Diesmal wartet eine äußerst ungewöhnliche Aufgabe auf die Freizeit-Detektive: Sie müssen ein Alien stoppen, das im Weltraum Chaos anrichtet. Die Zeit drängt, und wenn es Scooby Doo und seinen Freunden nicht gelingt, den Außerirdischen aufzuhalten, gerät eine wichtige NASA-Mission in Gefahr…