2021年，东京地区。从不明生命体“原肠动物”毁灭性的破坏中复苏的人类，到现在生活中还是饱受它们的威胁。对付原肠动物的最后磐石就是民警，高中生里见莲太郎是隶属于天童民间警备公司的其中一个民警，他在某个事件的现场遇到了带著面具的怪男子──蛭子影胤。他发挥了压倒性强大的力量，别说是警官们，连莲太郎都不在他的眼里，他称自己是“毁灭世界的人”之后，便失去了踪影‧‧‧。

第三次关东会战即将揭开序幕，重要的电池却始终没有送到，但敌人已来到眼前，“细剑贯穿计划”仍是需要执行。莲太郎顺利将EP炸爆投入毕宿五体内，但没想到EP炸弹却哑火没有爆炸，唯一的解决方法是在毕宿五的体内深处造成直接的冲击，但如此一来就必需有人牺牲，莲太郎可以顺利引爆EP炸弹吗？这场大战又有多少人牺牲？人类赢得胜利了吗？