Au décès d'un officier Commandant de Marine, les agents spéciaux de l'équipe d'intervention de la NCIS -la Naval Criminal Investigate Service-, Leroy Jethro Gibbs, Tony DiNozzo, et Ducky Mallard, se lancent dans l'enquête, ce qui ne semble guère au goût de T.C., l'agent du FBI chargé des investigations au sujet de cette mort suspecte.

Durant un périlleux exercice de formation de nuit, le parachute d'un marine ne s'ouvre pas, précipitant la jeune recrue sur une voiture garée, où se trouvaient deux adolescents. Les agents de la NCIS doivent déterminer rapidement la cause de la mort : est-elle accidentelle ? Ou bien un meurtre se cache-t-il derrière le drame ?

Un groupe de jeunes gens est dérangé par des coups de feu, et assiste au naufrage d'un bateau sur la plage. Pendant ce temps, l'équipe du NCIS est prévenue que le corps d'un capitaine vient d'être retrouvé au large des côtes. L'équipe ne tarde pas à faire le lien entre ce meurtre, et celui de deux hommes mêlés à un trafic de drogue. Gibbs reste cependant sceptique quant à l'implication d'un capitaine dans une affaire aussi douteuse...

En plongeant dans la mer, un jeune plongeur découvre le corps d'un marin habillé en tenue de cérémonie, et arborant une étrange épée. Lors de l'enquête menée par l'équipe du NCIS, ils ne tardent pas à découvrir que le jeune marin, Russel McDonald, faisait partie d'un cercle d'adeptes de jeux de rôles.