Członkowie pradawnego tajnego stowarzyszenia zostają zamordowani w niewyjaśnionych okolicznościach. Flynn, z pomocą pułkownik Baird muszą zapewnić bezpieczeństwo trzem osobom, które ocalały.

Bibliotekarzom udaje się zdobyć koronę króla Artura. Chwilę później okazuje się, że to pułapka, którą zastawił na nich wróg. Flynn zostaje ranny, a wszyscy są zagubieni w czasie i przestrzeni.

Grupa bibliotekarzy trafia do niezwykłego miasta, w którym bajki stają się rzeczywistością. Okazuje się niestety, że tylko z pozoru jest tam bezpiecznie.

Baird igra z alternatywnymi rzeczywistościami, przenosząc się z jednej do drugiej. Niestety, w każdej z nich grozi jej śmierć.

Flynn i jego pomocnicy ponownie łączą siły, gdy Manhattan nawiedza potężna burza. Jenkins zauważa wówczas, że z biblioteką jest coś nie tak.

Zły Prospero ożywia groźne postaci, m.in. profesora Moriarty'ego i potwora stworzonego przez doktora Frankensteina. Flynn i jego ekipa muszą stawić im czoła.

Tajemniczy osobnik o imieniu Ray uprowadza Flynna Carsena. Cierpiący na amnezję porywacz jest w posiadaniu artefaktów skradzionych z biblioteki.

Wszyscy członkowie ekipy wiodą spokojne, szczęśliwe życie i nie rozpamiętują przeszłości. Bibliotekarze muszą jednak połączyć siły i stanąć do walki z Prosperem.

Prospero kontynuuje swoje dzieło zniszczenia, paraliżując świat technologii. Realizuje swój utopijny projekt lasu. Flynn i Baird odkrywają, że mogą pokonać przeciwnika, podróżując w czasie.

Pewien człowiek zostaje opętany przez egipskiego boga chaosu, który planuje uwolnić siły zła. Bibliotekarze zamierzają mu w tym przeszkodzić. Udają się do muzeum nauki gdzie poszukują wskazówek.

Flynn dowodzi ekipą podczas misji ratunkowej, w trakcie której Bibliotekarze będą musieli stawić czoła śmiertelnym podziemnym pułapkom i krwiożerczym egipskim wilkołakom.

Zło w czystej postać szaleje na wolności, tymczasem zespół musi stawić czoła zagadce Trójkąta Bermudzkiego i odnaleźć Oko Ra. Flynna czeka seria wymagających zadań.

Bibliotekarze badają sprawę sekty posiadającej setki wyznawców. Tymczasem Flynn ulega urokowi jej charyzmatycznego lidera.

Podczas dochodzenia w sprawie przypadku samospalenia zespół Bibliotekarzy trafia do spa prowadzonego przez wampiry. Cassandra obawia się, że niedługo umrze.

Bibliotekarze ścigają się z czasem. Mają jedynie kilka godzin, aby uratować Shangri-La przed złymi mocami. Miasto zostało oblężone, a jego przywódcy wzięci do niewoli.

Flynn i Jenkins przebywają sami w bibliotece. Niespodziewanie zostają zaatakowani przez uzbrojonych agentów D.O.S.A. Bohaterowie muszą powstrzymać intruzów do czasu nadejścia pomocy.

Sekta z Watykanu odkrywa mapę przedstawiającą kamienie węgielne Biblioteki Aleksandryjskiej. Flynn i jego kompani zyskują nieoczekiwanych sprzymierzeńców. Nie chcą dopuścić do zniszczenia budynku.

Na skutek zbiegu okoliczności bibliotekarze trafiają do kasyna, którego właściciel potrafi kraść szczęście. Widzowie przekonają się, czy uda im się wyjść z tej sytuacji cało.

Po raz pierwszy od wieków Święty Mikołaj bierze wolne i zostawia swoje sanie pod opieką bibliotekarzy. Do sprawy wtrąca się jego brat oraz matka Ezekiela.

Flynn i Baird dostają się do ulubionego filmu Baird z gatunku noir. Mają nadzieję, że wprawne oko i cięty język wystarczą, by uszli z życiem.

Flynn jest zachwycony perspektywą współpracy ze swoim idolem Darringtonem Darem. On jednak ma dla niego groźne ostrzeżenie.

W rywalizacji o cenny artefakt Baird i Nicole Noone chcą pokonać rosyjskie hieny cmentarne. Widzowie przekonają się, czy to wystarczy, aby naprawić stosunki między nimi.

Po tym, jak świat przekształci się w okropne i nierozpoznawalne miejsce – takie, w którym Biblioteka nigdy nie istniała – do Bairda należy zebranie bibliotekarzy, zanim ten ponury, pozbawiony wiedzy świat stanie się nową rzeczywistością.