Albert contrata a Kyouma para investigar el ahogamiento del novelista de misterio recluso Shijuro Sakaki en su residencia en un hotel remoto en el lago Yasogami, infame para los avistamientos de fantasmas. Mira se enerva, viendo una figura fantasmal aunque no hay registro coincidente en sus registros. Kyouma visita la presa y un monumento conmemorativo para los que murieron en la inundación del lago artificial hace 21 años, mientras Mira escanea los libros del estudio de Sakaki - historias de fantasmas horribles que aún más la enojan. Kyouma se enfrenta a Albert que revela que los estudiantes que protestaban tomaron una Bobina Numerada para demostrar que la presa hidroeléctrica pronto sería obsoleta, y las expediciones para recuperar los Números se encontraron con la muerte. Las observaciones y las muertes se detuvieron hace una década cuando Sakaki compró el hotel, pero ahora los fantasmas han regresado. Koorogi reconstruye la memoria de un robot doméstico, mostrando figuras espectrales atacando a Sakaki, y sugiere que su materialización de Dimension W resultó en más datos de los que se podrían almacenar, sobrescribiendo fragmentos en tiempo real. Mientras tanto, reconstruyendo visualmente la aldea de Yasagami, Mira se encuentra atrapada en una visión con el pasado acodada sobre el presente, y es atacada por un fantasma. Un periodista es encontrado ahogado en una furgoneta del hotel, y otros tres huéspedes secuestran a la hermana afligida de Sakaki, Marisa. Mira es atado y mirado por Shiro Kamiki, quien revela que en el presente de Mira se llamaba Shijuro Sakaki.

El fantasmal Shiro Kamiki le dice a Mira que exterminará a cualquiera para proteger su mundo. Las figuras espectrales salen de la niebla para atacar a los del hotel. Kyouma se da cuenta de que se efectúan con agua embotellada, y Albert dispara los rociadores del hotel para detenerlos. Mira lucha con su propia mortalidad y hace cumplir su voluntad sobre la lógica del mundo atado, encontrándose con otro "fantasma" antes de despertar para decirle a Kyouma que los Números están ocultos dentro de la presa. Los secuestradores toman a una droga Marisa Sakaki en la presa, pero son derrotados por Kamiki. Elizabeth "Ellie" Greenhough-Smith, que también está buscando los Números, es advertida por Perdedor que se da cuenta de que Albert ha estado tratando de atraparlos. Mientras Kyouma y Mira corren hacia la presa, ella explica que los Números han almacenado una realidad alternativa en la Dimensión W tomada de la noche de la inundación, de la que Kamiki fue responsable, donde pudo salvar a los estudiantes del accidente pero no de él hermana. El verdadero Kamiki, que cambió su nombre por Sakaki, también deseó mantener vivos a sus amigos y así permitió que los Números los preservaran mientras protegían el mundo real. Kyouma se sumerge en agua de manantial para luchar contra Kamiki, mientras que Mira rompe las percepciones de Kamiki y le permite ver la verdad antes de apagar los Números.