Joe Flanigan (born January 5, 1967) is an American television actor best known for his portrayal of the character Major/Lt. Colonel John Sheppard in Stargate Atlantis.

Joe Flanigan (* 5. Januar 1967 in Los Angeles, Kalifornien; geboren als Joseph Harold Dunnigan III) ist ein amerikanischer Schauspieler.

Seine ersten Schauspielerfahrungen machte Flanigan dann in Werbespots. Sein Fernsehdebüt gab er indes 1994 in einer Hauptrolle in der mit einem Emmy nominierten NBC-Miniserie „Family Album“ der Schriftstellerin Danielle Steel.

Flanigan hatte Gastrollen in zahlreichen TV-Serien, wie zum Beispiel Profiler, First Monday und Sisters, bis ihm der Durchbruch mit der Rolle des Major/Lt. Colonel John Sheppard in Stargate Atlantis gelang. Für die Serie schrieb er auch die Drehbücher zu den Folgen Epiphany aus der zweiten und Outcast aus der vierten Staffel.

2010 spielte er die Hauptrolle des Colonel Sam Synn, im Film Ferocious Planet.

Urodzony w Los Angeles Flanigan przeprowadził się wraz z rodziną na małe ranczo w Reno w Nevadzie kiedy miał sześć lat. W wieku 14 lat zaczął naukę w Ojai, Kalifornia., gdzie zagrał Stanleya Kowalskiego w szkolnym przedstawieniu "Tramwaj zwany pożądaniem". Potem studiował historię na University of Colorado. Flanigan wystąpił w tytułowej roli w "Coriolanus" i studiował w Paryżu w ramach programu Junior Year Abroad. Po skończeniu nauki rozwinął swój talent pisarki i zaczął pisać dla nowojorskich magazynów "Interview" i "Town & Country". Potem, dzięki znajomościom, zaczął robić karierę aktorską. Po studiach na Neighborhood Playhouse, gdzie grał Eddiego w "Rabbit Trap", Flanigan zamieskał w Los Angeles. Innymi zainteresowaniami Flanigana są: narty, wspinaczka górska, surfing, tenis, chodzenie po górach i jazda konna. Aktor nie ma za wiele czasu na oglądanie sportu, co również jest jego wielką pasją. Joe przeprowadził się ze swoją rodziną z Malibu do Vancouver, gdzie aktor kręci "Stargate Atlantis".