Terwijl Emily zich zorgen maakt over haar herinneringen aan de tijd die ze met de aliens heeft doorgebracht, raakt Bill ook verontrust door de overeenkomsten tussen Emily en de aliens. Zoe moedigt een onwillige Bill aan om deze overeenkomsten in hun voordeel te gebruiken.

Bill injecteert Emily in het geheim met een biologisch wapen dat hij hoopt te gebruiken op de aliens; wanneer ze ziek wordt, gaan enkele van de overlevenden op zoek naar insuline om haar te behandelen; de verzetsbasis wordt aangevallen en de overlevenden worden gedwongen te vluchten.

Catherine, Sophia en Nathan gaan naar Londen, vergezeld door Victor, een overlevende die bij toeval wordt ontmoet. Onderweg nemen de gevaren toe. Sacha's gevoelens voor Emily worden intenser en het gedrag van de jongeman wordt steeds verontrustender. Bill voelt zich bedreigd en wordt gedwongen te vluchten.

Bill sluit zich aan bij de militaire groep gevormd door Ethan, Dominic en Michael. De drie mannen houden een jonge alien gegijzeld, Isla. Catherine, Sophia en Nathan blijven zoeken naar Bill. Adina en de aliens gaan ook op zoek naar Bill. Chloe beschuldigt de klap als ze zich realiseert dat Sacha Ash heeft vermoord. Ze stelt haar steeds onstabieler wordende zoon voor om met haar weg te rennen.

Op de universiteit kijkt Sophia naar de video's die zijn opgenomen door Dylan, een jonge man die ze dood hebben aangetroffen, terwijl Catherine zich concentreert op de algoritmen die hij achterliet en die het gedrag van robots ontcijferen. Dankzij de tussenkomst van Bill slaagt Isla erin te vluchten en zich bij haar familie te voegen.

Emily stemt ermee in om Bill te helpen haar te testen op het virus, maar krijgt al snel ernstige bijwerkingen. Sacha, die stiekem de groep is gevolgd om dicht bij Emily te blijven, probeert haar uit de groep te verwijderen. Van hun kant gingen Catherine, Sophia en Nathan opnieuw op zoek naar Bill Ward.

Catherine, Sophia, Zoe en de andere overlevenden, eindelijk herenigd, bereiden zich voor op de ultieme aanval. Maar het is Bill die als enige het lot van de mensheid in handen heeft, mits hij daarbij wordt geholpen door Isla.