Bubbie y Flapjack se encuentran con el hermano gemelo del malvado inventor de Several Leagues Under the Sea, y Bubbie trata de ayudarlo a cumplir sus sueños y el de crear un barco volador. Sin embargo, parece que el hermano gemelo está realmente enamorado de Bubbie, lo que lleva a una aventura peligrosa por encima del mar embravecido.

Peppermint Larry se niega a darle dulces a Flapjack y K’nuckles a menos que le traigan envoltorios de caramelos para cambiarlos por golosinas. Egoístamente, K’nuckles toma todos los dulces para él, rompiendo el corazón de Flapjack.

Después de un incidente con algunas mujeres en el Candy Barrel, el Capitán K’nuckles le cuenta a Flapjack cuándo estaba en una fiesta, y todos tenían citas, excepto K’nuckles, cuya cita lo abandonó. Él ha tenido Misogyny desde entonces.

Peppermint Larry presenta su Adventure Beard-Off anual. Hombres con barbas fantásticas compiten para ganar la mano de la hija de la dulce de pimienta de Peppermint Larry. El Capitán K’nuckles quiere una barba para competir (él y Flapjack piensan que la hija está hecha de dulces, y los dos quieren comerla), y Flapjack hace una barba falsa de pelo y pegamento. A la mañana siguiente, K’nuckles se despierta con una barba y entra a la competencia.

Flapjack le dice a Bubbie que no siga más al Capitán K’nuckles y le dice a Flapjack que lidere al Capitán K’nuckles, solo para que sea contraproducente. Flapjack lleva K’nuckles como un sello por error y K’nuckles se convierte en un sello.

Una pandilla de niños de la parte mala de Stormalong elige a Flapjack.

Cuando Flapjack descubre algo de fruta fresca, que no se ha visto en años, y el Capitán K’Nuckles se la come, los dos se dirigen a una isla para obtener algo más. Pero un hombre planta misterioso se interpone en el camino.

El Dock Hag atrapa a Flapjack y al Capitán K’nuckles ensuciando y los sentencia al servicio comunitario recogiendo cabezas de pescado. El doctor Barber, sin embargo, ofrece pagarles las cabezas, para su deleite, pero pronto descubren sus verdaderas intenciones para las cabezas de pescado.

A Flapjack lo siguen confundiendo con una niña, por lo que él y el Capitán K’Nuckles intentan engañarlo, solo para descubrir que su voz es el problema.

El Capitán K’nuckles se roba el corazón de una reina sirena llena de dulces, con la intención de que él y Flapjack lleguen a la isla Candied, pero rápidamente hacen un mal uso de los deseos y aprenden un terrible secreto sobre la sirena.

Flapjack y el Capitán K’nuckles son estafados por un hombre misterioso llamado Ben Boozle, y se ven obligados a trabajar en su barco hasta que Flapjack pueda alcanzar el rango de capitán.

Flapjack y el Capitán K’nuckles se cuelan a bordo de un crucero de golosinas, pero accidentalmente enojan al Poseidón cuando destruyen el mascarón de proa del barco, que era de su hija.

Believing K'nuckles to be a bad influence Bubbie tells Flapjack to stop following the pirate, but to lead him instead. Unfortunately, after taking the advice of an animal trainer Flapjack accidentally hypnotizes K'nuckles into believing he is a seal.

Bubbie falls in love with a whale named Harvey, who kidnaps Captain K'nuckles and Flapjack to work in his factory on Laundry Island – unknown to Bubbie, who thinks they are ignoring her.

After Flapjack finds a pair of legs adrift at sea, Captain K'nuckles uses them to terrorize the people of Stormalong Harbor. However, when a sea monster's torso comes to reclaim the legs a battle for ownership ensues.

Captain K'nuckles steals a mermaid queen's heart filled with wishes (in the form of candy) so he and Flapjack can go to Candied Island, but they quickly misuse the wishes and learn a terrible secret about the mermaid.

Flapjack is dubbed Captain K'nuckles' guardian angel by Bubbie but when Flapjack annoys him with constant protection, K'nuckles fakes his own death to have peace.

Taunted by a rich boy for being poor, Flapjack and Captain K'nuckles search for diamonds that the rich boy claims are in the sewers of Upper Stormalong Harbor.