Eine Reihe von Ladenüberfällen erschüttert Los Angeles. Die schwer bewaffneten Täter haben es ausschließlich auf Bargeld abgesehen. Merkwürdig ist, dass alle diese Läden wenige Stunden zuvor von zwei jungen Männern besucht wurden und die sind jetzt tot. Sie wurden erschossen. Alles deutet darauf hin, dass sie zu einer Fälscherbande gehören, auf deren Konto die Entführung der Grafik-Künstlerin Margo Hughes geht. Sie soll den Verbrechern bei der Herstellung der Blüten helfen.

Diebe haben einen Laster mit radioaktivem Material in ihre Gewalt gebracht. Sie drohen, eine „schmutzige Bombe“ in L.A. zu zünden, wenn nicht 20 Millionen Dollar an sie gezahlt werden. Während Don sich auf die Spuren des Trucks macht, versucht Charlie herauszufinden, wo in L.A. die Bombe den größten Schaden anrichten könnte. Sie finden heraus, dass die Aktion der Bande von deren eigentlichen Coup ablenken soll: ein Kunstraub im großen Stil.

Don und seine Kollegen verfolgen zwei Verbrecher, die bei einem Unfall aus einem Gefängnisbus geflohen sind. Er wird von Cooper unterstützt, einem Zielfahnder der Abteilung „Fugitive Recovery“. Reed, ein Agent der DEA, funkt jedoch dem FBI dazwischen, und McDowd, einer der Flüchtigen, kann entkommen. Über einen Algorithmus kann Charlie aber erkennen, wo sich McDowd aufhält – auf dem Territorium der Zee Boys. Wenig später findet Don deren Anführer Choi tot auf.

Erica Logan überfällt den Juwelier Rausch, legt ihm ein Bild seiner Frau und seiner Tochter vor und erpresst die Herausgabe von Diamanten mit dem Hinweis, dass seine Familie entführt worden ist. Auf dem Weg aus dem Laden wird die Frau vom Wachmann erschossen. Die Tote hat einen Autoschlüssel dabei, aber es ist kein passender Wagen zu finden. Da der Wagen einen automatischen Türöffner hat, entschlüsselt Charlie den Code des Schlüssels. Die Spur führt zu Steven, Ericas Vater.

Bei einem Einsatz im Gang-Milieu kommt der undercover ermittelnde FBI-Agent Anthony Rhimes ums Leben. Weil die Staatsanwaltschaft nicht möchte, dass seine Tarnung auffliegt, kann er nicht mit allen Ehren bestattet werden. Charlie ist über die Anzahl der Gang-Schießereien schockiert. Er stellt die These auf, dass viele dieser Morde untereinander wie Ketten in Verbindung stehen, da ein Mord eine Vergeltungsaktion nach sich zieht, die wiederum gerächt werden muss.

In einer abgelegenen Schlucht werden drei tote Latinas gefunden – alle Frauen sind brutal aufgeschlitzt worden. Die Ermittler bekommen bei diesem Fall Hilfe von einem Mann namens Kraft, dessen Visionen zum Auffinden der Leichen beigetragen haben. Charlie steht Kraft jedoch äußerst skeptisch gegenüber. Dons Meinung nach haben die drei Frauen als Drogenkuriere gearbeitet, die die Ware von Mexiko in die USA bringen sollten. Seine Recherchen führen die Ermittler zu Victor Borrego.

Diverse Anschläge auf Umspannwerke und Trafostationen im Großraum von Los Angeles haben keinen, wie angenommen, terroristischen Hintergrund. Eher sorgen sie dafür, dass im Bundesgefängnis ständig das Notstromaggregat anspringt. Mit einer vorgetäuschten Diesellieferung für die Aggregate versucht jetzt ein Drogenkartell seine Killer einzuschleusen, um den inhaftierten Tabakian zu ermorden. Der will nämlich gegen die Drogenbarone aussagen.

Ein toter Bergungstaucher deutet auf ein Verbrechen auf hoher See. Sein Bergungsschiff, dessen Besitzer verschollen sind, war auf der Suche nach der versunkenen „Cheetah“. Ungewöhnlich werden die Untersuchungen, als sich der Geheimdienst NSA in die Ermittlungen einklinkt und Charlie im Geheimen bittet, die „Cheetah“ zu lokalisieren, ohne das FBI darüber zu informieren. Dieses große Interesse an dem gesunkenen Schiff lässt auf eine begehrte, gefährliche Ladung an Bord schließen.

Don und seine Leute nehmen einen terrorverdächtigen US-Bürger fest, der zum Islam übergetreten ist. Sie kommen so einer einheimischen Terrorzelle auf die Schliche, die die gesamte Wasserversorgung von Los Angeles mit Sarin verseuchen will. Anhand eines Erpresserbriefes, in dem politische Forderungen gestellt und die Zahlung erheblicher Geldsummen verlangt werden, gelingt es mit Charlies Hilfe, die Struktur der Terrorzelle zu entschlüsseln.

Dem FBI wird ein Videoband zugespielt, auf dem ein unbekannter Kameramann im Haus des Schauspielers Brett Chandler eine Leiche in der Badewanne findet. Da sich das Gesicht der Frau teilweise unter Wasser befindet, entwirft Charlie ein Programm, um das Bild ihres Gesichtes zu entzerren. Der Computer spuckt zu dem Foto einen Namen aus: Andrea Barton. Es stellt sich jedoch heraus, dass die Frau quicklebendig ist und für den Escort-Service von Leslie Dennis arbeitet.

Bonnie Parks, eine bekannte Enthüllungsreporterin, wird vermisst – Don und sein Team machen sich sofort auf die Suche. Plötzlich wird Charlie von einem silbernen Truck verfolgt, dessen Fahrer ihn umzubringen versucht. Währenddessen stellt sich heraus, dass Richard Taylor die Reporterin entführen ließ, um sie für eine Weile außer Gefecht zu setzen. Parks weiß über die geheimen Machenschaften Taylors Bescheid, der Immobilienwerte manipuliert, um an billige Grundstücke zu gelangen.

Der Rapper Start Hunter wird auf offener Straße ermordet. Als David und Liz seine Frau nach dem Tathergang befragen, beginnt plötzlich ein gefährlicher Schusswechsel, bei dem Derek schwer verletzt wird. Angeblich hat Hunter ein äußerst schwieriges Mathematikprogramm entwickelt, was sofort Charlie und Larry auf den Plan ruft. Hunter soll diverse Radiosender bestochen haben, damit sie seine Musik spielen und die Songs eines anderen Rappers nicht veröffentlichen.

Seit Jahren jagt Agent Bloom, ein Veteran beim FBI, einen Geist. Besagter Mann schleicht sich in Firmen ein und hat bisher über zehn Millionen Dollar erbeutet. Bloom und Don liegen mit ihrer Vermutung falsch, denn Charlie hat schon eine ganz andere Spur. Der junge Mann heißt Kevin Oliver und war in den jeweiligen Firmen auf der Suche nach einer bestimmten Sozialversicherungsnummer. Doch was hat er mit dieser Nummer vor? Bloom hingegen begeht einen folgenschweren Fehler.

Eine neue Droge drängt auf den Markt – Hawaiian Ice. Charlie schlägt vor, den Markt frühzeitig zu zerstören und will alle Drogen aufkaufen und somit die Marke schädigen, da der Nachschub ausbleibt. Liz stellt sich zur Verfügung die Drogen undercover zu kaufen, doch Drogendealer ticken anders: Pritchard sieht seine Chance gekommen, den Preis in die Höhe zu treiben. Nun ist guter Rat teuer, denn damit hat Charlie keinesfalls gerechnet.

Don Eppes’ FBI-Team bearbeitet eine Reihe von Banküberfällen, für die der ehemalige FBI-Ermittler Bloom als Hauptverdächtiger gilt. Dieser bestreitet vehement, mit den Überfällen in Verbindung zu stehen. Nur Colby ist bereit, Bloom zu glauben… Charlie, der soeben sein neues Büro in der Universität bezogen hat, zweifelt an seiner Bestimmung, als Akademiker zu arbeiten. Amita gelingt es, seine Bedenken zu zerstreuen, doch schon wenig später wird sie Opfer einer Entführung.

In einer mit Trockenmittel gefüllten Kiste wird eine vertrocknete Leiche entdeckt. Genau dieses Szenarium wird mit dem Film ‚Bixel Street‘, der demnächst im Kino anlaufen soll, auf die Leinwand gebracht. Das FBI beginnt, in der Filmbranche zu ermitteln. Bei dem Opfer handelt es sich um Brett Fuller, einem B-Movie-Produzenten, der ursprünglich als Produzent für ‚Bixel Street‘ vorgesehen war. Schon bald werden weitere Morde verübt, die ebenfalls in dem Streifen zu finden sind.

Das FBI sucht nach einer verschwundenen Waffenlieferung belgischer BNT 35 Gewehre. In der Stadt wurde ein willkürlicher Mord mit diesem Waffentyp verübt. Der Waffenlieferant Randall Priest vermutet, dass die Lieferung noch im Hafen von L.A. in Containern lagert. Charlie versucht anhand von 4-D Abbildung auszurechnen, wo sich die Container befinden. Aber erst nach einem weiteren Anschlag mit zahlreichen Todesopfern hat Charlie genug Informationen, um die Container zu finden.