Al llegar a un planeta recién exterminado por los Goa'uld, Daniel descubre un espejo alienígena. Tras mirarlo un rato, le da un escalofrío. Al volver al StarGate.

Carter es poseída por un Goa'uld mientras ayudaban en un planeta que sufría el ataque de estos. El Goa'uld dice pertenecer a la Tok'ra, una legendaria facción, opuesta la los Señores del Sistema Goa'uld. El Tok'ra Jolinar es asesinado, pero salva la vida de Samantha Carter.

El SG1 es condenado a prisión en un planeta, debido a interferencias con el sistema judicial de otra cultura. Lo gran escapar con la ayuda de una mujer llamada Linnea. Una vez libres, descubren que la mujer es una asesina de masas llamada la "Destructora de Mundos".

El SG-1 llega a un planeta en el que sus habitantes están encerrados en unos capullos, viviendo una realidad virtual. El Guardia los encierra a ellos también, y les impide que cuenten la verdad a los habitantes de ese mundo.

El SG-1 regresa a Cimmeria para ayudarles ante el ataque de los Goa'uld. El SG-1 losgra ontactar con Thor, quien se muestra como un Asgard. el está enfadado con la iterrupción del SG-1, sin embargo, interviene con su nave para eliminar a los invasores.

Bra'tac trae noticias de Apophis. Este a secuestrado a Rya'c. Teal'c regresa a Chulak, para rescatar a su hijo. Allí descubre que su hijo es leal a Apophis y tiene que rescatarle.

Teal'c es picado por un insecto desconocido en BP6-3Q1. La picadura comienza a cambiar genéticamente su ADN. Cuando escapa del SG-1 conoce a Ally, una niña que le ayudará.

Carter descubre que aun posee los recuerdos del Tok’ra Jolinar. Ella halla la dirección de la posible base Tok'ra, y el equipo es enviado a contactar con ellos, y quizás formar una alianza. En tanto, el Gral. Hammond se entera que el padre de Carter, Jacob, está muriendo de cáncer.

Después de que los Tok'ra rechazaran la oferta de alianza con los Tau'ri, debido a que la Tierra no tiene nada para ofrecerles, ellos no permiten dejar irse al SG-1, ya que poseen la ubicación de su base. En ese momento, el anfitrión de un Tok’ra llamado Selmak está muriendo, por lo que el equipo ve allí una oportunidad para forjar una alianza y salvar la vida de Jacob Carter.

El SG-1 descubre una civilización descendiente de nativos americanos. Cuando el SGC comienza a realizar trabajos en una mina de Trinium de aquel mundo, los "Espíritus" de esta cultura indígena se ven perturbados e invaden la base. Pronto, el equipo descubre la identidad real de estos seres.

Los Asgard advierten al Comando Stargate que los Goa’uld planean atacar la Tierra. El SG-1, con ayuda de los Asgard, deberá negociar con tres Señores del Sistema Goa’uld para incluir a la Tierra dentro del Tratado de Planetas Protegidos.