Après une période de repos, les Knight Sabers reprennent du service grâce à une série de vols perpétrés par une organisation maléfique appelée Illegal Army, qui prend les armes et détruit la paix à MegaTokyo.

Un nouveau type de Boomer doté d'une intelligence artificielle avancée a été volé ! C'est aux Knight Sabers, récemment reformés, de le récupérer ! Cependant, ils auront fort à faire avec un groupe de Boomers de combat dirigé par un scientifique criminel qui cherche les supprimer.

Les Boomers de MegaTokyo se révoltent et plongent la ville dans le chaos. Pour mettre fin à ce désastre, les Knight Sabers doivent trouver le cerveau qui se cache derrière tout ça !