Родился в семье Георгия Павловича Малянтовича, сына Павла Николаевчича Малянтовича — видного российского юриста, министра юстиции во Временном правительстве от партии РСДРП (меньшевиков). Дед и отец были расстреляны во время репрессий конца 1930-х годов.

Сам Кирилл Георгиевич был дважды репрессирован в 1930-х и 1950-х годах как «член семьи врага народа». В общей сложности провёл в лагерях 5 лет. После смерти Сталина был полностью реабилитирован. Также посмертно были реабилитированы отец и дед Кирилла Георгиевича.

Участвовал в Великой Отечественной войне, награждён орденами Отечественной войны I и II степени.

В 1947 году работал на студии «Союзмультфильм» фазовщиком и прорисовщиком. В 1947—48 годах обучался на курсах художников-мультипликаторов при студии.

С 1947 по 1970 год (с перерывом с 1951 по 1954 год, когда находился в местах заключения) работал на киностудии «Союзмультфильм» мультипликатором рисованных и кукольных фильмов.

С 1970 по 1987 работал режиссёром и мультипликатором на студии «Мульттелефильм» ТО «Экран». Являлся режиссёром кукольных фильмов, работал в научной мультипликации. Принимал участие в организации и обучении специалистов мультстудий союзных республик СССР (Украины, Эстонии, Грузии и других).

В 1990-е годы являлся преподавателем на студии «Классика».

Кирилл Малянтович является автором рассказов-воспоминаний, публиковался в периодической печати (еженедельная газета «Алфавит», журналы «Новая Юность», «Русский адвокат», «Кинограф», «Киноведческие записки»), в литературном альманахе "С.Л.О.В.А" (вып. 2, 2015 год).