愁云惨淡的明治时代，曾遭到新政府利用和背叛的志志雄真实（池田政典 配音）从地狱活转，而今他的阴影笼罩在和平年代的上空。似乎与此同时，绯村剑心（凉风真世 配音）以及伙伴们皆明了志志雄的真正目的，即利用京都大火的混乱进军大阪。以此为契机，剑心、斋藤、相乐左之助分头向大阪挺进，而薰、弥彦、比谷清十郎以及京都御庭番众则留守戒备，随时迎接志志雄爪牙的入侵。濑田宗次郎、破军、四乃森苍紫等绝世高手相继登场，与原作大相径庭的经典对决，渐次拉开序幕……

本片根据和月伸宏的同名漫画改编，为动画版上映15周年纪念作。

Shishio's plan wordt uitgevoerd terwijl Kenshin en Misao de stad helpen verdedigen.

Shishio's plan is enacted while Kenshin and Misao help defend the city.

巻町操に緋村剣心の捜索を命じた京都御庭番衆の頭・翁が斬られた。それを見た操は思い人・蒼紫を追うことをあきらめ、京都御庭番衆御頭となることを決意。剣心に蒼紫を討つよう依頼する。京都破壊計画の糸を操る志々雄真実の策略を阻止するため、操は京都を防衛し、剣心は大阪港へ向かう。

Contada a partir da perspectiva de Makimachi Misao, está releitura suplente do arco de Kyoto narra as aventuras de espadachim errante Kenshin Himura e sua busca em colocar um ponto final no maldoso Shishio Makoto e seu plano de assumir o Japão.

Contada a partir da perspectiva de Misao Makimachi, esta é a segunda parte da releitura suplente do Arco de Kyoto, que narra as aventuras de espadachim errante Kenshin Himura e sua busca em colocar um ponto final no maldoso Makoto Shishio e seu plano de dominar o Japão.

El plan de Shishio se lleva a cabo mientras Kenshin y Misao ayudan a defender la ciudad.

El plan de Shishio se lleva a cabo mientras Kenshin y Misao ayudan a defender la ciudad.