. Later, a Commander from the Royal Navy shows up demanding that paper. After receiving it he shoots Meg, seriouly wounding her. Trying to find out who this 'Shepherd' is and why this document is so important, they end up chasing an assassin named 'Hemlock' apparently working for Russian hardliners and trying to kill the man behind 'Shepherd'

- Boris Yeltsin who is due in the US for a secret treaty signing. Locations: Washington, D.C.; Bethesda; Leesburg, Va.

A murdered female lieutenant turns out to be Lt. Schonke, a friend with whom Harm attended Academy, but neither Cdr. Krennick nor Agent Turque, an abrasive civilian investigator, buys Harm's claim that his relationship was strictly platonic. After the primary suspect of the murder is also found dead - a more than dubious suicide - Harm finds himself being the number one suspect for both murders ... Locations: US Naval Base Norfolk, Va.; Washington D.C.

Un gruppo di terroristi noti come I Difensori ruba la dichiarazione d'indipendenza, toccherà al JAG, aiutato dal maggiore Mackenzie ritrovarla.

Uno scheletro viene trovato a bordo di una nave della marina che sta per essere smantellata e Harm è convinto che questo sia legato a suo padre disperso in azione in Vietnam.

Vengono spiegati gli avvenimenti successivi all'ultimo episodio della prima stagione che si chiude con un cliffhanger. Harm ha scoperto l'assassino di Diane, sosia di Mac, donna cui ricambiava un sentimento forte ma inespresso e per il quale avevano deciso di parlare di un "futuro comune". Harm vuole vendicarla quando viene scoperto da Mac e le racconta tutto per poi scappare via. Trova l'assassino e gli punta addosso una pistola, dicendogli che non vuole portarlo al processo, quando sopraggiunge Mac in uniforme da guardiamarina. L'assassino la scambia per il fantasma di Diane e terrorrizato cade in mare, muorendo prima che Harm si possa vendicare. Alla fine Harm, guardando Mac, la bacia sulla bocca per la prima volta; lei accetta però poi gli dice che lo sapeva che lui stava baciando Diane e non lei.

(The time is 1980, several Russian soldiers are guarding a prisoner who is Harmon Rabb, Sr. at a train station. The KGB take a photo of the persons gathered there - a photo which has made its way to Harmon Rabb, Jr. in the present time.)

Clayton Webb meets with Harm at JAG and tells him who the men in the photo are. Webb mentions that one of them, Victor Lushov is now working in San Diego. Harm requests from the Admiral to take an F-14 hop to San Diego to visit his mother, keeping secret his true intentions.

In San Diego, Harm meets with Lushov who turns out to be a Russian pilot who was instrumental interoggating Harm, Sr. after he was shot down over Vietnam, later befriending him. He tells Harm Jr. all about what happened to his father, that Harm Sr. fed all kinds of disinformation to the Russians, which was worse than telling them nothing. Lushov gives Harm Jr. the KGB file number for his father. And says he wants to live and will not repeat what he has said to anyone.

Having been shot at by Russian fighters, Mac & Harm are forced to eject from their plane, which then noses into the bottom of a very deep lake. The Russians announce to the world that Harm & Mac have been killed, which is broadcasted back to the USA by ZNN reporter Chuck DePalma.

Webb tries to convince the Admiral that they have been killed, but when A.J. learns their bodies haven't been found, A.J. becomes irate and vows to go to Moscow himself to look for them. The SecNav orders A.J. not to go, who replies that the SecNav doesn't want to try & stop him.

In Russia, A.J. meets with DePalma who tells A.J. that he doesn't believe the Russians, that certain things in their story don't add up.

In the woods, a husband & wife gypsies come across Harm & Mac. They are disappointed when they learn that Harm & Mac are not American Spies as at least the spies have gold coins to give to Russians that help them.

Admiral Chegwidden and Clayton Webb make an unlikely team when they join forces to save a C.I.A. agent from Italian terrorists. Webb already tried once unsuccessfully to liberate the C.I.A. agent, who was his mentor, and knows he needs backup in order to retry the mission. He approaches the Admiral, with whom he has a tenuous relationship, but who he knows credits the agent with saving his life in Vietnam. Together, Webb and Chegwidden go to Italy and put into motion a dangerous trap for the terrorists that, if it backfires, will kill all involved. Meanwhile, Harm suffers an identity crisis when his classic Corvette is stolen.

At the request of Lt. Cmdr. Brumby, Admiral Chegwidden sends Harm and Bud to Australia to represent a U.S. Naval officer, Kevin Lee, who has suddenly surfaced 28 years after being "murdered" by an Australian sailor. Lee contends that he accidentally killed his Australian nemesis years ago and, in a panic, exchanged identities with the dead man.

Now, charged with both deserting and murder, Lee is to be tried in an Australian court, pitting Harm against Brumby. Harm and Brumby are also about to go head-to-head outside the courtroom when Mac appears in Sydney and Brumby decides it's time to make her choose between him and Harm.

The murder/desertion trial of Kevin Lee takes a bad turn after his wife changes her testimony under cross examination.

Harm and Mic fights to win over Mac

Questo episodio è la prima parte del backdoor pilot di NCIS - Unità anticrimine. Il cadavere del tenente Loren Singer, assente da tre mesi dopo aver lasciato il JAG e incinta, viene rinvenuto su un albero vicino alla riva del Potomac. Si occupa delle indagini il Major Case Response Team dell'NCIS, squadra comandata dall'agente speciale Leroy Jethro Gibbs e formata dagli agenti Antony DiNozzo e Vivian Blackadder[1]. Si scopre che la Singer era stata uccisa alcuni mesi prima, battendo la testa sulla ringhiera di un ponte a seguito di una colluttazione e venendo gettata nel fiume, ma il corpo si era conservato a lungo essendo rimasto intrappolato nel ghiaccio invernale del Potomac. Gibbs è inoltre sotto pressione in quanto il direttore dell'NCIS vuole che si liberi quanto prima del caso per occuparsi dell'interrogatorio di Amad Bin Atwad, un terrorista catturato in Europa mentre pianificava un attacco alla marina. La squadra di Gibbs scopre che il fratellastro del capitano Harmon Rabb, il sergente Sergei Zhukov dell'esercito russo, era in relazione con la vittima, per cui sospetta che lei attendesse un figlio da Zhukov e che sia stato Rabb ad ucciderla. Quest'ultimo è poco collaborativo e quando la squadra scopre che Rabb e la Singer si erano incontrati in un pub e avevano litigato poco prima dell'omicidio, il capitano viene arrestato.

Questo episodio è la seconda parte del backdoor pilot di NCIS - Unità anticrimine. Il processo contro il capitano Rabb ha inizio, e questi viene difeso dal tenente Faith Coleman. Nonostante la comparsa di una nuova prova, quando viene trovato in riva al fiume il cappello di Rabb, Gibbs è sempre meno convinto che questi sia colpevole, e lo ammette anche durante il processo. Le analisi di laboratorio rivelano che il cappello era una falsa prova di depistaggio; la squadra scopre che Rabb era innocente ed era stato il comandante Theodore Lindsey, per motivi passionali, a uccidere la Singer cercando poi di incastrare Rabb. Risolto il caso, Gibbs si reca a bordo della Chattanooga per interrogare Bin Atwad. Invitandolo a pranzo e parlando di questioni apparentemente banali, Gibbs riesce a carpire alcune informazioni sui suoi ultimi movimenti in Francia, che permettono di individuare la cellula terroristica. La squadra di Gibbs si reca in incognito nei pressi della nave usata dai terroristi come base, individuando il terrorista ricercato Hussan Mohammed. Una esitazione di Blackadder mette in allarme i terroristi e dà il via ad uno scontro a fuoco, nel quale gli attentatori vengono uccisi dagli agenti dell'NCIS.