В первом эпизоде рассказывается о метеоритном дожде, который обрушился на Смолвиль и изменил жизнь канзаского городка навсегда. Кларк Кент знакомится с Лексом Лютором и сталкивается с первым, из многих, человеком, изменившемся под влиянием странных метеоритных камней, которые сопровождали Кларка в его путешествии на Землю.

Кларк имеет дело с Грегом, коллекционером всевозможных пауков и насекомых и поклонником Ланы, у которого появились невероятные способности своих питомцев и он использует их против каждого, кто стоит у него на пути.

Грубый и вспыльчивый футбольный тренер получает способность контролировать огонь.

У Кларка начинаются «проблемы» со зрением — он начинает видеть как рентген. Между тем, в городе появляется таинственный грабитель, использующий способность менять свою внешность и ставящий других людей под подозрение.

У парня по имени Шон появляются способности поглощать тепло у всех вокруг, он начинает охотиться за людьми, чтобы получить тепло, необходимое ему для выживания.

Старик использует зелёный криптонит, чтобы обратить процесс старения. Он хочет отомстить детям присяжных, которые осудили его десятилетия назад. Тем временем, другая женщина в этом же доме престарелых имеет прорицательские способности. Она видит будущее Кларка и Лекса.

Одержимая лишним весом, девушка-подросток садится на диету из заражённых криптонитом овощей. Всего за две недели она худеет с 76 до 48 кг, но она должна питаться жиром других, чтобы поддерживать свой внешний вид.

Эксперимент на одном из перерабатывающих заводах Лютора делает старого друга Кентов буквально трясущимся и дрожащим. Он собирается мстить Лютору, который держит секрет его трансформации на «третьем уровне» местного завода.

В этом эпизоде Кларк приезжает в Метрополис и, не удивительно, совершает доброе дело — детектив Фелан становится свидетелем способностей Кларка и начинает шантажировать его. Кларк должен помочь детективу защититься от «Внутреннего расследования».

Невидимка преследует Лекса — это кто-то из домашнего окружения, а может и нет.

Боб Рикман имеет способность через прикосновение заставлять людей делать всё, что ему необходимо.

Во время школьной экскурсии в Кларка и его одноклассника Эрика попадает молния. В это время в сумке Эрика лежит кусок криптонита, и способности Кларка переходят к нему.

Уитни попадает в компанию бывших футболистов, который делают себе криптонитовые татуировки, позволяющие проходить сквозь стены. Между тем, Хлоя серьёзно ранена, а у Лекса есть свой собственный план.

Человек из прошлого Лекса напоминает ему о таинственной смерти в клубе «Zero», утверждая, что в этом вина Лекса. Между тем, Хлоя копается в прошлом Кларка, выясняя о его усыновлении.

Цветок, который появляется с «третьего уровня» перерабатывающего завода, приводит к странному поведению нескольких человек, в том числе Джонатана, Ланы и Пита.

Молодой беглец Райен умеет читать чужие мысли и спасается от своих жестоких приёмных родителей. Кенты оставляют его на ферме и скоро Кларк обнаруживает его способности, но не говорит ему об этом. Однако приёмные родители Райена имеют собственные планы на способности мальчика, они хотят направить их против Лекса.

Тайлер получает способность разрушать органические соединения одним прикосновением. Он решает помогать умирающим избавиться от страданий и отцу Уитни тоже. Тем временем Лайнел не доволен возвышением Лекса в Смолвиле.

Кларк участвует в школьных выборах. Его противник из-за воздействия криптонита может контролировать пчёл. Тем временем, журналистка из Метрополиса приезжает, чтобы написать статью о Лексе.

После повреждений во время аварии, студент теряет способность двигать руками, но приобретает способность телекинеза.

После взрыва Лана начинает видеть глазами убийцы и его следующая жертва — Хлоя. В это время, Лекс и журналист Роджер Никсон в результате опроса очевидца метеоритного дождя понимают, что в Смолвиль вместе с метеоритами упало что-то ещё.

Лекс разбит тем, что его отец закрывает перерабатывающий завод в Смолвиле, чтобы заставить его вернуться в Метрополис, обвиняя руководство завода в несостоятельности. Между тем, Кларк готовится к свиданию с Хлоей на весеннем школьном балу. Журналист Роджер Никсон пронюхивает об инопланетном происхождении Кларка и устраивает взрыв его автомобиля, чтобы проверить свои догадки. Уитни идёт добровольцем в морскую пехоту.

Кларк спасает Лану от гигантского торнадо и приносит её в больницу. Когда он возвращается домой, то узнает что корабль пропал, а его отец преследуя Роджера Никсона, попал в бурю. Лекс чувствует вину за то, что не помог отцу раньше и теперь Лайонел в больнице. Лекс принимает решение оплатить операцию отца на глазах. Джонатан и Никсон пытаются самостоятельно выбраться из склепа в котором оказались после того, как на них чуть не упал передвижной дом. Кларк появляется прежде чем у них заканчивается кислород, но метеориты ослабляют его. Никсон использует ситуацию и похищает Кларка. Лекс появляется и спасает жизнь Джонатану, убив Никсона прежде, чем тот смог убить Джонатана.

Из-за рекордно высокой жары у Кларка развиваются новые способности — тепло-видение, которое вызывает неконтролируемые вспышки огня из его глаз. Лекс женится на Дезире Аткинс — женщине, которую едва знает. Выясняется, что она может контролировать мужчин, так как метеориты усилили её феромоны. С помощью Джонатана Кларк выяснил, что вызывает его тепло-видение и учится управлять своей новой способностью. Дезире пытается использовать свои чары на Кларке, но он устоял. Тогда она убеждает Джонатана убить Лекса, чтобы унаследовать его состояние. Кларк успевает спасти Лекса прежде, чем Джонатан или Дезире смогли убить его.

После того, как Пит находит в поле космический корабль, Кларк, несмотря на протесты родителей, рассказывает ему свой секрет. Реакция Питта заставляет Кларка пожалеть о своем решении. Доктор Гамильтон, страдая от чрезмерного влияния метеоритов, крадет корабль Кларка. Когда Лекс не поверил его рассказам о корабле, доктор Гамильтон обращается к Лайнелу. Преданность Пита проходит проверку, когда доктор похищает его и пытается выяснить как открыть корабль. Кларк приходит, но доктор Гамильтон умирает от судорог вызванных метеоритами.

Кларк не слушает совета отца и покупает дорогое школьное кольцо. В кольце — красный метеорит, который влияет на психику Кларка. Сняв все запреты, Кларк ведет себя очень странно. Он крушит все на свидании с Ланой, когда в баре происходит драка. Проявляя негодование по отношению к родителям за то что заставляли его жить как мальчика с фермы, Кларк решает использовать свои способности, чтобы разбогатеть и оставить Смолвиль. Джонатан и Пит действуют сообща, чтобы остановить Кларка и снять кольцо с его руки. Кларк пытается извиниться перед родителями, но Джонатан подозревает, что Кларк выражал свои истинные чувства. Лана отказывается принять извинения Кларка, поскольку он не может объяснить ей своего поведения.

Лана обретает тайного поклонника в лице парня по имени Байрон. Однако, Байрон является бывшим подопытным одного из проектов Люторкорп, возглавляемых Лайонелом. После встречи с родителями Байрона, Кларк и Лана приходят к выводу, что Байрона держат взаперти и решают спасти его от родителей. Когда они освобождают Байрона, солнечный свет превращает его в суперчеловека склонного к насилию. Кларк выслеживает Байрона и во время схватки они оказываются в склепе. Тьма возвращает Байрона в нормальное состояние, Кларк отвозит его в больницу. Марта становится личным помощником Лайонела.

Когда студента вытаскивают из бассейна, оказывается, что он состарился за несколько минут на 60 лет. Кларк и Хлоя решают провести расследование. Они находят целую цепь подобных случаев, которые происходят вот уже 80 лет и все ни связаны с Крисси (Мисси) Паркер, еще одной студенткой. Лана находит фотографию своей матери с неизвестным мужчиной. Узнав о том, что её родители расставались на какое-то время, она считает что этот мужчина может быть её отцом. Без новой жертвы тело Мисси начинает быстро стареть. Кларк успевает спасти от неё нового директора и Мисси превращается в пыль.

Женщина по имени Рейчел Данлеви утверждает, что является биологической матерью Кларка. Она похищает Лекса и угрожает убить его, если Лайнел не раскроет правду об усыновлении Кларка. Лана находит своего биологического отца, Генри Смола, и хочет выяснить нужна ли она ему. Джонатан рассказывает Кларку, как Лайнел Лютор помог с его усыновлением, и что в замен он попросил уговорить Росса продать свой кукурузный завод. Рейчел видит, как Кларк использует свою силу и понимает, что он не её сын. Лайнел рассказывает Лексу, что он был отцом ещё одного ребенка, но тот умер в младенчестве.

После того как тетя бросила его из-за проблем с деньгами, Райен позвонил Кларку с просьбой о помощи. Кларк освобождает Райана из института Самерхолт, где над ним проводили эксперименты, и привозит его в Смолвиль. Вскоре обнаруживается, что у Райана опухоль мозга и ему осталось жить несколько дней.

Ян, отличник, имеет способность раздваиваться. Он использует свою силу для отличной учёбы и для того, чтобы встречаться одновременно с Ланой и Хлоей. Кларк и Пит раскрывают секрет Яна и тот пытается убить обеих девушек. Между тем, Лекс посещает группу управления гневом, где знакомится с доктором Хелен Брайс.

Кларк обнаруживает пещеры Коренных Американцев, расположенные прямо под новой строительной площадкой Люторкорп. На стенах пещеры нарисованы символы на неизвестном языке. Коренной Американец Джозеф Виллоубрук и его внучка Кайла рассказывают историю отображающую жизнь Кларка. Пытаясь спасти пещеры, Кайла хочет прогнать Люторов с земли, используя свою способность превращаться в волка, но во время нападения на Лайонела получает смертельное ранение.

Ко всеобщему удивлению, Уитни Фордман возвращается из армии. Утверждая, что потерял память во время последней битвы, он пытается восстановить отношения с Ланой, не зная о её письме. Не желая навредить ему, Лана дает ему возможность завоевать её обратно, но Кларк узнает что на самом деле Уитни — это Тина Грир. Когда Кларк сталкивается с Тиной, она использует против него зеленый криптонит. Беспомощного Кларка спасает его корабль, находящийся в подвале Кентов. Во время очередной стычки с Кларком Тина погибает.

После поражения в схватке с Лайонелом, Лекс обнаруживает, что его особняк полон подслушивающих устройств. Лекс хочет разместить свои жучки в Люторкорп, но его планы рушатся, поскольку в это время там работают Марта и Лайонел. Положение ухудшается, когда нанятые Лексом люди собираются ограбить сейф Люторкорп. Находясь в заложниках, Марта узнает, что Лайнел собирает досье на Кларка и хранит слитки очищенного метеорита.

Лайонел таинственным образом ранен в особняке Люторов, оставив большой список подозреваемых с различными мотивами. Джонатан, найденный без сознания в своем грузовике с бутылкой текилы и пистолетом в руках, арестован как главный подозреваемый. Кларк и Пит начинают расследование и раскрывают тщательно спланированный план человека, на которого и подумать-то трудно.

Пит и Хлоя заражены насекомоподобным существом, который проникает в шею людей, оказавшихся поблизости. Оно заставляет людей совершать крайне рискованные действия. Пит использует красный криптонит, чтобы Кларк присоединился к ним. Когда действие красного криптонита случайно снимается, Кларк отвозит своих друзей в больницу. Лекс нанимает доктора Фредерика Волдена, чтобы расшифровать надписи на стенах пещеры Ковачей.

Лекс обнаруживает, что его брат Лукас до сих пор жив. Лайонел знакомится с Лукасом и использует его, чтобы лишить Лекса наследства, так как он не может выкупить Люторкорп. Разоренный Лекс приходит к Кентам. Лукасу не нравятся планы Лайонела в отношении него, к тому же он узнает, что Лайонел уже не слепой. Разработав план с Лексом, они раскрывают ложь Лайонела и Лекс получает своё наследство обратно.

Марта, которая спрятала ключ от космического корабля в подвале, вдыхает метеоритную пыль и заболевает. Во время исследования Марты, Джонатан узнает, что она беременна. На ферме Кентов объявляют карантин, а ключ находят. Кларк, тоже вдохнувший метеоритную пыль, также серьёзно болен. После проверки его крови, доктор Хелен Брайс понимает, что Кларк не такой, как все. После того, как корабль Кларка вылечивает их.

Кларк решает вставить ключ в отверстие в пещере. Сразу после этого, он получает знания языка пещеры. Доктор Уолден находит ключ, но после его использования информационная перегрузка погружает его в кому. Дома тепловидение Кларка непроизвольно рисует символ на стене амбара. Кларк связывается с доктором Свонном, который рассказывает ему о его родной планете Криптон. Используя ключ в корабле Кларк читает послание своего биологического отца из которого узнает, что его судьба — захватить Землю.

Одноклассник Кларка, Сайрус, проявляет способности аналогичные его. Кларк узнает, что Сайрус считает себя пришельцем, прилетевшим на Землю вместе с метеоритным дождем, что приводит Кларка к мысле о том, что доктор Свонн, утверждающий, что Кларк единственный криптонианец, был не прав. Сайрус показывает Кларку башню для передачи сигнала его инопланетным родителям, но доказательства свидетельствуют, что Сайрус простой человек.

После того как на Лану напал студент колледжа Энди Коннерс, Кларк теряет контроль и по-видимому ранит парня. Когда Кентам приходит иск, Кларк начинает жалеть о своих способностях и пытается найти выход, чтобы избежать суда. Тем временем, бывший парень Хелен приезжает в город, чтобы вернуть её обратно. Когда она отвергает его, он нападает на Хелен, вынуждая Лекса взять правосудие в собственные руки.

Группа воров угоняет грузовик Люторкорп с находящимся в нем грузом очищенного метеорита. Кларк пытается задержать грабителей, но он оказывается слаб против них. Оказывается, что они производят жидкость из метеоритов, вдыхая которою становятся супер-сильными. Лайонел предлагает финансировать «Факел» и устроить Хлою на работу в «Дэйли Плэнет».

Лана думает, что видит призрака, когда её умершая 6 лет назад подруга детства Эмили, приходит к ней. Кларк узнает, что ребёнок на самом деле реален. Девочка очень быстро двигается и проходит сквозь стены. Кларк узнает, что отец Эмили клонировал её с помощью метеоритов. Недостаток клона Эмили заключается в том, что у неё нет представления о нравственности и это ставит жизнь Ланы под угрозу. Тем временем, Лекс готовится к свадьбе с Хелен.

Доктор Уолден приходит в себя после комы и рассказывает Лексу, что Кларк пришелец, который должен быть уничтожен. Романтические встречи Кларка и Ланы быстро становятся известны Хлое. Во время репетиции свадьбы Лекса и Хелен, Кларк слышит странный звук исходящий из их подвала.

Биологический отец Кларка Джор-Эл хочет, чтобы он покинул Смолвиль. Не желая оставлять семью и друзей, Кларк крадет копию ключа у Лайонела, сделанную из зелёного криптонита. Он вставляет ключ в корабль и тот взрывается. Это становится причиной того, что Марта теряет ребёнка. Чувствуя свою вину, Кларк решает уехать из Смолвиля, надев кольцо с красным криптонитом Хлои. Во время полёта с Хелен, Лекс просыпается и видит что самолет падает, а Хелен и пилот пропали.

Под влиянием красного криптонита Кларк отправляется в Метрополис, в то время как друзья и родители отчаянно пытаются найти его. Лекс вынужден столкнуться лицом к лицу со своими страхами на необитаемом острове. Джонатан Кент должен заплатить огромную цену за возможность вернуть сына.

В то время как Кларк и Джонатан сражаются друг с другом, Лекс возвращается в Смолвиль. Кларк должен иметь дело с главой криминального мира Морганом Эджем. Лекс должен определить, кто пытался убить его — Лайонел или Хелен.

Кларк обнаруживает, что кто-то охотится на людей поражённых осколками метеорита. Он узнает, что следующая жертва — Лекс. Кларк использует свою силу, чтобы спасти Лекса, но убийца застает Кларка врасплох, узнав о его слабости и создаёт пули из криптонита.

Кларку снится молодая напуганная девушка, которой нужна помощь. Он обнаруживает, что эта девушка — его соседка, которая лежит в коме уже несколько лет. Кларк обращается за помощью к Лане, чтобы узнать причины этого. Тем временем Лайонел требует, чтобы Лекс прошел психологическую проверку, перед тем как он возьмёт его на работу.

Перри Уайт — многообещающий журналист, чья карьера была уничтожена Лайонелом Лютором, приезжает в Смолвиль в поисках историй о инопланетянах для бульварной газеты. Несмотря на опьянение, Перри верит, в то что видел, как Кларк использовал его супер-скорость, поэтому он разрабатывает опасный план раскрытия силы Кларка. К несчастью из-за вспышек на Солнце Кларк временно теряет контроль над своими способностями. Тем временем Лекс узнает, что у Перри есть информация о темном прошлом его отца, Лайонела.

Кларк узнает, что Джор-Эл был уже на земле 40 лет назад. Дядя Ланы, которому был вынесен приговор за убийство его жены 40 лет тому назад, показывает ей фотографию мужчины, он верит, что этот человек убил её тетю. Лана потрясена, увидев на фотографии скитальца, похожего на Кларка. Кларк уверен, что этот мужчина — Джор-Эл. Расследование Кларка приводит его к медальону с криптонитом, что позволяет ему видеть отрывки прошлого. Выясняется, что Джор-Эл начал здесь жить за долго до появления Кларка на земле.

Лана неожиданно сближается с школьным приятелем и начинает вести себя как бунтарка, что в конечном счете оборачивается для неё тюремной камерой. Подозрения Кларка подтверждаются, когда он обнаруживает, что у нового друга Ланы есть магнетические способности, которые позволяют ему передвигать предметы и изменять чувства людей. Тем временем Лекс обнаруживает, что Хлоя все больше углубляется в расследование прошлого его отца, он предлагает объединить их усилия против Лайонела.

Лекс определяет место нахождения Моргана Эджа и уговаривает его признаться в том, что у него были грязные делишки с Лайонелом. Лекс пытается передать Эджа властям, но кто-то пытается убить Лютора-младшего в особняке. Чудом спасшийся Лекс убегает и просит у Кларка помощи. Когда Кларк возвращается в особняк для расследования, он не находит ничего необычного и начинает сомневаться, было ли это в действительности, особенно после того, как Лайонел заявляет, что у Лекса был психический срыв и он должен быть помещен в больницу.

Трое бывших противников Кларка обращаются к Лексу, чтобы заручиться его помощью и заманить Кларка в больницу, после того как они узнают, что Лайонел потребовал лечить Лекса с помощью шокотерапии, чтобы стереть его память. Но дела идут скверно, злодеи обманывают Лекса и используют криптонит, чтобы украсть силы Кларка. Тем временем Лана встречает загадочного незнакомца Адама в больнице.

Кларк временно слепнет, когда пытается остановить ограбление, он использует термозрение. Но вскоре, чтобы компенсировать недостаток зрения, у него проявляется суперслух. Как и в других случаях при появлении различных способностей, Кларк сперва не может контролировать этот дар.

Кто-то пытается убить Хлою по неизвестным причинам после того, как приходит письмо из Института Саммерхолт. Кларк должен найти отправителя этого письма. Хлоя обнаружила доказательство того, что они проводят исследования контроля над разумом человека. Лана решает арендовать квартиру над кафе для Адама, несмотря на предположение, что он скрывает нечто опасное о своем прошлом.

Кларк обнаруживает, что его одноклассник Джордан может предвидеть будущее. Он ужасается когда Джордан говорит ему, что видит Лану погибающей на пожаре в ближайшие несколько дней. Хлоя расследует обстоятельства жизни Адама из-за его подозрительного поведения. Девушка обнаруживает несколько волнующих подробностей.

Пит выигрывает уличную гонку, хотя организаторы просят его проиграть. Теперь они угрожают его жизни, поэтому он просит Кларка использовать свою силу, чтобы остановить их. Кларк взбешен из-за того, что тот поставил его в такое положение. Он должен помочь ему и сохранить секрет. Тем временем Джонатан начинает сожалеть о последствиях сделки с Джор-Элом.

Кларк вынужден использовать свои силы перед Алисией, новой девочкой в школе. Он удивлен, обнаружив, что у неё есть свои собственные силы. Они создают союз. Но со временем выясняется, что у Алисии есть куда больше тайн, зачастую неприятных. Тем временем Лана просит Лекса получить сведения об Адаме.

Джонатан ожидает операции на сердце. В это время Кларк знакомится с Гарретом, старший брат которого, Винц, умирает из-за болезни печени. Вскоре Винц появляется в больнице, живой и невредимый, но через некоторое время он снова начинает умирать. Гаретт привязывает к себе криптонитовую бомбу и требует, чтобы Джонатан стал донором.

Лана звонит Кларку, и сообщает, что её преследуют. Однако встретившись с Ланой в Тэлоне, Кларк узнает, что на неё никто не нападал и она ему не звонила. Кларк берется за расследование. Узнав, что звонок произошел из будущего, он пытается предотвратить роковые события…

Джонатан начинает вести себя странно. Кларк думает, что Джор-Эл отправляет сообщения Джонатану с помощью ключа, и это становится причиной того, что отец уходит из семьи. Кларк спускается в пещеры, чтобы столкнуться лицом к лицу со своим биологическим отцом, но Лайонел ловит его там и начинает собирать кусочки мозаики воедино, поручая это дело надежному доктору Свонну. Два миллиардера сталкиваются между собой, и здесь открываются истинные мотивы поведения Лайонела.

Когда Хлоя случайно вдыхает пары необычного крипто-газа, она обнаруживает, что это действует как сыворотка правды для тех, кто с ней разговаривает. Хлоя решает использовать свою способность и открыть секрет Кларка. Но её новая сила может привести к фатальным результатам. Кларк должен найти противоядие прежде, чем он раскроет правду о себе.

Веря, что ключевая информация о прошлом отца Лекса, была потеряна после электрошока, Лекс решает присоединиться к экспериментальной программе доктора Гарнера, чтобы восстановить её. Вспомнив всё, он сможет выдать отца ФБР. Зная, что Лекс раскроет секрет, если вернет память, Кларк решает остановить его. Но Кларка ловит Лайонел и подвергает такому же радикальному лечению. Теперь Лайонел может выяснить секрет Кларка.

Когда индеец Ковачи крадёт мифический нож из пещеры, ему даруется супер сила, очень похожая на силу Кларка. Молодой человек верит, что он легендарный Наман — человек, упавший со звезды. Кларк узнает о легенде, которая предсказывает, что с помощью ножа можно определить Сагита — врага Намана. Он пытается исправить это, прежде чем молодой индеец сможет использовать нож на Лайонеле.

Кларк решает рассказать Лане свой секрет, чтобы они наконец-то смогли быть вместе. Тем временем агент ФБР похищает и пытает Пита, чтобы тот открыл ему секрет Кларка. Лекс паникует после того, как ФБР дает ему 24 часа чтобы передать информацию о его отце. Помощь приходит совершенно из неожиданного источника. В то время, из камеры сбегает Эмили и притворяется новой хозяйкой кафе по имени Эмма. Эмили/Эмма похищает Лану и запирает её в камере и никто не ищет её, потому что все думают что она уехала. Пит решает уехать из города с мамой.

Всё меняется, когда Кара — симпатичная девушка с суперсилой, которая прибыла с Криптона, пытается убедить Кларка выполнить своё предназначение. Кларк обращается к родителям за советом. Он шокирован, когда Кара заставляет Джонатана рассказать о его договоренности с Джор-Элом. Также Кларк делает открытие, которое предопределяет его отношения с Лексом. В конце сезона отношения Кларка и Ланы достигают последней стадии.

Кларк возвращается в Смолвиль, перепрогамированный в Кал-Эла. Полный решимости исполнить своё предназначение, Кал-Эл летит к небу, чтобы украсть мощный кристалл с Криптона. Тем временем Лоис Лейн приезжает в город, чтобы расследовать убийство своей кузины Хлои. Также Лана возвращается из Парижа с новыми планами и новым бойфрендом. Джонатан находится в коме. Лайонел сталкивается с новой страшной жизнью в тюрьме.

Кларк и Лоис расследуют мнимое убийство Хлои, но их останавливает армейский офицер, Генерал Сэм Лейн - отец Лоис. Кларк узнает, что Сэм недавно общался с Лексом. Джейсон приезжает из Парижа и уверяет Лану в необходимости продолжения их отношений. Подозревая, что Хлоя все еще жива, Лайнел отправляет наемного убийцу с способностью преобразовывать свои конечности в металическое оружие, чтобы Хлоя не смогла дать показания против него.

Кларк встречает нового противника в лице стеснительной ученицы, которая обращается к пластическому хирургу, чтобы улучшить свою внешность и поднять свою популярность. Криптонит улучшает красоту, но это наносит ущерб тем кого она целует. Тем временем Джейсон и Лана продолжают скрывать их взаимоотношения от Кларка.

Кларк вступает в школьную футбольную команду и немедленно занимает позицию защитника после того, как предыдущий защитник провоцирует драку с новым тренером Джейсоном. Заинтересовавшиеся изменениями в поведении своего бывшего партнера по команде, Кларк и Лоис начинают расследование и узнают, что группа поддержки отравляет питьевую воду для команды криптонитом.

После кражи бумажника Джонатана, Кларк использует суперскорость, чтобы догнать вора. Однако похититель ускользает от Кларка со скоростью, превосходящей скорость Кларка. Барт, известный также по кличке Импульс, позже появляется на ферме и пытается поговорить с Кларком и убедить его оставить Смолвиль для того, чтобы жить в дороге использовать их суперсилу. Тем временем Лекс покупает бесценный заключенный в раму манускрипт с Криптоническими символами. Кларк узнаёт, что в карте спрятано что-то таинственное.

Кларк слышит мощный звенящий звук, который исходит из тюрьмы, где находится Лайонел. Когда он видит Лайонела, пытающего нанести удар Лексу с помощью пылающего камня, он пытается схватить камень, в результате чего Кларк и Лайонел меняются телами. Лайонел понимает, что его новое тело обладает суперсилой. Пойманный в ловушку за решёткой без своей силы, Кларк должен найти выход, чтобы заполучить своё тело и силу обратно.

Хлоя вовлечена в подпольный азартный клуб в школе со студентом Микеллом Миксэлпитэлеком и теряет все свои сбережения во время футбольного матча, после того как Микел использует свои силы для контроля всех игроков, включая Кларка. Когда Хлоя узнает секрет Микела, он похищает её и угрожает убить, если Кларк не проиграет игру. Лекс угрожает Микелу депортацией, если тот не использует свои силы в пользу Лекса.

После того как Лана прикасается к кровавому следу в книге 1600 года, она, Лоис и Хлоя становятся одержимы ведьмами, которые были сожжены заживо. Три ведьмы вернулись, чтобы добиться отмщения и найти мощные криптонические кристаллы, нанося вред и ущерб в городе. Кларк пытается остановить ведьм, но они лишают его силы и заставляют раскрыть место положение кристала, который он спрятал в пещере.

После того как Лекс обвинен в убийстве, Кларк намеревается доказать его невиновность. Клянясь, что он изменился, Лайонел предлагает Кларку проникнуть в суть преступления, но он требует кое-что взамен. Тем временем Лана встречает мать Джейсона и видит яркое воспоминание происшествия в Париже, подтверждающий своё подозрение, что она была там, когда у Ланы появилась татуировка.

Тайный эксперимент Лекса в ЛюторКорп принимает скверный оборот и опасный токсин попадает в Смолвиль. Те кто инфицированы токсином, включая Кларка, Лану, Лекса и Джейсона, воображают, что их самые страшные страхи становятся правдой и затем впадают в кому. Отчаявшись найти лекарство, Кларк предлагает немного своей крови Лексу.

Убедив всех в своем окончательном выздоровлении, Алисия выписывается из больницы БеллеРив и приезжает в Смолвиль, чтобы вновь разжечь былые отношения с Кларком. В начале, к разочарованию Алисии, Кларк видит в ней только человека, который знает его секрет. Тогда она решает получить от него больше и использует красный криптонит. «Плохой Кларк» появляется и мгновенно забирает Алисию в Лас-Вегас, чтобы жениться на ней.

На Лану и Джейсона нападает неизвестный, и они оказываются на волоске от смерти. Алисия является главным подозреваемым. Кларк сначала защищает свою новую девушку, но когда доказательства постепенно набираются, он начинает смотреть на Алисию по новому. В результате причинённой боли Кларком, Алисия раскрывает его силы перед Хлоей. Алисию убивают. Тем временем мать Джейсона возвращается в город с предложением для Лекса.

Чтобы заполучить Кларка в футбольную команду, Мет Ю отправляет их звёздного игрока Джефа для того чтобы тот показал Кларку, как они заинтересованы в нём. Один из игроков Мет Ю умирает при загадочных обстоятельствах, и Лоис арестована по обвинению в этом убийстве. Кларк узнаёт, что Джеф обладает суперсилой и использует её для парализации тех, кто встанет на его пути — включая Лоис. Тем временем Хлоя продолжает наблюдать за Кларком и узнает все больше его секретов.

Ведя машину, Лоис случайно сбивает собаку. Она приносит её на ферму, чтобы вылечить. Кларк узнает, что эта собака необычная после того, как щенок тянет за собой на цепи трактор. Кларк и Лоис узнают, что собака — это результат неудачного эксперимента ЛюторКорп, и использовалась для совершения преступлений. Тем временем Лана озадачена участием Джейсона в делах его мамы.

Узнав, что Джейсон и Лекс находятся в Китае в поисках таинственного кристалла, Кларк и Лана следует за ними в надежде найти его первыми. Кларк находит артефакт, который приведет их к кристаллу, но на его пути встаёт ведьма Изобел, которая собирается снова завладеть телом Ланы, чтобы забрать кристалл себе.

Младшая сестра Лоис, Люси, с которой они не виделись долгое время приезжает в город и очаровывает каждого с кем встречается. Тем не менее Кларк раскрывает темную сторону Люси, после того как замечает её ворующей деньги из бара. Он вынуждает рассказать правду о её неожиданном появлении в Смолвиле. Тем временем кристалл исчезает из комнаты Ланы и Джейсон обвиняет Лайонела в этом преступлении.

Взрыв криптонита разделяет Лекса на двое, и мы знакомимся с его дьявольской половиной. Он немедленно запирает Лекса в особняке и начинает своё буйство — пытается убить Кларка и Хлою в лаборатории, сражается с Лайонелом и угрожает закрыть Тэлон, если Лана не переедет к нему.

Хлоя поражена тем, что её номинировали на звание Королевы Школьного Бала. Она пытается уговорить Кларка и Лану пойти с ней на танцы. После того как её конкурентка Дон, попадает в автомобильную аварию в ущелье заполненное криптонитом, появляется дух Дон и начинает вселяться в тела, и изменяет их поведение. Лекс приготовил для всех специальный подарок — группа «Lifehouse» будет играть на танцах.

Кевин — парень который может влиять на людей так, что они теряют память. Он использует свои силы на Кларке, и тот полностью теряет память. Хлоя рассказывает Кларку о произошедшем, и учит его использовать свои силы в тайне от других. Путешествуя по страницам памяти, Кларк встречает Лану и влюбляется в неё вновь. Пользуясь ситуацией, Лекс убеждает Кларка показать ему, где спрятаны три камня.

Кларк и Лана находят брошенного ребенка на кукурузном поле и приносят его на ферму Кентов. За несколько дней новорожденный вырастает в 7 летнего ребенка. Кларк и Лана понимают, что он быстро стареет. Они начинают искать выход, прежде чем болезнь убьёт его. Тем временем Женивьева просит Лайонела убить Лану, иначе он окажется в тюрьме снова.

Школьный фотограф хочет сделать копию школы с помощью своих способностей заморозки и начинает похищать одноклассников, в том числе Хлою. Делает он это для того чтобы увековечить память о славных днях школы навсегда. Лекс и Лайонел похищены. Их пытает Джейсон в надежде найти кристалл. После того как Женивьева осознает, что кристалл у Ланы, она решает покончить с охотой на кристалл раз и навсегда.

Кларк начинает понимать зачем он был послан на землю после ночного кошмара о том, что нечто ужасное должно произойти в Смолвиле. Кларк приходит в пещеру, чтобы найти ответы у Джор-Эла. Его биологический отец говорит, что он должен соединить три кристалла немедленно, иначе произойдет катастрофа на планете и даже Кларк не сможет остановить это. Тем временем Лекс отбирает один из кристаллов у Лайонела. Понимая, что кристаллы связаны с Кларком, Хлоя пытается остановить Лекса от раскрытия правды.

Кларк спасает Землю от уничтожения, но опасность не отступила: пара злодеев-криптонианцев прибывают на Землю в поисках Кларка. Джор-Эл использует их, чтобы вернуть Кларка в Арктику, в только что построенную Крепость Одиночества к концу сего же дня или последствия будут ужасны. Однако в конце эпизода Кларка ждут гораздо более серьёзные и интригующие испытания, чем парочка суперврагов.

Кларк теряет свои силы. Джор-Эл лишает его суперспособностей, и Кларк становится обычным человеком. Обрадованный этим, он возобновляет отношения с Ланой, теперь между ними нет тайн. Однако, когда Лану, Джонатана и Марту берут в заложники три головореза, Кларк должен выяснить, как спасти близких, не имея теперь суперсил.

Габриэль предупреждает Хлою, что он собирается выпустить ракету и стереть Смолвиль с лица земли. Все ещё без своих суперсил, Кларк пытается помешать Габриэлю и получает огнестрельную рану. В больнице Кларк находится в состоянии клинической смерти, его судьба теперь в руках Джор-Эла. Тем временем, Лекс уверен, что у Лайонела есть ключ, чтобы открыть космический корабль.

Отдых на кратерном озере заканчивается драматично, когда Лоис ударяется головой во время прыжка в озеро. Но Кларк не успевает спасти её, это делает за него загадочный пловец Эй Си - Аквамен. Профессор Файн рассказывает Кларку, что Лекс скрытно разрабатывает оружие. Эй Си пытается проникнуть в лабораторию Лекса, чтобы уничтожить оружие, но оказывается в руках Лекса.

Лана буквально в последнюю минуту решает поступить в Университет Метрополиса. Поскольку она опоздала с поступлением и общежития заняты, она пробует стать членом общины Университета, чтобы получить место в их доме. Однако её новые подруги предлагают ей больше чем место в доме. Они обращают её в вампира и приказывают убить Кларка. Тем временем Хлоя отправляется на собеседование в Дэйли Плэнет, желая проходить там практику. Но суровому главному редактору не легко угодить.

Кларк и Джонатан в волнении. Сенатор Джейк Дженнингс, старый друг Джонатана, прибывает к Кентам, в поисках поддержки в предвыборной кампании. Но тут погибает девушка из стрипклуба, выясняется, что она была любовницей Дженнингса. Это делает его первым подозреваемым. В поисках ответа, кто же убил девушку, Хлоя убеждает Лоис устроится в клуб в качестве стриптизерши.

Под влиянием серебряного криптонита Кларк начинает испытывать параноидальные галлюцинации. Он уверен, что Хлоя откроет его секрет, что Джонатан задумал что-то с Лайонелом против него, что у Лекса с Ланой тайные отношения. Хлоя и Кенты лихорадочно ищут средство излечения, но лишь доктор Файн приходит на помощь, однако преследуя свои собственные интересы.

Профессор Файн уговаривает Кларка разрушить Крепость Одиночества. После того, как Марта заболевает неизвестной болезнью, жить ей остаются считанные часы. Кларк обращается к профессору Файн, который убеждает Кларка, что именно Джор-Эл повинен в болезни матери, и что единственный способ спасти ей жизнь — уничтожить Крепость Одиночества. Но как только они вдвоем прибывают в Крепость, профессор Файн пытается освободить генерала Зода и уничтожить Кларка.

Лекс получает конверт с компроматом, который может уничтожить жизнь Джонатана. Он должен решить, будет ли использовать это, так как нанесёт ущерб Кларку и Марте. Прежде чем он успевает принять решение, в него стреляют и он впадает в кому. Ему снится, что его мать навещает его. И показывает ему какая была бы жизнь, если бы он был вдали от отца и ЛюторКорп. В другой жизнь у Лекса счастливый брак с Ланой, которая ожидает ребенка. Тем временем Хлоя просит Кларка использовать свои способности, чтобы отправить рождественские подарки нуждающимся детям.

Джонатан получает угрозы из таинственного источника, который убеждает его выйти из предвыборной гонки. Позже, когда Кларк находит отца окровавленным и избитым, он решает найти нападавшего. Он обнаруживает, что группа сторонников Лекса собирается сделать что угодно, чтобы Лекс выиграл выборы. Лоис похищена и её жизни угрожают, заставляя убить Джонатана во время его речи. Лайонел предлагает Марте деньги, чтобы помочь кампании Джонатана. Лана убеждена, что ответы, которые она ищет, лежат в расследовании первого метеоритного дождя.

Двое полицейских, которые видели, как приземлился космический корабль во время метеоритного дождя, захватывают Лекса и Лану. Они угрожают их убить, если Лекс не откроет им местоположение корабля. Они пытаются спрятаться в бункере в особняке, и Лекс получает пулю, предназначенную Лане. Испугавшись, что Лекс может умереть, Лана просит его рассказать полицейским, где находится корабль, но он утверждает, что корабль исчез несколько недель назад. Тем временем, Кларк узнает, что Лана исследовала космический корабль с Лексом, и боится, что она совсем близко, чтобы узнать его тайну.

Кларк наконец открывает свой секрет Лане. Джонатан и Лекс узнают результаты выборов в сенат. А во время автокатастрофы умирает тот, кого любит Кларк. В отчаянии он обращается за помощью к Джор-Элу.

На Марту нападают грабители, но её спасает таинственная женщина. Кларк узнает, что новый репортер Дэйли Плэнет неуклюжая Андреа, на самом деле мстительница, которая борется со злом по ночам.

Дух молодой девушки появляется после того как Хлоя Салливан находит труп в стенах Телона. Кларк и Хлоя должны последовать за духом и найти её убийцу, который мучает девушек в Смолвиле на протяжении 10 лет.

Полный сочувствия доктор отпускает на волю Виктора — получеловека, полумашину, над которым проводили эксперименты в ЛюторКорп, но как только он убегает, его сбивает Лана. Видя, что на Викторе нет и царапины, она обращается к Кларку, который быстро находит киборга. Вместе они пытаются найти девушку Виктора, но прежде чем им это удаётся, Лекс забирает пациента обратно в ЛюторКорп.

Лекс узнает, что профессор Файн, находится в Гондурасе, и хочет поквитаться с ним. Кларк встречается с красивой и соблазнительной девушкой Симоной, которая использует гипнотические чары, чтобы все исполняли каждое её желание. Кларк раскрывает свои способности Симоне, которая решает воспользоваться Кларком, чтобы убить Лекса.

Все ещё расстроенная расставанием с Кларком, Лана принимает опасную сыворотку и видит умерших родителей. Обеспокоенный Кларк торопится помочь Лане. В результате его укалывают криптонитовой сывороткой, и ему удается пообщаться с недавно погибшим Джонатоном, который предупреждает его, что Лайонел знает его секрет. А Лайонел тем временем продолжает сближаться с Мартой.

Кларк и Марта приютили маленькую девочку Медди после трагической смерти её приёмной матери. Когда выясняется, что у Медди есть сила разрушать стекло, она становится главной подозреваемой. Тем временем, Хлоя застала Лекса и Лану в неловкой ситуации.

Маньяк в маске берет Лайонела в заложники и организовывает серию тщательно спланированных игр. Лайонел должен выиграть, чтобы остаться в живых. Кларк сообщает Марте, что Лайонел знает его секрет, она собирается поговорить с ним, но неожиданно становится частью игры маньяка.

В Метрополисе Кларк спасает жизнь незнакомцу по имени Грехем, который обещает отплатить Кларку за его доброту. К несчастью Грехем оказывается наёмным убийцей с способностью становиться невидимым, и решает убить Лекса, потому что это было бы лучшим подарком для Кларка.

Кларк поражен, когда видит привидение своего отца на кладбище, но ещё больше его шокирует то, что он говорит ему убить Лайонела. Тем временем Лекс разрабатывает вакцину против смертельного вируса Файна, но тот вступает в дело и вводит вакцину, что вызывает своеобразную реакцию у Лекса.

Брэйниак (Файн) выпускает смертельный вирус, который может убить миллионы людей, и отказывается дать вакцину Кларку, пока тот не согласится выпустить Зода. Кларк обращается к Лайонолу, который однажды общался с Джор-Элом. Тем временем Лекс шокирован своими новыми способностями. Он рассказывает о них Лане, которая решает быть с ним, во что бы то не стало, ещё не зная какой оборот примет жизнь Лекса с помощью дьявольских махинаций Брэйниака.

Кларк в ловушке в фантомной зоне, в то время как в тело Лекса воплотился Зод, чтобы уничтожить Землю. В суматохе всеобщего хаоса Хлоя неожиданно сталкивается лицом к лицу с человеком из своего прошлого, которого она меньше всего ожидала увидеть снова — Джимми Олсеном. Заброшенный в фантомную зону Кларк оказывается без своих суперсил, в окружении бандитов, которые хотят отомстить Джор-Элу — биологическому отцу Кларка. Тем временем, получивший тело Лекса, Зод удерживает Лану, желая получить от неё наследника, чтобы начать изменение Земли по типу Криптона. Он хочет использовать жёсткий диск с корабля криптонцев. Самолёт Марты и Лоис терпит крушение рядом с Крепостью. Джор-Эл объясняет Марте, как убить Зода.

Беспрестанно работая над устранением последствий Чёрного Четверга, Кларк подрывает своё здоровье и впервые в жизни простужается. Его простуда ведёт к развитию новой сверхспособности — супердыхание. Лана переезжает жить к Лексу в особняк. Лексу кажется, что кто-то следит за ним. Его подозрения вскоре подтверждаются, его похищают.

Кларк, Хлоя и Джимми расследуют загадочные убийства людей, совершённые в лесах неподалёку от Смолвиля. Некое существо использует тела людей, чтобы поселять там свои семена. Тем временем Лекс проводит благотворительный бал в пользу жертв Чёрного Четверга. Лоис соглашается пойти с Оливером Куином на бал Лекса.

На мероприятии по сбору средств на благотворительность Лоис становится свидетелем, когда Зелёная Стрела крадёт редкостное алмазное ожерелье с шеи Марты. Она клянется разгадать, кто скрывается за зелёным костюмом. Кларк проводит собственное расследование и обнаруживает, что Оливер Куин и есть Зелёная Стрела, что именно он грабит богатых, отдавая награбленное бедным. Тем временем Лекс с помощью Лайонела устраивает проверку преданности Ланы.

Будучи подростком, Лекс и Оливер посещали одну и ту же частную школу. Оливер с друзьями третировали Лекса и его друга Дункана. Лекс обещает Дункану помочь выбраться наверх, к высотам бизнеса. Лекс и Оливер возвращаются в школу в наши дни для встречи с одноклассниками. Школьные друзья Оливера начинают гибнуть один за другим. Тем временем Кларк получает снимки со спутника, сделанные в день его возвращения из Фантомной Зоны, которые подтверждают, что вместе с ним на Землю прорвались заключённые из фантомной зоны.

Кларк поражён, узнав, что Райа смогла бежать из Фантомной Зоны. Они быстро сходятся, хорошо понимая друг друга. Райа объясняет Кларку, как восстановить Крепость. Однако Бэйрн, убийца, сбежавший из Фантомной Зоны, нападает на Райу и Кларка, ища мести за своё заключение в Зону.

Кларк узнает, что Зелёная Стрела был ранен, когда пытался спасти парочку от ограбления. Но Оливер уверяет, что всё в порядке. Позднее Оливер становится агрессивным, неуравновешенным, и Кларк с Хлоей проводят расследование, выясняя, что Оливер принимает суперлекарство, излечивающее моментально, но имеющее побочные эффекты. Тем временем Лана делает шокирующее открытие.

Кларк узнает, что один из беглецов из Фантомной Зоны оказался в Сиэтле и уничтожил экипаж корабля. Во время расследования Кларк сталкивается с ужасным монстром, который высасывает кости из тел людей. Тем временем пациент секретной лаборатории ЛюторКорп, обладающий способностью видоизменяться в различные волны и излучения, сбегает с целью мести Лексу. Он заключает Лекса в особое измерение, где Лекс может видеть и слышать всех, но его никто не замечает.

Кларк в шоке, когда узнает, что его сосед фермер Джед МакНэлли держит у себя незаконно эмигрантов, силой принуждая работать на себя. Сам себя считая нелегальным эмигрантом на Земле, Кларк ищет помощи у Марты, чтобы помочь мексиканскому парню и его матери.

После того как Лана признается Хлое в своих колебаниях по поводу брака с Лексом из-за старых чувств к Кларку, репортер колонки сплетен Линда Лэйк пишет заметку в деталях об их разговоре. Чтобы не дать истории ход, Хлоя берётся за Лэйк и узнаёт, что та имеет способность превращаться в воду и использует это, чтобы подслушивать и узнавать сплетни для своей колонки. Тем временем Лоис начинает подозревать Оливера в том, что он и есть Зелёная Стрела и просит Кларка помочь доказать это.

Зелёная Стрела посылает за подкреплением, и Барт, он же Флэш или Импульс, Аквамэн и Киборг возвращаются в Смолвиль, чтобы разрушить секретную лабораторию ЛюторКорп. Во время взлома ЛюторКорп Флэш пойман, Лекс пытает его, Кларк пытается спасти Барта, но оказывается без сил из-за криптонита. По тревоге Хлоя спешит за помощью к Оливеру, и вновь созданная Лига начинает действовать, чтобы вытащить Барта и Кларка. Позже Лоис разрывает отношение с Оливером.

На Кларка совершается нападение. Очнувшись, он оказывается в психиатрической лечебнице. Его врач, доктор Хадсон рассказывает, что Кларк здесь уже пять лет, предаваясь фантазиям насчёт своего внеземного происхождения. В этом мире Марта замужем за Лайонелом Лютором, Хлоя душевнобольная, Лана выбрала Кларка, а не Лекса. Она умоляет Кларка согласиться на процедуру доктора Хадсона, и тогда они могли бы быть вместе. Но один из пациентов Джон, он же Марсианин рассказывает Кларку, что «добрый» доктор на самом деле фантом, что Кларк должен убить его, чтобы вернуться в реальность. Кларку предстоит принять тяжёлое решение.

После того, как Лоис испробовала помаду, изготовленную на основе красного криптонита, её охватывает непреодолимая тяга к Кларку. После жарких поцелуев красный криптонит передаётся Кларку, и тот немедленно слетает с тормозов, превращаясь в «плохого Кларка». Под влиянием метеорита Кларк вламывается на свадебный обед к Лексу и Лане и похищает будущую невесту.

За Ланой кто-то следит, она пытается выяснить кто это, не при помощи Лекса, так как может быть раскрыт секрет Кларка. В это же время Кларк Кент и его подручные друзья Джимми и Хлоя расследуют это дело и выясняют, что здесь замешан один фотограф, но вскоре выясняется, что не всё так просто и здесь также замешан и один из охранников Лекса (помешанный на Лане Лэнг).

Кларк и Хлоя обнаруживают Тобиаса — молодого человека, ослепленного метеоритным дождем, у парня появилась способность видеть людей заражённых метеоритами. Лекс с его помощью находит людей со способностями и ставит эксперименты над ними. Лана узнает о даре Тобиаса, и боится, что тот увидит Кларка как заражённого, поскольку один из них, предлагает ему пересадку глазной роговицы в обмен на его молчание. Однако Лана не готова узнать, что Кларк заражён.

В день своей свадьбы с Ланой Лекс получает звонок от доктора Лэнгстона, который угрожает рассказать Лане правду о её ребёнке. Лана начинает смотреть на свадьбу с другой стороны, а Кларк приходит ко мнению, что он не может позволить Лане выйти замуж за Лекса и решает раскрыть ей свой секрет. Тем не менее, никто не ожидал вмешательства Лайонела Лютора.

Кларк и Хлоя обнаруживают, что Титан, фантомник, является звездой секретного клуба борьбы, кровавые смертельные сражения которого передаются в Интеренет. Лоис чувствует запах истории и решает расследовать это дело самостоятельно, но захвачена и вынуждена участвовать в поединке с Атэной, как её первый противник. Кларк показывает силу, таким образом он может бороться с Титаном, но ошеломлён, когда вместо Титана на ринг выходит Лоис.

Лекс находит мать Хлои, Мойру, которая имеет способность управлять метеоритными фриками. Он разрабатывает лекарство, чтобы пробудить Мойру от её неподвижного состояния в психиатрической лечебнице, а затем угрожает убить Хлою, если она не использует свои способности, чтобы помочь ему. Кларк помогает Хлое ворваться в психиатрическую лечебницу, чтобы спасти Мойру и, наконец, узнать её мать.

После того, как Джоди, жена спецсолдата, устанавливает самодельную бомбу в одной из лаборатории Лекса — Лайонел сильно ранен, а Лекс взят в заложники разъярённой супругой. Лекс похитил её мужа, поэтому Джоди угрожает взорвать всю лабораторию с Лексом внутри, если он не скажет ей, где её муж. Кларк отправляется, чтобы спасти Лекса, но тотчас же сбит с ног криптонитом, которым покрыты глиняные стены. Лекс и Кларк понимают, что единственный способ спастись — это помочь друг другу.

После секретной встречи с Лайонелом Лана ранена в «Дэйли Плэнет» таинственным бандитом. Джимми лезет из кожи вон, изучая фотографии места преступления, и видит сон «Смолвиль в 40-х годах», в котором Лана является роковой женщиной, которая организовала убийство своего мужа, магната Лекса, Кларк работает в «Дэйли Плэнет» репортером, а Лоис — певица, работающая в баре, принадлежащим Лайонелу. Тем временем, в 2007 году, Кларк обнаруживает, почему Лана вышла замуж за Лекса.

Сенатор Берк выделяет миллиарды ЛексКорп на проект «Арес». Берк узнает, что Лекс хочет размножить Арес вместо производства прототипа. Он угрожает закрыть проект, на что в ответ Лекс угрожает поведать миру какая сумма у сенатора на счёте в Кайманах. Позже, Лоис говорит с сенатором перед рестораном о его кайманском счёте, и его и его охрану убивает кто-то незамеченный. Кажется прототип сбежал.

Кларк хочет убить Лайонела, когда узнал, что тот угрожал убить его, если Лана не выйдет замуж за Лекса. Лана говорит Лексу, что уходит от него, и Марсианин возвращается чтобы помочь Кларку остановить Лекса, который пытается найти последнего призрака из Фантомной Зоны, чтобы использовать его ДНК для создания всемогущей армии супер солдат. Тем временем Лоис направляется в Дамбу Надсмотрщиков в поисках информации о секретной лаборатории Лекса, где получает жестокий удар от охранника. Секретная сила Хлои раскрывается.

Кларк стоит перед фантомом, последним привидением из Фантомной Зоны, но последующая борьба заставляет сломаться дамбу и поток воды спешит вниз к земле. Лекс, которого только что арестовали за убийство Ланы, погружен под водой в патрульной машине, но спасен загадочной молодой женщиной. Лоис удалось вытянуть Хлою в безопасное место, но её считают мертвой в больнице. Та же женщина, которая спасла Лекса, появляется снова на ферме Кентов. Её находит Кларк и узнает что она супердевушка и его кузина с Криптона.

Кларк и Лоис обнаруживают космический корабль Кары, но прежде, чем они смогли открыть его, появляется Кара и ударяет Лоис. Кларк потрясен после того, как Кара сообщает ему, что она должна защитить младенца Кал-Эла. Несмотря на появление Кары, расстроенный Кларк решает, что без Ланы ему нечего делать в Смолвиле, и хочет отправится в Крепость Одиночества, чтобы начать готовиться как супергерой. Тем не менее, Джор-Эл называет ему отца Кары — Зор-Эла, который — брат Джор-Эла и предупреждает что Кара опасна, следовательно, Кларк должен остаться в Смолвиле, чтобы узнать зачем она пришла на Землю. Лекс делает ошеломляющие открытие относительно Ланы и проекта 33.1.

Кара отчаянно хочет обзавестись друзьями и остаться на Земле, но Кларк говорит ей, чтобы она не высовывалась, пока она не сможет управлять своими силами. Несмотря на его предупреждения, когда проходит конкурс красоты «Мисс Кукурузы», и Кара встречает конкуренцию — Тайлер, Карли и Буря — три заражённых метеоритами лисицы, которые используют свои силы, чтобы украсть ценную карту в скрытой капсуле времени в Смолвиле. После того, как Тайлер увидит Кару, использовавшую свои силы, девушки притворяются, что они её друзья, но в действительности планируют использовать её для своего плана.

Хлоя узнает, что доктор Куртис Кнокс оперирует заражённых метеоритами людей и удаляет их способности. Отчаянно, чтобы избавиться от своих сил, Хлоя назначает ему встречу, не подозревая, что доктор Кнокс имеет гнусный план убивать своих пациентов и вырезать их органы. Тем временем, Кара уговаривает Джимми помочь ей найти кристалл и игнорирует Кларка, чтобы остаться на ферме после того, как она обнаружит своё местоположение. Лана устанавливает секретный надзор за Лексом.

Резиденты Смолвиля трепещут когда «Ангел Воитель», кино, основанное в комической книге, начинают снимать в городе. Тем не менее, известная актриса, Рэйчел Дэвенпорт, снимаясь в сцене с автомобилем, узнаёт, что у него сломаны тормоза. Затем в неё пытаются стрелять. Кларк спасает её. К несчастью, одержимый оператор свидетельствует этому героическому случаю и решает что Кларк — супергерой настоящего, чья подруга Лана, и она должна умереть, чтобы Кларк принял свою судьбу супергероя. Тем временем, Лекс обнаруживает Лайонела.

Кларк узнаёт, что Кара в Вашингтоне и она ищет кристалл. Кару схватят после того, как она сломает лабораторию и введут в вену криптонит — сыворотку истины. Сыворотка заставляет её вспомнить свою предшествующую поездку на Землю, когда она сопровождала биологическую мать Кларка, Лару на ферму Кентов. Кларк появляется вовремя, чтобы спасти её, но он также попадает под сыворотку и видит то, что видит Кара: свою мать.

При несчастном случае с криптонитом и молнией, у Ланы появляются силы, такие же как у Кларка. Используя свои суперсилы, она ломает у Лекса сейф и крадёт подтверждения одного проекта, которое она затем доставляет Лоис и Гранту, требуя, чтобы они напечатали статью, раскрывающую секреты Лекса. После того, как Грант откажется использовать украденный материал, Лана решает позаботиться о Лексе сама. Кларк пытается остановить Лану, чтобы она не убила Лекса и далее следует суперборьба между Ланой и Кларком.

Кларк слышит из кристалла голос его биологической матери Лары, которая взывает к помощи, и решает выпустить её, несмотря на предупреждения Джор-Эла. Лара и Кларк воссоединяются и она даёт ему кольцо Джор-Эла, которое содержит синий криптонит. Как только Кларк надевает его, появляется Зор-Эл, знающий что синий криптонит забирает силы, он хочет управлять Крепостью Одиночества. Тем временем, Хлоя и Лекс узнают о связи Лоис и Гранта, и оба убеждают их прекратить это.

Кларк возвращается в Смолвиль из Крепости и сообщает Лане, что Кара пропала. Кларк поддерживает Лану и хочет, чтобы они вместе отомстили Лексу. Она даёт ему всю информацию которую собрала, включая о лаборантке , которая была заражена чужеродной субстанцией. Адриан тайно устанавливает бомбу на Хлое и сообщает Лоис, что если она не получит признания Лекса о своих экспериментах с 33.1, он взорвет бомбу. Хлоя, думающая, что она собирается умирать, признается Джимми, что она заражена метеоритами.

Пока Кларк заморожен в Крепости, Бизарро наслаждается его жизнью с Ланой. Неподозревая что она живет с Бизарро, Лана наслаждается «новым Кларком» и собирает информацию про многократного убийцу, который высасывает из своих жертв все минералы. Вдвоем они решают, что это должно быть Брейниак (профессор Файн), и Бизарро пытается найти его, чтобы использовать для своих целей. Лекс оглушен реакцией Лайонела, после того как он узнает об аналоге Джулиана.

При тайной работе для проекта Оливера, Хлоя перехватывает один из проектных файлов Лекса, но в этот момент её атакует Чёрная Канарейка, женщина с пронзающим криком. Дина Лэнс, альтер-эго Чёрной Канарейки, является хозяином ток-шоу, которое работает на Дэйли Плэнет, и сталкивается с Лоис Лейн. Лекс убеждает Чёрную Канарейку, что Зелёная Стрела и его группа — террористы, и она начинает охоту на Зелёную Стрелу и Кларка. Тем временем, Лоис узнает секрет Оливера.

Лоис следует за Лексом в Детройт и обнаруживает что он нашёл Кару, которая потеряла память. Финли, молодой человек, который преследует Кару и хочет её увезти, стреляет в Лекса и держит в пленниках Кару и Лоис. После того, как обнаруживают тело Лекса, который впал в кому, Хлоя предлагает излечить его, но Кларк не позволяет ей.

Кара и Джимми посещают концерт «One Republic» и там оказывается прежний резидент Смолвиля Пит Росс. Пит непреднамеренно жуёт жвачку, в которой содержится криптонит, и у него появляются супер силы. Кларк и Хлоя обрадованы что встретились с их старым другом, но предупреждают его не использовать свои силы на публике. Тем не менее, Лекс узнает о силах Пита и шантажирует его, чтобы он проник в сейф Лайонела, угрожая, что расскажет о том, что Хлоя является метеоритным уродом.

Лайонел размещает похищенного Кларка в клетке, облицованной криптонитом, в филиале Luthorcorp. После, Хлоя и Лана находят военное электрическое обороудование на ферме. Они приходят к Лайонелу, который бросает подозрение на Лекса. Хлоя и Лана берут Кару в Крепость, и просят Джор-Эла, чтобы он восстановил её память, так как она единственная кто сможет спасти Кларка.

Кара решает научить Кларка летать для того, чтобы усилить его шансы против Брейниака. Тем не менее, Брейниак кажется, имеет верх против супер кузенов, и некто из любимых Кларка пойман в ловушку.

Тайна «Вэритас» становится главной целью для Лекса, что начинает большую историю, которая помещает Лекса и Кларка в невероятные разногласия. В эпизоде имеет место главная борьба за власть, итогом которой станет то, что один из персонажей умрёт.

Кларк отчаянно пытается найти Кару и Брэйниака — единственного, кто способен вернуть Лану в нормальное состояние. Кларк просит Хлою проверить наличие крупных всплесков электроэнергии, поэтому она взламывает несколько правительственных компьютеров, выключая систему безопасности. Джимми в ловушке между Агентством Безопасности, которое угрожает ему сроком в тюрьме, если он не поможет арестовать Хлою, и Лексом, который предлагает помочь оправдать Хлою, если Джимми останется Лексу должен.

Кларк обнаруживает, что Кара отправила сообщения с Криптона из прошлого, которые указывают, что Брейниак хочет убить младенца Кал-Эла, чтобы Кларк не появился в будущем. Кларк думает, что мир должен быть лучше, если бы он никогда не прибыл бы в Смолвиль. Джор-Эл показывает ему, какая стала бы жизнь если Кларк не существовал — Лекс является президентом Соединенных Штатов, Кару воспитали Люторы, Джонатан жив, Лана счастлива в браке, а Хлоя и Лоис — отличные репортёры.

Лекс подвергается нападению скрытым незнакомцем, который вырезает криптонские символы на его груди — сообщение для Кларка. Хлоя и Кларк расследуют и обнаруживают, что один из членов клана Вэритас выжил и скрывается в церкви. Кларк и Лекс мчатся, чтобы быть первыми в нахождении этого таинственного члена Вэритас, который держит ключ к выживанию Кларка.

Кара сообщает Лексу, что он обречен побеждать Путешественника, и предлагает ему отправится в Крепость, чтобы узнать как это сделать. Кларк ошеломлен, что Кара идёт с Лексом, но обнаруживает, что Брейниак подражает Каре, а настоящая Кара заперта в Фантомной зоне. Хлоя арестована Отделом Внутренней Безопасности и Лана выходит из её коматозного состояния. Тем временем, в эпическом повороте событий, Кларк и Лекс встречаются в Крепости и Лекс узнает секрет Кларка.

Лоис спасает Кларка. Хлоя отчаянно пытается найти Оливера, поэтому она обращается к сомнительному источнику информации. Джонатан возвращается на Ферму Кентов с сообщением для Кларка, а Тесс просыпается в лаборатории LuthorCorp.

После того, как Лоис уезжает в Египет, Daily Planet нанимает на её место нового репортера по имени Кэт Грант. Убийца по имени Дедшот намечает себе цель — Кэт, но Кларк узнает, что у него есть и другие цели, среди которых и Пятно. Картер Холл прибывает в Египет, чтобы следить за Лоис, и он рассказывает ей о своей жене Шайере.

Кларк ошеломлён, когда Кара возвращается на Землю и сообщает ему, что её прислал Джор-Эл, чтобы остановить надвигающуюся тёмную силу, потому что он не верит, что Кларк сможет с этим справиться. Тем временем, Лоис противостоит Гордону Годфри, весьма агрессивному радио диджею, который начинает выступать против героев, после того, как он угрожал Зелёной Стреле. Однако, после того, как Годфри становится одержим тёмной силой, он берет Лоис в заложницы, а Кларк и Кара должны прийти ей на помощь.

В попытке приободрить Кларка Лоис убеждает его пойти на встречу выпускников по случаю пятилетней годовщины окончания школы. Возвращение в дом Воронов пробуждает в Кларке воспоминания о былых временах, о Лане и Хлое, в то время как Лоис разъярена тем, что никто не помнит, что она провела здесь в роли ученицы целых пять дней. Брейниак 5.0 прибывает из будущего, используя Кольцо Легиона, и проводит Кларка через его прошлое, настоящее и будущее. Он показывает Кларку, что в действительности произошло в ночь смерти Джонатана, настоящую боль Оливера и его будущее в «Daily Planet» с Лоис, и Кларка в роли любимого красно-синего супергероя Земли.

Лоис решает рассказать Кларку о том, что знает, что он — Пятно, однако случайно активирует древний артефакт, который трансформирует её в богиню Изиду с полным комплектом суперспособностей. Оливер и Кларк с неохотой просят у Тесс помощи. Тем временем, после того как Кэт Грант становится свидетелем того, как Лоис в роли Изиды использует суперспособности, она приходит к выводу, что Лоис и есть Пятно, и намеревается доказать это.

Кларк обеспокоен вопросом безопасности Лоис, он отвлекает её от освещения Закона о Регистрации Супергероев, предлагая ей заняться другой историей. После того, как он говорит с ней об этом напрямую, рассерженная Лоис говорит ему, что может и сама о себе позаботиться, но затем из-за спущенной шины им приходится остановить свою машину не весть где. События начинают принимать наихудший оборот, и в итоге Лоис оказывается в серьёзной опасности. Тем временем Тесс ищет лечение для Александра, который быстро стареет.

Генерал и Люси Лейн неожиданно решают заглянуть к Лоис и Кларку на обед в День благодарения. Между Кларком и Генералом возникает сильное напряжение после того, как отец Лоис выступает против супергероев и говорит Кларку, что он пытается принять закон о регистрации линчевателей. Тем временем, в попытке помешать принятию закона о регистрации линчевателей, Рик Флэгг обманывает Люси с целью выманить Кларка с фермы, чтобы убить Генерала. Лоис разрывается между тем, чтобы заставить своего отца гордиться ей, и своей любовью к Кларку.

Лоис находит видео, сделанное для неё её матерью, Эллой Лейн, перед смертью. После просмотра записи Лоис принимает радикальное решение относительно своих отношений с Кларком и идет в Крепость, где сталкивается с Джор-Элом и Ларой. Тем временем, Тесс видит ночной кошмар, вовлекающий её в детском возрасте и музыкальную шкатулку. После пробуждения она находит музыкальную шкатулку в особняке Люторов и намеревается узнать, кто её туда подбросил. Кларк сопровождает её в приют, которым управляет Гренни Гуднесс, которая, по-видимому, имеет не лучшие намерения относительно молодых девушек. Одна из молодых женщин, живущих в этом приюте, Харриет, находит шпионящего Кларка и решает взять дело в свои собственные руки с очень острыми коготками.

Оливер создает Комитет бдительности, чтобы защитить остальную часть команды и узнать, что планирует правительство. Подозрения Оливера подтверждены, когда он находит расположение ловушки, чтобы находить и арестовывать супергероев. Тогда Оливер переносится в закрытую тюрьму, где полковник Слэйд Уилсон проводит на нём жестокие испытания.

Кларк случайно активизирует коробку с криптонианским артефактом, которая переносит его в параллельную вселенную, где Лайонел нашёл его в полях вместо семьи Кентов. Кроме того оказывается, что в параллельной вселенной Кларк является убийцей, который поменялся местами с реальным Кларком

Закон о регистрации героев набрал полные обороты, и события принимают неудачный поворот после того, как Зелёная Стрела пытается предотвратить ограбление, но подвергается нападению граждан за то, что он — супергерой. Кларк обнаруживает, что люди, которые напали на Оливера, все были помечены меткой Тьмы. Картер Холл и Звёздная Девочка возвращаются с целью помочь Кларку разобраться с повторным выходом Слэйда после того, как он похищает Лоис.

Кларк, Лоис, Оливер и Дина освободились от Акта о Регистрации Героев, но у каждого из них остались воспоминания о Хлое, которые не дают им двигаться дальше. Когда Хлоя возвращается, Дина предупреждает всех, что Хлоя может быть предателем. Оливер отрицает эту возможность, но Кларк не знает может ли он доверять Хлое после её длительного отсутствия.

Кларк удивлен, когда видит в новостях, как Марта выступает на собрании в поддержку героев. Однако удивление быстро сменяется ужасом, когда он и Лоис видят, как в Марту стреляют прямо в эфире национального телевидения. Тем временем Лайонел являет себя миру и требует Тесс и Оливера вернуть ему ЛюторКорп. Лоис и Хлоя решают подбодрить Кларка и показывают ему видео с тысячами людей, поддерживающих Пятно. Видео было снято настоящими фанатами «Тайн Смолвиля».

Хлою и Оливера ошибочно принимают за агентов ФБР, расследующих серию недавних убийств совершенных ДеСадом, и похищают. ДеСад пытается заразить Хлою тьмой. В это время Лоис говорит Кларку, что ему стоит больше внимание уделять скрытию своей личности и предлагает ему маскировку.

После того, как Затанна присылает Кларку и Лоис бутылку волшебного искристого шампанского для их мальчишника/девичника, вся компания теряет сознание после тоста, а затем просыпается следующим утром, понимая, что они ничего не могут помнить о предыдущей ночи. Пытаясь проследить вчерашние события, Лоис понимает, что потеряла своё обручальное кольцо и тянет Оливера назад в Казино Fortune, где, по её мнению, она его и оставила… Эти двое сталкиваются с Фортуной, эксцентричным владельцем казино, который обвиняет их в краже его денег. Тем временем Кларк говорит Хлое, что у него остались воспоминания об угоне бронированного грузовика предыдущей ночью.

Лайонел и Тесс идут нога в ногу в сражении за имя Люторов. Кларк и Лоис ошеломлены последним подарком Тесс.

Кларк потрясён, найдя зеркальную коробку у себя в амбаре. Кларк Лютор застаёт его врасплох и посылает обратно в альтернативную вселенную, где Кларк сталкивается с очень рассерженным Джонатоном Кентом. Тем временем, в нашей вселенной Кларк Лютор приходит к Тесс и говорит, что если она не станет на его сторону, он убьёт её. Лоис просит Эмиля помочь ей вернуть Кларка.

После всей истории с ЗРГ, Лоис говорит, что Кларку было бы лучше сделать «Кларка Кента» незапоминающимся и неуклюжим, тогда люди не заподозрят, что он — Пятно. Однако, они оба ошеломлены, когда жадный до известности супергерой из будущего, Бустер Голд, появляется в городе и начинает спасать людей и позировать для прессы, полностью покорив город Метрополис. Бустер начинает свою кампанию по захвату места Пятна в качестве «Самого Великого Супергероя в Мире» и пытается прельстить Лоис, предложив написать о нём статью, но она не реагирует на его выходки и начинает свою собственную кампанию в поддержку Пятна. Во время одного из спасений Бустера, инопланетное оружие в форме жука-скарабея выпадает из грузовика и сливается с мальчиком по имени Джейм Рейес, превращая его в Синего Жука. К сожалению… Джейм неспособен управлять костюмом, и Синий Жук начинает нападать на Метрополис.

Тэсс узнает, что Генерал Слэйд получил доступ к спасательному порталу из Фантомной Зоны и попытался вырваться оттуда. Кларк хочет вернуться в Зону, для того чтобы убедиться, что остальные заключённые не смогут сбежать, и он очень рассержен, когда Оливер обманом проникает в Зону с ним. Поскольку силы Кларка пропадают, двоих гостей Зоны захватывают местные жители и ведут к своему новому лидеру - Зоду, который жаждет отомстить Кларку. Тем временем Лоис узнает, что Кларк доверяет какую-то тайну Тэсс, но не говорит об этой тайне самой Лоис.

Кларк приводит Лоис в Крепость, чтобы получить благословение Джор-Эла на свою свадьбу. Джор-Эл одаривает пару уникальным подарком — дает Лоис способности Кларка, чтобы она на один день почувствовала, какого это быть им. К сожалению, в Метрополис возвращается Тоймэн и теперь, Лоис должна противостоять уже знакомому нам злодею, вместо Кларка. В это время, Оливер в поисках «Радуги Ориона», которая, по его убеждению, должна стереть символ Омеги с его черепа. Он встречает Кару, у которой тоже своя миссия — остановить Дарксайда.

Кларк и Хлоя пытаются уговорить Лойс не отменять свадьбу. Гренни Гуднесс говорит Тесс о приближении планеты Дарксайда, Апоколипса. Тесс пытается предупредить Лигу, однако её похищают. Оливер, сам того не осознавая, подчиняется тьме в самый неподходящий момент. Лайнел ради своего сына идет на сделку с Дарксайдом.