Milán, 1506. Leonardo da Vinci es arrestado por envenenar a Caterina de Cremona. Después de declarar su inocencia ante el oficial Giraldi, Leonardo recuerda sus días en el estudio de Verrocchio, donde conoce a Caterina por primera vez. Allí lucha por lograr el éxito.

Leonardo recibe un nuevo encargo (La Última Cena), pero lucha con su confusión interna. Después de poner su creatividad a prueba y experimentar una nueva técnica, Leonardo se enfrenta a las consecuencias de sus actos mientras una situación problemática se intensifica con resultados devastadores.

Leonardo recibe el encargo de pintar el retrato que se convertirá en la Mona Lisa. Sin poder arreglar su relación rota con Caterina, Leonardo va a Imola a trabajar para Cesare Borgia, pero pronto se da cuenta de que no todo es lo que parece y pierde toda esperanza.