公元2201年，拒绝入侵伽米拉苏（Gamirasu）一年后，白彗星帝国（White Comet Empire）接触了太空中的每个星球。地球几乎在重建中就完工了，这座城市充满生机，充满了和平。 Susumu Kodai还陪同车队担任护航舰的船长，但不小心收到了来历不明的消息。传达的信息是一个女人的声音寻求帮助。前大和号船员发射大和号以找出这场危机的真实性质。

　　到达Teresato的古人救助了Teresa，后者是消息的发送者。特雷莎告诉我们，白彗星帝国正在一个又一个地入侵宇宙中的恒星，而下一个目标就是地球。 白彗星帝国以最先进的战舰“仙女座”为旗舰，歼灭了地球并歼灭了地球舰队。大和号向白彗星旋涡的核心发射波炮。彗星变成了火球并燃烧着，但随之而来的是一个巨大的堡垒，即城市帝国。 在激烈的战斗中，机组人员在行动中被一再杀死。古人入侵城市帝国的内部并摧毁了电炉。然而，巨大的战舰从城市帝国内部涌现。他前往嘲笑大和县的佐田皇帝，大和县几乎耗尽了精力，并告诉他，他将在远古时代彻底战斗。 在远古时代，当做出确定的决定时，幸存的少数船员被从大和号解雇，大和号被发射到巨型战列舰上。特蕾莎修女出现在那儿，与大和号一起驶向一艘巨大的战舰。大和号最终一闪而逝，消失在太空中。

Terwijl de Aarde aan het herstellen is van de Gamilon aanvallen, is zij begonnen met het koloniseren van kleine planeten. De staf van het ruimteschip Argo is inmiddels ontheven van zijn taken, en zijn hun heil in een andere omgeving gaan zoeken. Wanneer de 'White Comet Empire' van Lord Zordar de aarde wil veroveren, wordt de bemanning van de Gamilon weer bij elkaar gesprokkeld om de plannen van Lord Zordar te stoppen.

The Yamato and her crew face the onslaught of the Comet Empire, a civilization from the Andromeda Galaxy who seek to conquer Earth, led by Prince Zordar. They have harnessed a comet and is using its terrible power to unleash destruction upon its rivals and inferiors... which are in fact everyone. The Space Battleship Yamato heads back into action. But this time, it shall not return, and much of the Yamato crew have signed on for their last voyage.

הסרט השני מתוך חמישה סרטים.זהו סרט שמהווה גרסה מקוצרת של העונה השניה של חלוצי החלל אודות פלישת ממלכת כוכב השביט במטרת כיבוש הארץ.בניגוד לעונה השניה, הסרט מסתיים בהקרבת חיי הצוות והספינה להצלת הארץ וכך הסיפור מסתיים.לכן, יש להתייחס לסרט כפרק עצמאי, שאינו קשור לקו הזמן של הסדרה.

Anno 2201. La Terra è entrata in una fase di pace e prosperità. La corazzata Yamato, che aveva salvato la Terra dalla minaccia di Gamilas, è ormai destinata allo smaltimento, superata dalla nuova classe di corazzate spaziali Andromeda. Ma un giorno viene captata una richiesta di aiuto proveniente dall’ultima sopravvissuta del misterioso pianeta Terasat. Una voce femminile avverte dell’avanzata di un enorme cometa bianca, che distrugge ogni cosa al suo passaggio. Disobbedendo agli ordini dei superiori, la Yamato e il suo equipaggio ripartono per un nuovo viaggio verso l’ignoto.

ガミラス星との長い戦いが終わり、地球は順調に復興していた。ヤマトは廃艦になり、古代らは輸送船の護衛任務につく。だが、またもや人類に危機が迫っていた。宇宙の彼方から全宇宙の征服をたくらむ白色彗星帝国が接近していたのだ。そんなとき、古代は未知の星から発信された通信をキャッチする。それはテレサという女性からの助けを求めるメッセージだった。だが、地球連邦政府は取り合おうとしない。古代らは宇宙戦艦ヤマトで極秘に出航し、発信源の星へと向かうのだった。

2201년, 지구를 위기에서 구한 야마토의 자리를 안드로이드메다가 대신한다. 어느 날, 먼 우주로부터 SOS 메시지가 도착하고 야마토는 백색혜성제국을 막아내기 위해 테레자트로 출항한다!

Em uma outra galáxia, um enorme cometa branco viajava a uma grande velocidade, destruindo tudo em seu caminho e conquistando vários planetas: o Cometa Império, uma gigantesca cidade-fortaleza que possuía o maior e mais poderoso exército do universo. Seu próximo objetivo: conquistar a Via Láctea, mais especificamente, a Terra. Assim, sob o comando de seu líder, o Imperador Zordar, o Cometa Império, junto com suas tropas, segue rumo à Terra, visando a sua dominação. Então, com o intuito de investigar o que estaria acontecendo nos arredores da galáxia, o Yamato parte novamente para o espaço, em direção a Telezart. Porém, este era justamente o plano do inimigo. Uma nova e terrível batalha estava prestes a começar.

No ano de 2201, um ano após o Yamato ter salvo a Terra da contaminação radioativa, uma nova ameaça surge. O Yamato faz sua jornada final para salvar a Terra dessa nova ameaça. A Terra quase se recuperou da batalha contra Gamilus e a reconstrução se expandiu para os outros planetas. Quando ex-companheiros de tripulação de Yamato descobrem uma mensagem estranha e truncada que parece vir de um cometa branco vindo em direção à Terra. Eles sequestram sua antiga fortaleza espacial e começam uma nova batalha.

Кометная Империя - город-государство, путешествующий по эллиптической орбите на искусственной комете уже многие столетия, и грабящей и уничтожающей все встреченные по пути следования планеты. Мир уже забыл о войне, создал космофлот с кучей крохотных корабликов и решил поставить Ямато как памятник. Собравшись у памятника Капитану Оките, вся старая команда решает спасти Ямато от такой участи и угоняет его. В это время Кометная Империя приближается к Земле, и именно Ямато предстоит дать ей свой последний и решительный бой.