El General Hammond, al mando del Complejo de la Montaña Cheyenne hace llamar a los miembros del equipo original de la primera misión, viajan y se encuentran con el Dr. Jackson.

En ese momento el dios Goa'uld Apophis cruza la puerta y secuestra a Sha're y Skaara. Pero en el último instante, el jefe de la guardia de Apophis, el Jaffa Teal'c, les ayuda a escapar y se une a la huida viajando a la Tierra.

Kawalsky es poseído por un Goa'uld que intenta regresar a Chulak, es detenido y operado. Logran extraer algo de él, y cuando creen haberse librado del demonio Goa'uld, Kawalsky ataca a Teal'c.

En un planeta llamado Argos, el SG-1 encuentra una civilización de origen griego, en el que todos los dias son fiesta. Todos los días de sus vidas, que no superan los 100. O'neill es infectado y comienza a envejecer.

Teal'c les habla de un planeta que está prohibido por los Goa'ulds. El SG-1 viaja y descubre que se trata de un planeta donde unos descendientes de los vikingos, viven libres de los Goa'uld.

Teal'c revela que tiene mujer e hijos, y que a este le van a implantar un Goa'uld para convertirlo en Jaffa. El SG-1 va en su busca para salvarle. Cuando Teal'c llega, parece que aun puede evitarlo.

Jack, Sam y Teal'c regresan de un planeta en el que creen que ha muerto Daniel Jackson abrasado en un volcán. Todos ellos tienen la creencia de que está vivo, pero son incapaces de regresar.

El SG-7 no responde. Hammond envía al SG-1 en su busca y descubre que todo el planeta, SG-7 incluido ha muerto. Todos menos una joven niña llamada Cassandra. Carter vuelve con Daniel y la niña.

Durante un viaje de exploración, Teal'c es acusado de matar al padre de un de los habitantes de Carthago. Durante el Cor-Ai, el juicio, los Goa'uld atacan el planeta, y creen que ha sido Teal'c el que ha ordenado el ataque.

El SG-1 trae a la Tierra a unos seres que agonizaban delante de la puerta debido a una nube volcánica tóxica. Cuando despiertan en la Tierra, se comportan de modo extraño, poseen tecnología superior, y huyen atravesando una pared.

Taking after the author's vision of the pilot, visual effects have been enhanced, the soundtrack has been updated to include an entirely original score, and the new final cut features a more self-contained storyline.

Picking up the story nearly a year after the original 1994 Stargate film, Jack O'Neill and Sam Carter join a formidable Stargate team on a mission to Abydos to defeat fierce warriors led by the vicious Ra. With the threat of the brutal Gou'ald hanging over the galaxy, the team must succeed - or General Hammond will unleash an apocalyptic solution!