Panik und Schrecken verbreiten sich, als immer mehr Menschen in Chicago durch tödliche, fleischfressende Bakterien sterben. Eine Spezialabteilung der Polizei untersucht die Vorkommnisse und kommt zu dem Verdacht, dass der Ausbruch auf einen terroristischen Akt zurückzuführen ist, da ausschließlich zwei stark besiedelte Orte in der Stadt betroffen sind.

Das Crossover beginnt bei Chicago Fire S08E04 Die Seuche (I). Es geht weiter mit Chicago PD S07E04 Die Seuche (III).