Trosečníci začínají poznávat tajemství ostrova. Jack, Charlie a Kate se vydávají do temného nitra džungle, aby se pokusili najít leteckou vysílačku. Brzy však zjistí, že i hrdinové mají svá tajemství.

Poté, co trosečníci uniknou stvoření, které je pronásledovalo, a získají vysílačku, vydají se do vyšších poloh, aby mohli vyslat signál. Brzy zachytí záhadnou zprávu a setkají se s jedním z obyvatel ostrova.

Jack a Hurley odhalí tajemství o Kate. Šerifův život visí na vlásku. Někteří trosečníci přemýšlejí o záhadách ostrova, které odhalili. Michaela trápí, že se Walt spřátelil s Lockem.

Locke jde ulovit něco k jídlu a při této výpravě je jeden z trosečníků zraněn. Tajemství o Lockovi je odhaleno. Někteří trosečníci jsou zděšeni Jackovým plánem, jak naložit s mrtvými těly, která jsou stále roztroušena mezi troskami letadla.

Jack má problém překonat události, které ho přivedly do Austrálie. Boone se dostane do zrádného vlnobití, když se snaží zachránit ženu, která si šla zaplavat. Claire je velmi dehydrovaná a někdo asi ukradl poslední zásoby vody.

Když je Michael zbit, jsou ostatní v šoku, ale pravdu o útoku znají jen Jin a Sun, kteří neumějí anglicky. Kate, Jack, Sawyer a Sayid se dohadují o tom, kde by se měli trosečníci utábořit. Locke odhalí Charlieho tajemství.

Charlie si začíná s Lockovou pomocí odvykat od závislosti na drogách. Trosečníci se snaží najít a osvobodit Jacka pohřbeného zaživa v sutinách zavalené jeskyně. Někdo asi maří plány trosečníků pokoušejících se zjistit původ zprávy, kterou zachytili.

Shannon potřebuje nový inhalátor a Boone se domnívá, že zbývající tři má Sawyer ve svých věcech. Když je Sawyer odmítne vydat, Jack a Sayid se rozhodnou ho mučit.

Sayidův život se ocitne ve vážném nebezpečí poté, co narazí na zdroj záhadné francouzské zprávy z vysílačky – Danielle Rousseauovou.

Claire trápí strašlivá noční můra o tom, že jejímu už narozenému dítěti někdo ublížil nebo ho unesl. Flashbacky odhalují Claiřinu minulost.

Trosečníci přemýšlejí, kdo mohl unést Charlieho a Claire, a z jakého důvodu. Následně se do zrádné džungle vydává pátrací skupina, aby dvojici našla. Hlavním podezřelým je Ethan.

Jack, Kate a Sawyer se přou o vlastnictví nově objeveného, zamčeného kovového kufříku, který by mohl objasnit Katinu záhadnou minulost.

Locke se dozví, že Boone chce Shannon prozradit jejich tajemství, a rozhodne se dát mu lekci. Temná minulost Boona a Shannon je odhalena. Kate nejde do hlavy Sunino záhadné chování a zjištění, že umí anglicky.

Když se Michael a Locke nepohodnou kvůli Waltově výchově, dojde k násilnému konfliktu a znovu se objeví tajemná šelma. Charlie je mezitím v pokušení přečíst si deník zmizelé Claire.

Poté, co se Claire vrátí a nepamatuje si, co se událo od jejího nástupu na palubu havarovaného letadla Oceanic 815, vypracují Jack a Locke plán na obranu proti jejímu únosci.

Kate a Sawyer si navzájem prozradí temná tajemství, zatímco stopují kance, o kterém si Sawyer myslí, že ho záměrně obtěžuje.

Vor, který trosečníci stavěli, záhadně shoří a Michael je přesvědčen, že v tom má prsty Jin. Sun učiní překvapivé přiznání. Boone varuje Sayida před Shannon. Dozvídáme se podrobnosti o problematickém manželství Jin a Sun.

Když Hurley začne být posedlý Francouzkou a vydá se ji hledat do džungle, nezbývá Jackovi, Sayidovi a Charliemu než ho následovat.

Locke si myslí, že mu někdo poslal znamení, jak otevřít poklop, a vydá se s Boonem do vnitrozemí.

Jack ošetřuje těžce zraněného Boona poté, co ho Locke odnese zpátky do jeskyně. V nastalém zmatku se Locke vytratí, aby se vypořádal s pocitem viny.

Po dalším pohřbu vzrůstá napětí, trosečníci se začínají navzájem podezřívat a jeden z nich přísahá pomstu.

Když se Michaelovi při stavbě voru udělá hrozně zle, tuší v tom Jack něco nekalého. Mezi podezřelými jsou i Sawyer a Kate, kteří soupeří o poslední místo na voru.

Zatímco Michael a Jin připravují vor na plavbu, objeví se znenadání Francouzka a ohromí trosečníky hrozivým varováním před „těmi druhými“.

Na moři překvapí výpravu na voru něco nečekaného. Ti, co zůstali na ostrově, se snaží vyhodit do povětří poklop. Ve finále první série by jistý návštěvník tábora mohl ohrozit Claiřina novorozeného syna.

Jeden z trosečníků je vybrán, aby se spustil do tajemného bunkru pod poklopem, a Shannon ke svému údivu narazí v džungli na známou tvář.

Michael obviňuje Sawyera z Waltova únosu a slibuje, že svého syna přivede zpět. Kate se mezitím osvobodí z Desmondova zajetí a uteče.

Jack, Locke a Kate se dozvídají další tajemství o poklopu. Sawyer, Michael a Jin přemýšlejí, zda jejich věznitelé patří k trosečníkům, nebo k „těm druhým“.

Hurley dostal za úkol hlídat sklad s potravinami, ale dělá mu to problémy, protože ho trápí nepříjemné vzpomínky z minulosti. Claire mezitím zjistí šokující informaci.

Zoufalý Michael se vydává do džungle hledat Walta, ale zjišťuje, že není sám. Věznitelé dávají mezitím Sawyerovi a Jinovi příkaz, aby je odvedli do svého tábora.

Sawyerovo zranění se stává životu nebezpečným, když se s Michaelem a Jinem vydává do nitra ostrova spolu se skupinou trosečníků ze zadní části letadla.

Tato epizoda popisuje, jak prožívala otřesných prvních 40 dní na ostrově skupina 23 trosečníků ze zadní části letadla, kterými jsou Ana Lucia, pan Eko, Libby, Cindy, Bernard a Goodwin. Dozvídáme se podrobnosti o prvních děsivých dnech a o boji s obávanými „druhými“.

Když Ana Lucia a její skupina narazí na Sayida a ostatní trosečníky, dojde ke konfliktu.

Původní zločin, kvůli kterému se Kate ocitla na útěku, je odhalen. Mezitím ukládají trosečníci jednoho ze svých lidí k věčnému odpočinku a pan Eko má překvapení pro Locka.

Pan Eko vyslýchá Charlieho ohledně sošky Panny Marie a Claire začíná ztrácet důvěru v Charlieho.

Jack, Locke a Sawyer se vydávají po Michaelových stopách, zatímco hledá svého syna, a potkávají „ty druhé“.

Charlie má podivné živé sny, ve kterých Claiřinu dítěti Aaronovi hrozí nebezpečí. Locke má však podezření, že Charlie opět užívá drogy.

Když je Sun zraněna při neúspěšném pokusu o únos, trosečníci mají strach, že se „ti druzí“ možná vrátili. Mezitím se stupňuje napětí mezi Jackem, Lockem, Kate a Anou Luciou kvůli kontrole počítače, který byl nalezen pod poklopem.

Záhadná Francouzka Danielle Rousseauová se vrací, aby zavedla Sayida k tajemnému zajatci, který tvrdí, že na ostrově ztroskotal.

Když Claiřino dítě onemocní, rozhodne se Claire zjistit, co se jí stalo, a vzpomenout si na události z doby, kdy byla v zajetí „těch druhých“.

Sun zjistí, že by mohla být těhotná, a přemýšlí, zda o tom říct Jinovi. Když Jack ani Sayid neuspějí, je Ana Lucia pověřena Lockem, aby vyslechla vězně Henryho Galea.

Když poklop náhle začne žít vlastním životem, zůstane Locke sám uvězněn v bunkru a nezbývá mu než požádat o pomoc nepravděpodobného spojence.

Hurley si myslí, že na něj ostrov působí velmi zvláštně, a Libby se mu snaží nabídnout pomoc. Hurley vzpomíná na svou minulost s kamarádem Davem v psychiatrické léčebně.

Bernard se snaží přesvědčit ostatní, aby v písku pomocí kamenů sestavili nápis S.O.S. v naději, že ho uvidí satelit nebo letadlo.

Jack a Kate přivedou vyčerpaného Michaela zpět do tábora. Michael má zprávy o „těch druhých“. Ana Lucia se mezitím pokouší přimět Henryho Galea, aby se přiznal, že je špión.

Pan Eko požádá Locka, aby mu pomohl najít tajné místo, kde se podle něj skrývají odpovědi na záhady ostrova. Henrymu Galeovi se podaří uniknout z bunkru.

Michael se dozvídá podrobnosti o tom, kde se nacházel během třinácti dnů v zajetí v táboře „těch druhých“. Také se snaží přesvědčit Jacka, aby mu pomohl zorganizovat pátrání po jeho synovi Waltovi.

Jack a Sayid vymyslí plán, jak se postavit „těm druhým“.

V této epizodě se ukáže, zda byl Jackův a Sayidův plán postavit se „těm druhým“ úspěšný.

Jack, Kate a Sawyer jsou nyní zajatci „těch druhých“ a psychologická hra může začít.

Sayidův pokus zachránit Jacka, Kate a Sawyera ze zajetí „těch druhých“ ohrozí životy Sun a Jina.

Vidiny Locka, ve kterých se mu zjevuje Boone, ho přivedou k nové záhadě na ostrově.

„Ti druzí“ chtějí zabránit tomu, aby Sawyer dělal další problémy, a tak na něm provedou sadistický lékařský zákrok.

Pan Eko má vidiny, ve kterých se mu zjevuje mrtvý bratr, a tak se vydává zpět na místo, kde havarovalo jeho letadlo.

Kate se zoufale snaží ochránit Sawyera, aby ho „ti druzí“ nezabili. Ti mezitím plánují přimět Kate, aby donutila Jacka operovat Bena.

Sawyer a Kate se snaží uniknout z ostrova, zatímco Jack sabotuje Benovu operaci.

Poté, co Desmond zachrání Claire před utonutím, mají Charlie a Hurley podezření, že dokáže předvídat budoucnost, a snaží se z něj dostat odpovědi.

Jack je vyslýchán šerifkou Isabel, která patří k „těm druhým“. Ben má infekci v páteři a Jack výměnou za jeho ošetření vyjedná svobodu pro Juliet.

Hugo požádá Sawyera o pomoc se starou dodávkou, kterou našli na ostrově. Také je odhalena Hugova spojitost s čísly na poklopu.

Sayid, Locke a Kate najdou na cestě za záchranou Jacka další stanici výzkumného projektu Dharma. Sawyer se snaží dostat své věci zpět do tábora.

Claire rozjíždí plán, jak pomocí stěhovavých ptáků poslat zprávu, ale nechápe, proč ho Desmond neustále sabotuje.

Jack řekne Kate, že uzavřel dohodu s „těmi druhými“, a odplouvá z ostrova ponorkou. Locke se baví s Benem o tajemné síle ostrova.

Nikki a Paulo jsou další dva trosečníci se stejnou minulostí jako všichni ostatní. Co ale od havárie letadla dělali?

Když je tajné místo „těch druhých“ prozrazeno, opustí tábor a vezmou Locka s sebou, ale Juliet nechají uprostřed džungle připoutanou ke Kate.

Jack vezme Juliet zpět do tábora poté, co ji „ti druzí“ opustili.

Desmond má další vidinu, ve které na ostrově ztroskotá jeho bývalá přítelkyně Penny, ale je v ní také něco o Charliem.

Kdosi nečekaně pomůže Desmondovi zachránit život záhadné ženě, která na ostrov spadla s padákem, a Juliet pomáhá těhotné Sun zjistit, zda počala na ostrově.

Locke řekne Sawyerovi, že s ním musí jít zabít Bena, ale muž, kterého chce Locke zabít, je ve skutečnosti jeho otec a ten je zároveň postavou ze Sawyerovy minulosti.

Když Ben vezme Locka za Jacobem a odhalí mu tajemství ostrova, vychází najevo Benova minulost na ostrově a také osud výzkumného projektu Dharma.

Desmond má opět vidinu Charlieho smrti, ale tentokrát povede jeho smrt k záchraně Claire.

Jack a ostatní čekají, až Charlie vypne rušičku signálu „těch druhých“, ale nevědí, že byl zajat na stanici Zrcadlo. Část první.

Jack a ostatní dál marně čekají, až Charlie vypne rušičku signálu „těch druhých“. Část druhá.