토모의 발명품 ‘작아져라 머신’을 가지고 작아져버린 폴과 친구들!! 그 사실을 모르고 있던 벤이 그만 폴과 에밀리를 사과와 함께 삼켜버리는데... 아이들을 구하기 위해서 다이노들도 작아져라 머신을 이용해 벤의 몸 속으로 들어간다. 과연 폴과 에밀리는 무사히 돌아올 수 있을까??