能看见妖怪的夏目贵志有一位同样能看见妖怪的奶奶夏目玲子。玲子生前凭借自己强大的力量把自己打败的妖怪的名字记录在友人帐上。只要有了友人帐并且呼喊上面的名字便能命令妖怪们。在被妖怪追赶中的夏目，误破坏了神社的结界放出了一个酷似招财猫的妖怪斑。从斑那里夏目知道友人帐的作用，并且决定归还友人帐上面的名字。斑也决定留在夏目身边保护他，并让夏目称它为老师……
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这一天有一个叫露神的妖怪来找夏目归还名字，可是因为自己的名字在友人帐上与另外一个妖怪的名字粘到一起，强行撕开会伤害到自己。露神只好和夏目去找另一个妖怪，并且成功的把名字归还了给它们。露神长期被一个叫做花子的老奶奶信奉参拜者，这也是露神最后一位信奉者。前些日子花子老奶奶去世了，这样露神的妖力也越来越弱。等到夏目再来看露神的时候，露神已经快要消失了……
妖怪们找夏目希望他能帮助它们赶走一个八原的除妖师。夏目无奈只好答应。在调查中夏目感觉的同校的田沼能够和他一样看见妖怪。夏目想到自己童年的孤独，忍不住想去找找这位田沼，希望能够成为伙伴。在来到田沼家寄宿的寺庙时候巧遇除魔师，谁知这位除魔师就是田沼的父亲。因为担心自己儿子说能看见奇怪的东西变开始除魔。原来田沼只能模糊感觉到妖怪的存在，但是夏目认为自己找到了伙伴……
试胆大会，同班的笹田跟贵志说了旧校舍的传说，因为对人类的怨恨使招福的神成了低劣的妖怪，并且在旧校舍久久不去。而就在试胆大会期间，同班的同学居然一个个消失了。原来那个妖怪是真的存在的。笹田怀疑贵志能看到妖怪，并且请求能帮助她找到那个曾经帮助她的妖怪，并且希望能够打开那个妖怪的心结，不要认为自己是不洁的。最后贵志将名字还给了妖怪，也解放了他，妖怪时雨也向笹田说了谢谢……
在翻祖母遗物的时候，贵志翻到了一张车票，因为好奇志贵前往已经荒废的车站，却发现了一直在等铃子的河马型妖怪山斗，原来山斗和好朋友三棱吵架了，因为山斗把重要的名字给了铃子。铃子本来答应要陪山斗一起去雾沼找三棱，结果因为粗心大意而忘记了。为了完成铃子与妖怪的约定，贵志将名字还给了山斗并陪它前往了雾沼，两个好朋友也和好如初……
居住在水底双叶村的妖怪雨燕，为了向曾经帮助过自己的人道谢，就附在了贵志身上，后来雨燕虽然与救命恩人见了面，也说了道谢的话，但因为那人看不见她，所以没有回应。贵志总觉得这样的话，雨燕的心愿便没有达成，于是参加的妖怪们举办的双叶祭，在斑的帮助下，赢得了可以让妖怪变成人类的浴衣，雨燕也终于让救命恩人看到了自己……
温泉合宿，贵志救了一只被妖怪欺负的小狐狸，小狐狸的妈妈去世了，自己一个人在森林里很孤独，在得知了友人帐的事情以后，小狐狸写下了自己的名字交给贵志，但被贵志拒绝了。贵志走后，为了再见到贵志，小狐狸吃了能变成人一天的药，独自前往贵志所在的城市，看到了与家人一起热闹吃饭的贵志，便悄悄离开了---原来寂寞的只有自己。谁知贵志察觉到了小狐狸，并跟了出来，与小狐狸约定下次去看它……
贵志在河边遇到了章史先生，并得知章史在年轻的时候也看得见妖怪，并与一个萤火虫化身的妖怪相爱。结果有一天，章史突然看不见妖怪了，他每天都来到河边呼唤萤的名字，萤站在他面前，他却看不见。很久之后，章史就要结婚了，他打算最后来试运气见一次萤，然后再不来到河边。为了让章史看见自己，萤重新变成了萤火虫的形态---这么做的话，它就要在一天后死亡……
夏目外出的时候遇见了一名叫名取周一的名演员，还遇上了脖子上系着绳子的妖怪。晚上夏目被纸状的妖怪袭击，老师外出喝酒了不在，夏目挣脱妖怪的束缚之后，发现周一还有个除妖人的身份，对妖怪充满了憎恶。他要求夏目做他的助手去驱除一家仓库的妖怪。夏目发现在那仓库的妖怪就是曾遇上的脖子上系着绳子的，交谈中他了解到这妖怪的不幸经历，还发现它与周一间有着一段联系……
夏目遇见了一个打着伞的妖怪，它要抢夺夏目的身体。了解之后才知道原来有个在矶月之森弹奏的美丽妖怪浅葱患上了一种让身体像泥土一般剥落的疾病而无法弹琴，那个妖怪为了让浅葱弹琴把浅葱放入了夏目体内。为了让浅葱和自己分离，夏目决定帮忙实现浅葱的愿望。然而显身的浅葱却说了自己最后一次想为的的是一位一直在自己身边温柔的朋友弹最后一次琴……
斑老师偷吃了藤原家的虾，被夏目质问时又不幸踩坏了夏目借的CD，在夏目的责问下与夏目断绝关系离家出走。它不仅教训了夏目附近森林的对它有微言的低级妖怪，还变身为女高中生模样榨干了西村和北本的钱包。它打败了名叫猿猴的想抢夺友人帐的妖怪，伤痕累累的它回藤原家时发现，夏目高兴地正照顾着一只白色的小猫。生气嫉妒的斑老师离开夏目去喝闷酒，谁料卷入一场小小意外之中……
夏目归家途中为解救一只青蛙而遇上了被封印的妖怪，那妖怪正吞食其他妖怪时发现了夏目，扬言要吃掉它，夏目逃离了那片森林。夏目发现被妖怪碰过的地方出现了奇怪的血印，老师大意触碰之下才发现那是诅咒的印记，可惜受到诅咒的影响身体变小力量大打折扣，无法担任夏目的保镖。在老师的建议下，夏目利用友人帐召唤来了妖怪三筱，三筱表示对诅咒不熟帮夏目找来了妖怪丙……
与夏目分散的斑老师遇上了田沼，泄漏了自己是妖怪的秘密。与夏目汇合后，三人去了正在筹备当中的庙会，遇上了笹田，田沼协助夏目逃离，却落下了斑老师；小狐狸趁着庙会的时机来看望夏目却被其他妖怪欺负，名取周一为小狐狸解了围但隐瞒了他认识夏目的事实。田沼带夏目去了他家神社，夏目没有告诉田沼他能看见院子的池塘。笹田拴住了斑老师作为与夏目相见的筹码……
被球砸中的夏目掉进了别人家的院子里，帮忙捡球的时候遇见了抢夺友人帐的妖怪，逃窜中碰断了封印。被妖怪捉住的夏目呼吸困难，向猫咪老师求救，猫咪老师慵懒的神态惹怒了夏目，凭借自己的力量一拳打倒了妖怪，也顺带给了猫咪老师一拳。回家后夏目发现窗外有一只与猫咪老师相似的黑猫，误以为是猫咪老师，于是打开了窗放他进来……
老师不慎脚滑从围墙上摔下来扭伤了腰，于是夏目一起陪他去找治疗腰痛的乐草，来到了芝原野森林，以前这里有两座森林守护者的石像，但现在只剩了一座。猫咪老师独自前去寻找草药，夏目靠在石像上休息，不想却遇上了附在守护石像上的妖怪，那妖怪想让夏目成为盛装自己的容器，却阴错阳差进入了夏目做的雪兔体内……
回家途中夏目遇见了抬着轿子的小妖怪，妖怪们看着眼前的水洼不知道怎么过而犯愁，夏目顺手放了一块木板在水洼上，让他们通过了水洼，风吹起了帘子，夏目看到轿中的东西吓了一跳。回家后发现门缝里夹着纸人，不想却被取出来的纸人缠住了，纸人捆绑着夏目来到了名取的跟前，原来这是名取捣的鬼。接下来，夏目收到了与名取一起去温泉的邀请……
看到门口一晃而过的身影夏目追了出去，却在门口发现了妖怪写的字。晚上夏目担心那个没有被孵化的蛋爬上树去看，发现母鸟没有回来，便把还温暖着的鸟蛋带了回来，让猫咪老师孵化。放学回来的夏目看着门口的字，参悟了其中的意思，为此已疑惑时，写字的妖怪出现了，向他打听院子里的鸟蛋的下落，并且警告他不要打鸟蛋的主意……
回家后夏目发现了自己刚才看到的小妖怪，小妖被夏目看到后慌忙躲避，结果一头撞到大树上，喝茶时被热水烫了手。问及夏目是不是不记得他了时，夏目告诉他玲子已经去世了，得知这个消息的小妖过度震惊僵掉了。打算还给他名字的夏目发现友人帐上面没有他的名字，与猫咪老师探讨这一问题是小妖说他的名字没有在友人帐上……
西村拉着夏目一起去看5班的一个女生，西村上前搭讪时，多轨看到夏目后愣了楞神然后转身跑开了。夏目去找猫咪老师吃晚饭时听到了两个小妖说的话，顺着小妖所说的方向找去发现了一个像是阵的涂鸦，与猫咪老师研究时发现了正在画阵的多轨，而多轨脱口而出叫了夏目的名字。晚上睡觉是夏目做了一个可怕的梦，早晨刷牙意外发现自己身上有奇怪的字……
多轨被妖怪下了诅咒，曾经喊出名字的人会一起被妖怪吃掉。为了解除这个诅咒，夏目与多轨开始寻找那个妖怪。猫咪老师四处找寻夏目却只找到了夏目的包，知道夏目是被妖怪捉走了。妖怪把夏目被捉到了山洞，打算吃掉他，内心恐惧的夏目挣脱了妖怪的束缚，逃了出来，遇到了前来找他的猫咪老师，但是却发现自己看不见妖怪了……
夏目与朋友一起去参加习题集训，来到了民宿。晚上与猫咪老师在池塘里发现了会眨眼睛的鱼，夏目吃了一惊。大家入睡后，妖怪果然现身了，目标是夏目的友人帐。就在夏目与人鱼对峙期间，民宿的主人千津夫人出现了，人鱼看到有人来便离开了，随后，千津夫人告诉了夏目关于人鱼的传说，并且说起了自己小时候为自己重要的人乞求来了人鱼的血，并给他喝了下去……
夏目去旧货市场盘子，感觉到了一股奇怪的气息，追寻这股气息时映入眼帘的是一幅只画着树枝的画，卖家看夏目喜欢便送给了他。可是自从带着这幅画回家后，便发生了不可思议的事，每天醒来，房间里都会洒满花瓣。为了弄清原因，夏目与猫咪老师晚上没有睡觉，终于抓住了送花的妖怪。妖怪要求夏目把画归还给自己，却发现画紧紧贴在墙上取不下来......
摘完野生柳丁的夏目从树上下来，与猫咪老师争吵时感觉到了妖怪的气息，随后在俩人还没反应过来的时候一把斧头迎面飞来，钉在了夏目身后的树干上，吓得夏目与老师失声尖叫。与藤原叔叔一起回家的夏目，发现了家门前的脚印与涂鸦，这让夏目心里感到不安。半夜被惊醒夏目看到了妖怪的身影，追逐妖怪是遇见了起夜的叔叔，得知了以前也发生过相同的事......
陪塔子阿姨回家途中，看见了一只受伤的鸟妖，夏目急急告别塔子阿姨，追着鸟妖而去，见到夏目，鸟妖用求救的眼神看了他一眼，便被追赶他的妖怪吞食了。夏目巧遇了也赶到这里来的名取先生，并且被名取先生邀请参加咒术师的聚会。参加那个聚会，就能见到和自己一样的人，在这里，或许可以找到自己也能做到的事。抱着这样的想法，夏目与猫咪老师一起去了聚会......
受班长笹田所托，西村与北本带夏目来到了废弃的屋子。笹田好奇夏目的能力而想方设法让他承认，这让夏目感到很为难，幸好多轨及时出现，解救了夏目。这时猫咪老师也来了，嘱咐夏目早点离开这里，以免危险。听到这话的夏目担心多轨与笹田的安全，于是去找俩人，听见了小孩的声音，循声而去，在房间的棺材里，找到了一个小男孩......
名取告诉夏目，介是妖怪，恶鬼们为了解开封印而引来了介，而介前往宅邸也是为了寻找被封印的那口井。名取并没有奢望能够得到夏目的帮助，只是希望夏目别妨碍自己。得知这些的夏目难以接受，而名取只问了他，对他而言最重要的，究竟是人类，还是妖怪，夏目一时之间无法回答，甩开了名取的手，跑掉了......
夏目在藤原家发现一个茶碗似的妖怪。据猫咪老师说，这个妖怪叫做影茶杯。因为喜欢人类会寄居在陈旧民宅的地下，如果将有灾难降临到那家里，它会四处跑动来通知人类，有时候会作为人类的替身，代替人类承受灾难......
在沼田家的寺庙里，沼田发现了一个妖怪的影子。据妖怪们说，那个妖怪是浮春之乡的居民，他走出了浮春之乡，却回不去了。为了寻找回乡的办法旅行了很多年。浮春之乡是现世无法看到的、和外界没有交集的彼岸之乡。但以重大节日为机也会很罕见的和外界连接……
夏目在给即将过生日的滋先生买蛋糕的时候，遇上的他小学时的同学—柴田。柴田把夏目带到一个小公园里，希望夏目帮他确认一下他喜欢的女孩子村崎是不是妖怪。这天晚上夏目做了一个噩梦，梦见柴田被村崎吃掉了......
夏目小时候被同龄孩子说他是骗子，经常有奇怪的行为，并且疏远夏目。在树上坐着的一只妖怪很讨厌人类，无聊的时候经常倒挂在树上吓人，可惜普通人看不到她。这时她遇到了夏目，她原本以为夏目看不到，就和平时一样吓人，发现夏目能看见妖怪……
夏目和田沼在多轨家避雨时帮助多轨打扫仓库，夏目在仓库看见了三件和服，但后来却发现只剩下了两件，而他在走廊上还遇见了和服妖怪和一个友好的小妖怪，小妖怪说因为夏目把倒贴的画撕了下来，所以妖怪跑了出来，那个和服妖怪叫仓狩，要是它找齐了身体会发生可怕的事情，夏目想阻止这件事情，没想到却被仓狩带到了后院，幸好猫咪老师及时赶到，妖怪们也来帮忙，终于制服了仓狩，多轨家又恢复了平静。
夏目遇到一只妖怪，发现她身上有血，于是跟着她的鞋印到了一间寺庙，夏目看到寺庙里满是被袭击的妖怪。突然，夏目被某个不知名的人掐住脖子，幸好之前的妖怪救了他。后来发现原来那个不知名的人是的场一族的少爷的场静司......
夏目被的场静司抓走以后被其告知在不远的森林里被封印着一只强大的妖怪，而的场为了唤醒妖怪 便取妖怪们的血作为诱饵，引诱妖怪觉醒。夏目得知以后决定阻止的场，趁的场被人叫走时逃了出去。的场追了过去，名取和猫咪先生为了救夏目也赶了过去……
小狐狸每天都在森林某处的一块石头上眺望车站，想着什么时候夏目会来。这天他捡到了一块手表，正巧夏目跟藤原先生一起参加陶瓷班，来到了森林。小狐狸一直想帮助夏目，在得知夏目需要一种草药时去帮忙寻找……
学院祭要开始了，而夏目在桥上遇到了妖怪。为了躲避妖怪夏目从桥上跳入河中，却正好被朋友西村与北本看见了。西村和北本慌忙之中跳下河救了夏目。晚上夏目正对着昏睡着的猫咪先生自言自语时，从书包里滚出一块附着妖怪的石头……
夏目与猫老师外出寻找因雷击古树而出现的酒泉，却意外走散而遇到田沼。在森林之中田沼被妖怪附身，虽然在几天以后的学校中夏目发现了这一事实，但妖怪却要求夏目协助自己寻找自己镜子的碎片。于是夏目、田沼和多轨三人从校园中开始寻找碎片……
夏目因为担心田沼，和猫咪先生当夜住在田沼家，找到的碎片融入夏目眼中。晚上，夏目通过看见妖怪的梦，知道她迫切需要镜子的原因。遭到学校里出现过的妖怪袭击后的第二天，夏目、田沼和多轨三人继续在校园寻找碎片，这次猫咪老师拿给夏目接近完成的镜子……
夏目遇见了以前还没来塔子阿姨家，想要自己和他一起去的妖怪。并被袭击了，后来晕倒。做梦梦见了自己以前遇见那个妖怪时的事情。在遇见了那个妖怪以后自己也去因为塔子夫妇对自己询问想要去他们那，而更加不想去妖怪那……
考试结束后，夏目他们商量着下次出门玩的事。正说着去哪玩的时候，话题转到了儿时的游戏。想到了从未加入过、只在一旁看的踩影子的游戏。翌日，夏目硬是被妖怪们带到宴会上。情绪高涨的妖怪们说想玩人类的孩子的游戏。于是，便试着同妖怪们玩起了脱口而出的踩影子游戏…
夏目为了救一个不认识的小妖怪的朋友走进了森林,在帮助小妖怪从石头下出来后却被猴面怪给袭击,幸好猫咪老师及时赶来救了夏目.但是,在那之后夏目在上学时却被那群猴面怪绑走并带到他们所居住的森林.虽然猫咪老师再次赶过来救了夏目,但是,本想同身为保镖的猫咪老师离开那片森林的夏目却发生了意外与猫咪老师失散,并且在不经意间在森林中发现了一座古宅...
夏目被关进了的场家的囚室之中,那位被的场封印的猴面怪逐渐了解到了真实的夏目.但的场为了让猴面怪之首六月为己所用,对森林动了手脚……随后,丙、"中级妖怪"、三簌也前来帮忙……最终,森林恢复了平静……
夏目在放学的时候救了一个小毛球,帮其疗伤后离去.得到了名字却丢失了戒指的甘菜来找夏目,要求其三天内将戒指还给他.夏目终于从小毛球那里得到了戒指,可是因愤怒而失去自我的甘菜想要攻击夏目.最终,小毛球们在救了夏目之后,离开了...
冒充塔子阿姨声音的妖怪呼子进了夏目家里,挟持了夏目去找名叫狩纸的妖怪,呼子想要请狩纸修复因为雨水而无法打开的信纸.信件是一个名叫阳子的人类女子留下的,呼子因为无法看阳子小姐伤心而一直冒充隆彦的声音陪伴着阳子.直到有一天,阳子直到了呼子并不是隆彦...
由梨子是夏目之前的同学.在神社的时候夏目为了躲避妖怪而踹开由梨子,两人因此熟识.黑色镰刀妖怪因为夏目救了一只栖猫而诅咒追杀他.然后夏目却感到镰刀妖怪一直在戏弄他,再次被迫转学的夏目告诉连道妖怪自己将要离开,于是,镰刀妖怪告诉了他真相...
夏目被妖怪瓶子吸了进去.晚上祭典的妖怪想要拿走瓶子当祭品给御柱大人,却被猫咪老师阻止了.白天猫咪老师扮成夏目的样子去学校询问情况.田沼发现了"夏目"的失常,却被卷入事件之中...
因为夏目被抓走而被卷入事件的田沼意外的能看到了妖怪.田沼潜入妖怪聚会救出了夏目,名取趁机制造混乱让几人逃跑,然后整个公馆都被封印起来没有人可以出去,御柱竟然要把所有妖怪当做口粮...
夏目被突然从空中出现的妖怪抓走了!这个误认夏目是铃子的妖怪,希望夏目藉由友人帐的力量,呼唤他被封印的妖怪朋友.另一方面,与夏目失散的猫咪老师,在山中废屋的古井中,感觉到奇妙的气息而不小心失足掉进古井.而猫咪老师在古井中遇见的,竟然是除妖人的场一门的七濑…
月分祭,是丰收之神丰月神,与荒作之神不月神举行比赛,进而祈求丰收的祭典.要是不月神得胜,整座山将会牯陧C但是在祭典开始之前,丰月神竟然被除妖人封印了.名取接受委托,要找出丰月神的下落,而来到了三隅山.然而,应该已经被封印的丰月神,却出现在名取面前.而这个丰月神,长得跟夏目一模一样…
月分祭终于开始了.夏目代替被封印的丰收之神,与受托寻找丰月神的名取,一起前往留有丰月神气息的悬崖边.这一次与不月神比赛的内容,是谁先抓到壶中逃出的怪兽,谁就是赢家.为了赢得比赛,夏目用名取准备好的咒文与瓶子封印了怪兽,眼看胜利就在眼前…
夏目与田沼等人约好要去寻找柠檬汽水的涌泉.正当一群男生嬉闹时,夏目接到以前曾受过照顾的亲戚来电.原来是夏目小时候曾跟父亲一起生活过的房子,已经找到买主,要转手卖掉.有这麼多心地善良的人在身边,夏目自觉应该不会再为往事心痛,於是他找出一张年代悠久的相片,相片中的身影,是夏目的父母…
夏目告诉藤原夫妇,他想回去看看老家最後一眼.於是夏目来到亲戚三世子的家里,要拿老家的钥匙.以前曾在这个家待过一阵子的夏目,看著附近熟悉又陌生的景色,想起儿时的回忆,也想起这个家里,以前住着一个妖怪…
夏目被住在三世子家的妖怪食虫侵入了内心,使他的意识迷失回忆中.而他看见的是,住在三世子家时,悲伤痛苦的回忆.在那里,自觉没有栖身之所的夏目,只能欺骗自己,自己一点也不寂寞.当他领悟,无论再怎麼呼喊,也永远得不到时,他决定再也不去呼喊,决定忘记一切…
贵志有了许多妖怪朋友，现在的他一点也不感觉到寂寞。平日里时长有妖怪来找贵志要回自己的名字，贵志都很痛快的把名字归还，但是这些妖怪们似乎都认为贵志就是玲子。这天的放学路上，贵志被一个不停滚动的壶追赶，这一定是妖怪在捣鬼。没想到几天之后，那只躲在壶里的妖怪竟然找到了贵志家的门口，它找贵志似乎另有目的。
某个雨天，夏目在放学途中捡到一条毛巾，这条毛巾是一个小妖怪落下的，夏目没来得及还给它就被同学叫走了。回到家里的夏目思索如何将这条毛巾还给小妖怪，没想到小妖怪竟然追到了夏目的家里。小妖怪来夏目家的目的不止一个，它要回了毛巾，同时也希望夏目能帮它将毛巾还给原来的主人。
夏目收到了的场寄来的信件，的场家族以前对夏目做过过分的事，这次寄信来肯定事出有因。夏目决定先不拆开信件，去找猫咪老师商量。路上夏目遇见了一个正在封印妖怪的除妖人，此人将妖怪封印后就将封印之壶丢弃。夏目看得专注，无意间将的场寄来的新弄丢了。猫咪老师随后现身，两人发现刚才那个除妖人的封印并不专业，被装进壶里的妖怪没有完全封印，这样下去两三天之内妖怪就会破印而出。
的场先生没有收到夏目的回信，亲自出发去迎接他。夏目无法拒绝的场先生的邀请，只好跟他去了的场一族的别邸。的场先生写信给夏目果然别有用心，他希望夏目能加入的场一族，成为一名除妖人。现在许多除妖人的家族都已渐渐衰败，为了避免妖怪们的报复，的场打算召集有才能的除妖人加入的场一族，保全除妖人的人身安全。
夏目在学校整理教室时无意发现了一个巨大的怪物正在教室门外盯着他，当他想去一查究竟时那妖怪便消失不见。之后多轨跟他说起自己家里曾经进来过一只妖怪，多轨帮助那只迷路的妖怪走出了遍布阵法的家。夏目听后觉得有些不妥，他带着猫咪老师准备去多轨家让多轨多加防范。没想到到了多轨家，夏目就察觉这个家里还有妖怪存在。
夏目帮塔子阿姨出门买东西，途中遭遇多毛妖怪袭击，幸好有一只大鸟形态的妖怪前来相救。鸟妖怪把夏目带到自己的巢穴，一个荒凉的山谷，还管夏目叫玲子。夏目想解释身份，不料声音被多毛妖怪封印无法发声。随后猫咪老师赶来将夏目带回家，然而夏目的声音还是无法恢复，就在他着急时，鸟妖怪上门拜访，要夏目把名字还给他。
田沼邀请大家去他亲戚家开的旅馆，顺带帮忙收拾刚装修好的旅馆，作为保镖猫咪老师也跟来了。明后两天后山举办祭典，夏目他们正好能去玩，还有五位客人就是为此而来的。夏目和田沼打扫后院时，遇到了之前照顾过田沼的糸婆婆。这天晚上，夏目察觉旅馆有妖怪入侵，客人也莫名其妙的多了一位……
这是名取高中时代的故事，名取家曾从事除妖师一职，但因无人能看见妖怪便废业了。名取一族畏惧妖怪的报复，在这种情况下能看见妖怪的名取周一，便被家族视为不详的存在。某日，一位除妖师上门拜访，名取意外得知的场家举办除妖师聚会的事，于是偷偷前往。为什么要做除妖师？为了振兴家族，还是为了保护大家？
这天放学，夏目又被奇怪的妖怪盯上了，他一路逃跑，在桥下撞倒了一只香菇模样的小妖怪。小妖怪的斗笠被夏目划了个小口子，小妖怪要求夏目帮它修复伤疤，因为只有打扮得漂亮才能追上自己崇拜的朱远大人。朱远大人是修行的旅者，今晚旅者队伍会途径这座山丘，小妖怪无意间得知要加入队伍必须准备贡品，最好是美味的人类之子……
塔子阿姨和滋叔叔一直过着温馨却又些许寂寞的二人生活，一场远亲的葬礼让滋注意到了在亲戚间辗转流离的夏目，看着夏目孤单又瘦弱的背影，滋生起了接管夏目的念头，塔子闻言喜极而泣。夫妻两人决心收养夏目，随着猫咪老师的加入，夏目也渐渐敞开内心，彼此接纳，成为了真正的一家人。
夏目忙着准备期末考试，中级妖怪寂寞无聊之际，突然想起最近是赏花的好时节，于是在放学途中硬拉着夏目去看三羽丘的白雾花。夏目跟随中级来到山顶，在悬崖上看到了美丽的白雾花丛。没想到这次爬山让夏目患上了重感冒，学校也请了好几天的假，得知此事的中级决定找大妖怪寻求治百病的草药。
夏目和猫咪老师在购物途中遇到一个被罐子卡住脑袋的妖怪，夏目好心救了它。作为回报，妖怪月日食未经夏目同意就将他返老还童。变小了的夏目失去了长大后的记忆，他不认得猫咪老师了。无奈之下猫咪老师只得请路过的田沼和多轨帮忙照看小夏目，老师自己一人去寻找将夏目变小的月日食。
夏目在路上发现了画有花朵图案的石头，经过询问得知这是石洗大人在净化石头。之后夏目偶然遇见了石洗大人本尊，他似乎有事想请夏目帮忙。这位石洗大人叫做七莳，他正在四处旅行寻找他的徒弟东。七莳非常疼爱东，当东踏上旅途去洗净八万石头时，时常送信回来报平安。可是最近半年东突然断信，最后一次的送信地点就是夏目所居住的小镇，七莳希望夏目能帮他一起寻找自己的徒弟东。
夏目以前的同学柴田打来电话想约他见面叙叙旧，夏目带着田沼去赴约。三人聊天中柴田无意说到了自己听到的“外木的人偶屋”传说，勾起了夏目的兴趣，于是柴田带着夏目和田沼去看看这座人偶屋。不料夏目在人偶屋楼下与屋内的人偶对视，夏目有预感这人偶会追随袭击自己。柴田认为这是自己的责任，所以跟着夏目和田沼住进了田沼家里。果不其然，半夜里诅咒人偶“二体大人”追寻着夏目的气味来到了田沼家里。
夏目和猫咪老师观影回家途中发现了名取先生的纸人偶，上面写着樱洗塚14点。夏目担心名取先生遇到什么麻烦，就带着猫咪老师去樱洗塚看看。在那里夏目遇到了一个好心女生，她热情的邀请夏目去自己家里避雨。到了女生家，猫咪老师立刻察觉到这里的气息不对。果不其然，女生说家里最近时常发生奇怪的现象，夏目决定帮女生查出原因。
拓间月子的父亲原本是除妖师，现在年事已高已经失去了看见妖怪的能力。但是拓间先生以前缔结契约的式神们没有得到解放，月子小姐误以为家里进了妖怪所以将家里到处贴上了符咒，但这样的后果就是把拓间先生三个式神中的两位关在了门外。进不了家门的式神们认为拓间先生抛弃了他们，所以在拓间家设下诅咒，希望能重回拓间先生的身边。
夏目刚转学过来时还是个沉默寡言的少年，在一次偶然的情况下西村与夏目搭上了话，夏目谎称自己贫血，其实是见到了妖怪。西村好心带夏目去自己家里休息，夏目却在西村家里发现了妖怪的踪影。不善言辞的夏目为了引出妖怪直接跑出了西村家，西村的哥哥却误以为夏目是个没礼貌的孩子。夏目不想让西村受妖怪牵连，但妖怪还是缠上了西村。西村被妖怪缠身变得焦躁易怒，在妖怪即将吞噬西村的时候，夏目和猫咪老师及时出现解救了西村，两人也因此变得要好起来。
妖怪御持半夜造访夏目家，它不是为了求夏目还回名字，而是想报答以前玲子的恩情。御持所居住的森林里有两位很强大的妖怪千机和百子，它们为了争夺抢来的新娘贵舟吵得不可开交，森林里四处都是被它们争吵所破坏的树木。御持想请玲子帮忙解决千机和百子的纠纷，玲子也为贵舟打抱不平，她决定跟千机和百子比试一下，胜出的人可以拥有贵舟。
夏目在回家的车站遇到了一个等车的男子，男子拜托夏目带他去学校，他想寻找一个女孩。路上男子告诉夏目自己叫熏，直到学校夏目才发觉这个男子不是人类。熏要寻找的女孩园川香也可以看见妖怪，他们从小就在树林里聊天打闹，但长大后熏担心园川香总跟妖怪走太近会被社会排挤，所以故意疏远了她。熏这次特地来寻找园川香，是因为他受到了香的婚礼请帖，夏目听后也想见一见这位园川香，所以决定帮助熏寻找香。
夏目、田沼、西村、北本报名参加学校惯例的三天两夜学习合宿，这次的举办地在山上的教室。夏目四人负责打扫河对岸的小神祠，西村称这个神祠被称为“四面塚”，夏目果然在祠堂里看到了怒哀乐四张面具，但田沼等人只看到了三张面具。到了晚上，山中突降暴雨河水泛滥，就连教室也可能遭殃……
对妖怪和除妖人术式进行研究的箱崎先生前几日去世了，他留下了庞大的珍贵资料，这对除妖人来说有着不小的吸引力。宅邸里聚集着众多的除妖人，他们都想得到箱崎家的遗产，夏目也跟着名取来到了宅邸，因为这些资料里可能有着对友人帐的记录，在庞大的宅邸里他们要找到被箱崎先生用妖术隐藏起来的书斋。
夏目被妖怪威胁，幸好名取先生及时出现他才得以解救。但是妖怪威胁夏目交出友人帐的事情被名取先生听见，无奈之下夏目只好向名取另约时间说明这件事。箱崎先生的宅邸被蜂拥而至的除妖人弄得凌乱不堪，但是丝毫没有找到书斋的踪影。在名取和熟人交谈时夏目得到了启发，他想起红子小姐说过箱崎先生曾经为她种下过一棵枫树，这或许是找到书斋的重要线索。
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